PDB: 129 件ウェブページステータス検索Chemie searchBIRD

---

4R7E	Structure of Bre1 RING domain 分子名称: E3 ubiquitin-protein ligase BRE1, ZINC ION 著者 Kumar, P, Wolberger, C. 登録日 2014-08-27 公開日 2015-05-13 最終更新日 2024-02-28 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.251 Å) 主引用文献 Structure of the yeast Bre1 RING domain. Proteins, 83, 2015
2K4D	E2-c-Cbl recognition is necessary but not sufficient for ubiquitination activity 分子名称: E3 ubiquitin-protein ligase CBL, ZINC ION 著者 Huang, A, De Jong, R.N, Wienk, H, Winkler, S.G, Timmers, H.T.M, Boelens, R. 登録日 2008-06-06 公開日 2009-01-20 最終更新日 2023-06-14 実験手法 SOLUTION NMR 主引用文献 E2-c-Cbl recognition is necessary but not sufficient for ubiquitination activity J.Mol.Biol., 385, 2009
2ECW	Solution structure of the Zinc finger, C3HC4 type (RING finger) domain Tripartite motif protein 30 分子名称: Tripartite motif-containing protein 30, ZINC ION 著者 Abe, H, Miyamoto, K, Tochio, N, Yoneyama, M, Kigawa, T, Yokoyama, S, RIKEN Structural Genomics/Proteomics Initiative (RSGI) 登録日 2007-02-14 公開日 2008-02-26 最終更新日 2022-03-09 実験手法 SOLUTION NMR 主引用文献 Solution structure of the Zinc finger, C3HC4 type (RING finger) domain Tripartite motif protein 30 To be Published
2LDR	Solution structure of Helix-RING domain of Cbl-b in the Tyr363 phosphorylated form 分子名称: E3 ubiquitin-protein ligase CBL-B, ZINC ION 著者 Kumeta, H, Kobashigawa, Y, Inagaki, F. 登録日 2011-06-01 公開日 2011-12-14 最終更新日 2023-06-14 実験手法 SOLUTION NMR 主引用文献 Autoinhibition and phosphorylation-induced activation mechanisms of human cancer and autoimmune disease-related E3 protein Cbl-b Proc.Natl.Acad.Sci.USA, 108, 2011
2MWX	The RING Domain of human Promyelocytic Leukemia Protein (PML) 分子名称: Protein PML, ZINC ION 著者 Huang, S.Y, Chang, C.F, Fan, P.J, Guntert, P, Shih, H.M, Huang, T.H. 登録日 2014-12-02 公開日 2015-02-11 最終更新日 2023-06-14 実験手法 SOLUTION NMR 主引用文献 The RING domain of human promyelocytic leukemia protein (PML). J.Biomol.Nmr, 61, 2015
1BOR	TRANSCRIPTION FACTOR PML, A PROTO-ONCOPROTEIN, NMR, 1 REPRESENTATIVE STRUCTURE AT PH 7.5, 30 C, IN THE PRESENCE OF ZINC 分子名称: TRANSCRIPTION FACTOR PML, ZINC ION 著者 Borden, K.L.B, Freemont, P.S. 登録日 1995-09-27 公開日 1997-04-01 最終更新日 2022-02-16 実験手法 SOLUTION NMR 主引用文献 The solution structure of the RING finger domain from the acute promyelocytic leukaemia proto-oncoprotein PML. EMBO J., 14, 1995
1CHC	STRUCTURE OF THE C3HC4 DOMAIN BY 1H-NUCLEAR MAGNETIC RESONANCE SPECTROSCOPY; A NEW STRUCTURAL CLASS OF ZINC-FINGER 分子名称: EQUINE HERPES VIRUS-1 RING DOMAIN, ZINC ION 著者 Barlow, P.N, Everett, R.D, Luisi, B. 登録日 1994-02-02 公開日 1994-04-30 最終更新日 2022-02-16 実験手法 SOLUTION NMR 主引用文献 Structure of the C3HC4 domain by 1H-nuclear magnetic resonance spectroscopy. A new structural class of zinc-finger. J.Mol.Biol., 237, 1994
6IR0	Zinc finger domain of the human DTX protein 分子名称: Probable E3 ubiquitin-protein ligase DTX2, ZINC ION 著者 Miyamoto, K. 登録日 2018-11-09 公開日 2019-11-13 最終更新日 2023-06-14 実験手法 SOLUTION NMR 主引用文献 Zinc finger domain of the human DTX protein adopts a unique RING fold. Protein Sci., 28, 2019
5YUF	Crystal Structure of PML RING tetramer 分子名称: Protein PML, ZINC ION 著者 Wang, P, Benhend, S, Wu, H, Breitenbach, V, Zhen, T, Jollivet, F, Peres, L, Li, Y, Chen, S, Chen, Z, de THE, H, Meng, G. 登録日 2017-11-22 公開日 2018-04-11 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (1.6 Å) 主引用文献 RING tetramerization is required for nuclear body biogenesis and PML sumoylation. Nat Commun, 9, 2018
4GB0	Crystal Structure of the RING domain of RNF168 分子名称: E3 ubiquitin-protein ligase RNF168, MALONATE ION, ZINC ION 著者 Zhang, X.Q, Wang, C.L, Zang, J.Y. 登録日 2012-07-26 公開日 2013-07-10 最終更新日 2024-03-20 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.6 Å) 主引用文献 Structural basis for role of ring finger protein RNF168 RING domain Cell Cycle, 12, 2013
5H7R	Structural basis of the flanking zinc-finger motifs crucial for the E3 ligase activity of the LNX1 RING domain 分子名称: E3 ubiquitin-protein ligase LNX, ZINC ION 著者 Nayak, D, Sivaraman, J. 登録日 2016-11-21 公開日 2017-11-29 最終更新日 2023-11-08 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (1.7 Å) 主引用文献 Structure of LNX1:Ubc13~Ubiquitin Complex Reveals the Role of Additional Motifs for the E3 Ligase Activity of LNX1. J. Mol. Biol., 430, 2018
5TRB	Crystal structure of the RNF20 RING domain 分子名称: E3 ubiquitin-protein ligase BRE1A, ZINC ION 著者 Foglizzo, M, Middleton, A.J, Day, C.L. 登録日 2016-10-25 公開日 2016-11-02 最終更新日 2024-03-06 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (1.8 Å) 主引用文献 Structure and Function of the RING Domains of RNF20 and RNF40, Dimeric E3 Ligases that Monoubiquitylate Histone H2B. J.Mol.Biol., 428, 2016
3L11	Crystal Structure of the Ring Domain of RNF168 分子名称: E3 ubiquitin-protein ligase RNF168, MALONATE ION, ZINC ION 著者 Neculai, D, Yermekbayeva, L, Crombet, L, Weigelt, J, Bountra, C, Edwards, A.M, Arrowsmith, C.H, Bochkarev, A, Dhe-Paganon, S, Structural Genomics Consortium (SGC) 登録日 2009-12-10 公開日 2010-01-19 最終更新日 2023-09-06 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.12 Å) 主引用文献 Molecular insights into the function of RING finger (RNF)-containing proteins hRNF8 and hRNF168 in Ubc13/Mms2-dependent ubiquitylation. J.Biol.Chem., 287, 2012
8AMR	Coiled-coil domain of human TRIM3 分子名称: 3,6,9,12,15,18,21-HEPTAOXATRICOSANE-1,23-DIOL, GLYCEROL, Tripartite motif-containing protein 3 著者 Perez-Borrajero, C, Murciano, B, Hennig, J. 登録日 2022-08-04 公開日 2023-11-15 最終更新日 2023-12-20 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (3.8 Å) 主引用文献 Structural and biophysical studies of TRIM2 and TRIM3 To Be Published
1JM7	Solution structure of the BRCA1/BARD1 RING-domain heterodimer 分子名称: BRCA1-ASSOCIATED RING DOMAIN PROTEIN 1, BREAST CANCER TYPE 1 SUSCEPTIBILITY PROTEIN, ZINC ION 著者 Brzovic, P.S, Rajagopal, P, Hoyt, D.W, King, M.-C, Klevit, R.E. 登録日 2001-07-17 公開日 2001-10-03 最終更新日 2022-02-23 実験手法 SOLUTION NMR 主引用文献 Structure of a BRCA1-BARD1 heterodimeric RING-RING complex. Nat.Struct.Biol., 8, 2001
8A58	X-ray structure of TRIM21 RING E3 ligase in complex with E2 enzyme Ube2W 分子名称: E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 W, ZINC ION 著者 James, L.C, Kiss, L. 登録日 2022-06-14 公開日 2023-04-26 最終更新日 2024-02-07 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.25 Å) 主引用文献 Trim-Away ubiquitinates and degrades lysine-less and N-terminally acetylated substrates. Nat Commun, 14, 2023
3VGO	Crystal structure of the N-terminal fragment of Cbl-b 分子名称: E3 ubiquitin-protein ligase CBL-B 著者 Kobashigawa, Y, Noda, N.N, Inagaki, F. 登録日 2011-08-18 公開日 2011-12-14 最終更新日 2023-11-08 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (3.1 Å) 主引用文献 Autoinhibition and phosphorylation-induced activation mechanisms of human cancer and autoimmune disease-related E3 protein Cbl-b Proc.Natl.Acad.Sci.USA, 108, 2011
1RMD	RAG1 DIMERIZATION DOMAIN 分子名称: RAG1, ZINC ION 著者 Bellon, S.F, Rodgers, K.K, Schatz, D.G, Coleman, J.E, Steitz, T.A. 登録日 1997-01-10 公開日 1997-07-23 最終更新日 2024-02-14 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.1 Å) 主引用文献 Crystal structure of the RAG1 dimerization domain reveals multiple zinc-binding motifs including a novel zinc binuclear cluster. Nat.Struct.Biol., 4, 1997
5O76	Structure of phosphoY371 c-CBL in complex with ZAP70-peptide and UbV.pCBL ubiquitin variant 分子名称: CALCIUM ION, E3 ubiquitin-protein ligase CBL, Tyrosine protein kinase ZAP70 peptide, ... 著者 Gabrielsen, M, Buetow, L, Huang, D.T. 登録日 2017-06-08 公開日 2017-11-01 最終更新日 2024-01-17 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.473 Å) 主引用文献 A General Strategy for Discovery of Inhibitors and Activators of RING and U-box E3 Ligases with Ubiquitin Variants. Mol. Cell, 68, 2017
5OLM	TRIM21 分子名称: E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, ZINC ION 著者 James, L.C. 登録日 2017-07-28 公開日 2018-04-25 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (1.95 Å) 主引用文献 Intracellular antibody signalling is regulated by phosphorylation of the Fc receptor TRIM21. Elife, 7, 2018
6V0V	Cryo-EM structure of mouse WT RAG1/2 NFC complex (DNA0) 分子名称: CALCIUM ION, DNA (30-MER), V(D)J recombination-activating protein 1, ... 著者 Chen, X, Yang, W, Gellert, M. 登録日 2019-11-19 公開日 2020-01-29 最終更新日 2024-03-06 実験手法 ELECTRON MICROSCOPY (3.61 Å) 主引用文献 Cutting antiparallel DNA strands in a single active site. Nat.Struct.Mol.Biol., 27, 2020
2Y1M	Structure of native c-Cbl 分子名称: CALCIUM ION, E3 UBIQUITIN-PROTEIN LIGASE, ZINC ION 著者 Dou, H, Sibbet, G.J, Huang, D.T. 登録日 2010-12-08 公開日 2012-01-18 最終更新日 2023-12-20 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.67 Å) 主引用文献 Structural Basis for Autoinhibition and Phosphorylation-Dependent Activation of C-Cbl. Nat.Struct.Mol.Biol., 19, 2012
7OIK	Mouse RNF213:UBE2L3 transthiolation intermediate, chemically stabilized 分子名称: ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE, E3 ubiquitin-protein ligase RNF213, MAGNESIUM ION, ... 著者 Grabarczyk, D, Ahel, J, Clausen, T. 登録日 2021-05-11 公開日 2022-06-01 実験手法 ELECTRON MICROSCOPY (3.5 Å) 主引用文献 E3 ubiquitin ligase RNF213 employs a non-canonical zinc finger active site and is allosterically regulated by ATP To Be Published
7OIM	Mouse RNF213, with mixed nucleotides bound 分子名称: ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE, ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE, E3 ubiquitin-protein ligase RNF213, ... 著者 Grabarczyk, D, Ahel, J, Clausen, T. 登録日 2021-05-11 公開日 2022-06-01 実験手法 ELECTRON MICROSCOPY (4 Å) 主引用文献 E3 ubiquitin ligase RNF213 employs a non-canonical zinc finger active site and is allosterically regulated by ATP To Be Published
2Y1N	Structure of c-Cbl-ZAP-70 peptide complex 分子名称: CALCIUM ION, E3 UBIQUITIN-PROTEIN LIGASE, TYROSINE-PROTEIN KINASE ZAP-70 ZAP-70,70 KDA ZETA-ASSOCIATED PROTEIN, ... 著者 Dou, H, Sibbet, G.J, Huang, D.T. 登録日 2010-12-08 公開日 2012-01-18 最終更新日 2023-12-20 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (1.999 Å) 主引用文献 Structural Basis for Autoinhibition and Phosphorylation-Dependent Activation of C-Cbl. Nat.Struct.Mol.Biol., 19, 2012

 

123456>