1RFI

Crystal structure of human Tyrosyl-DNA Phosphodiesterase complexed with vanadate, pentapeptide KLNYK, and tetranucleotide AGTC

1RFI の概要

• エントリーDOI: 10.2210/pdb1rfi/pdb
• 関連するPDBエントリー: 1JY1 1NOP 1RFF 1RG1 1RG2
• 分子名称: 5'-D(*AP*GP*TP*C)-3', Tyrosyl-DNA phosphodiesterase 1, Topoisomerase I-Derived Peptide, ... (6 entities in total)
• 機能のキーワード: protein-dna complex, vanadate complex, transition state mimic., hydrolase-dna complex, hydrolase/dna
• 由来する生物種: Homo sapiens (human); 詳細
• 細胞内の位置: Nucleus: Q9NUW8
• タンパク質・核酸の鎖数: 6
• 化学式量合計: 113609.89

構造登録者

Davies, D.R.,Interthal, H.,Champoux, J.J.,Hol, W.G. (登録日: 2003-11-10, 公開日: 2004-03-02, 最終更新日: 2024-02-14)

• 主引用文献: Davies, D.R.,Interthal, H.,Champoux, J.J.,Hol, W.G.; Explorations of peptide and oligonucleotide binding sites of tyrosyl-DNA phosphodiesterase using vanadate complexes.; J.Med.Chem., 47:829-837, 2004; PubMed: 14761185; DOI: 10.1021/jm030487x

実験手法

X-RAY DIFFRACTION (2.2 Å)