eF-site ID 1f88-AB
PDB Code 1f88
Chain A, B

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Title CRYSTAL STRUCTURE OF BOVINE RHODOPSIN
Classification SIGNALING PROTEIN
Compound RHODOPSIN
Source ORGANISM_COMMON: cattle; ORGANISM_SCIENTIFIC: Bos taurus;
Sequence A:  MNGTEGPNFYVPFSNKTGVVRSPFEAPQYYLAEPWQFSML
AAYMFLLIMLGFPINFLTLYVTVQHKKLRTPLNYILLNLA
VADLFMVFGGFTTTLYTSLHGYFVFGPTGCNLEGFFATLG
GEIALWSLVVLAIERYVVVCKPMSNFRFGENHAIMGVAFT
WVMALACAAPPLVGWSRYIPEGMQCSCGIDYYTPHEETNN
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PIFMTIPAFFAKTSAVYNPVIYIMMNKQFRNCMVTTLCCG
KNPSTTVSKTETSQVAPA
B:  MNGTEGPNFYVPFSNKTGVVRSPFEAPQYYLAEPWQFSML
AAYMFLLIMLGFPINFLTLYVTVQHKKLRTPLNYILLNLA
VADLFMVFGGFTTTLYTSLHGYFVFGPTGCNLEGFFATLG
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ACAAPPLVGWSRYIPEGMQCSCGIDYYTPHEETNNESFVI
YMFVVHFIIPLIVIFFCYGQLTQKAEKEVTRMVIIMVIAF
LICWLPYAGVAFYIFTHQGSDFGPIFMTIPAFFAKTSAVY
NPVIYIMMNKQFRNCMVTTLCCGKN
Description (1)  RHODOPSIN


Functional site

1) chain A
residue 123-139
type prosite
sequence IALWSLVVLAIERYVVV
description G_PROTEIN_RECEP_F1_1 G-protein coupled receptors family 1 signature. IALwSLVVLAIERYVvV
source prosite : PS00237

2) chain A
residue 290-306
type prosite
sequence IPAFFAKTSAVYNPVIY
description OPSIN Visual pigments (opsins) retinal binding site. IPaFfAKTSAvyNPviY
source prosite : PS00238

3) chain A
residue 1-36
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4) chain A
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5) chain A
residue 174-202
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6) chain A
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7) chain B
residue 1-36
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sequence MNGTEGPNFYVPFSNKTGVVRSPFEAPQYYLAEPWQ
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8) chain B
residue 97-110
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9) chain B
residue 174-202
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10) chain B
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11) chain A
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12) chain A
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13) chain B
residue 201
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sequence E
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14) chain B
residue 279
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sequence Q
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15) chain A
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16) chain B
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17) chain A
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sequence M
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18) chain B
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type MOD_RES
sequence M
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19) chain A
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20) chain B
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21) chain A
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22) chain A
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sequence S
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23) chain A
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24) chain A
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25) chain A
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26) chain A
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27) chain A
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28) chain A
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29) chain B
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31) chain B
residue 323
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