Title
|
RNASE PH CORE OF THE ARCHAEAL EXOSOME IN COMPLEX WITH U8 RNA |
Classification
|
HYDROLASE |
Compound
|
PROBABLE EXOSOME COMPLEX EXONUCLEASE 2 |
Source
|
(ECX1_SULSO) |
|
Sequence
|
A: |
MSSTPSNQNIIPIIKKESIVSLFEKGIRQDGRKLTDYRPL
SITLDYAKKADGSALVKLGTTMVLAGTKLEIDKPYEDTPN
QGNLIVNVELLPDENAIELARVVDRSLRDSKALDLTKLVI
EPGKSVWTVWLDVYVLDYGGNVLDACTLASVAALYNTKVY
KVEQISVNKNEVVGKLPLNYPVVTISVAKVDKYLVVDPDL
DEESIMDAKISFSYTPDLKIVGIQKSGKGSMSLQDIDQAE
NTARSTAVKLLEELKKHLGI
|
B: |
ERPKLILDDGKRTDGRKPDELRSIKIELGVLKNADGSAIF
EMGNTKAIAAVYGPKEMHPRHLSLPDRAVLRVRYHMTPFS
TDERKNPAPSRREIELSKVIREALESAVLVELFPRTAIDV
FTEILQADAGSRLVSLMAASLALADAGIPMRDLIAGVAVG
KADGVIILDLNETEDMWGEADMPIAMMPSLNQVTLFQLNG
SMTPDEFRQAFDLAVKGINIIYNLEREALKSKYVEFKEEG
V
|
C: |
MSSTPSNQNIIPIIKKESIVSLFEKGIRQDGRKLTDYRPL
SITLDYAKKADGSALVKLGTTMVLAGTKLEIDKPYEDTPN
QGNLIVNVELLPDENAIELARVVDRSLRDSKALDLTKLVI
EPGKSVWTVWLDVYVLDYGGNVLDACTLASVAALYNTKVY
KVEQISVNKNEVVGKLPLNYPVVTISVAKVDKYLVVDPDL
DEESIMDAKISFSYTPDLKIVGIQKSGKGSMSLQDIDQAE
NTARSTAVKLLEELKKHLGI
|
D: |
REMLQVERPKLILDDGKRTDGRKPDELRSIKIELGVLKNA
DGSAIFEMGNTKAIAAVYGPKEMHPRHLSLPDRAVLRVRY
HMTPFSTDERKNPAPSRREIELSKVIREALESAVLVELFP
RTAIDVFTEILQADAGSRLVSLMAASLALADAGIPMRDLI
AGVAVGKADGVIILDLNETEDMWGEADMPIAMMPSLNQVT
LFQLNGSMTPDEFRQAFDLAVKGINIIYNLEREALKSKYV
EFKEEGV
|
E: |
MSSTPSNQNIIPIIKKESIVSLFEKGIRQDGRKLTDYRPL
SITLDYAKKADGSALVKLGTTMVLAGTKLEIDKPYEDTPN
QGNLIVNVELLPDENAIELARVVDRSLRDSKALDLTKLVI
EPGKSVWTVWLDVYVLDYGGNVLDACTLASVAALYNTKVY
KVEQISVNKNEVVGKLPLNYPVVTISVAKVDKYLVVDPDL
DEESIMDAKISFSYTPDLKIVGIQKSGKGSMSLQDIDQAE
NTARSTAVKLLEELKKHLGI
|
F: |
ERPKLILDDGKRTDGRKPDELRSIKIELGVLKNADGSAIF
EMGNTKAIAAVYGPKEMHPRHLSLPDRAVLRVRYHMTPFS
TDERKNPAPSRREIELSKVIREALESAVLVELFPRTAIDV
FTEILQADAGSRLVSLMAASLALADAGIPMRDLIAGVAVG
KADGVIILDLNETEDMWGEADMPIAMMPSLNQVTLFQLNG
SMTPDEFRQAFDLAVKGINIIYNLEREALKSKYVEFKEEG
V
|
G: |
MSSTPSNQNIIPIIKKESIVSLFEKGIRQDGRKLTDYRPL
SITLDYAKKADGSALVKLGTTMVLAGTKLEIDKPYEDTPN
QGNLIVNVELLPDENAIELARVVDRSLRDSKALDLTKLVI
EPGKSVWTVWLDVYVLDYGGNVLDACTLASVAALYNTKVY
KVEQISVNKNEVVGKLPLNYPVVTISVAKVDKYLVVDPDL
DEESIMDAKISFSYTPDLKIVGIQKSGKGSMSLQDIDQAE
NTARSTAVKLLEELKKHLGI
|
H: |
ERPKLILDDGKRTDGRKPDELRSIKIELGVLKNADGSAIF
EMGNTKAIAAVYGPKEMHPRHLSLPDRAVLRVRYHMTPFS
TDERKNPAPSRREIELSKVIREALESAVLVELFPRTAIDV
FTEILQADAGSRLVSLMAASLALADAGIPMRDLIAGVAVG
KADGVIILDLNETEDMWGEADMPIAMMPSLNQVTLFQLNG
SMTPDEFRQAFDLAVKGINIIYNLEREALKSKYVEFKEEG
V
|
I: |
MSSTPSNQNIIPIIKKESIVSLFEKGIRQDGRKLTDYRPL
SITLDYAKKADGSALVKLGTTMVLAGTKLEIDKPYEDTPN
QGNLIVNVELLPDENAIELARVVDRSLRDSKALDLTKLVI
EPGKSVWTVWLDVYVLDYGGNVLDACTLASVAALYNTKVY
KVEQISVNKNEVVGKLPLNYPVVTISVAKVDKYLVVDPDL
DEESIMDAKISFSYTPDLKIVGIQKSGKGSMSLQDIDQAE
NTARSTAVKLLEELKKHLGI
|
J: |
ERPKLILDDGKRTDGRKPDELRSIKIELGVLKNADGSAIF
EMGNTKAIAAVYGPKEMHPRHLSLPDRAVLRVRYHMTPFS
TDERKNPAPSRREIELSKVIREALESAVLVELFPRTAIDV
FTEILQADAGSRLVSLMAASLALADAGIPMRDLIAGVAVG
KADGVIILDLNETEDMWGEADMPIAMMPSLNQVTLFQLNG
SMTPDEFRQAFDLAVKGINIIYNLEREALKSKYVEFKEEG
V
|
K: |
MSSTPSNQNIIPIIKKESIVSLFEKGIRQDGRKLTDYRPL
SITLDYAKKADGSALVKLGTTMVLAGTKLEIDKPYEDTPN
QGNLIVNVELLPDENAIELARVVDRSLRDSKALDLTKLVI
EPGKSVWTVWLDVYVLDYGGNVLDACTLASVAALYNTKVY
KVEQISVNKNEVVGKLPLNYPVVTISVAKVDKYLVVDPDL
DEESIMDAKISFSYTPDLKIVGIQKSGKGSMSLQDIDQAE
NTARSTAVKLLEELKKHLGI
|
L: |
REMLQVERPKLILDDGKRTDGRKPDELRSIKIELGVLKNA
DGSAIFEMGNTKAIAAVYGPKEMHPRHLSLPDRAVLRVRY
HMTPFSTDERKNPAPSRREIELSKVIREALESAVLVELFP
RTAIDVFTEILQADAGSRLVSLMAASLALADAGIPMRDLI
AGVAVGKADGVIILDLNETEDMWGEADMPIAMMPSLNQVT
LFQLNGSMTPDEFRQAFDLAVKGINIIYNLEREALKSKYV
EFKEEGV
|
M: |
MSSTPSNQNIIPIIKKESIVSLFEKGIRQDGRKLTDYRPL
SITLDYAKKADGSALVKLGTTMVLAGTKLEIDKPYEDTPN
QGNLIVNVELLPDENAIELARVVDRSLRDSKALDLTKLVI
EPGKSVWTVWLDVYVLDYGGNVLDACTLASVAALYNTKVY
KVEQISVNKNEVVGKLPLNYPVVTISVAKVDKYLVVDPDL
DEESIMDAKISFSYTPDLKIVGIQKSGKGSMSLQDIDQAE
NTARSTAVKLLEELKKHLGI
|
N: |
ERPKLILDDGKRTDGRKPDELRSIKIELGVLKNADGSAIF
EMGNTKAIAAVYGPKEMHPRHLSLPDRAVLRVRYHMTPFS
TDERKNPAPSRREIELSKVIREALESAVLVELFPRTAIDV
FTEILQADAGSRLVSLMAASLALADAGIPMRDLIAGVAVG
KADGVIILDLNETEDMWGEADMPIAMMPSLNQVTLFQLNG
SMTPDEFRQAFDLAVKGINIIYNLEREALKSKYVEFKEEG
V
|
O: |
MSSTPSNQNIIPIIKKESIVSLFEKGIRQDGRKLTDYRPL
SITLDYAKKADGSALVKLGTTMVLAGTKLEIDKPYEDTPN
QGNLIVNVELLPDENAIELARVVDRSLRDSKALDLTKLVI
EPGKSVWTVWLDVYVLDYGGNVLDACTLASVAALYNTKVY
KVEQISVNKNEVVGKLPLNYPVVTISVAKVDKYLVVDPDL
DEESIMDAKISFSYTPDLKIVGIQKSGKGSMSLQDIDQAE
NTARSTAVKLLEELKKHLGI
|
P: |
MREMLQVERPKLILDDGKRTDGRKPDELRSIKIELGVLKN
ADGSAIFEMGNTKAIAAVYGPKEMHPRHLSLPDRAVLRVR
YHMTPFSTDERKNPAPSRREIELSKVIREALESAVLVELF
PRTAIDVFTEILQADAGSRLVSLMAASLALADAGIPMRDL
IAGVAVGKADGVIILDLNETEDMWGEADMPIAMMPSLNQV
TLFQLNGSMTPDEFRQAFDLAVKGINIIYNLEREALKSKY
VEFKEEGV
|
Q: |
MSSTPSNQNIIPIIKKESIVSLFEKGIRQDGRKLTDYRPL
SITLDYAKKADGSALVKLGTTMVLAGTKLEIDKPYEDTPN
QGNLIVNVELLPDENAIELARVVDRSLRDSKALDLTKLVI
EPGKSVWTVWLDVYVLDYGGNVLDACTLASVAALYNTKVY
KVEQISVNKNEVVGKLPLNYPVVTISVAKVDKYLVVDPDL
DEESIMDAKISFSYTPDLKIVGIQKSGKGSMSLQDIDQAE
NTARSTAVKLLEELKKHLGI
|
R: |
MLQVERPKLILDDGKRTDGRKPDELRSIKIELGVLKNADG
SAIFEMGNTKAIAAVYGPKEMHPRHLSLPDRAVLRVRYHM
TPFSTDERKNPAPSRREIELSKVIREALESAVLVELFPRT
AIDVFTEILQADAGSRLVSLMAASLALADAGIPMRDLIAG
VAVGKADGVIILDLNETEDMWGEADMPIAMMPSLNQVTLF
QLNGSMTPDEFRQAFDLAVKGINIIYNLEREALKSKYVEF
KEEGV
|
S: |
MSSTPSNQNIIPIIKKESIVSLFEKGIRQDGRKLTDYRPL
SITLDYAKKADGSALVKLGTTMVLAGTKLEIDKPYEDTPN
QGNLIVNVELLPDENAIELARVVDRSLRDSKALDLTKLVI
EPGKSVWTVWLDVYVLDYGGNVLDACTLASVAALYNTKVY
KVEQISVNKNEVVGKLPLNYPVVTISVAKVDKYLVVDPDL
DEESIMDAKISFSYTPDLKIVGIQKSGKGSMSLQDIDQAE
NTARSTAVKLLEELKKHLGI
|
T: |
REMLQVERPKLILDDGKRTDGRKPDELRSIKIELGVLKNA
DGSAIFEMGNTKAIAAVYGPKEMHPRHLSLPDRAVLRVRY
HMTPFSTDERKNPAPSRREIELSKVIREALESAVLVELFP
RTAIDVFTEILQADAGSRLVSLMAASLALADAGIPMRDLI
AGVAVGKADGVIILDLNETEDMWGEADMPIAMMPSLNQVT
LFQLNGSMTPDEFRQAFDLAVKGINIIYNLEREALKSKYV
EFKEEGV
|
U: |
MSSTPSNQNIIPIIKKESIVSLFEKGIRQDGRKLTDYRPL
SITLDYAKKADGSALVKLGTTMVLAGTKLEIDKPYEDTPN
QGNLIVNVELLPDENAIELARVVDRSLRDSKALDLTKLVI
EPGKSVWTVWLDVYVLDYGGNVLDACTLASVAALYNTKVY
KVEQISVNKNEVVGKLPLNYPVVTISVAKVDKYLVVDPDL
DEESIMDAKISFSYTPDLKIVGIQKSGKGSMSLQDIDQAE
NTARSTAVKLLEELKKHLGI
|
V: |
LQVERPKLILDDGKRTDGRKPDELRSIKIELGVLKNADGS
AIFEMGNTKAIAAVYGPKEMHPRHLSLPDRAVLRVRYHMT
PFSTDERKNPAPSRREIELSKVIREALESAVLVELFPRTA
IDVFTEILQADAGSRLVSLMAASLALADAGIPMRDLIAGV
AVGKADGVIILDLNETEDMWGEADMPIAMMPSLNQVTLFQ
LNGSMTPDEFRQAFDLAVKGINIIYNLEREALKSKYVEFK
EEGV
|
W: |
MSSTPSNQNIIPIIKKESIVSLFEKGIRQDGRKLTDYRPL
SITLDYAKKADGSALVKLGTTMVLAGTKLEIDKPYEDTPN
QGNLIVNVELLPDENAIELARVVDRSLRDSKALDLTKLVI
EPGKSVWTVWLDVYVLDYGGNVLDACTLASVAALYNTKVY
KVEQISVNKNEVVGKLPLNYPVVTISVAKVDKYLVVDPDL
DEESIMDAKISFSYTPDLKIVGIQKSGKGSMSLQDIDQAE
NTARSTAVKLLEELKKHLGI
|
X: |
ERPKLILDDGKRTDGRKPDELRSIKIELGVLKNADGSAIF
EMGNTKAIAAVYGPKEMHPRHLSLPDRAVLRVRYHMTPFS
TDERKNPAPSRREIELSKVIREALESAVLVELFPRTAIDV
FTEILQADAGSRLVSLMAASLALADAGIPMRDLIAGVAVG
KADGVIILDLNETEDMWGEADMPIAMMPSLNQVTLFQLNG
SMTPDEFRQAFDLAVKGINIIYNLEREALKSKYVEFKEEG
V
|
|
Description
|