立体構造予測

• CRNPRED（アミノ酸配列に基づく立体構造予測）
• Spanner（構造既知の類似配列分子と利用して立体構造予測）
• SFAS（配列比較と構造予測を組み合わせたサービス）

[CRNPRED]

CRNPRED （クルンプレッド）はアミノ酸配列に基づき、２次構造（secondary structure）、埋もれ度（contact number）、残基毎コンタクトオーダ（residue-wise contact order）を含む１次元の蛋白質立体構造予測を行うウェブサービスです。

URL: http://pdbj.org/crnpred/

[Spanner]

Spanner （スパナー）は既知の立体構造との類似性に基づいて、構造が分かっていないアミノ酸配列の立体構造を予測するプログラムです。

URL: http://pdbj.org/spanner/

[SFAS]

SFAS （Sequence to Function Annotation Server）はアミノ酸配列から構造を予測するウェブサービスです。 SFASは配列相同性比較（sequence alignment）と構造予測（structural modeling）を行う外部プログラムの結果を組み合わせて実行されています。 現在、配列相同性比較に数種類が選択できるようになっていますが、構造予測にはまだ1種類しか選択できません。将来選択肢は増える予定です。

URL: http://pdbj.org/sfas/