eF-site ID 2c37-ABCDEFGHIJKLMNOPQRSTUVWX
PDB Code 2c37
Chain A, B, C, D, E, F, G, H, I, J, K, L, M, N, O, P, Q, R, S, T, U, V, W, X
Title RNASE PH CORE OF THE ARCHAEAL EXOSOME IN COMPLEX WITH U8 RNA
Classification HYDROLASE
Compound PROBABLE EXOSOME COMPLEX EXONUCLEASE 2
Source (ECX1_SULSO)
Sequence A:  MSSTPSNQNIIPIIKKESIVSLFEKGIRQDGRKLTDYRPL
SITLDYAKKADGSALVKLGTTMVLAGTKLEIDKPYEDTPN
QGNLIVNVELLPDENAIELARVVDRSLRDSKALDLTKLVI
EPGKSVWTVWLDVYVLDYGGNVLDACTLASVAALYNTKVY
KVEQISVNKNEVVGKLPLNYPVVTISVAKVDKYLVVDPDL
DEESIMDAKISFSYTPDLKIVGIQKSGKGSMSLQDIDQAE
NTARSTAVKLLEELKKHLGI
B:  ERPKLILDDGKRTDGRKPDELRSIKIELGVLKNADGSAIF
EMGNTKAIAAVYGPKEMHPRHLSLPDRAVLRVRYHMTPFS
TDERKNPAPSRREIELSKVIREALESAVLVELFPRTAIDV
FTEILQADAGSRLVSLMAASLALADAGIPMRDLIAGVAVG
KADGVIILDLNETEDMWGEADMPIAMMPSLNQVTLFQLNG
SMTPDEFRQAFDLAVKGINIIYNLEREALKSKYVEFKEEG
V
C:  MSSTPSNQNIIPIIKKESIVSLFEKGIRQDGRKLTDYRPL
SITLDYAKKADGSALVKLGTTMVLAGTKLEIDKPYEDTPN
QGNLIVNVELLPDENAIELARVVDRSLRDSKALDLTKLVI
EPGKSVWTVWLDVYVLDYGGNVLDACTLASVAALYNTKVY
KVEQISVNKNEVVGKLPLNYPVVTISVAKVDKYLVVDPDL
DEESIMDAKISFSYTPDLKIVGIQKSGKGSMSLQDIDQAE
NTARSTAVKLLEELKKHLGI
D:  REMLQVERPKLILDDGKRTDGRKPDELRSIKIELGVLKNA
DGSAIFEMGNTKAIAAVYGPKEMHPRHLSLPDRAVLRVRY
HMTPFSTDERKNPAPSRREIELSKVIREALESAVLVELFP
RTAIDVFTEILQADAGSRLVSLMAASLALADAGIPMRDLI
AGVAVGKADGVIILDLNETEDMWGEADMPIAMMPSLNQVT
LFQLNGSMTPDEFRQAFDLAVKGINIIYNLEREALKSKYV
EFKEEGV
E:  MSSTPSNQNIIPIIKKESIVSLFEKGIRQDGRKLTDYRPL
SITLDYAKKADGSALVKLGTTMVLAGTKLEIDKPYEDTPN
QGNLIVNVELLPDENAIELARVVDRSLRDSKALDLTKLVI
EPGKSVWTVWLDVYVLDYGGNVLDACTLASVAALYNTKVY
KVEQISVNKNEVVGKLPLNYPVVTISVAKVDKYLVVDPDL
DEESIMDAKISFSYTPDLKIVGIQKSGKGSMSLQDIDQAE
NTARSTAVKLLEELKKHLGI
F:  ERPKLILDDGKRTDGRKPDELRSIKIELGVLKNADGSAIF
EMGNTKAIAAVYGPKEMHPRHLSLPDRAVLRVRYHMTPFS
TDERKNPAPSRREIELSKVIREALESAVLVELFPRTAIDV
FTEILQADAGSRLVSLMAASLALADAGIPMRDLIAGVAVG
KADGVIILDLNETEDMWGEADMPIAMMPSLNQVTLFQLNG
SMTPDEFRQAFDLAVKGINIIYNLEREALKSKYVEFKEEG
V
G:  MSSTPSNQNIIPIIKKESIVSLFEKGIRQDGRKLTDYRPL
SITLDYAKKADGSALVKLGTTMVLAGTKLEIDKPYEDTPN
QGNLIVNVELLPDENAIELARVVDRSLRDSKALDLTKLVI
EPGKSVWTVWLDVYVLDYGGNVLDACTLASVAALYNTKVY
KVEQISVNKNEVVGKLPLNYPVVTISVAKVDKYLVVDPDL
DEESIMDAKISFSYTPDLKIVGIQKSGKGSMSLQDIDQAE
NTARSTAVKLLEELKKHLGI
H:  ERPKLILDDGKRTDGRKPDELRSIKIELGVLKNADGSAIF
EMGNTKAIAAVYGPKEMHPRHLSLPDRAVLRVRYHMTPFS
TDERKNPAPSRREIELSKVIREALESAVLVELFPRTAIDV
FTEILQADAGSRLVSLMAASLALADAGIPMRDLIAGVAVG
KADGVIILDLNETEDMWGEADMPIAMMPSLNQVTLFQLNG
SMTPDEFRQAFDLAVKGINIIYNLEREALKSKYVEFKEEG
V
I:  MSSTPSNQNIIPIIKKESIVSLFEKGIRQDGRKLTDYRPL
SITLDYAKKADGSALVKLGTTMVLAGTKLEIDKPYEDTPN
QGNLIVNVELLPDENAIELARVVDRSLRDSKALDLTKLVI
EPGKSVWTVWLDVYVLDYGGNVLDACTLASVAALYNTKVY
KVEQISVNKNEVVGKLPLNYPVVTISVAKVDKYLVVDPDL
DEESIMDAKISFSYTPDLKIVGIQKSGKGSMSLQDIDQAE
NTARSTAVKLLEELKKHLGI
J:  ERPKLILDDGKRTDGRKPDELRSIKIELGVLKNADGSAIF
EMGNTKAIAAVYGPKEMHPRHLSLPDRAVLRVRYHMTPFS
TDERKNPAPSRREIELSKVIREALESAVLVELFPRTAIDV
FTEILQADAGSRLVSLMAASLALADAGIPMRDLIAGVAVG
KADGVIILDLNETEDMWGEADMPIAMMPSLNQVTLFQLNG
SMTPDEFRQAFDLAVKGINIIYNLEREALKSKYVEFKEEG
V
K:  MSSTPSNQNIIPIIKKESIVSLFEKGIRQDGRKLTDYRPL
SITLDYAKKADGSALVKLGTTMVLAGTKLEIDKPYEDTPN
QGNLIVNVELLPDENAIELARVVDRSLRDSKALDLTKLVI
EPGKSVWTVWLDVYVLDYGGNVLDACTLASVAALYNTKVY
KVEQISVNKNEVVGKLPLNYPVVTISVAKVDKYLVVDPDL
DEESIMDAKISFSYTPDLKIVGIQKSGKGSMSLQDIDQAE
NTARSTAVKLLEELKKHLGI
L:  REMLQVERPKLILDDGKRTDGRKPDELRSIKIELGVLKNA
DGSAIFEMGNTKAIAAVYGPKEMHPRHLSLPDRAVLRVRY
HMTPFSTDERKNPAPSRREIELSKVIREALESAVLVELFP
RTAIDVFTEILQADAGSRLVSLMAASLALADAGIPMRDLI
AGVAVGKADGVIILDLNETEDMWGEADMPIAMMPSLNQVT
LFQLNGSMTPDEFRQAFDLAVKGINIIYNLEREALKSKYV
EFKEEGV
M:  MSSTPSNQNIIPIIKKESIVSLFEKGIRQDGRKLTDYRPL
SITLDYAKKADGSALVKLGTTMVLAGTKLEIDKPYEDTPN
QGNLIVNVELLPDENAIELARVVDRSLRDSKALDLTKLVI
EPGKSVWTVWLDVYVLDYGGNVLDACTLASVAALYNTKVY
KVEQISVNKNEVVGKLPLNYPVVTISVAKVDKYLVVDPDL
DEESIMDAKISFSYTPDLKIVGIQKSGKGSMSLQDIDQAE
NTARSTAVKLLEELKKHLGI
N:  ERPKLILDDGKRTDGRKPDELRSIKIELGVLKNADGSAIF
EMGNTKAIAAVYGPKEMHPRHLSLPDRAVLRVRYHMTPFS
TDERKNPAPSRREIELSKVIREALESAVLVELFPRTAIDV
FTEILQADAGSRLVSLMAASLALADAGIPMRDLIAGVAVG
KADGVIILDLNETEDMWGEADMPIAMMPSLNQVTLFQLNG
SMTPDEFRQAFDLAVKGINIIYNLEREALKSKYVEFKEEG
V
O:  MSSTPSNQNIIPIIKKESIVSLFEKGIRQDGRKLTDYRPL
SITLDYAKKADGSALVKLGTTMVLAGTKLEIDKPYEDTPN
QGNLIVNVELLPDENAIELARVVDRSLRDSKALDLTKLVI
EPGKSVWTVWLDVYVLDYGGNVLDACTLASVAALYNTKVY
KVEQISVNKNEVVGKLPLNYPVVTISVAKVDKYLVVDPDL
DEESIMDAKISFSYTPDLKIVGIQKSGKGSMSLQDIDQAE
NTARSTAVKLLEELKKHLGI
P:  MREMLQVERPKLILDDGKRTDGRKPDELRSIKIELGVLKN
ADGSAIFEMGNTKAIAAVYGPKEMHPRHLSLPDRAVLRVR
YHMTPFSTDERKNPAPSRREIELSKVIREALESAVLVELF
PRTAIDVFTEILQADAGSRLVSLMAASLALADAGIPMRDL
IAGVAVGKADGVIILDLNETEDMWGEADMPIAMMPSLNQV
TLFQLNGSMTPDEFRQAFDLAVKGINIIYNLEREALKSKY
VEFKEEGV
Q:  MSSTPSNQNIIPIIKKESIVSLFEKGIRQDGRKLTDYRPL
SITLDYAKKADGSALVKLGTTMVLAGTKLEIDKPYEDTPN
QGNLIVNVELLPDENAIELARVVDRSLRDSKALDLTKLVI
EPGKSVWTVWLDVYVLDYGGNVLDACTLASVAALYNTKVY
KVEQISVNKNEVVGKLPLNYPVVTISVAKVDKYLVVDPDL
DEESIMDAKISFSYTPDLKIVGIQKSGKGSMSLQDIDQAE
NTARSTAVKLLEELKKHLGI
R:  MLQVERPKLILDDGKRTDGRKPDELRSIKIELGVLKNADG
SAIFEMGNTKAIAAVYGPKEMHPRHLSLPDRAVLRVRYHM
TPFSTDERKNPAPSRREIELSKVIREALESAVLVELFPRT
AIDVFTEILQADAGSRLVSLMAASLALADAGIPMRDLIAG
VAVGKADGVIILDLNETEDMWGEADMPIAMMPSLNQVTLF
QLNGSMTPDEFRQAFDLAVKGINIIYNLEREALKSKYVEF
KEEGV
S:  MSSTPSNQNIIPIIKKESIVSLFEKGIRQDGRKLTDYRPL
SITLDYAKKADGSALVKLGTTMVLAGTKLEIDKPYEDTPN
QGNLIVNVELLPDENAIELARVVDRSLRDSKALDLTKLVI
EPGKSVWTVWLDVYVLDYGGNVLDACTLASVAALYNTKVY
KVEQISVNKNEVVGKLPLNYPVVTISVAKVDKYLVVDPDL
DEESIMDAKISFSYTPDLKIVGIQKSGKGSMSLQDIDQAE
NTARSTAVKLLEELKKHLGI
T:  REMLQVERPKLILDDGKRTDGRKPDELRSIKIELGVLKNA
DGSAIFEMGNTKAIAAVYGPKEMHPRHLSLPDRAVLRVRY
HMTPFSTDERKNPAPSRREIELSKVIREALESAVLVELFP
RTAIDVFTEILQADAGSRLVSLMAASLALADAGIPMRDLI
AGVAVGKADGVIILDLNETEDMWGEADMPIAMMPSLNQVT
LFQLNGSMTPDEFRQAFDLAVKGINIIYNLEREALKSKYV
EFKEEGV
U:  MSSTPSNQNIIPIIKKESIVSLFEKGIRQDGRKLTDYRPL
SITLDYAKKADGSALVKLGTTMVLAGTKLEIDKPYEDTPN
QGNLIVNVELLPDENAIELARVVDRSLRDSKALDLTKLVI
EPGKSVWTVWLDVYVLDYGGNVLDACTLASVAALYNTKVY
KVEQISVNKNEVVGKLPLNYPVVTISVAKVDKYLVVDPDL
DEESIMDAKISFSYTPDLKIVGIQKSGKGSMSLQDIDQAE
NTARSTAVKLLEELKKHLGI
V:  LQVERPKLILDDGKRTDGRKPDELRSIKIELGVLKNADGS
AIFEMGNTKAIAAVYGPKEMHPRHLSLPDRAVLRVRYHMT
PFSTDERKNPAPSRREIELSKVIREALESAVLVELFPRTA
IDVFTEILQADAGSRLVSLMAASLALADAGIPMRDLIAGV
AVGKADGVIILDLNETEDMWGEADMPIAMMPSLNQVTLFQ
LNGSMTPDEFRQAFDLAVKGINIIYNLEREALKSKYVEFK
EEGV
W:  MSSTPSNQNIIPIIKKESIVSLFEKGIRQDGRKLTDYRPL
SITLDYAKKADGSALVKLGTTMVLAGTKLEIDKPYEDTPN
QGNLIVNVELLPDENAIELARVVDRSLRDSKALDLTKLVI
EPGKSVWTVWLDVYVLDYGGNVLDACTLASVAALYNTKVY
KVEQISVNKNEVVGKLPLNYPVVTISVAKVDKYLVVDPDL
DEESIMDAKISFSYTPDLKIVGIQKSGKGSMSLQDIDQAE
NTARSTAVKLLEELKKHLGI
X:  ERPKLILDDGKRTDGRKPDELRSIKIELGVLKNADGSAIF
EMGNTKAIAAVYGPKEMHPRHLSLPDRAVLRVRYHMTPFS
TDERKNPAPSRREIELSKVIREALESAVLVELFPRTAIDV
FTEILQADAGSRLVSLMAASLALADAGIPMRDLIAGVAVG
KADGVIILDLNETEDMWGEADMPIAMMPSLNQVTLFQLNG
SMTPDEFRQAFDLAVKGINIIYNLEREALKSKYVEFKEEG
V
Description

Display surface

Download
Links