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オリジナルeProtSの分類

オリジナルeProtS(旧eProtS)に従った分類です.

目次


酵素

  • アルコール脱水素酵素クラスIVσ鎖 [ヒト(Homo sapiens)]: PDB:1D1S
  • 3-イソプロピルリンゴ酸脱水素酵素(IMDH) [Thermus thermophilus(好熱性細菌)]: PDB:1IPD
  • バナジウムを含むクロロペルオキシダーゼ(CPO) [Curvularia inaequalis(真菌類)]: PDB:1VNC
  • チトクロム cペルオキシダーゼ [パン酵母]: PDB:2CYP
  • PCB分解酵素 [Burkholderia cepacia(細菌)]: PDB:1HAN
  • ルシフェラーゼ [北アメリカホタル]: PDB:1LCI
  • スーパーオキシドジスムターゼ [ヒト]: PDB:1SPD
  • リボヌクレオチド還元酵素R2 [大腸菌]: PDB:1MXR
  • ピルビン酸脱水素酵素複合体 [Geobacillus stearothermophilus(好熱性細菌)]: PDB:1W85
  • チトクロムc酸化酵素(酸化前、CO結合状態) [ウシ]: PDB:1OCO
  • チトクロムc酸化酵素(酸化後、過酸化物イオン結合状態) [ウシ]: PDB:2OCC
  • D-アミノ酸アミノ基転移酵素 [好熱菌PS3]: PDB:1DAA
  • ヌクレオシド2リン酸リン酸化酵素(NDPキナーゼ) [キイロタマホコリカビ(細胞性粘菌)P105G変異体]: PDB:1NCL
  • リパーゼ [ヒト(Homo sapiens)]: PDB:1HLG
  • ホスホリパーゼA2 [ヒト]: PDB:1POD
  • リボヌクレアーゼA/阻害剤(RI) 複合体 [ウシ(Bos taurus)]: PDB:1DFJ
  • リボヌクレアーゼ阻害タンパク質(RI) [ブタ]: PDB:2BNH
  • リン酸エステル加水分解酵素5(ホスホジエステラーゼ5、PDE5) [ヒト]: PDB:1UDT
  • αアミラーゼ [ヒト]: PDB:1SMD
  • ポリシアル酸分解酵素(エンドシアリダーゼ) [バクテリオファージK1F]: PDB:1V0E
  • 卵白リゾチーム [ニワトリ]: PDB:2LYZ
  • トリプシン [ヒト]: PDB:1TRN
  • Gal6ブレオマイシン加水分解酵素 [パン酵母(Saccharomyces cerevisiae)]: PDB:1GCB
  • 20S-プロテアソーム [パン酵母]: PDB:1RYP
  • ペニシリン・アシラーゼ/阻害剤複合体 [大腸菌]: PDB:1PNL
  • ATP合成酵素(F1部分) [ウシ(Bos taurus)]: PDB:1E79
  • ATP合成酵素(F0部分) [大腸菌(Escherichia coli)]: PDB:1C17
  • トリオースリン酸異性化酵素(トリオースリン酸イソメラーゼ、TIM) [ニワトリ]: PDB:1TPH
  • ラノステロール合成酵素 [ヒト]: PDB:1W6J
  • トリプトファン-tRNA合成酵素(mini TrpRS) [ヒト]: PDB:1ULH
  • リポ酸タンパク質リン酸化酵素(Lpl) [Thermoplasma acidophilum(好熱性古細菌)]: PDB:2C8M
  • デチオビオチン合成酵素(DBTS) [大腸菌(Escherichia coli)]: PDB:1BYI
  • アセチル補酵素A (CoA) カルボキシラーゼ [パン酵母]: PDB:1W93
  • タンパク質脱リン酸化酵素2A(ヘテロ三量体ホロ酵素) [ヒト]: PDB:2IAE
  • グルタミン酸脱炭酸酵素1(GAD67)/補因子PLP複合体 [ヒト]: PDB:2OKJ

免疫系

  • 免疫グロブリン IGG2A [マウス(ハツカネズミ)]: PDB:1IGT
  • 免疫グロブリンG1-κ D1.3 Fab(軽鎖) [ハツカネズミ(マウス、Mus musculus)]: PDB:1FDL
  • 触媒抗体1F7(コリスミン酸ムターゼ活性) [ハツカネズミ(マウス、Mus musculus)]: PDB:1FIG
  • クラスI組織適合抗原(ヒト白血球抗原B*2705) [ヒト]: PDB:1HSA
  • 免疫抑制剤FK506/FKBP蛋白質 複合体 [ヒト(Homo sapiens)]: PDB:1FKF
  • IgMリュウマチ因子のFab部分/IgG4 Fc 複合体 [ヒト(Homo sapiens)]: PDB:1ADQ
  • MHC/ウィルス由来ペプチド/T細胞受容体複合体 [ヒト(Homo sapiens)]: PDB:1AO7
  • ガンマデルタT細胞受容体/MHC T22複合体 [マウス(ハツカネズミ)]: PDB:1YPZ
  • ラクダの単一ドメインVH抗体/リゾチーム複合体 [ヒトコブラクダ]: PDB:1MEL
  • ナイシン(抗菌ペプチド)/脂質II複合体 [乳酸菌]: PDB:1WCO
  • キノロン耐性発現5残基反復蛋白質 MfpA [ヒト型結核菌(細菌)]: PDB:2BM4

毒素など

  • コレラ毒素 [コレラ菌]: PDB:1XTC
  • 血液凝固因子IX-結合タンパク質A [ハブ(Trimeresurus flavoviridis)]: PDB:1BJ3
  • 血液凝固因子X結合タンパク質 [ヒト]: PDB:1IOD
  • 炭疽菌致死因子 [炭疽菌]: PDB:1J7N
  • 毒素RelB/抗毒素RelE複合体 [Pyrococcus horikoshii(好熱性古細菌)]: PDB:1WMI
  • ベロ毒素-1 [大腸菌(Escherichia coli)]: PDB:1BOV
  • ボツリヌス神経毒素タイプB [ボツリヌス菌(Clostridium botulinum)]: PDB:1EPW
  • ボツリヌス神経毒素タイプB/亜鉛イオン・ビス(5-アミジノ-2-ベンジミダゾリル)メタン複合体 [ボツリヌス菌(Clostridium botulinum)]: PDB:1G9B
  • ボツリヌス神経毒素タイプB/シアリルラクトース複合体 [ボツリヌス菌(Clostridium botulinum)]: PDB:1F31

ウイルスなど

  • 逆転写酵素/転写阻害剤ネビラピン 複合体 [エイズウイルス1型]: PDB:3HVT
  • エンベロープタンパク質gp120 [エイズウイルス1型(Human Immunodeficiency Virus type 1)]: PDB:1GC1
  • ヒトライノウイルス14コートタンパク質 [ライノウイルス14(ヒト カゼウイルス)]: PDB:4RHV
  • 口蹄疫ウイルス [口蹄疫ウイルス(Foot-and-mouth disease virus)]: PDB:1BBT
  • インフルエンザAサブタイプN2ノイラミニダーゼ [インフルエンザウイルス]: PDB:1IVD
  • HIV-1 プロテアーゼ [エイズウイルス1型]: PDB:7HVP
  • 足場タンパク質GPD [バクテリオファージ φ173(Enterobacteria phage phiX174)]: PDB:1CD3
  • 肝炎ウイルス・NS3プロテアーゼ [C型肝炎ウイルス(Hepatitis C virus)]: PDB:1A1R
  • VP4スパイク様蛋白質 [ロタウィルス]: PDB:1SLQ
  • 肝炎ウィルスレプリカーゼNS5A [C型肝炎ウィルス]: PDB:1ZH1
  • SARSコロナウィルス・メインプロテイナーゼ [SARSコロナウイルス]: PDB:1UJ1
  • HIV-1エンベロープタンパク質gp120とb12抗体の複合体 [ヒト]: PDB:2NY7
  • サルモネラ菌エフェクタータンパク質SopA [サルモネラ菌]: PDB:2QYU

遺伝子類とそれらの制御

  • DNA [なし(合成)]: PDB:1BNA
  • トリプトファン オペロン リプレッサ/オペレータ複合体 [大腸菌]: PDB:1TRO
  • アルギニルtRNA合成酵素/tRNA/アルギニン 複合体 [パン酵母(Saccharomyces cerevisiae)]: PDB:1F7U
  • DNA依存性RNAポリメラーゼII [パン酵母]: PDB:1I6H
  • DNA修復酵素 [ヒト(Homo sapiens)]: PDB:1EWN
  • Taqポリメラーゼ(DNA合成酵素)/DNA 複合体 [好熱菌]: PDB:1TAU
  • 制限酵素EcoRV/DNA 複合体(DNA切断前、Mg2+イオンなし) [大腸菌]: PDB:1RVA
  • 制限酵素EcoRV/DNA 複合体(DNA切断後、Mg2+イオンあり) [大腸菌]: PDB:1RVC
  • 転写活性化因子GCN4/DNA 複合体 [パン酵母]: PDB:1YSA
  • XPD ヘリカーゼ [超好熱好酸性古細菌]: PDB:3CRV
  • 転写因子Zif268のジンクフィンガー(DNA結合部位)/DNA 複合体 [マウス(ハツカネズミ)]: PDB:1ZAA
  • リボソーム・リサイクリング因子(RRF) [Thermotoga maritima(好熱性細菌)]: PDB:1DD5
  • 真核生物のポリペプチド鎖終結因子eRF1 [ヒト(Homo sapiens)]: PDB:1DT9
  • 複製終結蛋白質(Tus)/DNA複合体 [大腸菌(Escherichia coli)]: PDB:1ECR
  • 転写因子c-Fos-c-Jun / DNA 複合体 [ヒト(Homo sapiens)]: PDB:1FOS
  • mRNAデキャッピング酵素Dcp1p [パン酵母]: PDB:1Q67
  • 転写因子IIB/RNAポリメラーゼII複合体 [パン酵母]: PDB:1R5U
  • DNAプライマーゼ機能を持つポリメラーゼ [Sulfolobus islandicus(古細菌)]: PDB:1RNI
  • アデニンDNAグリコシラーゼ(MutY)と損傷DNA複合体 [Bacillus stearothermophilus(好熱性細菌)]: PDB:1RRQ
  • RNAポリメラーゼII/転写複合体 [パン酵母]: PDB:1SFO
  • クランプローダー(RFC)とDNAクランプ(PCNA)複合体 [パン酵母]: PDB:1SXJ
  • グループI自己スプライシングイントロン/エクソン複合体 [ヒト]: PDB:1U6B
  • アルゴノート(RNA干渉蛋白質) [Pyrococcus furiosus(好熱性古細菌)]: PDB:1U04
  • 最小RISC構造を作るヒト・アルゴノート2 [Pyrococcus furiosus (好熱性古細菌)]: PDB:1Z25
  • DNA修復酵素複合体RecBCD [大腸菌]: PDB:1W36
  • RNAパッキングモーター蛋白質P4 [バクテリオファージ phi12]: PDB:1W44
  • ヒト・テロメアDNA(22塩基、1本鎖) [ヒト]: PDB:1KF1
  • 真核生物Rad54のクロマチン再構築ドメイン [ゼブラ・フィッシュ]: PDB:1Z3I
  • RNA干渉タンパク質(アルゴノート)のPiwiドメイン/siRNA様物質 複合体 [Archaeoglobus fulgidus(好熱性古細菌)]: PDB:2BGG
  • 大腸菌DNAポリメラーゼβサブユニット [大腸菌]: PDB:2POL
  • 大腸菌DNAポリメラーゼβサブユニットとDNAの複合体 [大腸菌]: PDB:3BEP
  • 性決定(Sxl)蛋白質/RNA複合体 [キイロショウジョウバエ(Drosophila melanogaster)]: PDB:1B7F
  • 制限酵素BamHI/DNA複合体 [Bacillus amyloliquefaciens (細菌)]: PDB:1BHM
  • Trp RNA結合減衰蛋白質(TRAP)/RNA複合体 [バシラス・ステアロサーモフィラス(Bacillus stearothermophilus、好熱性細菌)]: PDB:1C9S
  • カタボライト遺伝子活性化蛋白質(CAP)/DNA複合体 [大腸菌(Escherichia coli)]: PDB:1CGP
  • Metリプレッサー/オペレーター複合体 [大腸菌(Escherichia coli)]: PDB:1CMA
  • ヒト8-オキソグアニンDNAグリコシラーゼ (hOGG1、損傷DNA修復酵素)/DNA複合体 [ヒト(Homo sapiens)]: PDB:1EBM
  • 哺乳類のポリAポリメラーゼ [ウシ(Bos taurus)]: PDB:1F5A
  • ラクトースリプレッサー [大腸菌]: PDB:1LBI
  • デオキシリボジピリミジン 光回復酵素/DNA複合体 [Synechococcus sp. PCC 6301 (藍藻)]: PDB:1TEZ
  • セリン/アルギニンリッチ(SR)蛋白質リン酸化酵素 SRPK1 / ペプチド複合体 [ヒト]: PDB:1WBP
  • インテインPI-SceIホーミングエンドヌクレアーゼ [パン酵母(Saccharomyces cerevisiae)]: PDB:1DFA
  • インテインPI-SceIホーミングエンドヌクレアーゼ/DNA 複合体 [パン酵母]: PDB:1LWS
  • YibKメチル基転移酵素(結び目蛋白質)/阻害剤(AdoHcy)複合体 [インフルエンザ菌(細菌)]: PDB:1MXI
  • RNA2'-O-リボースメチル基転移酵素様蛋白質(RrmA) [Thermus thermophilus(好熱性細菌)]: PDB:1IPA
  • 5-メチルウリジン メチル基転移酵素 TrmA [大腸菌(Escherichia coli)]: PDB:3BT7
  • グループIリボザイム(自己スプライシングイントロン)/産生物複合体 [バクテリオファージ トゥウォート(ウイルス)]: PDB:1Y0Q
  • CCA付加酵素 [Archaeoglobus fulgidus (古細菌)]: PDB:1UET
  • ヒストン修飾タンパク質WRD5/ヒストンH3 複合体 [ヒト]: PDB:2H13
  • FtsK(C端)の六量体 [Pseudomonas aeruginosa (緑膿菌)]: PDB:2IUU

ガン関連

  • C-H-RAS P21タンパク質触媒ドメイン(野生型) [ヒト]: PDB:1Q21
  • C-H-RAS P21タンパク質触媒ドメイン(発癌性の G12V) [ヒト]: PDB:2Q21
  • NAD(P)H:キノン酸化還元酵素1 [ヒト(Homo sapiens)]: PDB:1GG5
  • インターロイキン-18 [ヒト]: PDB:1J0S
  • シスプラチン/DNA複合体 [なし]: PDB:5BNA
  • SV40-ラージT抗原 [Simian virus 40 (ウイルス)]: PDB:1SVM
  • PJS病関連蛋白質Mo25α/STE-20関連アダプター(STRAD)擬リン酸化酵素C末端複合体 [ヒト]: PDB:1UPK
  • アルギナーゼI/nor-NOHA 複合体 [ドブネズミ(ラット、Rattus norvegicus)]: PDB:1HQH
  • ニコチンアミドホスホリボシル基転移酵素 (NMPRTase) / FK866 複合体 [ヒト]: PDB:2GVJ

植物関連

  • 集光性タンパク質B-800/850 [Rhodopseudomonas acidophila(光合成細菌)]: PDB:1KZU
  • 光化学系I P700クロロフィルaアポタンパクA1 [Synechococcus elongatus(藍藻)]: PDB:1JB0
  • 光化学系II [Synechococcus elongatus (藍藻)]: PDB:1FE1
  • 光合成反応中心 [Rhodopseudomonas viridis (紅色光合成細菌)]: PDB:1PRC
  • ニトロゲナーゼ・モリブデン鉄タンパク [Azotobacter vinelandii (好気性窒素固定細菌)]: PDB:3MIN
  • パパイン [パパイヤ]: PDB:9PAP
  • クランビン [アビシニアンキャベツ(Crambe abyssinica)]: PDB:1CRN
  • シアノバクテリア光化学系II [Thermosynechococcus elongatus (藍藻)]: PDB:1S5L
  • 光化学系IIの集光性複合体 (LHC-II) [ほうれん草]: PDB:1RWT
  • チトクロムb6f複合体 [Mastigocladus laminosus (藍藻)]: PDB:1VF5
  • 古細菌のRrp4エクソソーム [Archaeoglobus fulgidus (古細菌) ]: PDB:2BA0
  • [Not available]: PDB:3AEK

動き

  • ミオシンH鎖 [イタヤガイの仲間(Argopecten irradians)]: PDB:1B7T
  • アクチン/DNアーゼI 複合体 [アナウサギ(Oryctolagus cuniculus)]: PDB:1ATN
  • ヒト心臓・トロポニン Ca2+飽和型 [ヒト]: PDB:1J1D
  • フォルミン蛋白質Bni1p FH2ドメイン/ATP-actin 複合体 [パン酵母]: PDB:1Y64
  • Ta0583, 古細菌のアクチンホモログ [Thermoplasma acidophilum(好熱性古細菌)]: PDB:2FSN

薬物標的

  • プロスタグランジンH2合成酵素1/フルルビプロフェン 複合体 [ヒツジ(Ovis aries)]: PDB:1CQE
  • β-ラクタマーゼ [Bacillus licheniformis (細菌)]: PDB:4BLM
  • βセクレターゼ 2 (BACE2) [ヒト]: PDB:2EWY
  • ニコチンアミドホスホリボシル基転移酵素 (NMPRTase) / NMN 複合体 [ヒト]: PDB:2GVG

タンパク質の折り畳み

  • シャペロニン(GroEL-GroES)/ADP複合体 [大腸菌(Escherichia coli)]: PDB:1AON
  • チオール:ジスルフィド交換タンパク質DsbC [大腸菌(Escherichia coli)]: PDB:1EEJ
  • 熱ショックタンパク質HSP33 [大腸菌]: PDB:1HW7
  • 熱ショックタンパク質Hsc70/Hsp110の複合体 [ウシ/酵母]: PDB:3C7N
  • フラビン酵素Ero1p [パン酵母]: PDB:1RP4
  • ペリプラズム・シャペロンSkp [大腸菌]: PDB:1SG2
  • リボソーム・シャペロントリガー因子/50Sリボソーム複合体 [大腸菌]: PDB:1W26
  • Trp-cage設計蛋白質TC5b [なし(合成)]: PDB:1L2Y

酸素輸送と貯蔵

  • ミオグロビン [マッコウクジラ]: PDB:1MBN
  • 酸化型αヘモグロビン/αヘモグロビン安定化タンパク質(AHSP) 複合体 [ヒト]: PDB:1Z8U

ホルモン,サイトカインと受容体

  • インシュリン [ブタ]: PDB:4INS
  • インターフェロン-α2B [ヒト]: PDB:1RH2
  • インターロイキン-1β [ヒト]: PDB:1I1B
  • 成長ホルモン/受容体複合体 [ヒト]: PDB:3HHR
  • アンドロゲン受容体 [ヒト(Homo sapiens)]: PDB:1E3G
  • 骨形成タンパク質BMP2/BR1A複合体 [ヒト(Homo sapiens)]: PDB:1ES7
  • 低比重リポ蛋白質(LDL)受容体(細胞外ドメイン) [ヒト]: PDB:1N7D
  • アセチルコリン受容体 [ゴマフシビレエイ]: PDB:1OED
  • レチノイン酸受容体/レチノイン酸複合体 [ヒト]: PDB:2LBD
  • B細胞活性化因子(BAFF)/BAFF受容体(BAFF-R) 複合体 [ヒト]: PDB:1OTZ
  • GM-CSFとGM-CSF受容体の複合体 [ヒト]: PDB:3CXE

細胞制御とアポトーシス

  • サイクリンA/サイクリン依存性キナーゼ2(CDK-2) 複合体 [ヒト(Homo sapiens)]: PDB:1FIN
  • インターロイキン-1β変換酵素/活性阻害ペプチド 複合体 [ヒト]: PDB:1IBC
  • アポトーシス阻害剤BCL-XL [ヒト]: PDB:1MAZ
  • チロシンプロテインキナーゼc-Src/AMP-PNP 複合体 [ヒト]: PDB:2SRC
  • シアル酸転移酵素CstII/CMP-NeuAc 複合体 [カンピロバクター (細菌)]: PDB:1RO7
  • インテグリンα-IIb-β3/カコジル酸イオン 複合体 [ヒト]: PDB:1TYE
  • アポトーシス・プロテアーゼ活性因子1/ADP 複合体 [ヒト]: PDB:1Z6T
  • アキソニンN末端ドメイン [ニワトリ(Gallus gallus)]: PDB:1CS6
  • アポトーシス誘導リガンド2(Apo2L,TRAIL)/細胞死受容体 5(DR5) 複合体 [ヒト(Homo sapiens)]: PDB:1D0G
  • Rabex-5/ユビキチン複合体 [ヒト]: PDB:2C7N
  • インテグリンBサブユニット細胞質ドメイン/タリンF3領域の複合体 [ニワトリ]: PDB:2H7E
  • イノシトール要求タンパク質-1(Ire1) [酵母]: PDB:2RIO

金属輸送,ポンプとチャネル

  • 鉄輸送蛋白質 セロトランスフェリン(血清トランスフェリン) [ブタ(Sus scrofa)]: PDB:1H76
  • トランスフェリン(鉄輸送蛋白質)受容体(TfR) [ヒト(Homo sapiens)]: PDB:1CX8
  • 鉄輸送蛋白質 フェリチン のH鎖(Lys86をGlnに置き換えた変異体) [ヒト(Homo sapiens)]: PDB:1FHA
  • カルモジュリン [ヒト(Homo sapiens)]: PDB:1CLL
  • カルシウムイオンによって開いたK+チャネル [メタン菌(古細菌)]: PDB:1LNQ
  • 機械刺激受容イオンチャネル [結核菌 (細菌)]: PDB:2OAR
  • 水チャネル・アクアポリン0 [ヒツジ]: PDB:1SOR
  • カルシウム・ポンプ [ウサギ]: PDB:1VFP
  • 筋小胞体カルシウム・ポンプ [ウサギ]: PDB:2ZBD
  • KcsAカリウム・イオンチャネル [放線菌(Streptomyces lividans)]: PDB:1BL8
  • 水チャネル・アクアポリン1 [ウシ]: PDB:1J4N
  • 電位依存性カリウム・イオンチャネル KvAP [Aeropyrum pernix (好熱性古細菌)]: PDB:1ORQ
  • 内向き整流性カリウム・イオンチャネル KirBac1.1 [Burkholderia pseudomallei (類鼻疽菌)]: PDB:1P7B
  • カリウムイオンチャネル KcsA [放線菌]: PDB:1ZWI
  • 筋小胞体/小胞体カルシウムATPアーゼ1 [ウサギ]: PDB:1IWO
  • ホスホポリン [大腸菌]: PDB:1PHO
  • 外膜ポリンD2(OprD) [緑膿菌]: PDB:2ODJ

物質輸送

  • アポリポタンパク質E3のLDL受容体結合ドメイン [ヒト]: PDB:1LPE
  • α-トロンビン/ヒルジン複合体 [ヒト/ヒル]: PDB:4HTC
  • クラスリン重鎖 [ウシ(Bos taurus)]: PDB:1B89
  • 長鎖脂肪酸トランスポータ(FadL) [大腸菌]: PDB:1T16
  • 血清アルブミン前駆体 [ヒト]: PDB:1UOR
  • ヌクレオポリン蛋白質Nup159のN末端ドメイン [パン酵母]: PDB:1XIP
  • 多剤排出輸送体 AcrB [大腸菌]: PDB:1IWG
  • ABC輸送体 Sav1866 [黄色ブドウ球菌]: PDB:2HYD
  • グルタミン酸輸送体類似蛋白質 [好熱菌(古細菌)]: PDB:1XFH
  • ペリプラズム結合タンパク質 [百日咳菌(細菌)]: PDB:2F5X
  • アンフィフィシン(膜曲率センサー蛋白質)のBARドメイン [キイロショウジョウバエ]: PDB:1URU
  • Rab11/FIP2(RBD領域)複合体 [ヒト]: PDB:2GZD

信号伝達

  • ロドプシン [ウシ(Bos taurus)]: PDB:1F88
  • 蛋白質リン酸化酵素CheY/CheA複合体(バクテリア走化性) [大腸菌(Escherichia coli)]: PDB:1A0O
  • β-PIXのDBLホモロジードメイン [ヒト(Homo sapiens)]: PDB:1BY1
  • ユビキチン・リガーゼ複合体 [パン酵母]: PDB:1LDD
  • ESCRT-II複合体 [パン酵母]: PDB:1U5T
  • 菌類のガレクチン CGL2 [Coprinopsis cinerea (ヒトヨタケ)]: PDB:1UL9
  • ゴルジ体局在化因子TRAPP中のBet3p蛋白質 [マウス(ハツカネズミ)]: PDB:1WC8
  • バクテリア・センサリーロドプシン(細菌感覚ロドプシン) [アナベナ(藍藻)]: PDB:1XIO
  • 核受容体CAR/逆作用薬複合体 [マウス(ハツカネズミ)]: PDB:1XNX
  • ユビキチンリガーゼ(E6AP)/ユビキチン結合酵素(UbcH7)複合体 [ヒト(Homo sapiens)]: PDB:1C4Z
  • アルギナーゼI/nor-NOHA 複合体 [ドブネズミ(ラット、Rattus norvegicus)]: PDB:1HQH
  • MAPキナーゼ ERK2 [ドブネズミ(ラット、Rattus norvegicus)]: PDB:1ERK
  • シグナル認識粒子(SRP)/受容体(SR)複合体 [好熱菌(細菌)]: PDB:1RJ9
  • 核受容体hLRH-1/SHPのNR box1モチーフ 複合体 [ヒト]: PDB:1YUC
  • 低分子量G蛋白質Rab5/Rabaptin5 C末端ドメイン 複合体 [ヒト]: PDB:1TU3
  • ヒト肝臓受容体ホモログ蛋白質のDNA結合ドメイン(hLRH-1 DBD)と2本鎖DNAの複合体 [ヒト]: PDB:2A66
  • アデニル・サイクラーゼ/α、βメチレンATP複合体 [スピルリナ(藍藻)]: PDB:1WC0
  • SUMO1共役チミンDNAグリコシラーゼ [ヒト]: PDB:1WYW
  • 転写制御因子CSL-Notch-Mastermind/DNA 複合体 [線虫]: PDB:2FO1
  • レチノール結合タンパク質 [ヒト(Homo sapiens)]: PDB:1BRP
  • 菌体密度感知タンパク質 SdiA [バクテリア(大腸菌)]: PDB:2AVX
  • 核内受容体mSF-1/PG(リガンド)の複合体 [マウス]: PDB:1YMT

発色蛋白質

  • クラスタシアニン [ヨーロピアン・ロブスター(Homarus gammarus)]: PDB:1GKA
  • 緑色蛍光タンパク質 [オワンクラゲ(Aequorea victoria)]: PDB:1EMA

生体の維持構成

  • E-カドヘリン [マウス(ハツカネズミ、Mus musculus)]: PDB:1EDH
  • 神経カドヘリン(N-カドヘリン) [マウス(ハツカネズミ)]: PDB:1NCI
  • 抗凍結蛋白質アイソフォームhplc6 [カレイ]: PDB:1WFB
  • 血液凝固第VIII因子前駆体 [ヒト(Homo sapiens)]: PDB:1D7P
  • コラーゲン様ペプチド [ヒト?]: PDB:1CAG
  • 神経成長因子(NGF)/受容体p75 複合体 [ヒト]: PDB:1SG1
  • γ-Bクリスタリン(眼水晶体蛋白質) [ウシ]: PDB:4GCR
  • Tie2受容体細胞外ドメイン/Ang2 複合体 [ヒト]: PDB:2GY7

人工蛋白質

  • Trp-cage設計蛋白質TC5b [なし(合成)]: PDB:1L2Y
  • 人工ヌクレオチド結合蛋白質(ANBP)/ADP複合体 [なし(合成)]: PDB:1UW1

その他

執筆中

  • チアミンピロリン酸特異性リボスイッチ [大腸菌(細菌)]: PDB:2GDI