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万見生物種
- EMDB/PDB/SASBDBの生物種情報 -

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キーワード検索の結果

検索 (キーワード: Drosophila melanogaster)の結果全4件を表示しています

名称EMDBPDBSASBDB
Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster (バクテリア)060
Drosophila melanogaster (キイロショウジョウバエ)21812840
Drosophila melanogaster American nodavirus (ANV) SW-2009a (ウイルス)010
Drosophila melanogaster Nora virus (ウイルス)110

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生物種情報

名称Drosophila melanogaster
和名 *1キイロショウジョウバエ
名称 *2Drosophila melanogaster
画像 *3

キイロショウジョウバエ, fruit fly, Drosophila melanogaster

その他の名称 *2GenBank一般名: fruit fly / 別称: Sophophora melanogaster / includes: Diptera sp. DNAS-2A9-224646 / その他: Drosophila melanogaster Meigen, 1830 / Sophophora melanogaster (Meigen, 1830)
構造データでの名称Fruit fly
NCBI Taxonomy ID7227
系統 *2細胞生物 > 真核生物 > オピストコンタ > 動物 > 真正後生動物 > 左右相称動物 > 前口動物 > 脱皮動物 > 汎節足動物 > 節足動物 > 大顎類 > 汎甲殻類 > 六脚類 > 昆虫 > Dicondylia > 有翅亜綱 > 新翅下綱 > Endopterygota > ハエ目 > ハエ亜目 > ハエ下目 > Eremoneura > Cyclorrhapha > Schizophora > Acalyptratae > Ephydroidea > ショウジョウバエ > Drosophilinae > Drosophilini > Drosophila > Sophophora > melanogaster group > melanogaster subgroup
ウィキペディアウィキペディア - キイロショウジョウバエ: キイロショウジョウバエ（黄色猩々蝿）は、ハエ目（双翅目）・ショウジョウバエ科の昆虫である。

生物学の様々な分野でモデル生物として用いられ、多くの発見がなされた...

コメント節足動物
出典*1: DBCLSメタ用語集-翻訳用テーブル-学名と和名の対応 ライフサイエンス統合データベースプロジェクト
*2: NCBI Taxonomy
*3: 生物アイコン (c) ライフサイエンス統合データベースセンター licensed under CC表示2.1 日本

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万見生物種について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか？ / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例：em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

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万見生物種

EMDB/PDB/SASBDBの生物種情報

EMDB/PDB/SASBDBの構造データの試料情報、由来する生物種に関するデータベース

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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