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PDBjの新サービス「omni検索」の機能を使って、必要な情報やサービスをより素早く探し出すことができます。 検索キーワードを入力している途中でも、PDBjが提供する様々なデータベースに対して検索を行い、キーワードに合った項目を表示します。
PDBj各ページ上にあるomni検索バーに「ubi」を入力したところ
現在、PDBj各ページの上にあるomni検索バーでは以下の検索を行うことができます。
  • PDBjサービス検索
  • PDB ID検索
  • PDB キーワード検索(英語、日本語)
  • PDB 著者検索
  • PDB リガンド ID(comp_id)検索
  • Promode Elastic エントリー ID検索
  • PDBj ヘルプタイトル(英語、日本語)
  • 今月の分子タイトル検索(英語、日本語)
  • EMDB ID検索
  • BMRB ID検索
  • 配列検索*
*「配列検索」のクエリ入力は、配列自身だけで、タイトル(fasta形式中の"> title")は含みません。
PDBjのSequence Navigatorサービスへのリンクは、データベース(上述した)中にヒットしない場合で、クエリの長さが10文字以上の場合に、表示されます。 一方、配列クエリを入力後、[エンター]キーをたたくか、"完全一致配列検索"をクリックすると、PDBjのデータベース (Mine PDB, PDBjウェブページ, 未公開エントリー, 化合物)に対して、詳細検索を開始します。
PDBj各ページ上にあるomni検索バーを使って、"ESADLRALAKHLYDSYIKSFPLTKAKARAILTGKTTDKSPFVIYDMNSLMMGEDKIKFKH"を検索しようとすると、”完全一致配列検索"と"類似配列検索(Sequence Navigator)"の2つのリンクが表示されたところ

使い方

omni検索バーで提示された候補のどれか一つをクリックすると、該当するページに移動します。「Find all」リンクがある時、これをクリックすると関連するカテゴリ内でより詳細な検索が行われます(例:「PDBキーワード」の下にある「Find all」をクリックすると、PDBj Mine キーワード検索が行われます。) Enterを入力するか、または入力ボックスの右にある検索ボタンをクリックすると、PDBデータ、PDBjウェブページ(ヘルプやニュース)、未公開エントリー(ステータス検索)、PDBj Chemie(リガンド)データに対しより詳細な検索が始まります。
PDBj各ページ上にあるomni検索バーに「mine」を入力したところ
PDBjサービス、PDBエントリー、未公開エントリー、PDBj Chemieエントリー、Promode-Elasticエントリー、ヘルプページ、BMRB ID、EMDB IDのいずれかに完全一致した時、Enterを入力すると該当するページに直接移動します。 完全一致した項目があった場合、結果の先頭には復帰マーク(↵)が置かれます。 Shiftを押しながらEnterを入力して検索を行うと、通常の全体に対する検索を行います。
PDBj各ページ上にあるomni検索バーに「2prg」を入力したところ
日本語モードでは、日本語検索はもちろん、日本語によるand検索(空白区切り)も可能です。
ただし、一部環境にて、漢字変換確定操作で検索が始まってしまうため、「空白区切りによるand検索」(日本語変換後に次の単語を入力)ができない場合があります。この場合、他のアプリケーションで検索語を入力し、コピー・貼り付けで検索を行うか、または他のブラウザをご利用下さい。
2014-08-21 (last edited: more than 1 year ago)2015-07-13
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