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-基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1ekz | ||||||
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タイトル | NMR STRUCTURE OF THE COMPLEX BETWEEN THE THIRD DSRBD FROM DROSOPHILA STAUFEN AND A RNA HAIRPIN | ||||||
要素 |
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キーワード | cell cycle/RNA / protein/RNA / protein dsRBD / Drosophila / RNA hairpin / cell cycle-RNA COMPLEX | ||||||
機能・相同性 | 機能・相同性情報 germ plasm / subsynaptic reticulum / pole plasm RNA localization / bicoid mRNA localization / regulation of oskar mRNA translation / pole plasm protein localization / posterior cell cortex / regulation of pole plasm oskar mRNA localization / asymmetric protein localization involved in cell fate determination / anterograde dendritic transport of messenger ribonucleoprotein complex ...germ plasm / subsynaptic reticulum / pole plasm RNA localization / bicoid mRNA localization / regulation of oskar mRNA translation / pole plasm protein localization / posterior cell cortex / regulation of pole plasm oskar mRNA localization / asymmetric protein localization involved in cell fate determination / anterograde dendritic transport of messenger ribonucleoprotein complex / positive regulation of cytoplasmic mRNA processing body assembly / pole plasm assembly / neuroblast fate determination / RNA localization / positive regulation of synaptic assembly at neuromuscular junction / neuronal ribonucleoprotein granule / basal cortex / anterior/posterior axis specification, embryo / messenger ribonucleoprotein complex / intracellular mRNA localization / protein localization to synapse / apical cortex / oogenesis / germ cell development / long-term memory / dendrite cytoplasm / basal plasma membrane / mRNA 3'-UTR binding / P-body / cytoplasmic ribonucleoprotein granule / cytoplasmic stress granule / double-stranded RNA binding / apical part of cell / 細胞皮質 / neuron projection / apical plasma membrane / mRNA binding / neuronal cell body / RNA binding / 細胞膜 / 細胞質 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | Drosophila melanogaster (キイロショウジョウバエ) | ||||||
手法 | 溶液NMR | ||||||
データ登録者 | Ramos, A. / Grunert, S. / Bycroft, M. / St Johnston, D. / Varani, G. | ||||||
引用 | ジャーナル: EMBO J. / 年: 2000 タイトル: RNA recognition by a Staufen double-stranded RNA-binding domain. 著者: Ramos, A. / Grunert, S. / Adams, J. / Micklem, D.R. / Proctor, M.R. / Freund, S. / Bycroft, M. / St Johnston, D. / Varani, G. | ||||||
履歴 |
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-構造の表示
構造ビューア | 分子: MolmilJmol/JSmol |
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-ダウンロードとリンク
-ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | 1ekz.cif.gz | 1.5 MB | 表示 | PDBx/mmCIF形式 |
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PDB形式 | pdb1ekz.ent.gz | 1.3 MB | 表示 | PDB形式 |
PDBx/mmJSON形式 | 1ekz.json.gz | ツリー表示 | PDBx/mmJSON形式 | |
その他 | その他のダウンロード |
-検証レポート
アーカイブディレクトリ | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/ek/1ekz ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/ek/1ekz | HTTPS FTP |
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-関連構造データ
-リンク
-集合体
登録構造単位 |
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1 |
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NMR アンサンブル |
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-要素
#1: RNA鎖 | 分子量: 9612.737 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 合成 |
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#2: タンパク質 | 分子量: 8463.958 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 由来: (組換発現) Drosophila melanogaster (キイロショウジョウバエ) 発現宿主: Escherichia coli (大腸菌) / 参照: UniProt: P25159 |
-実験情報
-実験
実験 | 手法: 溶液NMR |
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-試料調製
結晶化 | *PLUS 手法: その他 / 詳細: NMR |
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-解析
NMRアンサンブル | コンフォーマー選択の基準: structures with the least restraint violations, structures with the lowest energy 計算したコンフォーマーの数: 50 / 登録したコンフォーマーの数: 36 |
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