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- EMDB-9362: Structure of human mitochondrial translation initiation factor 3 ... -

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登録情報
データベース: EMDB / ID: EMD-9362
タイトルStructure of human mitochondrial translation initiation factor 3 bound to the small ribosomal subunit -Class I
マップデータStructure of human mitochondrial translation initiation factor 3 bound to the small ribosomal subunit
試料
  • 複合体: Structure of human mitochondrial translation initiation factor 3 bound to the small ribosomal subunit
    • RNA: x 1種
    • タンパク質・ペプチド: x 31種
機能・相同性
機能・相同性情報


Mitochondrial translation elongation / Mitochondrial translation termination / mitochondrial translational initiation / peptide biosynthetic process / mitochondrial ribosome binding / translation factor activity, RNA binding / ribosome disassembly / mitochondrial ribosome assembly / positive regulation of mitochondrial translation / Mitochondrial translation initiation ...Mitochondrial translation elongation / Mitochondrial translation termination / mitochondrial translational initiation / peptide biosynthetic process / mitochondrial ribosome binding / translation factor activity, RNA binding / ribosome disassembly / mitochondrial ribosome assembly / positive regulation of mitochondrial translation / Mitochondrial translation initiation / mitochondrial small ribosomal subunit / mitochondrial ribosome / mitochondrial translation / ribosomal small subunit binding / translation initiation factor activity / small ribosomal subunit rRNA binding / ribosomal small subunit assembly / ribosome binding / regulation of translation / small ribosomal subunit / kinase activity / ミトコンドリア内膜 / cell population proliferation / tRNA binding / rRNA binding / リボソーム / structural constituent of ribosome / 翻訳 (生物学) / ribonucleoprotein complex / protein domain specific binding / リン酸化 / mRNA binding / apoptotic process / 核小体 / ミトコンドリア / RNA binding / 核質
類似検索 - 分子機能
Translation initiation factor 3 / Translation initiation factor 3, N-terminal / Translation initiation factor 3 (IF-3), N-terminal domain superfamily / Translation initiation factor 3 (IF-3), C-terminal domain superfamily / Translation initiation factor IF-3, N-terminal domain / Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 1 / 28S ribosomal protein S26 / Mitochondrial ribosome subunit S26 / Cysteine alpha-hairpin motif superfamily / 28S ribosomal protein S27, mitochondrial ...Translation initiation factor 3 / Translation initiation factor 3, N-terminal / Translation initiation factor 3 (IF-3), N-terminal domain superfamily / Translation initiation factor 3 (IF-3), C-terminal domain superfamily / Translation initiation factor IF-3, N-terminal domain / Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 1 / 28S ribosomal protein S26 / Mitochondrial ribosome subunit S26 / Cysteine alpha-hairpin motif superfamily / 28S ribosomal protein S27, mitochondrial / MRPS27/PTCD2 / Mitochondrial 28S ribosomal protein S27 / Ribosomal protein S22, mitochondrial / Ribosomal protein S23, mitochondrial / Ribosomal protein S23/S25, mitochondrial / Mitochondrial 28S ribosomal protein S31 / Mitochondrial 28S ribosomal protein S22 / Mitochondrial ribosomal protein S23 / Mitochondrial 28S ribosomal protein S31 / Ribosomal protein S29, mitochondrial / Ribosomal protein S28, mitochondrial / 28S ribosomal protein S10, mitochondrial / Mitochondrial ribosomal protein MRP-S35 / 28S ribosomal protein S24, mitochondrial / Mitochondrial 28S ribosomal protein S34 / Pentatricopeptide repeat domain-containing protein 3 / 28S ribosomal protein S17, mitochondrial / 28S ribosomal protein S18b, mitochondrial / : / Mitochondrial ribosome subunit S24 / Mitochondrial 28S ribosomal protein S34 / 40S ribosomal protein rpS2 (S5p), N-terminal / 28S ribosomal protein S25, mitochondrial / Pentatricopeptide repeat domain / Ribosomal protein S27/S33, mitochondrial / Ribosomal protein S24/S35, mitochondrial / Mitochondrial ribosomal subunit S27 / Ribosomal protein S24/S35, mitochondrial, conserved domain / Mitochondrial ribosomal subunit protein / Pentatricopeptide (PPR) repeat profile. / Ribosomal protein S23/S29, mitochondrial / Mitochondrial ribosomal death-associated protein 3 / Pentatricopeptide repeat / Mitochondrial mRNA-processing protein COX24, C-terminal / Mitochondrial mRNA-processing protein COX24, C-terminal / Mitochondrial domain of unknown function (DUF1713) / CHCH / CHCH domain / Coiled coil-helix-coiled coil-helix (CHCH) domain profile. / Ribosomal protein/NADH dehydrogenase domain / Mitochondrial ribosomal protein L51 / S25 / CI-B8 domain / Mitochondrial ribosomal protein L51 / S25 / CI-B8 domain / Ribosomal protein S21 superfamily / Ribosomal protein S21 / Ribosomal protein S21 / Ribosomal protein S2, bacteria/mitochondria/plastid / Ribosomal protein S18, conserved site / Ribosomal protein S18 signature. / Ribosomal protein S16 / Ribosomal protein S16 / Ribosomal protein S16 domain superfamily / Ribosomal protein S15, bacterial-type / Ribosomal protein S6 / Ribosomal protein S6 / Ribosomal protein S6 superfamily / Ribosomal protein S12, bacterial-type / Translation elongation factor EF1B/ribosomal protein S6 / Ribosomal protein S18 / Ribosomal protein S18 / Ribosomal protein S18 superfamily / Ribosomal protein S2 signature 1. / Ribosomal protein S2, conserved site / Ribosomal protein S2 / Ribosomal protein S2, flavodoxin-like domain superfamily / Ribosomal protein S14 / Ribosomal protein S2 / Ribosomal protein S14p/S29e / Ribosomal protein S5, N-terminal, conserved site / Ribosomal protein S5 signature. / Ribosomal protein S5 / Ribosomal protein S5, N-terminal / Ribosomal S11, conserved site / Ribosomal protein S10p/S20e / S5 double stranded RNA-binding domain profile. / Ribosomal protein S5, C-terminal / Ribosomal protein S9, conserved site / Ribosomal protein S5, N-terminal domain / Ribosomal protein S10 domain / Ribosomal protein S10 domain superfamily / Ribosomal protein S5, C-terminal domain / Ribosomal protein S11 / Ribosomal protein S5/S7 / Ribosomal protein S7 domain / Ribosomal protein S7 domain superfamily / Ribosomal protein S10p/S20e / Ribosomal protein S9 / Ribosomal protein S11 / Ribosomal protein S17/S11 / Ribosomal_S15 / Ribosomal protein S15
類似検索 - ドメイン・相同性
DAP3 protein / Small ribosomal subunit protein mS22 / Small ribosomal subunit protein mS25 / Small ribosomal subunit protein uS10m / Small ribosomal subunit protein uS11m / Small ribosomal subunit protein uS15m / Small ribosomal subunit protein bS16m / Small ribosomal subunit protein uS17m / Small ribosomal subunit protein bS18m / Small ribosomal subunit protein mS40 ...DAP3 protein / Small ribosomal subunit protein mS22 / Small ribosomal subunit protein mS25 / Small ribosomal subunit protein uS10m / Small ribosomal subunit protein uS11m / Small ribosomal subunit protein uS15m / Small ribosomal subunit protein bS16m / Small ribosomal subunit protein uS17m / Small ribosomal subunit protein bS18m / Small ribosomal subunit protein mS40 / Small ribosomal subunit protein bS21m / Small ribosomal subunit protein uS2m / Small ribosomal subunit protein mS31 / Small ribosomal subunit protein mS33 / Small ribosomal subunit protein bS1m / Small ribosomal subunit protein mS34 / Small ribosomal subunit protein bS6m / Small ribosomal subunit protein mS38 / Small ribosomal subunit protein uS12m / Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain containing 1 / Small ribosomal subunit protein mS39 / Small ribosomal subunit protein uS5m / Small ribosomal subunit protein uS3m / Small ribosomal subunit protein mS23 / Small ribosomal subunit protein mS35 / Small ribosomal subunit protein mS27 / Small ribosomal subunit protein mS26 / Small ribosomal subunit protein uS7m / Small ribosomal subunit protein uS9m / Small ribosomal subunit protein uS14m / Translation initiation factor IF-3, mitochondrial
類似検索 - 構成要素
生物種Homo sapiens (ヒト) / Bovine (ウシ) / Human (ヒト)
手法単粒子再構成法 / クライオ電子顕微鏡法 / 解像度: 3.48 Å
データ登録者Sharma M / Koripella R / Agrawal R
資金援助 米国, 2件
OrganizationGrant number国
National Institutes of Health/Eunice Kennedy Shriver National Institute of Child Health & Human Development (NIH/NICHD)R01 GM61576 米国
National Institutes of Health/National Institute of General Medical Sciences (NIH/NIGMS)R01 GM 32734 米国
引用ジャーナル: iScience / 年: 2019
タイトル: Structure of Human Mitochondrial Translation Initiation Factor 3 Bound to the Small Ribosomal Subunit.
著者: Ravi K Koripella / Manjuli R Sharma / Md Emdadul Haque / Paul Risteff / Linda L Spremulli / Rajendra K Agrawal /
要旨: The human mitochondrial translational initiation factor 3 (IF3) carries mitochondrial-specific amino acid extensions at both its N and C termini (N- and C-terminal extensions [NTE and CTE, ...The human mitochondrial translational initiation factor 3 (IF3) carries mitochondrial-specific amino acid extensions at both its N and C termini (N- and C-terminal extensions [NTE and CTE, respectively]), when compared with its eubacterial counterpart. Here we present 3.3- to 3.5-Å-resolution cryoelectron microscopic structures of the mammalian 28S mitoribosomal subunit in complex with human IF3. Unique contacts observed between the 28S subunit and N-terminal domain of IF3 explain its unusually high affinity for the 28S subunit, whereas the position of the mito-specific NTE suggests NTE's role in binding of initiator tRNA to the 28S subunit. The location of the C-terminal domain (CTD) clarifies its anti-association activity, whereas the orientation of the mito-specific CTE provides a mechanistic explanation for its role in destabilizing initiator tRNA in the absence of mRNA. Furthermore, our structure hints at a possible role of the CTD in recruiting leaderless mRNAs for translation initiation. Our findings highlight unique features of IF3 in mitochondrial translation initiation.
履歴
登録2018年12月19日-
ヘッダ(付随情報) 公開2019年2月27日-
マップ公開2019年2月27日-
更新2019年12月11日-
現状2019年12月11日処理サイト: RCSB / 状態: 公開

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構造の表示

ムービー
  • 表面図（断面を密度値に従い着色）
  • 表面レベル: 0.25
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ムービービューア
構造ビューアEMマップ:
SurfViewMolmilJmol/JSmol
添付画像

emd_9362.png

ダウンロードとリンク

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マップ

ファイルダウンロード / ファイル: emd_9362.map.gz / 形式: CCP4 / 大きさ: 244.1 MB / タイプ: IMAGE STORED AS FLOATING POINT NUMBER (4 BYTES)
注釈Structure of human mitochondrial translation initiation factor 3 bound to the small ribosomal subunit
ボクセルのサイズX=Y=Z: 1.07 Å
密度
表面レベル登録者による: 0.15 / ムービー #1: 0.25
最小 - 最大-1.2054142 - 2.2557297
平均 (標準偏差)-0.0012940647 (±0.06735699)
対称性空間群: 1
詳細

EMDB XML:

マップ形状
Axis orderXYZ
Origin000
サイズ400400400
Spacing400400400
セルA=B=C: 428.00003 Å
α=β=γ: 90.0 °

CCP4マップ ヘッダ情報:

modeImage stored as Reals
Å/pix. X/Y/Z1.071.071.07
M x/y/z400400400
origin x/y/z0.0000.0000.000
length x/y/z428.000428.000428.000
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NX/NY/NZ364364364
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D min/max/mean-1.2052.256-0.001

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添付データ

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試料の構成要素

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全体 : Structure of human mitochondrial translation initiation factor 3 ...

全体名称: Structure of human mitochondrial translation initiation factor 3 bound to the small ribosomal subunit
要素
  • 複合体: Structure of human mitochondrial translation initiation factor 3 bound to the small ribosomal subunit
    • RNA: 28S ribosomal RNA, mitochondriaリボソームRNA
    • タンパク質・ペプチド: 28S ribosomal protein S24, mitochondrialリボソーム
    • タンパク質・ペプチド: 28S ribosomal protein S5, mitochondrialリボソーム
    • タンパク質・ペプチド: 28S ribosomal protein S12, mitochondrialリボソーム
    • タンパク質・ペプチド: 28S ribosomal protein S16, mitochondrialリボソーム
    • タンパク質・ペプチド: 28S ribosomal protein S17, mitochondrialリボソーム
    • タンパク質・ペプチド: 28S ribosomal protein S22, mitochondrialリボソーム
    • タンパク質・ペプチド: 28S ribosomal protein S25, mitochondrialリボソーム
    • タンパク質・ペプチド: 28S ribosomal protein S26, mitochondrialリボソーム
    • タンパク質・ペプチド: 28S ribosomal protein S27, mitochondrialリボソーム
    • タンパク質・ペプチド: 28S ribosomal protein S34, mitochondrialリボソーム
    • タンパク質・ペプチド: 28S ribosomal protein S18b, mitochondrialリボソーム
    • タンパク質・ペプチド: 28S ribosomal protein S7, mitochondrialリボソーム
    • タンパク質・ペプチド: 28S ribosomal protein S9, mitochondrialリボソーム
    • タンパク質・ペプチド: 28S ribosomal protein S10, mitochondrialリボソーム
    • タンパク質・ペプチド: 28S ribosomal protein S14, mitochondrialリボソーム
    • タンパク質・ペプチド: DAP3 protein
    • タンパク質・ペプチド: 28S ribosomal protein S31, mitochondrialリボソーム
    • タンパク質・ペプチド: 28S ribosomal protein S33, mitochondrialリボソーム
    • タンパク質・ペプチド: 28S ribosomal protein S35, mitochondrialリボソーム
    • タンパク質・ペプチド: Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain containing 1
    • タンパク質・ペプチド: Pentatricopeptide repeat domain-containing protein 3, mitochondrial
    • タンパク質・ペプチド: 28S ribosomal protein S2, mitochondrialリボソーム
    • タンパク質・ペプチド: 28S ribosomal protein S6, mitochondrialリボソーム
    • タンパク質・ペプチド: 28S ribosomal protein S11, mitochondrialリボソーム
    • タンパク質・ペプチド: 28S ribosomal protein S15, mitochondrialリボソーム
    • タンパク質・ペプチド: 28S ribosomal protein S18c, mitochondrialリボソーム
    • タンパク質・ペプチド: 28S ribosomal protein S21, mitochondrialリボソーム
    • タンパク質・ペプチド: 28S ribosomal protein S23, mitochondrialリボソーム
    • タンパク質・ペプチド: 28S ribosomal protein S28, mitochondrialリボソーム
    • タンパク質・ペプチド: Aurora kinase A interacting protein 1
    • タンパク質・ペプチド: Translation initiation factor IF-3, mitochondrial

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超分子 #1: Structure of human mitochondrial translation initiation factor 3 ...

超分子名称: Structure of human mitochondrial translation initiation factor 3 bound to the small ribosomal subunit
タイプ: complex / ID: 1 / 親要素: 0 / 含まれる分子: all
詳細: Structure of human mitochondrial translation initiation factor 3 bound to the small ribosomal subunit
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)

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分子 #1: 28S ribosomal RNA, mitochondria

分子名称: 28S ribosomal RNA, mitochondria / タイプ: rna / ID: 1 / コピー数: 1
由来(天然)生物種: Bovine (ウシ)
分子量理論値: 306.932719 KDa
配列文字列: CAUAGGUUUG GUCCCAGCCU UCCUGUUAAC UCUUAAUAAA CUUACACAUG CAAGCAUCUA CACCCCAGUG AGAAUGCCCU CUAGGUUAU UAAAACUAAG AGGAGCUGGC AUCAAGCACA CACCCUGUAG CUCACGACGC CUUGCUUAAC CACACCCCAC G GGAAACAG ...文字列:
CAUAGGUUUG GUCCCAGCCU UCCUGUUAAC UCUUAAUAAA CUUACACAUG CAAGCAUCUA CACCCCAGUG AGAAUGCCCU CUAGGUUAU UAAAACUAAG AGGAGCUGGC AUCAAGCACA CACCCUGUAG CUCACGACGC CUUGCUUAAC CACACCCCAC G GGAAACAG CAGUGACAAA AAUUAAGCCA UAAACGAAAG UUUGACUAAG UUAUAUUAAU UAGGGUUGGU AAAUCUCGUG CC AGCCACC GCGGUCAUAC GAUUAACCCA AGCUAACAGG AGUACGGCGU AAAACGUGUU AAAGCACCAU ACCAAAUAGG GUU AAAUUC UAACUAAGCU GUAAAAAGCC AUGAUUAAAA UAAAAAUAAA UGACGAAAGU GACCCUACAA UAGCCGACGC ACUA UAGCU AAGACCCAAA CUGGGAUUAG AUACCCCACU AUGCUUAGCC CUAAACACAG AUAAUUACAU AAACAAAAUU AUUCG CCAG AGUACUACUA GCAACAGCUU AAAACUCAAA GGACUUGGCG GUGCUUUAUA UCCUUCUAGA GGAGCCUGUU CUAUAA UCG AUAAACCCCG AUAAACCUCA CCAAUUCUUG CUAAUACAGU CUAUAUACCG CCAUCUUCAG CAAACCCUAA AAAGGAA AA AAAGUAAGCG UAAUUAUGAU ACAUAAAAAC GUUAGGUCAA GGUGUAACCU AUGAAAUGGG AAGAAAUGGG CUACAUUC U CUACACCAAG AGAAUCAAGC ACGAAAGUUA UUAUGAAACC AAUAACCAAA GGAGGAUUUA GCAGUAAACU AAGAAUAGA GUGCUUAGUU GAAUUAGGCC AUGAAGCACG CACACACCGC CCGUCACCCU CCUCAAAUAG AUUCAGUGCA UCUAACCCUA UUUAAACGC ACUAGCUACA UGAGAGGAGA CAAGUCGUAA CAAGGUAAGC AUACUGGAAA GUGUGCUUGG AUAAAU

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分子 #2: 28S ribosomal protein S24, mitochondrial

分子名称: 28S ribosomal protein S24, mitochondrial / タイプ: protein_or_peptide / ID: 2 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Bovine (ウシ)
分子量理論値: 19.111455 KDa
配列文字列:
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+
分子 #3: 28S ribosomal protein S5, mitochondrial

分子名称: 28S ribosomal protein S5, mitochondrial / タイプ: protein_or_peptide / ID: 3 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Bovine (ウシ)
分子量理論値: 47.956941 KDa
配列文字列: MAAAVRAAGF LPALCGASAG RLWSRQLYLN TFPTASIWAL KAVPSNGPSS SAGARGRCRS THLGPALQTQ CCTPAPGNVT AQQYRSYSF FTKLTADELW KGALAETGAG ARKGRGKRTK RKRRKDLNRG QIIGEGRRGF LWPGLNAPLM KSGAIQTITQ R SKEEQEKV ...文字列:
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分子 #4: 28S ribosomal protein S12, mitochondrial

分子名称: 28S ribosomal protein S12, mitochondrial / タイプ: protein_or_peptide / ID: 4 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Bovine (ウシ)
分子量理論値: 15.479285 KDa
配列文字列:
MSWSGLLRGL SMSLNYGLAL APRPWGTRPM ATLNQLHRRG PPKFPPSKPG PTEGRPQLKG VVLRTFIRKP KKPNSANRKC CRVRLSTGR EAVCFIPGEG HNLQEHHVVL VQGGRTQDLP GVKLKVVRGK YDCGHVQKKK

+
分子 #5: 28S ribosomal protein S16, mitochondrial

分子名称: 28S ribosomal protein S16, mitochondrial / タイプ: protein_or_peptide / ID: 5 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Bovine (ウシ)
分子量理論値: 15.157631 KDa
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MVQLTTVLCK AYRGGHLTIR LALGGCTNRP FYRIVAAHNK CPRDGRFVEQ LGSYDPMPNS HGEKLVALNL DRIRHWIGCG AHLSKPVEK LLGLSGFFPL HPMVITNAER LRRKRAQEVL LAAQKTDTEA TETKEN

+
分子 #6: 28S ribosomal protein S17, mitochondrial

分子名称: 28S ribosomal protein S17, mitochondrial / タイプ: protein_or_peptide / ID: 6 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Bovine (ウシ)
分子量理論値: 14.497051 KDa
配列文字列:
MSVVRSSVHA KWIVGKVIGT AMQKTAKVRV TRLVLDPYLL KYFNKRKTYF AHDALQQCTV GDIVLLKALP VPRTKHVKHE LAEIVFKVG QVVDPVTGKR CAGTTYLESP VDLETTPLAK NLEELSLSTT Q

+
分子 #7: 28S ribosomal protein S22, mitochondrial

分子名称: 28S ribosomal protein S22, mitochondrial / タイプ: protein_or_peptide / ID: 7 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Bovine (ウシ)
分子量理論値: 40.720562 KDa
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MATLRVSLSL WNLHAGSRGA GRVYFRARAR PRPGDLFQPL PGVCGAGTPC RGLCSEAESG SPKIKKPTFM DEEVQSILIK MTGLDLLKI FKPAVQETKP PTYKLMTQAQ LEEATRQAIE AAKVRLKMPP VLEERTPIND VLAEDKILEG TETGKYVFTD I SYSIPHRE RFIVVREPSG TLRKASWEER DRMIQIYFPK EGRRVLTPVI FREENLQTMY SQDRHVDVLN LCVAQFEPDS AD YIKVHHQ TYEDIDKYGK YDLLRSTRHF GGMAWYFVNK KKIDGLLIDQ IQRDLVDDAA SLVQLYHILH PDGQSAQEAK EQA AEGLQL IKVFAKTEAQ KGAYIELTLQ AYQEAFISSS AAS

+
分子 #8: 28S ribosomal protein S25, mitochondrial

分子名称: 28S ribosomal protein S25, mitochondrial / タイプ: protein_or_peptide / ID: 8 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Bovine (ウシ)
分子量理論値: 20.085312 KDa
配列文字列:
MPMKGRFPIR RTLQYLSQGD VVFKDSVKVM TVNYNTHGEL GEGARKFVFF NIPQIQYKNP WVQIMLFKNM TPTPFLRFYL DSGEQVLVD VETKSNKEIM EHVKKILGKN EETLRRERQE REQLSHPAHF GPRKYCLREC ICEVEGQVPC PAVVPLPREL T GKFQAALR AGAQD

+
分子 #9: 28S ribosomal protein S26, mitochondrial

分子名称: 28S ribosomal protein S26, mitochondrial / タイプ: protein_or_peptide / ID: 9 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Bovine (ウシ)
分子量理論値: 23.815941 KDa
配列文字列: MLRALSTLGA RPLGRPPAQF LLLARGRKTR HDPPAKSKIG RVATPPAVDP AEFFVLTERY RQYRQTVRAL RQEFVTEVRR KVHEARAGV LAERKALQDA AEHRELMAWN QAENQRLHEL RMARLRQEAR EQEQWQAEEA AREAREAEAW ARLKEQEVLQ L QEDAKNFI ...文字列:
MLRALSTLGA RPLGRPPAQF LLLARGRKTR HDPPAKSKIG RVATPPAVDP AEFFVLTERY RQYRQTVRAL RQEFVTEVRR KVHEARAGV LAERKALQDA AEHRELMAWN QAENQRLHEL RMARLRQEAR EQEQWQAEEA AREAREAEAW ARLKEQEVLQ L QEDAKNFI TRENLEARVE EALDSPKSYN WAVTREGQVV TPQHKGS

+
分子 #10: 28S ribosomal protein S27, mitochondrial

分子名称: 28S ribosomal protein S27, mitochondrial / タイプ: protein_or_peptide / ID: 10 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Bovine (ウシ)
分子量理論値: 48.017867 KDa
配列文字列: MAAPMVRRAI FLARNVLLPQ LSLAGKRYLL SAAYEDSRKW EARAKEDCHL ADLASLMDKT YERKLPVSSL TISRFVDNIS SREEIDHAE YYLYKFRHSP NCWYLRNWTI HTWIRQCLKY GAQDKALYTL VNKVQYGIFP DNYTFNLLMD HFIKKENYKD A LSVVFEIM ...文字列:
MAAPMVRRAI FLARNVLLPQ LSLAGKRYLL SAAYEDSRKW EARAKEDCHL ADLASLMDKT YERKLPVSSL TISRFVDNIS SREEIDHAE YYLYKFRHSP NCWYLRNWTI HTWIRQCLKY GAQDKALYTL VNKVQYGIFP DNYTFNLLMD HFIKKENYKD A LSVVFEIM MQEAFEVPST QLLSLYVLYQ CLAKKTDFSW EEERNFGASL LLPGLKQKNS VGLSSQLYGY ALLGKVELQQ GL RAVYHNM PLLWRPGYLD RALQVMEKVA SSPEDGKLCR EALGVLDRAL KALTAPAQES PEEQPQEGEE SPASEELMEQ LDV EETEQS KLPRYVERYE ALHSKLQALG KVESESLLTL TTQLVKEQLP TCEAEDIATY EQKLQEWHLE LVNLIEREKE MREK ARLKH EARRAAKAAA

+
分子 #11: 28S ribosomal protein S34, mitochondrial

分子名称: 28S ribosomal protein S34, mitochondrial / タイプ: protein_or_peptide / ID: 11 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Bovine (ウシ)
分子量理論値: 25.880799 KDa
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MARRKVRPRL IAELARRVRA LREQRERPRD SVRYALDYET LIRPHSGRKL PLRAWVDVRR ESRLLQLLGR LPFFGLGRLV TRKSWLWQH DEPCYWRLTR VRPDYTAQNL DHGKAWGILT FKGKTESEAR EIEQVMHHDW RLVPKHEEAA FTSFTPAPEE T PRPVPYPP LLRAMILAER QKNGDPSTEE PMLSLERIRT DPWDYPENQE AKKKTKGTAV

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分子 #12: 28S ribosomal protein S18b, mitochondrial

分子名称: 28S ribosomal protein S18b, mitochondrial / タイプ: protein_or_peptide / ID: 12 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Bovine (ウシ)
分子量理論値: 29.217355 KDa
配列文字列: MAASVLNVLL RRLPYFSPFR GAYGVQVPLQ TLCTKAPPED DSLPPIPVSP YEDEPWKYLD SEEYHNRNGS RPVWADYRRN HKGGIPPQR TRKMCIRGNK VAGNPCPICR DQKLHVDFRN VKLLKQFVCA HTGIIFHAPY TGVCMKQHKK LTQAIQKARD H GLLSYHIP ...文字列:
MAASVLNVLL RRLPYFSPFR GAYGVQVPLQ TLCTKAPPED DSLPPIPVSP YEDEPWKYLD SEEYHNRNGS RPVWADYRRN HKGGIPPQR TRKMCIRGNK VAGNPCPICR DQKLHVDFRN VKLLKQFVCA HTGIIFHAPY TGVCMKQHKK LTQAIQKARD H GLLSYHIP QVEPRDLDFS TSHGAVSATP PAPTLVSGDP WYPWYSWKQP PERELSRLRR LYQGHLREES GPPPESMPKV PL TAPNEAT STEQAGPQSA L

+
分子 #13: 28S ribosomal protein S7, mitochondrial

分子名称: 28S ribosomal protein S7, mitochondrial / タイプ: protein_or_peptide / ID: 13 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Bovine (ウシ)
分子量理論値: 28.17901 KDa
配列文字列: MAAPTAKVSR GWSGLALGVR IAVLRLPGLT QVRWSRYGPE YQDPQIDKEY YRKPLAQLTE EETYERELRK TQVIKAAPAT KTSSVFEDP VISKFTNMMM KGGNKILARS LMTQTLEAVK RKQFEKYHAA SAEEQATVER NPYTIFHQAL KNCEPVIGLV P ILKGGHFY ...文字列:
MAAPTAKVSR GWSGLALGVR IAVLRLPGLT QVRWSRYGPE YQDPQIDKEY YRKPLAQLTE EETYERELRK TQVIKAAPAT KTSSVFEDP VISKFTNMMM KGGNKILARS LMTQTLEAVK RKQFEKYHAA SAEEQATVER NPYTIFHQAL KNCEPVIGLV P ILKGGHFY QVPVPLAERR RRFLAMKWMI TECREKKPRR MLMPEKLSQE LLEAFCNRGP VIKRKHDMHK MAEANRALAH YR WW

+
分子 #14: 28S ribosomal protein S9, mitochondrial

分子名称: 28S ribosomal protein S9, mitochondrial / タイプ: protein_or_peptide / ID: 14 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Bovine (ウシ)
分子量理論値: 45.302754 KDa
配列文字列: MAAPSVSCGA AVPYRLFLAG RVSFAREQGL WKAAASGLQT GTRCQILRLK HSPAVTTTKN VAALRRESYT VDFIKKQIEE FNIGKRHLA NMMGEDPETF TQEDVDRAIT YLFPSGLFEK RARPIMKHPE EIFPKQRAVQ WGEDGRPFHF LFYTGKQSYY S LMHEAYGK ...文字列:
MAAPSVSCGA AVPYRLFLAG RVSFAREQGL WKAAASGLQT GTRCQILRLK HSPAVTTTKN VAALRRESYT VDFIKKQIEE FNIGKRHLA NMMGEDPETF TQEDVDRAIT YLFPSGLFEK RARPIMKHPE EIFPKQRAVQ WGEDGRPFHF LFYTGKQSYY S LMHEAYGK VLHAEERQDQ LRAKGLFSEK SKSKDLIGSR WLIKEELEEM LVEKLSDQDY AQFIRLLERL SALPCDAAEE EF VGRFRRT VTVQSKKHLI EPLQYDEQGM AFSTGQGKRK TANAEAVVYG HGSGKIEING VDYLLYFPVT QDREQLMFPF HFL DRLGKH DVTCTVSGGG RSSQAGAIRL AMSRALCSFI TEDEVEWMRQ AGLLTTDPRV RERKKPGQEG ARRKFTWKKR

+
分子 #15: 28S ribosomal protein S10, mitochondrial

分子名称: 28S ribosomal protein S10, mitochondrial / タイプ: protein_or_peptide / ID: 15 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Bovine (ウシ)
分子量理論値: 23.069605 KDa
配列文字列: MAVRAVFGAL GRRLWQGSKN FSVSSSRSNI AKNDGFLLST SMKWVQFSNL HVDVPKDLTK PTITISDEPD TLYKRLSVLV KGHDKAVLD SYEYFAVLAA KELGISVKVH EPPRKIERFT LLKSVHIFKK HRVQYEMRTL YRCLELEHLT GSTADVYLEY I QRNLPEGV ...文字列:
MAVRAVFGAL GRRLWQGSKN FSVSSSRSNI AKNDGFLLST SMKWVQFSNL HVDVPKDLTK PTITISDEPD TLYKRLSVLV KGHDKAVLD SYEYFAVLAA KELGISVKVH EPPRKIERFT LLKSVHIFKK HRVQYEMRTL YRCLELEHLT GSTADVYLEY I QRNLPEGV AMEVTKTRLE QLPEHIKKPV WETTPEEKGD SKS

+
分子 #16: 28S ribosomal protein S14, mitochondrial

分子名称: 28S ribosomal protein S14, mitochondrial / タイプ: protein_or_peptide / ID: 16 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Bovine (ウシ)
分子量理論値: 15.073671 KDa
配列文字列:
MATSMLGSLL RIVRQVVPSS ASGQARSYYV DWRMLRDVKR RKMAYEYADE RLRINSLRKN TILPKHLQEV ADEEIAALPR DSCPVRIRN RCVMTSRPRG VKRRWRLSRI VFRHLADHGQ LSGIQRAIW

+
分子 #17: DAP3 protein

分子名称: DAP3 protein / タイプ: protein_or_peptide / ID: 17 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Bovine (ウシ)
分子量理論値: 40.505719 KDa
配列文字列: ISRTLENDPA KHGEQHVGQH YNISIQELKT VFPHGLPPRF VMQVKTFNEA CLMVRKPALE LLHYLKNTNF AHPAVRYVLY GEKGTGKTL SLCHIIHFCA KQDWLILHIP DAHLWVKNCR DLLQSTYNKQ RFDQPLEASI WLKNFKTANE RFLSQIKVQD K YIWNKRES ...文字列:
ISRTLENDPA KHGEQHVGQH YNISIQELKT VFPHGLPPRF VMQVKTFNEA CLMVRKPALE LLHYLKNTNF AHPAVRYVLY GEKGTGKTL SLCHIIHFCA KQDWLILHIP DAHLWVKNCR DLLQSTYNKQ RFDQPLEASI WLKNFKTANE RFLSQIKVQD K YIWNKRES TEKGSPLAEV VEQGIMRVRN ATDAVGIVLK ELKRQSSLGV FRLLVAVDGV NALWGRTTLK REDKSPITPE EL ALIYNLR KMVKNDWQGG AIVLTVSQTG SLFKPRKAYL PQELLGKEGF DTLDPFIPIL VSNYNPKEFE GCIQYYLENN WLQ HEKAHT EEGKKELLFL SNRNPGLLER LCAYL

+
分子 #18: 28S ribosomal protein S31, mitochondrial

分子名称: 28S ribosomal protein S31, mitochondrial / タイプ: protein_or_peptide / ID: 18 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Bovine (ウシ)
分子量理論値: 43.740461 KDa
配列文字列: MFPRVSAVLP FRPLSRLPLC SAGPEASAAT VVPLASPHGT VRTKCNIQRY FGTNSVIYSK KDDKSVPACE ISKETENQGS TKENKKKDL VNIIKGMKVE LSTVNVQTTK PPNRGQLKSL EAAIRRLQKS PEDAPQKSKS LSPELVAAAT AVADSLPFDK Q TTKSELLR ...文字列:
MFPRVSAVLP FRPLSRLPLC SAGPEASAAT VVPLASPHGT VRTKCNIQRY FGTNSVIYSK KDDKSVPACE ISKETENQGS TKENKKKDL VNIIKGMKVE LSTVNVQTTK PPNRGQLKSL EAAIRRLQKS PEDAPQKSKS LSPELVAAAT AVADSLPFDK Q TTKSELLR QLRQHEEDSK AQKDGEKPKI SFSNIISDMK VARSSTARAS TRPVHQIQFD EGADDFVDRE ETADLRKRFR KN IFKGKRL NIFELKPVTE EAPETEAAPS LWDVEFAKQL AAVTEQPFQN GFEEMIQWTK EGKLWEFPIN NEAGFDDDGS EFH EHIFLD KYLEGFPKQG PIRHFMELVT CGLSKNPYLS VKQKVEHIEW FRNYFNEKQD ILKESGINFS

+
分子 #19: 28S ribosomal protein S33, mitochondrial

分子名称: 28S ribosomal protein S33, mitochondrial / タイプ: protein_or_peptide / ID: 19 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Bovine (ウシ)
分子量理論値: 12.480582 KDa
配列文字列:
MSSLSEYALR MSRLSARLFS EVARPTDSKS MKVVKLFSEQ PLAKRKETYD WYPNHNTYFA LMGILRSVGL YRDEHQDFKD EQLRLKKLR GKVKPRKGEG KRAAKKK

+
分子 #20: 28S ribosomal protein S35, mitochondrial

分子名称: 28S ribosomal protein S35, mitochondrial / タイプ: protein_or_peptide / ID: 20 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Bovine (ウシ)
分子量理論値: 37.129746 KDa
配列文字列: MAAPSLPAWL ALQTRARTLR AFSTAVSPVT GAQRLSPPTT ERTSKHERAP RRKALPPRTE KMSVDQDWPS VYPVAAPFKP SAVPLPVRM GYPVKRGVPM AKEGNLELLK IPNFLHLTPV AIKKHCEALK DFCTEWPAAL DSDEKCEKHF PIEIDTADYI S SGPSIRNP ...文字列:
MAAPSLPAWL ALQTRARTLR AFSTAVSPVT GAQRLSPPTT ERTSKHERAP RRKALPPRTE KMSVDQDWPS VYPVAAPFKP SAVPLPVRM GYPVKRGVPM AKEGNLELLK IPNFLHLTPV AIKKHCEALK DFCTEWPAAL DSDEKCEKHF PIEIDTADYI S SGPSIRNP KARVVTLRVK LSSLNLDDHA KKKLIKLVGD RYCKSTDVLT IKTDRCPLKR QNYDYAMYLL TVLYHESWKT EE WEKKKTE ADMEEYVWKD SASEKNILET LFQIKAAEKN TELSKEELLS TKEVEDYKNS VVSLKNEGDN ENTISQYKES VKR LLHLM

+
分子 #21: Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain containing 1

分子名称: Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain containing 1
タイプ: protein_or_peptide / ID: 21 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Bovine (ウシ)
分子量理論値: 13.581974 KDa
配列文字列:
MATPSLRGRL ARLGNPRKPI LKPNKPLILA NHVGERRREK GEATCITEMS IMMACWKQNE FRDEACKKEI RDFFDCASRA EAARKMRSI QEDLGELGSL PPRKLNKLLQ RFPNKPHLS

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分子 #22: Pentatricopeptide repeat domain-containing protein 3, mitochondrial

分子名称: Pentatricopeptide repeat domain-containing protein 3, mitochondrial
タイプ: protein_or_peptide / ID: 22 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Bovine (ウシ)
分子量理論値: 60.587832 KDa
配列文字列: MASVASARWL RVSCGLCVPL TARRAGPCGR TPSSRFYSGS AAVPKDEGAD IAGTEEVVIP KKKTWDKVAV LQALASTVHR DTTAAPYAF QDDPYLIPTS SVESHSFLLA KKSGENAAKF IINSYPKYFQ KDIAEPHIPC LMPE(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK) ...文字列:
MASVASARWL RVSCGLCVPL TARRAGPCGR TPSSRFYSGS AAVPKDEGAD IAGTEEVVIP KKKTWDKVAV LQALASTVHR DTTAAPYAF QDDPYLIPTS SVESHSFLLA KKSGENAAKF IINSYPKYFQ KDIAEPHIPC LMPE(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)SLAT YHHIIQLFY(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)MFFQSA MRVCSSLRDL ELAYQVHGLL NTGDNRKFIG PDPRRNFYYS KFFSLLCLME QIDVTLKWY KDLIPSVFFP HSQTLIDLLQ ALDVANRLEM IPQIWKDSKE YGHTFRSDLK EEILMLMARD QHPPELQAAF ADCAADIKST YESQDARQT ASEWPANSLN YIAILFLRAG RTQEAWKMLG LFRKHNKIPR NELLNEFMDS AKASSSPAQA VEVVKLANSF S LPICEGLT QRLTADFTLS QEQKEALGDL TALTSDSESD SDSDTSKDK

+
分子 #23: 28S ribosomal protein S2, mitochondrial

分子名称: 28S ribosomal protein S2, mitochondrial / タイプ: protein_or_peptide / ID: 23 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Bovine (ウシ)
分子量理論値: 31.775492 KDa
配列文字列: MATGAVLPRL LGAGVRAAPR GRAAQRGRTL GSAAAAAARE PERDSDRSAR ILSEPLKHSD FFNVKELFSV RSLFNARVHL GHKAGCRHR FMEPYIFGSR LGQDIIDLEQ TATHLQLALN FTAHVAFRGG IILFVSRARQ FSHLIESTAR SCGEYAHTRY F KGGLLTNA ...文字列:
MATGAVLPRL LGAGVRAAPR GRAAQRGRTL GSAAAAAARE PERDSDRSAR ILSEPLKHSD FFNVKELFSV RSLFNARVHL GHKAGCRHR FMEPYIFGSR LGQDIIDLEQ TATHLQLALN FTAHVAFRGG IILFVSRARQ FSHLIESTAR SCGEYAHTRY F KGGLLTNA PLLLGARVRL PDLIIFLHTL NNVFEPHVAV RDAAKMSIPT VGVVDTNCNP CLITYPVPGN DDSPPAVQLF CQ LFQTAVT RAKEKRRQLE ALYRLQGAPG PHPANPAAPG APSPGAQAQL GMGHSP

+
分子 #24: 28S ribosomal protein S6, mitochondrial

分子名称: 28S ribosomal protein S6, mitochondrial / タイプ: protein_or_peptide / ID: 24 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Bovine (ウシ)
分子量理論値: 14.171551 KDa
配列文字列:
MPRYELALIL KAMQRPETAA ALKRTLEALM DRGAVVRSLE NLGERTLPYK MSAHSQRHTR GGYFLVDFYA PTTTVASIME HLSRDIDVI RPNVVKHPLT QEVKECEGIV PVPLEEKLYS TKKRK

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分子 #25: 28S ribosomal protein S11, mitochondrial

分子名称: 28S ribosomal protein S11, mitochondrial / タイプ: protein_or_peptide / ID: 25 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Bovine (ウシ)
分子量理論値: 20.869008 KDa
配列文字列: MQVLRNSGSW LLRSWAWPPT TRVVAGVPAP TIHMSAQQMQ DAAAKEEVEK AETPAPAPSR SSFSIYPPIP GQESSLRWAG KKFEEIPIA HIKASYNNTQ IHVVSAAHQP LARASCGTEG FRNAKKGTGI AAQTAGIAAA AKATGKGVTH VRVVVKGLGP G RLSAIKGL ...文字列:
MQVLRNSGSW LLRSWAWPPT TRVVAGVPAP TIHMSAQQMQ DAAAKEEVEK AETPAPAPSR SSFSIYPPIP GQESSLRWAG KKFEEIPIA HIKASYNNTQ IHVVSAAHQP LARASCGTEG FRNAKKGTGI AAQTAGIAAA AKATGKGVTH VRVVVKGLGP G RLSAIKGL TMGGLEVISI TDNTPIPHNG CRPRKARRL

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分子 #26: 28S ribosomal protein S15, mitochondrial

分子名称: 28S ribosomal protein S15, mitochondrial / タイプ: protein_or_peptide / ID: 26 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Bovine (ウシ)
分子量理論値: 29.245316 KDa
配列文字列: MLRAAWRALS SIRTQAVTQP PVLGLPGGGC AKLLSVQRDL PSSLILQAAR GYATQKPVQQ SQEDDPPPSM LLKDYQNVPG IEKVDDVVK RLISLEMANK KEMLKIKKEQ LMSKVVENPK DTSSLEAQIV ALTVKIRSYE EHMQKHQKDK AHKRYLLMSI D KRQKMLKN ...文字列:
MLRAAWRALS SIRTQAVTQP PVLGLPGGGC AKLLSVQRDL PSSLILQAAR GYATQKPVQQ SQEDDPPPSM LLKDYQNVPG IEKVDDVVK RLISLEMANK KEMLKIKKEQ LMSKVVENPK DTSSLEAQIV ALTVKIRSYE EHMQKHQKDK AHKRYLLMSI D KRQKMLKN LRKTNYPVFE KTCKELGIEY TFPPPYHRKI HRRLATKKAL CIRVFQEVQK LKKQKRALKT AAAAAQKQGQ RN PESPSEA RSEAIKETQ

+
分子 #27: 28S ribosomal protein S18c, mitochondrial

分子名称: 28S ribosomal protein S18c, mitochondrial / タイプ: protein_or_peptide / ID: 27 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Bovine (ウシ)
分子量理論値: 16.240283 KDa
配列文字列:
MAAVLGLCGG LGKRKFTRFP TAFVCLTNSG TRAVLWRSCS QCKQVTSSED LPIPMENPYK EPLKKCILCE KRVDYKNVQL LSQFISPFT GCIYGRHITG LCGKKQREIT KAIKRAQILG FMPVTYKDPA YLKDPKVCNI RYRE

+
分子 #28: 28S ribosomal protein S21, mitochondrial

分子名称: 28S ribosomal protein S21, mitochondrial / タイプ: protein_or_peptide / ID: 28 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Bovine (ウシ)
分子量理論値: 10.697583 KDa
配列文字列:
MAKHLKFIAR TVMVQEGNVE GAYRTLNRIL TMDGLIEDIK RRRYYEKPCR RRQRESYETC RRIYNMEMAR KINFLMRKNR ADPWQGC

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分子 #29: 28S ribosomal protein S23, mitochondrial

分子名称: 28S ribosomal protein S23, mitochondrial / タイプ: protein_or_peptide / ID: 29 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Bovine (ウシ)
分子量理論値: 21.625533 KDa
配列文字列: MAGSRLETVG SIFTRTRDLI RAGVLKEKPL WFDVYNAFPP LREPVFRRPR LRYGKAKSPT QDIYYHEDQI RAKFYAAYGS GPKAFDLFN PNFKSTCQRF VEKYIELQKL GETDEEKLFV EAGKALLAEG VILRRVEKAR TQQEGSQVSR KSESMGVESQ T ALEENPPL ...文字列:
MAGSRLETVG SIFTRTRDLI RAGVLKEKPL WFDVYNAFPP LREPVFRRPR LRYGKAKSPT QDIYYHEDQI RAKFYAAYGS GPKAFDLFN PNFKSTCQRF VEKYIELQKL GETDEEKLFV EAGKALLAEG VILRRVEKAR TQQEGSQVSR KSESMGVESQ T ALEENPPL KEVPQAQHLE SPGEESKGLS PP

+
分子 #30: 28S ribosomal protein S28, mitochondrial

分子名称: 28S ribosomal protein S28, mitochondrial / タイプ: protein_or_peptide / ID: 30 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Bovine (ウシ)
分子量理論値: 21.077977 KDa
配列文字列: MAALCRTRAV TAESHFLRVF LFSRSCRGAG TESGSGSESS NSTEPRPRPG GFASALERHS ELQRKAELAR TRGSPKNVES FASMLRHSP LTQMGPAKDK IVIGRIFHIV ENDLYIDFGG KFHCVCKRPE VDGEKYQKGT RVRLRLLDLE LTSRFLGATT D TTILEAEA ...文字列:
MAALCRTRAV TAESHFLRVF LFSRSCRGAG TESGSGSESS NSTEPRPRPG GFASALERHS ELQRKAELAR TRGSPKNVES FASMLRHSP LTQMGPAKDK IVIGRIFHIV ENDLYIDFGG KFHCVCKRPE VDGEKYQKGT RVRLRLLDLE LTSRFLGATT D TTILEAEA VLLGLQESKD SKSKEERREN K

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分子 #31: Aurora kinase A interacting protein 1

分子名称: Aurora kinase A interacting protein 1 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 31 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Bovine (ウシ)
分子量理論値: 22.968365 KDa
配列文字列: MFLMRLTSQL LRAVPRAGCS GPWPVLGVLG RHACRPCYST KPTGPSGVAS LPGRRVHMEL EEMLVPRKMS ISPLESWLTI RYLLPRLDT GAPGTVSPAQ LYECPPSRVG EGVEQGGKDV FDAPQMQCRN VLKIRRRKMN HHKYRKLVKR TRFLRRKVRE A RLKRKQMK ...文字列:
MFLMRLTSQL LRAVPRAGCS GPWPVLGVLG RHACRPCYST KPTGPSGVAS LPGRRVHMEL EEMLVPRKMS ISPLESWLTI RYLLPRLDT GAPGTVSPAQ LYECPPSRVG EGVEQGGKDV FDAPQMQCRN VLKIRRRKMN HHKYRKLVKR TRFLRRKVRE A RLKRKQMK FERDLRRIWQ KAGLKEAPPG WQTPKIYLKG K

+
分子 #32: Translation initiation factor IF-3, mitochondrial

分子名称: Translation initiation factor IF-3, mitochondrial / タイプ: protein_or_peptide / ID: 32 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Human (ヒト)
分子量理論値: 28.21316 KDa
配列文字列: TAPAQLSPIA SAPRLSFLIH AKAFSTAEDT QNEGKKTKKN KTAFSNVGRK ISQRVIHLFD EKGNDLGNMH RANVIRLMDE RDLRLVQRN TSTEPAEYQL MTGLQILQER QRLREMEKAN PKTGPTLRKE LILSSNIGQH DLDTKTKQIQ QWIKKKHLVQ I TIKKGKNV ...文字列:
TAPAQLSPIA SAPRLSFLIH AKAFSTAEDT QNEGKKTKKN KTAFSNVGRK ISQRVIHLFD EKGNDLGNMH RANVIRLMDE RDLRLVQRN TSTEPAEYQL MTGLQILQER QRLREMEKAN PKTGPTLRKE LILSSNIGQH DLDTKTKQIQ QWIKKKHLVQ I TIKKGKNV DVSENEMEEI FHQILQTMPG IATFSSRPQA VQGGKALMCV LRAFSKNEEK AYKETQETQE RDTLNKDHGN DK ESNVLHQ

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実験情報

-
構造解析

手法クライオ電子顕微鏡法
解析単粒子再構成法
試料の集合状態particle

-
試料調製

緩衝液pH: 7.6
グリッド詳細: unspecified
凍結凍結剤: ETHANE

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電子顕微鏡法

顕微鏡FEI TITAN KRIOS
電子線加速電圧: 300 kV / 電子線源: OTHER
電子光学系照射モード: OTHER / 撮影モード: OTHER
撮影フィルム・検出器のモデル: GATAN K2 SUMMIT (4k x 4k)
平均電子線量: 70.0 e/Å2
実験機器
モデル: Titan Krios / 画像提供: FEI Company

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画像解析

初期モデルモデルのタイプ: PDB ENTRY
PDBモデル - PDB ID:

3jd5

初期 角度割当タイプ: PROJECTION MATCHING
最終 角度割当タイプ: MAXIMUM LIKELIHOOD
最終 再構成アルゴリズム: FOURIER SPACE / 解像度のタイプ: BY AUTHOR / 解像度: 3.48 Å / 解像度の算出法: FSC 0.143 CUT-OFF / ソフトウェア - 名称: cryoSPARC / 使用した粒子像数: 99178

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原子モデル構築 1

初期モデルPDB ID:

3jd5

精密化プロトコル: OTHER / 温度因子: 97
得られたモデル

PDB-6nf8:
Structure of human mitochondrial translation initiation factor 3 bound to the small ribosomal subunit -Class I

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万見について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか？ / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例：em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

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万見 (Yorodumi)

幾万の構造データを、幾万の視点から

  • 万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
  • EM Navigatorの詳細ページの後継、Omokage検索のフロントエンドも兼ねています。

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較 / 万見検索 / 2016年8月31日: 新しいEM Navigatorと万見 / 万見文献 / Jmol/JSmol / 機能・相同性情報 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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