サービス&ソフトウェア
ASH
ASH は3次元構造アライメントを行うプログラムです。 ASHホームページ上で処理することも、ソフトウェアをダウンロードして利用することもできます。 いずれも無料で利用できます。
URL: http://pdbj.org/ash/
NMRToolBox
CRNPRED
CRNPRED (クルンプレッド)はアミノ酸配列に基づき、2次構造(secondary structure)、埋もれ度(contact number)、残基毎コンタクトオーダ(residue-wise contact order)を含む1次元の蛋白質立体構造予測を行うウェブサービスです。
SFAS
SFAS(Sequence to Function Annotation Server)はアミノ酸配列から構造を予測するウェブサービスです。 SFASは配列相同性比較(sequence alignment)と構造予測(structural modeling)を行う外部プログラムの結果を組み合わせて実行されています。 現在、配列相同性比較に数種類が選択できるようになっていますが、構造予測にはまだ1種類しか選択できません。将来選択肢は増える予定です。
作成日: 2017-08-29 (最終更新日: more than 1 year ago)