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- EMDB-32319: The cryo-EM structure of human pre-C*-II complex -

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基本情報

登録情報
データベース: EMDB / ID: EMD-32319
タイトルThe cryo-EM structure of human pre-C*-II complex
マップデータThe cryo-EM map of human pre-C*-II complex
試料
  • 複合体: Human pre-C*-II complex
    • タンパク質・ペプチド: x 39種
    • RNA: x 3種
  • RNA: x 2種
  • リガンド: x 5種
機能・相同性
機能・相同性情報


second spliceosomal transesterification activity / exon-exon junction subcomplex mago-y14 / negative regulation of selenocysteine incorporation / regulation of nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay / spliceosomal complex disassembly / cellular response to selenite ion / selenocysteine insertion sequence binding / exon-exon junction complex / pre-mRNA 3'-splice site binding / snRNP binding ...second spliceosomal transesterification activity / exon-exon junction subcomplex mago-y14 / negative regulation of selenocysteine incorporation / regulation of nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay / spliceosomal complex disassembly / cellular response to selenite ion / selenocysteine insertion sequence binding / exon-exon junction complex / pre-mRNA 3'-splice site binding / snRNP binding / post-mRNA release spliceosomal complex / negative regulation of proteasomal protein catabolic process / U2 snRNP binding / regulation of retinoic acid receptor signaling pathway / negative regulation of toll-like receptor signaling pathway / U7 snRNA binding / histone pre-mRNA DCP binding / intracellular mRNA localization / regulation of translation at postsynapse, modulating synaptic transmission / 3'-5' RNA helicase activity / U7 snRNP / generation of catalytic spliceosome for first transesterification step / renal system process / negative regulation of excitatory postsynaptic potential / histone pre-mRNA 3'end processing complex / alternative mRNA splicing, via spliceosome / regulation of vitamin D receptor signaling pathway / Z-decay: degradation of maternal mRNAs by zygotically expressed factors / SLBP independent Processing of Histone Pre-mRNAs / SLBP Dependent Processing of Replication-Dependent Histone Pre-mRNAs / negative regulation of interleukin-8 production / regulation of mRNA processing / negative regulation of lipopolysaccharide-mediated signaling pathway / Deadenylation of mRNA / embryonic brain development / negative regulation of phosphorylation / protein methylation / U12-type spliceosomal complex / methylosome / 7-methylguanosine cap hypermethylation / negative regulation of interferon-beta production / nuclear retinoic acid receptor binding / U2-type catalytic step 1 spliceosome / U1 snRNP binding / pICln-Sm protein complex / Prp19 complex / RNA splicing, via transesterification reactions / poly(A) binding / positive regulation of androgen receptor activity / M-decay: degradation of maternal mRNAs by maternally stored factors / RNA stem-loop binding / mRNA 3'-end processing / spliceosomal tri-snRNP complex / small nuclear ribonucleoprotein complex / P granule / pre-mRNA binding / sno(s)RNA-containing ribonucleoprotein complex / ATP-dependent activity, acting on RNA / SMN-Sm protein complex / embryonic cranial skeleton morphogenesis / mRNA cis splicing, via spliceosome / U2-type spliceosomal complex / telomerase RNA binding / U2-type precatalytic spliceosome / positive regulation of mRNA splicing, via spliceosome / telomerase holoenzyme complex / C2H2 zinc finger domain binding / regulation of mRNA splicing, via spliceosome / U2-type prespliceosome assembly / U2-type catalytic step 2 spliceosome / commitment complex / positive regulation by host of viral transcription / U4 snRNP / positive regulation of vitamin D receptor signaling pathway / Transport of Mature mRNA derived from an Intron-Containing Transcript / Notch binding / U2 snRNP / nuclear vitamin D receptor binding / Regulation of gene expression in late stage (branching morphogenesis) pancreatic bud precursor cells / RNA Polymerase II Transcription Termination / RUNX3 regulates NOTCH signaling / U1 snRNP / NOTCH4 Intracellular Domain Regulates Transcription / U2-type prespliceosome / ubiquitin-ubiquitin ligase activity / nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay / K63-linked polyubiquitin modification-dependent protein binding / WD40-repeat domain binding / NOTCH3 Intracellular Domain Regulates Transcription / exploration behavior / positive regulation of neurogenesis / lipid biosynthetic process / precatalytic spliceosome / nuclear androgen receptor binding / cyclosporin A binding / negative regulation of type I interferon-mediated signaling pathway / regulation of alternative mRNA splicing, via spliceosome / spliceosomal complex assembly / negative regulation of NF-kappaB transcription factor activity / protein kinase inhibitor activity
類似検索 - 分子機能
FAM192A/Fyv6, N-terminal / PSME3-interacting protein / FAM192A/Fyv6, N-terminal domain / Protein FAM32A / Cactin, central domain / Cactin, C-terminal / FAM32A / Cactus-binding C-terminus of cactin protein / Conserved mid region of cactin / PRKR-interacting protein 1 ...FAM192A/Fyv6, N-terminal / PSME3-interacting protein / FAM192A/Fyv6, N-terminal domain / Protein FAM32A / Cactin, central domain / Cactin, C-terminal / FAM32A / Cactus-binding C-terminus of cactin protein / Conserved mid region of cactin / PRKR-interacting protein 1 / Protein of unknown function (DUF1168) / CASC3/Barentsz eIF4AIII binding / CASC3/Barentsz eIF4AIII binding / Btz domain / Pre-mRNA-splicing factor SLU7 domain / Pre-mRNA-splicing factor SLU7 / Pre-mRNA splicing Prp18-interacting factor / DHX8/ Prp22, DEXH-box helicase domain / Mago nashi protein / RNA-binding motif protein 8 / RBM8, RNA recognition motif / Mago nashi superfamily / Mago nashi protein / : / : / : / : / Intron-binding protein aquarius, beta-barrel / Intron-binding protein aquarius insert domain / : / Pre-mRNA-splicing factor SPF27 / Breast carcinoma amplified sequence 2 (BCAS2) / CWF11 family / Intron-binding protein aquarius, N-terminal / Intron-binding protein aquarius N-terminal / Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase E / Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase E, RNA recognition motif / mRNA splicing factor SYF2 / SYF2 splicing factor / Cactus-binding C-terminus of cactin protein / U2 small nuclear ribonucleoprotein B'', RNA recognition motif 2 / U2 small nuclear ribonucleoprotein B'', RNA recognition motif 1 / Cyclophilin-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin A-like / mRNA splicing factor Cwf21 domain / cwf21 domain / Pre-mRNA-processing factor 17 / : / STL11, N-terminal / Pre-mRNA-splicing factor 19 / Pre-mRNA-processing factor 19 / : / Prp19/Pso4-like / DNA2/NAM7 helicase, helicase domain / DNA2/NAM7-like helicase / AAA domain / WD repeat Prp46/PLRG1-like / U-box domain / BUD31/G10-related, conserved site / : / : / G10 protein signature 1. / G10 protein signature 2. / SKI-interacting protein SKIP, SNW domain / SKI-interacting protein, SKIP / SKIP/SNW domain / Myb-like DNA-binding domain / Pre-mRNA-splicing factor Cwf15/Cwc15 / HAT (Half-A-TPR) repeat / Cwf15/Cwc15 cell cycle control protein / Pre-mRNA-splicing factor Cwc2/Slt11 / G10 protein / Pre-mRNA-splicing factor BUD31 / Pre-mRNA splicing factor component Cdc5p/Cef1, C-terminal / pre-mRNA splicing factor component / Small ribonucleoprotein associated, SmB/SmN / Initiation factor eIF-4 gamma, MA3 / MA3 domain / MI domain profile. / Domain in DAP-5, eIF4G, MA-3 and other proteins. / MIF4G domain / Spt5 C-terminal domain / Spt5 C-terminal nonapeptide repeat binding Spt4 / Small nuclear ribonucleoprotein D1 / U-box domain profile. / U2A'/phosphoprotein 32 family A, C-terminal / occurring C-terminal to leucine-rich repeats / Middle domain of eukaryotic initiation factor 4G (eIF4G) / MIF4G-like, type 3 / ロイシンリッチリピート / Modified RING finger domain / Pre-mRNA-splicing factor Syf1-like / U-box domain / Zinc finger, CCCH-type superfamily / Snu114, GTP-binding domain / 116kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, N-terminal / 116kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, C-terminal / 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component N-terminus / : / Helicase associated domain (HA2), ratchet-like / ジンクフィンガー
類似検索 - ドメイン・相同性
Protein CASC3 / Pleiotropic regulator 1 / RNA helicase aquarius / Pre-mRNA-processing factor 17 / Pre-mRNA-splicing factor SPF27 / Pre-mRNA-splicing factor SLU7 / Pre-mRNA-splicing factor SYF2 / U2 small nuclear ribonucleoprotein B'' / U2 small nuclear ribonucleoprotein A' / Small nuclear ribonucleoprotein-associated proteins B and B' ...Protein CASC3 / Pleiotropic regulator 1 / RNA helicase aquarius / Pre-mRNA-processing factor 17 / Pre-mRNA-splicing factor SPF27 / Pre-mRNA-splicing factor SLU7 / Pre-mRNA-splicing factor SYF2 / U2 small nuclear ribonucleoprotein B'' / U2 small nuclear ribonucleoprotein A' / Small nuclear ribonucleoprotein-associated proteins B and B' / Eukaryotic initiation factor 4A-III / Protein BUD31 homolog / Protein mago nashi homolog / Small nuclear ribonucleoprotein E / Small nuclear ribonucleoprotein F / Small nuclear ribonucleoprotein G / Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1 / Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2 / Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3 / SNW domain-containing protein 1 / ATP-dependent RNA helicase DHX8 / 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component / Pre-mRNA-processing-splicing factor 8 / Splicing factor Cactin / U5 small nuclear ribonucleoprotein 40 kDa protein / Cell division cycle 5-like protein / Crooked neck-like protein 1 / PSME3-interacting protein / PRKR-interacting protein 1 / Pre-mRNA-splicing factor CWC22 homolog / Pre-mRNA-splicing factor SYF1 / Pre-mRNA-splicing factor RBM22 / Spliceosome-associated protein CWC15 homolog / Pre-mRNA-processing factor 19 / Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase E / Serine/arginine repetitive matrix protein 2 / Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase-like 1 / Protein FAM32A / RNA-binding protein 8A
類似検索 - 構成要素
生物種Homo sapiens (ヒト) / human (ヒト) / unidentified adenovirus (ウイルス)
手法単粒子再構成法 / クライオ電子顕微鏡法 / 解像度: 3.6 Å
データ登録者Zhan X / Lu Y / Shi Y
資金援助 中国, 1件
OrganizationGrant number
National Natural Science Foundation of China (NSFC) 中国
引用ジャーナル: Mol Cell / : 2022
タイトル: Mechanism of exon ligation by human spliceosome.
著者: Xiechao Zhan / Yichen Lu / Xiaofeng Zhang / Chuangye Yan / Yigong Shi /
要旨: Pre-mRNA splicing involves two sequential reactions: branching and exon ligation. The C complex after branching undergoes remodeling to become the C complex, which executes exon ligation. Here, we ...Pre-mRNA splicing involves two sequential reactions: branching and exon ligation. The C complex after branching undergoes remodeling to become the C complex, which executes exon ligation. Here, we report cryo-EM structures of two intermediate human spliceosomal complexes, pre-C-I and pre-C-II, both at 3.6 Å. In both structures, the 3' splice site is already docked into the active site, the ensuing 3' exon sequences are anchored on PRP8, and the step II factor FAM192A contacts the duplex between U2 snRNA and the branch site. In the transition of pre-C-I to pre-C-II, the step II factors Cactin, FAM32A, PRKRIP1, and SLU7 are recruited. Notably, the RNA helicase PRP22 is positioned quite differently in the pre-C-I, pre-C-II, and C complexes, suggesting a role in 3' exon binding and proofreading. Together with information on human C and C complexes, our studies recapitulate a molecular choreography of the C-to-C transition, revealing mechanistic insights into exon ligation.
履歴
登録2021年11月29日-
ヘッダ(付随情報) 公開2022年6月22日-
マップ公開2022年6月22日-
更新2022年8月17日-
現状2022年8月17日処理サイト: PDBj / 状態: 公開

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構造の表示

添付画像

ダウンロードとリンク

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マップ

ファイルダウンロード / ファイル: emd_32319.map.gz / 形式: CCP4 / 大きさ: 244.1 MB / タイプ: IMAGE STORED AS FLOATING POINT NUMBER (4 BYTES)
注釈The cryo-EM map of human pre-C*-II complex
ボクセルのサイズX=Y=Z: 1.338 Å
密度
表面レベル登録者による: 0.39
最小 - 最大-1.6002729 - 3.50466
平均 (標準偏差)0.012822298 (±0.09330014)
対称性空間群: 1
詳細

EMDB XML:

マップ形状
Axis orderXYZ
Origin000
サイズ400400400
Spacing400400400
セルA=B=C: 535.2 Å
α=β=γ: 90.0 °

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添付データ

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試料の構成要素

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全体 : Human pre-C*-II complex

全体名称: Human pre-C*-II complex
要素
  • 複合体: Human pre-C*-II complex
    • タンパク質・ペプチド: Pre-mRNA-processing-splicing factor 8
    • RNA: U5 snRNA
    • タンパク質・ペプチド: 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component
    • タンパク質・ペプチド: U5 small nuclear ribonucleoprotein 40 kDa protein
    • RNA: U6 snRNA
    • RNA: U2 snRNA
    • タンパク質・ペプチド: Pre-mRNA-splicing factor SYF1
    • タンパク質・ペプチド: Crooked neck-like protein 1
    • タンパク質・ペプチド: Pre-mRNA-splicing factor SPF27
    • タンパク質・ペプチド: Cell division cycle 5-like protein
    • タンパク質・ペプチド: Pre-mRNA-splicing factor SYF2
    • タンパク質・ペプチド: Protein BUD31 homolog
    • タンパク質・ペプチド: Pre-mRNA-splicing factor RBM22
    • タンパク質・ペプチド: Spliceosome-associated protein CWC15 homolog
    • タンパク質・ペプチド: RNA helicase aquarius
    • タンパク質・ペプチド: SNW domain-containing protein 1
    • タンパク質・ペプチド: Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase-like 1
    • タンパク質・ペプチド: Pleiotropic regulator 1
    • タンパク質・ペプチド: Serine/arginine repetitive matrix protein 2
    • タンパク質・ペプチド: Pre-mRNA-splicing factor CWC22 homolog
    • タンパク質・ペプチド: Pre-mRNA-processing factor 17
    • タンパク質・ペプチド: PSME3-interacting protein
    • タンパク質・ペプチド: ATP-dependent RNA helicase DHX8
    • タンパク質・ペプチド: Cactin
    • タンパク質・ペプチド: PRKR-interacting protein 1
    • タンパク質・ペプチド: Protein FAM32A
    • タンパク質・ペプチド: Small nuclear ribonucleoprotein-associated proteins B and B'
    • タンパク質・ペプチド: Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase E
    • タンパク質・ペプチド: Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3
    • タンパク質・ペプチド: Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1
    • タンパク質・ペプチド: Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2
    • タンパク質・ペプチド: Small nuclear ribonucleoprotein F
    • タンパク質・ペプチド: Small nuclear ribonucleoprotein E
    • タンパク質・ペプチド: Small nuclear ribonucleoprotein G
    • タンパク質・ペプチド: Protein mago nashi homolog
    • タンパク質・ペプチド: RNA-binding protein 8A
    • タンパク質・ペプチド: Eukaryotic initiation factor 4A-III
    • タンパク質・ペプチド: Protein CASC3
    • タンパク質・ペプチド: Pre-mRNA-processing factor 19
    • タンパク質・ペプチド: U2 small nuclear ribonucleoprotein A'
    • タンパク質・ペプチド: U2 small nuclear ribonucleoprotein B''
    • タンパク質・ペプチド: Pre-mRNA-splicing factor SLU7
  • RNA: Pre-mRNA一次転写産物
  • RNA: Pre-mRNA一次転写産物
  • リガンド: INOSITOL HEXAKISPHOSPHATEフィチン酸
  • リガンド: GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATEグアノシン三リン酸
  • リガンド: MAGNESIUM ION
  • リガンド: ZINC ION
  • リガンド: ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE

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超分子 #1: Human pre-C*-II complex

超分子名称: Human pre-C*-II complex / タイプ: complex / ID: 1 / 親要素: 0 / 含まれる分子: #1-#5, #8-#44
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)

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分子 #1: Pre-mRNA-processing-splicing factor 8

分子名称: Pre-mRNA-processing-splicing factor 8 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 1 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: human (ヒト)
分子量理論値: 273.97425 KDa
配列文字列: MAGVFPYRGP GNPVPGPLAP LPDYMSEEKL QEKARKWQQL QAKRYAEKRK FGFVDAQKED MPPEHVRKII RDHGDMTNRK FRHDKRVYL GALKYMPHAV LKLLENMPMP WEQIRDVPVL YHITGAISFV NEIPWVIEPV YISQWGSMWI MMRREKRDRR H FKRMRFPP ...文字列:
MAGVFPYRGP GNPVPGPLAP LPDYMSEEKL QEKARKWQQL QAKRYAEKRK FGFVDAQKED MPPEHVRKII RDHGDMTNRK FRHDKRVYL GALKYMPHAV LKLLENMPMP WEQIRDVPVL YHITGAISFV NEIPWVIEPV YISQWGSMWI MMRREKRDRR H FKRMRFPP FDDEEPPLDY ADNILDVEPL EAIQLELDPE EDAPVLDWFY DHQPLRDSRK YVNGSTYQRW QFTLPMMSTL YR LANQLLT DLVDDNYFYL FDLKAFFTSK ALNMAIPGGP KFEPLVRDIN LQDEDWNEFN DINKIIIRQP IRTEYKIAFP YLY NNLPHH VHLTWYHTPN VVFIKTEDPD LPAFYFDPLI NPISHRHSVK SQEPLPDDDE EFELPEFVEP FLKDTPLYTD NTAN GIALL WAPRPFNLRS GRTRRALDIP LVKNWYREHC PAGQPVKVRV SYQKLLKYYV LNALKHRPPK AQKKRYLFRS FKATK FFQS TKLDWVEVGL QVCRQGYNML NLLIHRKNLN YLHLDYNFNL KPVKTLTTKE RKKSRFGNAF HLCREVLRLT KLVVDS HVQ YRLGNVDAFQ LADGLQYIFA HVGQLTGMYR YKYKLMRQIR MCKDLKHLIY YRFNTGPVGK GPGCGFWAAG WRVWLFF MR GITPLLERWL GNLLARQFEG RHSKGVAKTV TKQRVESHFD LELRAAVMHD ILDMMPEGIK QNKARTILQH LSEAWRCW K ANIPWKVPGL PTPIENMILR YVKAKADWWT NTAHYNRERI RRGATVDKTV CKKNLGRLTR LYLKAEQERQ HNYLKDGPY ITAEEAVAVY TTTVHWLESR RFSPIPFPPL SYKHDTKLLI LALERLKEAY SVKSRLNQSQ REELGLIEQA YDNPHEALSR IKRHLLTQR AFKEVGIEFM DLYSHLVPVY DVEPLEKITD AYLDQYLWYE ADKRRLFPPW IKPADTEPPP LLVYKWCQGI N NLQDVWET SEGECNVMLE SRFEKMYEKI DLTLLNRLLR LIVDHNIADY MTAKNNVVIN YKDMNHTNSY GIIRGLQFAS FI VQYYGLV MDLLVLGLHR ASEMAGPPQM PNDFLSFQDI ATEAAHPIRL FCRYIDRIHI FFRFTADEAR DLIQRYLTEH PDP NNENIV GYNNKKCWPR DARMRLMKHD VNLGRAVFWD IKNRLPRSVT TVQWENSFVS VYSKDNPNLL FNMCGFECRI LPKC RTSYE EFTHKDGVWN LQNEVTKERT AQCFLRVDDE SMQRFHNRVR QILMASGSTT FTKIVNKWNT ALIGLMTYFR EAVVN TQEL LDLLVKCENK IQTRIKIGLN SKMPSRFPPV VFYTPKELGG LGMLSMGHVL IPQSDLRWSK QTDVGITHFR SGMSHE EDQ LIPNLYRYIQ PWESEFIDSQ RVWAEYALKR QEAIAQNRRL TLEDLEDSWD RGIPRINTLF QKDRHTLAYD KGWRVRT DF KQYQVLKQNP FWWTHQRHDG KLWNLNNYRT DMIQALGGVE GILEHTLFKG TYFPTWEGLF WEKASGFEES MKWKKLTN A QRSGLNQIPN RRFTLWWSPT INRANVYVGF QVQLDLTGIF MHGKIPTLKI SLIQIFRAHL WQKIHESIVM DLCQVFDQE LDALEIETVQ KETIHPRKSY KMNSSCADIL LFASYKWNVS RPSLLADSKD VMDSTTTQKY WIDIQLRWGD YDSHDIERYA RAKFLDYTT DNMSIYPSPT GVLIAIDLAY NLHSAYGNWF PGSKPLIQQA MAKIMKANPA LYVLRERIRK GLQLYSSEPT E PYLSSQNY GELFSNQIIW FVDDTNVYRV TIHKTFEGNL TTKPINGAIF IFNPRTGQLF LKIIHTSVWA GQKRLGQLAK WK TAEEVAA LIRSLPVEEQ PKQIIVTRKG MLDPLEVHLL DFPNIVIKGS ELQLPFQACL KVEKFGDLIL KATEPQMVLF NLY DDWLKT ISSYTAFSRL ILILRALHVN NDRAKVILKP DKTTITEPHH IWPTLTDEEW IKVEVQLKDL ILADYGKKNN VNVA SLTQS EIRDIILGME ISAPSQQRQQ IAEIEKQTKE QSQLTATQTR TVNKHGDEII TSTTSNYETQ TFSSKTEWRV RAISA ANLH LRTNHIYVSS DDIKETGYTY ILPKNVLKKF ICISDLRAQI AGYLYGVSPP DNPQVKEIRC IVMVPQWGTH QTVHLP GQL PQHEYLKEME PLGWIHTQPN ESPQLSPQDV TTHAKIMADN PSWDGEKTII ITCSFTPGSC TLTAYKLTPS GYEWGRQ NT DKGNNPKGYL PSHYERVQML LSDRFLGFFM VPAQSSWNYN FMGVRHDPNM KYELQLANPK EFYHEVHRPS HFLNFALL Q EGEVYSADRE DLYA

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分子 #3: 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component

分子名称: 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component
タイプ: protein_or_peptide / ID: 3 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: human (ヒト)
分子量理論値: 109.560625 KDa
配列文字列: MDTDLYDEFG NYIGPELDSD EDDDELGRET KDLDEMDDDD DDDDVGDHDD DHPGMEVVLH EDKKYYPTAE EVYGPEVETI VQEEDTQPL TEPIIKPVKT KKFTLMEQTL PVTVYEMDFL ADLMDNSELI RNVTLCGHLH HGKTCFVDCL IEQTHPEIRK R YDQDLCYT ...文字列:
MDTDLYDEFG NYIGPELDSD EDDDELGRET KDLDEMDDDD DDDDVGDHDD DHPGMEVVLH EDKKYYPTAE EVYGPEVETI VQEEDTQPL TEPIIKPVKT KKFTLMEQTL PVTVYEMDFL ADLMDNSELI RNVTLCGHLH HGKTCFVDCL IEQTHPEIRK R YDQDLCYT DILFTEQERG VGIKSTPVTV VLPDTKGKSY LFNIMDTPGH VNFSDEVTAG LRISDGVVLF IDAAEGVMLN TE RLIKHAV QERLAVTVCI NKIDRLILEL KLPPTDAYYK LRHIVDEVNG LISMYSTDEN LILSPLLGNV CFSSSQYSIC FTL GSFAKI YADTFGDINY QEFAKRLWGD IYFNPKTRKF TKKAPTSSSQ RSFVEFILEP LYKILAQVVG DVDTSLPRTL DELG IHLTK EELKLNIRPL LRLVCKKFFG EFTGFVDMCV QHIPSPKVGA KPKIEHTYTG GVDSDLGEAM SDCDPDGPLM CHTTK MYST DDGVQFHAFG RVLSGTIHAG QPVKVLGENY TLEDEEDSQI CTVGRLWISV ARYHIEVNRV PAGNWVLIEG VDQPIV KTA TITEPRGNEE AQIFRPLKFN TTSVIKIAVE PVNPSELPKM LDGLRKVNKS YPSLTTKVEE SGEHVILGTG ELYLDCV MH DLRKMYSEID IKVADPVVTF CETVVETSSL KCFAETPNKK NKITMIAEPL EKGLAEDIEN EVVQITWNRK KLGEFFQT K YDWDLLAARS IWAFGPDATG PNILVDDTLP SEVDKALLGS VKDSIVQGFQ WGTREGPLCD ELIRNVKFKI LDAVVAQEP LHRGGGQIIP TARRVVYSAF LMATPRLMEP YYFVEVQAPA DCVSAVYTVL ARRRGHVTQD APIPGSPLYT IKAFIPAIDS FGFETDLRT HTQGQAFSLS VFHHWQIVPG DPLDKSIVIR PLEPQPAPHL AREFMIKTRR RKGLSEDVSI SKFFDDPMLL E LAKQDVVL NYPM

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分子 #4: U5 small nuclear ribonucleoprotein 40 kDa protein

分子名称: U5 small nuclear ribonucleoprotein 40 kDa protein / タイプ: protein_or_peptide / ID: 4 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: human (ヒト)
分子量理論値: 39.359492 KDa
配列文字列: MIEQQKRKGP ELPLVPVKRQ RHELLLGAGS GPGAGQQQAT PGALLQAGPP RCSSLQAPIM LLSGHEGEVY CCKFHPNGST LASAGFDRL ILLWNVYGDC DNYATLKGHS GAVMELHYNT DGSMLFSAST DKTVAVWDSE TGERVKRLKG HTSFVNSCYP A RRGPQLVC ...文字列:
MIEQQKRKGP ELPLVPVKRQ RHELLLGAGS GPGAGQQQAT PGALLQAGPP RCSSLQAPIM LLSGHEGEVY CCKFHPNGST LASAGFDRL ILLWNVYGDC DNYATLKGHS GAVMELHYNT DGSMLFSAST DKTVAVWDSE TGERVKRLKG HTSFVNSCYP A RRGPQLVC TGSDDGTVKL WDIRKKAAIQ TFQNTYQVLA VTFNDTSDQI ISGGIDNDIK VWDLRQNKLT YTMRGHADSV TG LSLSSEG SYLLSNAMDN TVRVWDVRPF APKERCVKIF QGNVHNFEKN LLRCSWSPDG SKIAAGSADR FVYVWDTTSR RIL YKLPGH AGSINEVAFH PDEPIIISAS SDKRLYMGEI Q

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分子 #9: Pre-mRNA-splicing factor SYF1

分子名称: Pre-mRNA-splicing factor SYF1 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 9 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: human (ヒト)
分子量理論値: 100.148711 KDa
配列文字列: MVVMARLSRP ERPDLVFEEE DLPYEEEIMR NQFSVKCWLR YIEFKQGAPK PRLNQLYERA LKLLPCSYKL WYRYLKARRA QVKHRCVTD PAYEDVNNCH ERAFVFMHKM PRLWLDYCQF LMDQGRVTHT RRTFDRALRA LPITQHSRIW PLYLRFLRSH P LPETAVRG ...文字列:
MVVMARLSRP ERPDLVFEEE DLPYEEEIMR NQFSVKCWLR YIEFKQGAPK PRLNQLYERA LKLLPCSYKL WYRYLKARRA QVKHRCVTD PAYEDVNNCH ERAFVFMHKM PRLWLDYCQF LMDQGRVTHT RRTFDRALRA LPITQHSRIW PLYLRFLRSH P LPETAVRG YRRFLKLSPE SAEEYIEYLK SSDRLDEAAQ RLATVVNDER FVSKAGKSNY QLWHELCDLI SQNPDKVQSL NV DAIIRGG LTRFTDQLGK LWCSLADYYI RSGHFEKARD VYEEAIRTVM TVRDFTQVFD SYAQFEESMI AAKMETASEL GRE EEDDVD LELRLARFEQ LISRRPLLLN SVLLRQNPHH VHEWHKRVAL HQGRPREIIN TYTEAVQTVD PFKATGKPHT LWVA FAKFY EDNGQLDDAR VILEKATKVN FKQVDDLASV WCQCGELELR HENYDEALRL LRKATALPAR RAEYFDGSEP VQNRV YKSL KVWSMLADLE ESLGTFQSTK AVYDRILDLR IATPQIVINY AMFLEEHKYF EESFKAYERG ISLFKWPNVS DIWSTY LTK FIARYGGRKL ERARDLFEQA LDGCPPKYAK TLYLLYAQLE EEWGLARHAM AVYERATRAV EPAQQYDMFN IYIKRAA EI YGVTHTRGIY QKAIEVLSDE HAREMCLRFA DMECKLGEID RARAIYSFCS QICDPRTTGA FWQTWKDFEV RHGNEDTI K EMLRIRRSVQ ATYNTQVNFM ASQMLKVSGS ATGTVSDLAP GQSGMDDMKL LEQRAEQLAA EAERDQPLRA QSKILFVRS DASREELAEL AQQVNPEEIQ LGEDEDEDEM DLEPNEVRLE QQSVPAAVFG SLKED

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分子 #10: Crooked neck-like protein 1

分子名称: Crooked neck-like protein 1 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 10 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: human (ヒト)
分子量理論値: 100.610008 KDa
配列文字列: MTATVENLTF QKDTLGNAVD KNTSRLELRS YSLAGRHGST EPLVLAWSSQ FRRLTWGCAL DALHRSPCVA ASQHGVTHLI RSSRTPHST RCRKEDAQPG HHGNGAASVT AQARGQRSVL QVPLPVPRSC LFSESFVVSV SSQSRFLASV PGTGVQRSTA A DMAASTAA ...文字列:
MTATVENLTF QKDTLGNAVD KNTSRLELRS YSLAGRHGST EPLVLAWSSQ FRRLTWGCAL DALHRSPCVA ASQHGVTHLI RSSRTPHST RCRKEDAQPG HHGNGAASVT AQARGQRSVL QVPLPVPRSC LFSESFVVSV SSQSRFLASV PGTGVQRSTA A DMAASTAA GKQRIPKVAK VKNKAPAEVQ ITAEQLLREA KERELELLPP PPQQKITDEE ELNDYKLRKR KTFEDNIRKN RT VISNWIK YAQWEESLKE IQRARSIYER ALDVDYRNIT LWLKYAEMEM KNRQVNHARN IWDRAITTLP RVNQFWYKYT YME EMLGNV AGARQVFERW MEWQPEEQAW HSYINFELRY KEVDRARTIY ERFVLVHPDV KNWIKYARFE EKHAYFAHAR KVYE RAVEF FGDEHMDEHL YVAFAKFEEN QKEFERVRVI YKYALDRISK QDAQELFKNY TIFEKKFGDR RGIEDIIVSK RRFQY EEEV KANPHNYDAW FDYLRLVESD AEAEAVREVY ERAIANVPPI QEKRHWKRYI YLWINYALYE ELEAKDPERT RQVYQA SLE LIPHKKFTFA KMWILYAQFE IRQKNLSLAR RALGTSIGKC PKNKLFKVYI ELELQLREFD RCRKLYEKFL EFGPENC TS WIKFAELETI LGDIDRARAI YELAISQPRL DMPEVLWKSY IDFEIEQEET ERTRNLYRRL LQRTQHVKVW ISFAQFEL S SGKEGSLTKC RQIYEEANKT MRNCEEKEER LMLLESWRSF EEEFGTASDK ERVDKLMPEK VKKRRKVQTD DGSDAGWEE YFDYIFPEDA ANQPNLKLLA MAKLWKKQQQ EKEDAEHHPD EDVDESES

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分子 #11: Pre-mRNA-splicing factor SPF27

分子名称: Pre-mRNA-splicing factor SPF27 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 11 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: human (ヒト)
分子量理論値: 26.16342 KDa
配列文字列: MAGTGLVAGE VVVDALPYFD QGYEAPGVRE AAAALVEEET RRYRPTKNYL SYLTAPDYSA FETDIMRNEF ERLAARQPIE LLSMKRYEL PAPSSGQKND ITAWQECVNN SMAQLEHQAV RIENLELMSQ HGCNAWKVYN ENLVHMIEHA QKELQKLRKH I QDLNWQRK ...文字列:
MAGTGLVAGE VVVDALPYFD QGYEAPGVRE AAAALVEEET RRYRPTKNYL SYLTAPDYSA FETDIMRNEF ERLAARQPIE LLSMKRYEL PAPSSGQKND ITAWQECVNN SMAQLEHQAV RIENLELMSQ HGCNAWKVYN ENLVHMIEHA QKELQKLRKH I QDLNWQRK NMQLTAGSKL REMESNWVSL VSKNYEIERT IVQLENEIYQ IKQQHGEANK ENIRQDF

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分子 #12: Cell division cycle 5-like protein

分子名称: Cell division cycle 5-like protein / タイプ: protein_or_peptide / ID: 12 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: human (ヒト)
分子量理論値: 92.406883 KDa
配列文字列: MPRIMIKGGV WRNTEDEILK AAVMKYGKNQ WSRIASLLHR KSAKQCKARW YEWLDPSIKK TEWSREEEEK LLHLAKLMPT QWRTIAPII GRTAAQCLEH YEFLLDKAAQ RDNEEETTDD PRKLKPGEID PNPETKPARP DPIDMDEDEL EMLSEARARL A NTQGKKAK ...文字列:
MPRIMIKGGV WRNTEDEILK AAVMKYGKNQ WSRIASLLHR KSAKQCKARW YEWLDPSIKK TEWSREEEEK LLHLAKLMPT QWRTIAPII GRTAAQCLEH YEFLLDKAAQ RDNEEETTDD PRKLKPGEID PNPETKPARP DPIDMDEDEL EMLSEARARL A NTQGKKAK RKAREKQLEE ARRLAALQKR RELRAAGIEI QKKRKRKRGV DYNAEIPFEK KPALGFYDTS EENYQALDAD FR KLRQQDL DGELRSEKEG RDRKKDKQHL KRKKESDLPS AILQTSGVSE FTKKRSKLVL PAPQISDAEL QEVVKVGQAS EIA RQTAEE SGITNSASST LLSEYNVTNN SVALRTPRTP ASQDRILQEA QNLMALTNVD TPLKGGLNTP LHESDFSGVT PQRQ VVQTP NTVLSTPFRT PSNGAEGLTP RSGTTPKPVI NSTPGRTPLR DKLNINPEDG MADYSDPSYV KQMERESREH LRLGL LGLP APKNDFEIVL PENAEKELEE REIDDTYIED AADVDARKQA IRDAERVKEM KRMHKAVQKD LPRPSEVNET ILRPLN VEP PLTDLQKSEE LIKKEMITML HYDLLHHPYE PSGNKKGKTV GFGTNNSEHI TYLEHNPYEK FSKEELKKAQ DVLVQEM EV VKQGMSHGEL SSEAYNQVWE ECYSQVLYLP GQSRYTRANL ASKKDRIESL EKRLEINRGH MTTEAKRAAK MEKKMKIL L GGYQSRAMGL MKQLNDLWDQ IEQAHLELRT FEELKKHEDS AIPRRLECLK EDVQRQQERE KELQHRYADL LLEKETLKS KF

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分子 #13: Pre-mRNA-splicing factor SYF2

分子名称: Pre-mRNA-splicing factor SYF2 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 13 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: human (ヒト)
分子量理論値: 28.780518 KDa
配列文字列: MAAIAASEVL VDSAEEGSLA AAAELAAQKR EQRLRKFREL HLMRNEARKL NHQEVVEEDK RLKLPANWEA KKARLEWELK EEEKKKECA ARGEDYEKVK LLEISAEDAE RWERKKKRKN PDLGFSDYAA AQLRQYHRLT KQIKPDMETY ERLREKHGEE F FPTSNSLL ...文字列:
MAAIAASEVL VDSAEEGSLA AAAELAAQKR EQRLRKFREL HLMRNEARKL NHQEVVEEDK RLKLPANWEA KKARLEWELK EEEKKKECA ARGEDYEKVK LLEISAEDAE RWERKKKRKN PDLGFSDYAA AQLRQYHRLT KQIKPDMETY ERLREKHGEE F FPTSNSLL HGTHVPSTEE IDRMVIDLEK QIEKRDKYSR RRPYNDDADI DYINERNAKF NKKAERFYGK YTAEIKQNLE RG TAV

+
分子 #14: Protein BUD31 homolog

分子名称: Protein BUD31 homolog / タイプ: protein_or_peptide / ID: 14 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: human (ヒト)
分子量理論値: 17.03285 KDa
配列文字列:
MPKVKRSRKA PPDGWELIEP TLDELDQKMR EAETEPHEGK RKVESLWPIF RIHHQKTRYI FDLFYKRKAI SRELYEYCIK EGYADKNLI AKWKKQGYEN LCCLRCIQTR DTNFGTNCIC RVPKSKLEVG RIIECTHCGC RGCSG

+
分子 #15: Pre-mRNA-splicing factor RBM22

分子名称: Pre-mRNA-splicing factor RBM22 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 15 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: human (ヒト)
分子量理論値: 46.959555 KDa
配列文字列: MATSLGSNTY NRQNWEDADF PILCQTCLGE NPYIRMTKEK YGKECKICAR PFTVFRWCPG VRMRFKKTEV CQTCSKLKNV CQTCLLDLE YGLPIQVRDA GLSFKDDMPK SDVNKEYYTQ NMEREISNSD GTRPVGMLGK ATSTSDMLLK LARTTPYYKR N RPHICSFW ...文字列:
MATSLGSNTY NRQNWEDADF PILCQTCLGE NPYIRMTKEK YGKECKICAR PFTVFRWCPG VRMRFKKTEV CQTCSKLKNV CQTCLLDLE YGLPIQVRDA GLSFKDDMPK SDVNKEYYTQ NMEREISNSD GTRPVGMLGK ATSTSDMLLK LARTTPYYKR N RPHICSFW VKGECKRGEE CPYRHEKPTD PDDPLADQNI KDRYYGINDP VADKLLKRAS TMPRLDPPED KTITTLYVGG LG DTITETD LRNHFYQFGE IRTITVVQRQ QCAFIQFATR QAAEVAAEKS FNKLIVNGRR LNVKWGRSQA ARGKEKEKDG TTD SGIKLE PVPGLPGALP PPPAAEEEAS ANYFNLPPSG PPAVVNIALP PPPGIAPPPP PGFGPHMFHP MGPPPPFMRA PGPI HYPSQ DPQRMGAHAG KHSSP

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分子 #16: Spliceosome-associated protein CWC15 homolog

分子名称: Spliceosome-associated protein CWC15 homolog / タイプ: protein_or_peptide / ID: 16 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: human (ヒト)
分子量理論値: 26.674447 KDa
配列文字列: MTTAARPTFE PARGGRGKGE GDLSQLSKQY SSRDLPSHTK IKYRQTTQDA PEEVRNRDFR RELEERERAA AREKNRDRPT REHTTSSSV SKKPRLDQIP AANLDADDPL TDEEDEDFEE ESDDDDTAAL LAELEKIKKE RAEEQARKEQ EQKAEEERIR M ENILSGNP ...文字列:
MTTAARPTFE PARGGRGKGE GDLSQLSKQY SSRDLPSHTK IKYRQTTQDA PEEVRNRDFR RELEERERAA AREKNRDRPT REHTTSSSV SKKPRLDQIP AANLDADDPL TDEEDEDFEE ESDDDDTAAL LAELEKIKKE RAEEQARKEQ EQKAEEERIR M ENILSGNP LLNLTGPSQP QANFKVKRRW DDDVVFKNCA KGVDDQKKDK RFVNDTLRSE FHKKFMEKYI K

+
分子 #17: RNA helicase aquarius

分子名称: RNA helicase aquarius / タイプ: protein_or_peptide / ID: 17 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO / EC番号: ヘリカーゼ
由来(天然)生物種: human (ヒト)
分子量理論値: 171.502453 KDa
配列文字列: MAAPAQPKKI VAPTVSQINA EFVTQLACKY WAPHIKKKSP FDIKVIEDIY EKEIVKSRFA IRKIMLLEFS QYLENYLWMN YSPEVSSKA YLMSICCMVN EKFRENVPAW EIFKKKPDHF PFFFKHILKA ALAETDGEFS LHEQTVLLLF LDHCFNSLEV D LIRSQVQQ ...文字列:
MAAPAQPKKI VAPTVSQINA EFVTQLACKY WAPHIKKKSP FDIKVIEDIY EKEIVKSRFA IRKIMLLEFS QYLENYLWMN YSPEVSSKA YLMSICCMVN EKFRENVPAW EIFKKKPDHF PFFFKHILKA ALAETDGEFS LHEQTVLLLF LDHCFNSLEV D LIRSQVQQ LISLPMWMGL QLARLELELK KTPKLRKFWN LIKKNDEKMD PEAREQAYQE RRFLSQLIQK FISVLKSVPL SE PVTMDKV HYCERFIELM IDLEALLPTR RWFNTILDDS HLLVHCYLSN LVRREEDGHL FSQLLDMLKF YTGFEINDQT GNA LTENEM TTIHYDRITS LQRAAFAHFP ELYDFALSNV AEVDTRESLV KFFGPLSSNT LHQVASYLCL LPTLPKNEDT TFDK EFLLE LLVSRHERRI SQIQQLNQMP LYPTEKIIWD ENIVPTEYYS GEGCLALPKL NLQFLTLHDY LLRNFNLFRL ESTYE IRQD IEDSVSRMKP WQSEYGGVVF GGWARMAQPI VAFTVVEVAK PNIGENWPTR VRADVTINLN VRDHIKDEWE GLRKHD VCF LITVRPTKPY GTKFDRRRPF IEQVGLVYVR GCEIQGMLDD KGRVIEDGPE PRPNLRGESR TFRVFLDPNQ YQQDMTN TI QNGAEDVYET FNIIMRRKPK ENNFKAVLET IRNLMNTDCV VPDWLHDIIL GYGDPSSAHY SKMPNQIATL DFNDTFLS I EHLKASFPGH NVKVTVEDPA LQIPPFRITF PVRSGKGKKR KDADVEDEDT EEAKTLIVEP HVIPNRGPYP YNQPKRNTI QFTHTQIEAI RAGMQPGLTM VVGPPGTGKT DVAVQIISNI YHNFPEQRTL IVTHSNQALN QLFEKIMALD IDERHLLRLG HGEEELETE KDFSRYGRVN YVLARRIELL EEVKRLQKSL GVPGDASYTC ETAGYFFLYQ VMSRWEEYIS KVKNKGSTLP D VTEVSTFF PFHEYFANAP QPIFKGRSYE EDMEIAEGCF RHIKKIFTQL EEFRASELLR SGLDRSKYLL VKEAKIIAMT CT HAALKRH DLVKLGFKYD NILMEEAAQI LEIETFIPLL LQNPQDGFSR LKRWIMIGDH HQLPPVIKNM AFQKYSNMEQ SLF TRFVRV GVPTVDLDAQ GRARASLCNL YNWRYKNLGN LPHVQLLPEF STANAGLLYD FQLINVEDFQ GVGESEPNPY FYQN LGEAE YVVALFMYMC LLGYPADKIS ILTTYNGQKH LIRDIINRRC GNNPLIGRPN KVTTVDRFQG QQNDYILLSL VRTRA VGHL RDVRRLVVAM SRARLGLYIF ARVSLFQNCF ELTPAFSQLT ARPLHLHIIP TEPFPTTRKN GERPSHEVQI IKNMPQ MAN FVYNMYMHLI QTTHHYHQTL LQLPPAMVEE GEEVQNQETE LETEEEAMTV QADIIPSPTD TSCRQETPAF QTDTTPS ET GATSTPEAIP ALSETTPTVV GAVSAPAEAN TPQDATSAPE ETK

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分子 #18: SNW domain-containing protein 1

分子名称: SNW domain-containing protein 1 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 18 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: human (ヒト)
分子量理論値: 61.770648 KDa
配列文字列: MALTSFLPAP TQLSQDQLEA EEKARSQRSR QTSLVSSRRE PPPYGYRKGW IPRLLEDFGD GGAFPEIHVA QYPLDMGRKK KMSNALAIQ VDSEGKIKYD AIARQGQSKD KVIYSKYTDL VPKEVMNADD PDLQRPDEEA IKEITEKTRV ALEKSVSQKV A AAMPVRAA ...文字列:
MALTSFLPAP TQLSQDQLEA EEKARSQRSR QTSLVSSRRE PPPYGYRKGW IPRLLEDFGD GGAFPEIHVA QYPLDMGRKK KMSNALAIQ VDSEGKIKYD AIARQGQSKD KVIYSKYTDL VPKEVMNADD PDLQRPDEEA IKEITEKTRV ALEKSVSQKV A AAMPVRAA DKLAPAQYIR YTPSQQGVAF NSGAKQRVIR MVEMQKDPME PPRFKINKKI PRGPP(SEP)PPAP VMH(SEP) PSRKM TVKEQQEWKI PPCISNWKNA KGYTIPLDKR LAADGRGLQT VHINENFAKL AEALYIADRK AREAVEMRAQ VERKM AQKE KEKHEEKLRE MAQKARERRA GIKTHVEKED GEARERDEIR HDRRKERQHD RNLSRAAPDK RSKLQRNENR DISEVI ALG VPNPRTSNEV QYDQRLFNQS KGMDSGFAGG EDEIYNVYDQ AWRGGKDMAQ SIYRPSKNLD KDMYGDDLEA RIKTNRF VP DKEFSGSDRR QRGREGPVQF EEDPFGLDKF LEEAKQHGGS KRPSDSSRPK EHEHEGKKRR KE

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分子 #19: Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase-like 1

分子名称: Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase-like 1 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 19 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO / EC番号: プロリルイソメラーゼ
由来(天然)生物種: human (ヒト)
分子量理論値: 18.257805 KDa
配列文字列:
MAAIPPDSWQ PPNVYLETSM GIIVLELYWK HAPKTCKNFA ELARRGYYNG TKFHRIIKDF MIQGGDPTGT GRGGASIYGK QFEDELHPD LKFTGAGILA MANAGPDTNG SQFFVTLAPT QWLDGKHTIF GRVCQGIGMV NRVGMVETNS QDRPVDDVKI I KAYPSG

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分子 #20: Pleiotropic regulator 1

分子名称: Pleiotropic regulator 1 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 20 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: human (ヒト)
分子量理論値: 57.280758 KDa
配列文字列: MVEEVQKHSV HTLVFRSLKR THDMFVADNG KPVPLDEESH KRKMAIKLRN EYGPVLHMPT SKENLKEKGP QNATDSYVHK QYPANQGQE VEYFVAGTHP YPPGPGVALT ADTKIQRMPS ESAAQSLAVA LPLQTKADAN RTAPSGSEYR HPGASDRPQP T AMNSIVME ...文字列:
MVEEVQKHSV HTLVFRSLKR THDMFVADNG KPVPLDEESH KRKMAIKLRN EYGPVLHMPT SKENLKEKGP QNATDSYVHK QYPANQGQE VEYFVAGTHP YPPGPGVALT ADTKIQRMPS ESAAQSLAVA LPLQTKADAN RTAPSGSEYR HPGASDRPQP T AMNSIVME TGNTKNSALM AKKAPTMPKP QWHPPWKLYR VISGHLGWVR CIAVEPGNQW FVTGSADRTI KIWDLASGKL KL SLTGHIS TVRGVIVSTR SPYLFSCGED KQVKCWDLEY NKVIRHYHGH LSAVYGLDLH PTIDVLVTCS RDSTARIWDV RTK ASVHTL SGHTNAVATV RCQAAEPQII TGSHDTTIRL WDLVAGKTRV TLTNHKKSVR AVVLHPRHYT FASGSPDNIK QWKF PDGSF IQNLSGHNAI INTLTVNSDG VLVSGADNGT MHLWDWRTGY NFQRVHAAVQ PGSLDSESGI FACAFDQSES RLLTA EADK TIKVYREDDT ATEETHPVSW KPEIIKRKRF

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分子 #21: Serine/arginine repetitive matrix protein 2

分子名称: Serine/arginine repetitive matrix protein 2 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 21 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: human (ヒト)
分子量理論値: 300.255312 KDa
配列文字列: MYNGIGLPTP RGSGTNGYVQ RNLSLVRGRR GERPDYKGEE ELRRLEAALV KRPNPDILDH ERKRRVELRC LELEEMMEEQ GYEEQQIQE KVATFRLMLL EKDVNPGGKE ETPGQRPAVT ETHQLAELNE KKNERLRAAF GISDSYVDGS SFDPQRRARE A KQPAPEPP ...文字列:
MYNGIGLPTP RGSGTNGYVQ RNLSLVRGRR GERPDYKGEE ELRRLEAALV KRPNPDILDH ERKRRVELRC LELEEMMEEQ GYEEQQIQE KVATFRLMLL EKDVNPGGKE ETPGQRPAVT ETHQLAELNE KKNERLRAAF GISDSYVDGS SFDPQRRARE A KQPAPEPP KPYSLVRESS SSRSPTPKQK KKKKKKDRGR RSESSSPRRE RKKSSKKKKH RSESESKKRK HRSPTPKSKR KS KDKKRKR SRSTTPAPKS RRAHRSTSAD SASSSDTSRS RSRSAAAKTH TTALAGRSPS PASGRRGEGD APFSEPGTTS TQR PSSPET ATKQPSSPYE DKDKDKKEKS ATRPSPSPER SSTGPEPPAP TPLLAERHGG SPQPLATTPL SQEPVNPPSE ASPT RDRSP PKSPEKLPQS SSSESSPPSP QPTKVSRHAS SSPESPKPAP APGSHREISS SPTSKNRSHG RAKRDKSHSH TPSRR MGRS RSPATAKRGR SRSRTPTKRG HSRSRSPQWR RSRSAQRWGR SRSPQRRGRS RSPQRPGWSR SRNTQRRGRS RSARRG RSH SRSPATRGRS RSRTPARRGR SRSRTPARRR SRSRTPTRRR SRSRTPARRG RSRSRTPARR RSRTRSPVRR RSRSRSP AR RSGRSRSRTP ARRGRSRSRT PARRGRSRSR TPARRSGRSR SRTPARRGRS RSRTPRRGRS RSRSLVRRGR SHSRTPQR R GRSGSSSERK NKSRTSQRRS RSNSSPEMKK SRISSRRSRS LSSPRSKAKS RLSLRRSLSG SSPCPKQKSQ TPPRRSRSG SSQPKAKSRT PPRRSRSSSS PPPKQKSKTP SRQSHSSSSP HPKVKSGTPP RQGSITSPQA NEQSVTPQRR SCFESSPDPE LKSRTPSRH SCSGSSPPRV KSSTPPRQSP SRSSSPQPKV KAIISPRQRS HSGSSSPSPS RVTSRTTPRR SRSVSPCSNV E SRLLPRYS HSGSSSPDTK VKPETPPRQS HSGSISPYPK VKAQTPPGPS LSGSKSPCPQ EKSKDSLVQS CPGSLSLCAG VK SSTPPGE SYFGVSSLQL KGQSQTSPDH RSDTSSPEVR QSHSESPSLQ SKSQTSPKGG RSRSSSPVTE LASRSPIRQD RGE FSASPM LKSGMSPEQS RFQSDSSSYP TVDSNSLLGQ SRLETAESKE KMALPPQEDA TASPPRQKDK FSPFPVQDRP ESSL VFKDT LRTPPRERSG AGSSPETKEQ NSALPTSSQD EELMEVVEKS EEPAGQILSH LSSELKEMST SNFESSPEVE ERPAV SLTL DQSQSQASLE AVEVPSMASS WGGPHFSPEH KELSNSPLRE NSFGSPLEFR NSGPLGTEMN TGFSSEVKED LNGPFL NQL ETDPSLDMKE QSTRSSGHSS SELSPDAVEK AGMSSNQSIS SPVLDAVPRT PSRERSSSAS SPEMKDGLPR TPSRRSR SG SSPGLRDGSG TPSRHSLSGS SPGMKDIPRT PSRGRSECDS SPEPKALPQT PRPRSRSPSS PELNNKCLTP QRERSGSE S SVDQKTVART PLGQRSRSGS SQELDVKPSA SPQERSESDS SPDSKAKTRT PLRQRSRSGS SPEVDSKSRL SPRRSRSGS SPEVKDKPRA APRAQSGSDS SPEPKAPAPR ALPRRSRSGS SSKGRGPSPE GSSSTESSPE HPPKSRTARR GSRSSPEPKT KSRTPPRRR SSRSSPELTR KARLSRRSRS ASSSPETRSR TPPRHRRSPS VSSPEPAEKS RSSRRRRSAS SPRTKTTSRR G RSPSPKPR GLQRSRSRSR REKTRTTRRR DRSGSSQSTS RRRQRSRSRS RVTRRRRGGS GYHSRSPARQ ESSRTSSRRR RG RSRTPPT SRKRSRSRTS PAPWKRSRSR ASPATHRRSR SRTPLISRRR SRSRTSPVSR RRSRSRTSVT RRRSRSRASP VSR RRSRSR TPPVTRRRSR SRTPTTRRRS RSRTPPVTRR RSRSRTPPVT RRRSRSRTSP ITRRRSRSRT SPVTRRRSRS RTSP VTRRR SRSRTSPVTR RRSRSRTPPA IRRRSRSRTP LLPRKRSRSR SPLAIRRRSR SRTPRTARGK RSLTRSPPAI RRRSA SGSS SDRSRSATPP ATRNHSGSRT PPVALNSSRM SCFSRPSMSP TPLDRCRSPG MLEPLGSSRT PMSVLQQAGG SMMDGP GPR IPDHQRTSVP ENHAQSRIAL ALTAISLGTA RPPPSMSAAG LAARMSQVPA PVPLMSLRTA PAANLASRIP AASAAAM NL ASARTPAIPT AVNLADSRTP AAAAAMNLAS PRTAVAPSAV NLADPRTPTA PAVNLAGART PAALAALSLT GSGTPPTA A NYPSSSRTPQ APASANLVGP RSAHATAPVN IAGSRTAAAL APASLTSARM APALSGANLT SPRVPLSAYE RVSGRTSPP LLDRARSRTP PSAPSQSRMT SERAPSPSSR MGQAPSQSLL PPAQDQPRSP VPSAFSDQSR CLIAQTTPVA GSQSLSSGAV ATTTSSAGD HNGMLSVPAP GVPHSDVGEP PASTGAQQPS ALAALQPAKE RRSSSSSSSS SSSSSSSSSS SSSSSSSGSS S SDSEGSSL PVQPEVALKR VPSPTPAPKE AVREGRPPEP TPAKRKRRSS SSSSSSSSSS SSSSSSSSSS SSSSSSSSSS SS SSSSSSS SPSPAKPGPQ ALPKPASPKK PPPGERRSRS PRKPIDSLRD SRSLSYSPVE RRRPSPQPSP RDQQSSSSER GSR RGQRGD SRSPSHKRRR ETPSPRPMRH RSSRSP

+
分子 #22: Pre-mRNA-splicing factor CWC22 homolog

分子名称: Pre-mRNA-splicing factor CWC22 homolog / タイプ: protein_or_peptide / ID: 22 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: human (ヒト)
分子量理論値: 105.646578 KDa
配列文字列: MKSSVAQIKP SSGHDRRENL NSYQRNSSPE DRYEEQERSP RDRDYFDYSR SDYEHSRRGR SYDSSMESRN RDREKRRERE RDTDRKRSR KSPSPGRRNP ETSVTQSSSA QDEPATKKKK DELDPLLTRT GGAYIPPAKL RMMQEQITDK NSLAYQRMSW E ALKKSING ...文字列:
MKSSVAQIKP SSGHDRRENL NSYQRNSSPE DRYEEQERSP RDRDYFDYSR SDYEHSRRGR SYDSSMESRN RDREKRRERE RDTDRKRSR KSPSPGRRNP ETSVTQSSSA QDEPATKKKK DELDPLLTRT GGAYIPPAKL RMMQEQITDK NSLAYQRMSW E ALKKSING LINKVNISNI SIIIQELLQE NIVRGRGLLS RSVLQAQSAS PIFTHVYAAL VAIINSKFPQ IGELILKRLI LN FRKGYRR NDKQLCLTAS KFVAHLINQN VAHEVLCLEM LTLLLERPTD DSVEVAIGFL KECGLKLTQV SPRGINAIFE RLR NILHES EIDKRVQYMI EVMFAVRKDG FKDHPIILEG LDLVEEDDQF THMLPLEDDY NPEDVLNVFK MDPNFMENEE KYKA IKKEI LDEGDTDSNT DQDAGSSEED EEEEEEEGEE DEEGQKVTIH DKTEINLVSF RRTIYLAIQS SLDFEECAHK LLKME FPES QTKELCNMIL DCCAQQRTYE KFFGLLAGRF CMLKKEYMES FEGIFKEQYD TIHRLETNKL RNVAKMFAHL LYTDSL PWS VLECIKLSEE TTTSSSRIFV KIFFQELCEY MGLPKLNARL KDETLQPFFE GLLPRDNPRN TRFAINFFTS IGLGGLT DE LREHLKNTPK VIVAQKPDVE QNKSSPSSSS SASSSSESDS SDSDSDSSDS SSESSSEESD SSSISSHSSA SANDVRKK G HGKTRSKEVD KLIRNQQTND RKQKERRQEH GHQETRTERE RRSEKHRDQN SSGSNWRDPI TKYTSDKDVP SERNNYSRV ANDRDQEMHI DLENKHGDPK KKRGERRNSF SENEKHTHRI KDSENFRRKD RSKSKEMNRK HSGSRSDEDR YQNGAERRWE KSSRYSEQS RESKKNQDRR REKSPAKQK

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分子 #23: Pre-mRNA-processing factor 17

分子名称: Pre-mRNA-processing factor 17 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 23 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: human (ヒト)
分子量理論値: 65.61218 KDa
配列文字列: MSAAIAALAA SYGSGSGSES DSDSESSRCP LPAADSLMHL TKSPSSKPSL AVAVDSAPEV AVKEDLETGV HLDPAVKEVQ YNPTYETMF APEFGPENPF RTQQMAAPRN MLSGYAEPAH INDFMFEQQR RTFATYGYAL DPSLDNHQVS AKYIGSVEEA E KNQGLTVF ...文字列:
MSAAIAALAA SYGSGSGSES DSDSESSRCP LPAADSLMHL TKSPSSKPSL AVAVDSAPEV AVKEDLETGV HLDPAVKEVQ YNPTYETMF APEFGPENPF RTQQMAAPRN MLSGYAEPAH INDFMFEQQR RTFATYGYAL DPSLDNHQVS AKYIGSVEEA E KNQGLTVF ETGQKKTEKR KKFKENDASN IDGFLGPWAK YVDEKDVAKP SEEEQKELDE ITAKRQKKGK QEEEKPGEEK TI LHVKEMY DYQGRSYLHI PQDVGVNLRS TMPPEKCYLP KKQIHVWSGH TKGVSAVRLF PLSGHLLLSC SMDCKIKLWE VYG ERRCLR TFIGHSKAVR DICFNTAGTQ FLSAAYDRYL KLWDTETGQC ISRFTNRKVP YCVKFNPDED KQNLFVAGMS DKKI VQWDI RSGEIVQEYD RHLGAVNTIV FVDENRRFVS TSDDKSLRVW EWDIPVDFKY IAEPSMHSMP AVTLSPNGKW LACQS MDNQ ILIFGAQNRF RLNKKKIFKG HMVAGYACQV DFSPDMSYVI SGDGNGKLNI WDWKTTKLYS RFKAHDKVCI GAVWHP HET SKVITCGWDG LIKLWD

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分子 #24: PSME3-interacting protein

分子名称: PSME3-interacting protein / タイプ: protein_or_peptide / ID: 24 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: human (ヒト)
分子量理論値: 28.95924 KDa
配列文字列: MDGGDDGNLI IKKRFVSEAE LDERRKRRQE EWEKVRKPED PEECPEEVYD PRSLYERLQE QKDRKQQEYE EQFKFKNMVR GLDEDETNF LDEVSRQQEL IEKQRREEEL KELKEYRNNL KKVGISQENK KEVEKKLTVK PIETKNKFSQ AKLLAGAVKH K SSESGNSV ...文字列:
MDGGDDGNLI IKKRFVSEAE LDERRKRRQE EWEKVRKPED PEECPEEVYD PRSLYERLQE QKDRKQQEYE EQFKFKNMVR GLDEDETNF LDEVSRQQEL IEKQRREEEL KELKEYRNNL KKVGISQENK KEVEKKLTVK PIETKNKFSQ AKLLAGAVKH K SSESGNSV KRLKPDPEPD DKNQEPSSCK SLGNTSLSGP SIHCPSAAVC IGILPGLGAY SGSSDSESSS DSEGTINATG KI VSSIFRT NTFLEAP

+
分子 #25: ATP-dependent RNA helicase DHX8

分子名称: ATP-dependent RNA helicase DHX8 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 25 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO / EC番号: ヘリカーゼ
由来(天然)生物種: human (ヒト)
分子量理論値: 139.522312 KDa
配列文字列: MAVAVAMAGA LIGSEPGPAE ELAKLEYLSL VSKVCTELDN HLGINDKDLA EFVISLAEKN TTFDTFKASL VKNGAEFTDS LISNLLRLI QTMRPPAKPS TSKDPVVKPK TEKEKLKELF PVLCQPDNPS VRTMLDEDDV KVAVDVLKEL EALMPSAAGQ E KQRDAEHR ...文字列:
MAVAVAMAGA LIGSEPGPAE ELAKLEYLSL VSKVCTELDN HLGINDKDLA EFVISLAEKN TTFDTFKASL VKNGAEFTDS LISNLLRLI QTMRPPAKPS TSKDPVVKPK TEKEKLKELF PVLCQPDNPS VRTMLDEDDV KVAVDVLKEL EALMPSAAGQ E KQRDAEHR DRTKKKKRSR SRDRNRDRDR DRERNRDRDH KRRHRSRSRS RSRTRERNKV KSRYRSRSRS QSPPKDRKDR DK YGERNLD RWRDKHVDRP PPEEPTIGDI YNGKVTSIMQ FGCFVQLEGL RKRWEGLVHI SELRREGRVA NVADVVSKGQ RVK VKVLSF TGTKTSLSMK DVDQETGEDL NPNRRRNLVG ETNEETSMRN PDRPTHLSLV SAPEVEDDSL ERKRLTRISD PEKW EIKQM IAANVLSKEE FPDFDEETGI LPKVDDEEDE DLEIELVEEE PPFLRGHTKQ SMDMSPIKIV KNPDGSLSQA AMMQS ALAK ERRELKQAQR EAEMDSIPMG LNKHWVDPLP DAEGRQIAAN MRGIGMMPND IPEWKKHAFG GNKASYGKKT QMSILE QRE SLPIYKLKEQ LVQAVHDNQI LIVIGETGSG KTTQITQYLA EAGYTSRGKI GCTQPRRVAA MSVAKRVSEE FGCCLGQ EV GYTIRFEDCT SPETVIKYMT DGMLLRECLI DPDLTQYAII MLDEAHERTI HTDVLFGLLK KTVQKRQDMK LIVTSATL D AVKFSQYFYE APIFTIPGRT YPVEILYTKE PETDYLDASL ITVMQIHLTE PPGDILVFLT GQEEIDTACE ILYERMKSL GPDVPELIIL PVYSALPSEM QTRIFDPAPP GSRKVVIATN IAETSLTIDG IYYVVDPGFV KQKVYNSKTG IDQLVVTPIS QAQAKQRAG RAGRTGPGKC YRLYTERAYR DEMLTTNVPE IQRTNLASTV LSLKAMGIND LLSFDFMDAP PMETLITAME Q LYTLGALD DEGLLTRLGR RMAEFPLEPM LCKMLIMSVH LGCSEEMLTI VSMLSVQNVF YRPKDKQALA DQKKAKFHQT EG DHLTLLA VYNSWKNNKF SNPWCYENFI QARSLRRAQD IRKQMLGIMD RHKLDVVSCG KSTVRVQKAI CSGFFRNAAK KDP QEGYRT LIDQQVVYIH PSSALFNRQP EWVVYHELVL TTKEYMREVT TIDPRWLVEF APAFFKVSDP TKLSKQKKQQ RLEP LYNRY EEPNAWRISR AFRRR

+
分子 #26: Cactin

分子名称: Cactin / タイプ: protein_or_peptide / ID: 26 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: human (ヒト)
分子量理論値: 88.860062 KDa
配列文字列: MGRDTRSRSR SAGRRGRRRQ SQSGSRSRSR SHGRRNRRRR EDEGRRRRRR RSRERRSDSE EERWQRSGMR SRSPPRPKWH SRDGSSQSD SGEEQSRGQW ARRRRRARSW SPSSSASSSA SPGRSQSPRA AAAALSQQQS LQERLRLREE RKQQEELMKA F ETPEEKRA ...文字列:
MGRDTRSRSR SAGRRGRRRQ SQSGSRSRSR SHGRRNRRRR EDEGRRRRRR RSRERRSDSE EERWQRSGMR SRSPPRPKWH SRDGSSQSD SGEEQSRGQW ARRRRRARSW SPSSSASSSA SPGRSQSPRA AAAALSQQQS LQERLRLREE RKQQEELMKA F ETPEEKRA RRLAKKEAKE RKKREKMGWG EEYMGYTNTD NPFGDNNLLG TFIWNKALEK KGISHLEEKE LKERNKRIQE DN RLELQKV KQLRLERERE KAMREQELEM LQREKEAEHF KTWEEQEDNF HLQQAKLRSK IRIRDGRAKP IDLLAKYISA EDD DLAVEM HEPYTFLNGL TVADMEDLLE DIQVYMELEQ GKNADFWRDM TTITEDEISK LRKLEASGKG PGERREGVNA SVSS DVQSV FKGKTYNQLQ VIFQGIEGKI RAGGPNLDMG YWESLLQQLR AHMARARLRE RHQDVLRQKL YKLKQEQGVE SEPLF PILK QEPQSPSRSL EPEDAAPTPP GPSSEGGPAE AEVDGATPTE GDGDGDGEGE GEGEAVLMEE DLIQQSLDDY DAGRYS PRL LTAHELPLDA HVLEPDEDLQ RLQLSRQQLQ VTGDASESAE DIFFRRAKEG MGQDEAQFSV EMPLTGKAYL WADKYRP RK PRFFNRVHTG FEWNKYNQTH YDFDNPPPKI VQGYKFNIFY PDLIDKRSTP EYFLEACADN KDFAILRFHA GPPYEDIA F KIVNREWEYS HRHGFRCQFA NGIFQLWFHF KRYRYRR

+
分子 #27: PRKR-interacting protein 1

分子名称: PRKR-interacting protein 1 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 27 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: human (ヒト)
分子量理論値: 21.040176 KDa
配列文字列:
MASPAASSVR PPRPKKEPQT LVIPKNAAEE QKLKLERLMK NPDKAVPIPE KMSEWAPRPP PEFVRDVMGS SAGAGSGEFH VYRHLRRRE YQRQDYMDAM AEKQKLDAEF QKRLEKNKIA AEEQTAKRRK KRQKLKEKKL LAKKMKLEQK KQEGPGQPKE Q GSSSSAEA SGTEEEEEVP SFTMGR

+
分子 #28: Protein FAM32A

分子名称: Protein FAM32A / タイプ: protein_or_peptide / ID: 28 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: human (ヒト)
分子量理論値: 13.213453 KDa
配列文字列:
MEAYEQVQKG PLKLKGVAEL GVTKRKKKKK DKDKAKLLEA MGTSKKNEEE KRRGLDKRTP AQAAFEKMQE KRQMERILKK ASKTHKQRV EDFNRHLDTL TEHYDIPKVS WTK

+
分子 #29: Small nuclear ribonucleoprotein-associated proteins B and B'

分子名称: Small nuclear ribonucleoprotein-associated proteins B and B'
タイプ: protein_or_peptide / ID: 29 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: human (ヒト)
分子量理論値: 24.642131 KDa
配列文字列: MTVGKSSKML QHIDYRMRCI LQDGRIFIGT FKAFDKHMNL ILCDCDEFRK IKPKNSKQAE REEKRVLGLV LLRGENLVSM TVEGPPPKD TGIARVPLAG AAGGPGIGRA AGRGIPAGVP MPQAPAGLAG PVRGVGGPSQ QVMTPQGRGT VAAAAAAATA S IAGAPTQY ...文字列:
MTVGKSSKML QHIDYRMRCI LQDGRIFIGT FKAFDKHMNL ILCDCDEFRK IKPKNSKQAE REEKRVLGLV LLRGENLVSM TVEGPPPKD TGIARVPLAG AAGGPGIGRA AGRGIPAGVP MPQAPAGLAG PVRGVGGPSQ QVMTPQGRGT VAAAAAAATA S IAGAPTQY PPGRGGPPPP MGRGAPPPGM MGPPPGMRPP MGPPMGIPPG RGTPMGMPPP GMRPPPPGMR GPPPPGMRPP RP

+
分子 #30: Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase E

分子名称: Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase E / タイプ: protein_or_peptide / ID: 30 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO / EC番号: プロリルイソメラーゼ
由来(天然)生物種: human (ヒト)
分子量理論値: 33.475773 KDa
配列文字列: MATTKRVLYV GGLAEEVDDK VLHAAFIPFG DITDIQIPLD YETEKHRGFA FVEFELAEDA AAAIDNMNES ELFGRTIRVN LAKPMRIKE GSSRPVWSDD DWLKKFSGKT LEENKEEEGS EPPKAETQEG EPIAKKARSN PQVYMDIKIG NKPAGRIQML L RSDVVPMT ...文字列:
MATTKRVLYV GGLAEEVDDK VLHAAFIPFG DITDIQIPLD YETEKHRGFA FVEFELAEDA AAAIDNMNES ELFGRTIRVN LAKPMRIKE GSSRPVWSDD DWLKKFSGKT LEENKEEEGS EPPKAETQEG EPIAKKARSN PQVYMDIKIG NKPAGRIQML L RSDVVPMT AENFRCLCTH EKGFGFKGSS FHRIIPQFMC QGGDFTNHNG TGGKSIYGKK FDDENFILKH TGPGLLSMAN SG PNTNGSQ FFLTCDKTDW LDGKHVVFGE VTEGLDVLRQ IEAQGSKDGK PKQKVIIADC GEYV

+
分子 #31: Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3

分子名称: Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 31 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: human (ヒト)
分子量理論値: 13.940308 KDa
配列文字列:
MSIGVPIKVL HEAEGHIVTC ETNTGEVYRG KLIEAEDNMN CQMSNITVTY RDGRVAQLEQ VYIRGSKIRF LILPDMLKNA PMLKSMKNK NQGSGAGRGK AAILKAQVAA RGRGRGMGRG NIFQKRR

+
分子 #32: Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1

分子名称: Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 32 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: human (ヒト)
分子量理論値: 13.310653 KDa
配列文字列:
MKLVRFLMKL SHETVTIELK NGTQVHGTIT GVDVSMNTHL KAVKMTLKNR EPVQLETLSI RGNNIRYFIL PDSLPLDTLL VDVEPKVKS KKREAVAGRG RGRGRGRGRG RGRGRGGPRR

+
分子 #33: Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2

分子名称: Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 33 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: human (ヒト)
分子量理論値: 13.551928 KDa
配列文字列:
MSLLNKPKSE MTPEELQKRE EEEFNTGPLS VLTQSVKNNT QVLINCRNNK KLLGRVKAFD RHCNMVLENV KEMWTEVPKS GKGKKKSKP VNKDRYISKM FLRGDSVIVV LRNPLIAGK

+
分子 #34: Small nuclear ribonucleoprotein F

分子名称: Small nuclear ribonucleoprotein F / タイプ: protein_or_peptide / ID: 34 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: human (ヒト)
分子量理論値: 9.734171 KDa
配列文字列:
MSLPLNPKPF LNGLTGKPVM VKLKWGMEYK GYLVSVDGYM NMQLANTEEY IDGALSGHLG EVLIRCNNVL YIRGVEEEEE DGEMRE

+
分子 #35: Small nuclear ribonucleoprotein E

分子名称: Small nuclear ribonucleoprotein E / タイプ: protein_or_peptide / ID: 35 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: human (ヒト)
分子量理論値: 10.817601 KDa
配列文字列:
MAYRGQGQKV QKVMVQPINL IFRYLQNRSR IQVWLYEQVN MRIEGCIIGF DEYMNLVLDD AEEIHSKTKS RKQLGRIMLK GDNITLLQS VSN

+
分子 #36: Small nuclear ribonucleoprotein G

分子名称: Small nuclear ribonucleoprotein G / タイプ: protein_or_peptide / ID: 36 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: human (ヒト)
分子量理論値: 8.508084 KDa
配列文字列:
MSKAHPPELK KFMDKKLSLK LNGGRHVQGI LRGFDPFMNL VIDECVEMAT SGQQNNIGMV VIRGNSIIML EALERV

+
分子 #37: Protein mago nashi homolog

分子名称: Protein mago nashi homolog / タイプ: protein_or_peptide / ID: 37 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: human (ヒト)
分子量理論値: 17.189625 KDa
配列文字列:
MESDFYLRYY VGHKGKFGHE FLEFEFRPDG KLRYANNSNY KNDVMIRKEA YVHKSVMEEL KRIIDDSEIT KEDDALWPPP DRVGRQELE IVIGDEHISF TTSKIGSLID VNQSKDPEGL RVFYYLVQDL KCLVFSLIGL HFKIKPI

+
分子 #38: RNA-binding protein 8A

分子名称: RNA-binding protein 8A / タイプ: protein_or_peptide / ID: 38 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: human (ヒト)
分子量理論値: 19.92507 KDa
配列文字列:
MADVLDLHEA GGEDFAMDED GDESIHKLKE KAKKRKGRGF GSEEGSRARM REDYDSVEQD GDEPGPQRSV EGWILFVTGV HEEATEEDI HDKFAEYGEI KNIHLNLDRR TGYLKGYTLV EYETYKEAQA AMEGLNGQDL MGQPISVDWC FVRGPPKGKR R GGRRRSRS PDRRRR

+
分子 #39: Eukaryotic initiation factor 4A-III

分子名称: Eukaryotic initiation factor 4A-III / タイプ: protein_or_peptide / ID: 39 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO / EC番号: ヘリカーゼ
由来(天然)生物種: human (ヒト)
分子量理論値: 46.930961 KDa
配列文字列: MATTATMATS GSARKRLLKE EDMTKVEFET SEEVDVTPTF DTMGLREDLL RGIYAYGFEK PSAIQQRAIK QIIKGRDVIA QSQSGTGKT ATFSISVLQC LDIQVRETQA LILAPTRELA VQIQKGLLAL GDYMNVQCHA CIGGTNVGED IRKLDYGQHV V AGTPGRVF ...文字列:
MATTATMATS GSARKRLLKE EDMTKVEFET SEEVDVTPTF DTMGLREDLL RGIYAYGFEK PSAIQQRAIK QIIKGRDVIA QSQSGTGKT ATFSISVLQC LDIQVRETQA LILAPTRELA VQIQKGLLAL GDYMNVQCHA CIGGTNVGED IRKLDYGQHV V AGTPGRVF DMIRRRSLRT RAIKMLVLDE ADEMLNKGFK EQIYDVYRYL PPATQVVLIS ATLPHEILEM TNKFMTDPIR IL VKRDELT LEGIKQFFVA VEREEWKFDT LCDLYDTLTI TQAVIFCNTK RKVDWLTEKM REANFTVSSM HGDMPQKERE SIM KEFRSG ASRVLISTDV WARGLDVPQV SLIINYDLPN NRELYIHRIG RSGRYGRKGV AINFVKNDDI RILRDIEQYY STQI DEMPM NVADLI

+
分子 #40: Protein CASC3

分子名称: Protein CASC3 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 40 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: human (ヒト)
分子量理論値: 76.381992 KDa
配列文字列: MADRRRQRAS QDTEDEESGA SGSDSGGSPL RGGGSCSGSA GGGGSGSLPS QRGGRTGALH LRRVESGGAK SAEESECESE DGIEGDAVL SDYESAEDSE GEEGEYSEEE NSKVELKSEA NDAVNSSTKE EKGEEKPDTK STVTGERQSG DGQESTEPVE N KVGKKGPK ...文字列:
MADRRRQRAS QDTEDEESGA SGSDSGGSPL RGGGSCSGSA GGGGSGSLPS QRGGRTGALH LRRVESGGAK SAEESECESE DGIEGDAVL SDYESAEDSE GEEGEYSEEE NSKVELKSEA NDAVNSSTKE EKGEEKPDTK STVTGERQSG DGQESTEPVE N KVGKKGPK HLDDDEDRKN PAYIPRKGLF FEHDLRGQTQ EEEVRPKGRQ RKLWKDEGRW EHDKFREDEQ APKSRQELIA LY GYDIRSA HNPDDIKPRR IRKPRYGSPP QRDPNWNGER LNKSHRHQGL GGTLPPRTFI NRNAAGTGRM SAPRNYSRSG GFK EGRAGF RPVEAGGQHG GRSGETVKHE ISYRSRRLEQ TSVRDPSPEA DAPVLGSPEK EEAASEPPAA APDAAPPPPD RPIE KKSYS RARRTRTKVG DAVKLAEEVP PPPEGLIPAP PVPETTPTPP TKTGTWEAPV DSSTSGLEQD VAQLNIAEQN WSPGQ PSFL QPRELRGMPN HIHMGAGPPP QFNRMEEMGV QGGRAKRYSS QRQRPVPEPP APPVHISIME GHYYDPLQFQ GPIYTH GDS PAPLPPQGML VQPGMNLPHP GLHPHQTPAP LPNPGLYPPP VSMSPGQPPP QQLLAPTYFS APGVMNFGNP SYPYAPG AL PPPPPPHLYP NTQAPSQVYG GVTYYNPAQQ QVQPKPSPPR RTPQPVTIKP PPPEVVSRGS S

+
分子 #41: Pre-mRNA-processing factor 19

分子名称: Pre-mRNA-processing factor 19 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 41 / コピー数: 4 / 光学異性体: LEVO / EC番号: RING-type E3 ubiquitin transferase
由来(天然)生物種: human (ヒト)
分子量理論値: 55.245547 KDa
配列文字列: MSLICSISNE VPEHPCVSPV SNHVYERRLI EKYIAENGTD PINNQPLSEE QLIDIKVAHP IRPKPPSATS IPAILKALQD EWDAVMLHS FTLRQQLQTT RQELSHALYQ HDAACRVIAR LTKEVTAARE ALATLKPQAG LIVPQAVPSS QPSVVGAGEP M DLGELVGM ...文字列:
MSLICSISNE VPEHPCVSPV SNHVYERRLI EKYIAENGTD PINNQPLSEE QLIDIKVAHP IRPKPPSATS IPAILKALQD EWDAVMLHS FTLRQQLQTT RQELSHALYQ HDAACRVIAR LTKEVTAARE ALATLKPQAG LIVPQAVPSS QPSVVGAGEP M DLGELVGM TPEIIQKLQD KATVLTTERK KRGKTVPEEL VKPEELSKYR QVASHVGLHS ASIPGILALD LCPSDTNKIL TG GADKNVV VFDKSSEQIL ATLKGHTKKV TSVVFHPSQD LVFSASPDAT IRIWSVPNAS CVQVVRAHES AVTGLSLHAT GDY LLSSSD DQYWAFSDIQ TGRVLTKVTD ETSGCSLTCA QFHPDGLIFG TGTMDSQIKI WDLKERTNVA NFPGHSGPIT SIAF SENGY YLATAADDSS VKLWDLRKLK NFKTLQLDNN FEVKSLIFDQ SGTYLALGGT DVQIYICKQW TEILHFTEHS GLTTG VAFG HHAKFIASTG MDRSLKFYSL

+
分子 #42: U2 small nuclear ribonucleoprotein A'

分子名称: U2 small nuclear ribonucleoprotein A' / タイプ: protein_or_peptide / ID: 42 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: human (ヒト)
分子量理論値: 28.456584 KDa
配列文字列: MVKLTAELIE QAAQYTNAVR DRELDLRGYK IPVIENLGAT LDQFDAIDFS DNEIRKLDGF PLLRRLKTLL VNNNRICRIG EGLDQALPC LTELILTNNS LVELGDLDPL ASLKSLTYLS ILRNPVTNKK HYRLYVIYKV PQVRVLDFQK VKLKERQEAE K MFKGKRGA ...文字列:
MVKLTAELIE QAAQYTNAVR DRELDLRGYK IPVIENLGAT LDQFDAIDFS DNEIRKLDGF PLLRRLKTLL VNNNRICRIG EGLDQALPC LTELILTNNS LVELGDLDPL ASLKSLTYLS ILRNPVTNKK HYRLYVIYKV PQVRVLDFQK VKLKERQEAE K MFKGKRGA QLAKDIARRS KTFNPGAGLP TDKKKGGPSP GDVEAIKNAI ANASTLAEVE RLKGLLQSGQ IPGRERRSGP TD DGEEEME EDTVTNGS

+
分子 #43: U2 small nuclear ribonucleoprotein B''

分子名称: U2 small nuclear ribonucleoprotein B'' / タイプ: protein_or_peptide / ID: 43 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: human (ヒト)
分子量理論値: 25.524367 KDa
配列文字列: MDIRPNHTIY INNMNDKIKK EELKRSLYAL FSQFGHVVDI VALKTMKMRG QAFVIFKELG SSTNALRQLQ GFPFYGKPMR IQYAKTDSD IISKMRGTFA DKEKKKEKKK AKTVEQTATT TNKKPGQGTP NSANTQGNST PNPQVPDYPP NYILFLNNLP E ETNEMMLS ...文字列:
MDIRPNHTIY INNMNDKIKK EELKRSLYAL FSQFGHVVDI VALKTMKMRG QAFVIFKELG SSTNALRQLQ GFPFYGKPMR IQYAKTDSD IISKMRGTFA DKEKKKEKKK AKTVEQTATT TNKKPGQGTP NSANTQGNST PNPQVPDYPP NYILFLNNLP E ETNEMMLS MLFNQFPGFK EVRLVPGRHD IAFVEFENDG QAGAARDALQ GFKITPSHAM KITYAKK

+
分子 #44: Pre-mRNA-splicing factor SLU7

分子名称: Pre-mRNA-splicing factor SLU7 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 44 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: human (ヒト)
分子量理論値: 68.510844 KDa
配列文字列: MSATVVDAVN AAPLSGSKEM SLEEPKKMTR EDWRKKKELE EQRKLGNAPA EVDEEGKDIN PHIPQYISSV PWYIDPSKRP TLKHQRPQP EKQKQFSSSG EWYKRGVKEN SIITKYRKGA CENCGAMTHK KKDCFERPRR VGAKFTGTNI APDEHVQPQL M FDYDGKRD ...文字列:
MSATVVDAVN AAPLSGSKEM SLEEPKKMTR EDWRKKKELE EQRKLGNAPA EVDEEGKDIN PHIPQYISSV PWYIDPSKRP TLKHQRPQP EKQKQFSSSG EWYKRGVKEN SIITKYRKGA CENCGAMTHK KKDCFERPRR VGAKFTGTNI APDEHVQPQL M FDYDGKRD RWNGYNPEEH MKIVEEYAKV DLAKRTLKAQ KLQEELASGK LVEQANSPKH QWGEEEPNSQ MEKDHNSEDE DE DKYADDI DMPGQNFDSK RRITVRNLRI REDIAKYLRN LDPNSAYYDP KTRAMRENPY ANAGKNPDEV SYAGDNFVRY TGD TISMAQ TQLFAWEAYD KGSEVHLQAD PTKLELLYKS FKVKKEDFKE QQKESILEKY GGQEHLDAPP AELLLAQTED YVEY SRHGT VIKGQERAVA CSKYEEDVKI HNHTHIWGSY WKEGRWGYKC CHSFFKYSYC TGEAGKEIVN SEECIINEIT GEESV KKPQ TLMELHQEKL KEEKKKKKKK KKKHRKSSSD SDDEEKKHEK LKKALNAEEA RLLHVKETMQ IDERKRPYNS MYETRE PTE EEMEAYRMKR QRPDDPMASF LGQ

+
分子 #2: U5 snRNA

分子名称: U5 snRNA / タイプ: rna / ID: 2 / コピー数: 1
由来(天然)生物種: human (ヒト)
分子量理論値: 37.254855 KDa
配列文字列:
AUACUCUGGU UUCUCUUCAG AUCGCAUAAA UCUUUCGCCU UUUACUAAAG AUUUCCGUGG AGAGGAACAA CUCUGAGUCU UAACCCAAU UUUUUGAGGC CUUGCUUUGG CAAGGCUA

+
分子 #5: U6 snRNA

分子名称: U6 snRNA / タイプ: rna / ID: 5 / コピー数: 1
由来(天然)生物種: human (ヒト)
分子量理論値: 34.404438 KDa
配列文字列:
GUGCUCGCUU CGGCAGCACA UAUACUAAAA UUGGAACGAU ACAGAGAAGA UUAGCAUGGC CCCUGCGCAA GGAUGACACG CAAAUUCGU GAAGCGUUCC AUAUUUUU

+
分子 #6: Pre-mRNA

分子名称: Pre-mRNA / タイプ: rna / ID: 6 / コピー数: 1
由来(天然)生物種: unidentified adenovirus (ウイルス)
分子量理論値: 14.72978 KDa
配列文字列:
GAUCGGGCUC GCCACUCUUG GAUCGGAACC CGUCGGCCUC CGAACG

+
分子 #7: Pre-mRNA

分子名称: Pre-mRNA / タイプ: rna / ID: 7 / コピー数: 1
由来(天然)生物種: unidentified adenovirus (ウイルス)
分子量理論値: 55.660688 KDa
配列文字列:
GUAAGAGCCU AGCAUGUAGA ACUGGUUACC UGCAGCCCAA GCUUGCUGCA CGUCUAGGGC GCAGUAGUCC AGGGUUUCCU UGAUGAUGU CAUACUUAUC CUGUCCCUUU UUUUUCCACA GCUCGCGGUU GAGGACAAAC UCUUCGCGGU CUUUCCAGUG G GGAUCCGA UAUCCG

+
分子 #8: U2 snRNA

分子名称: U2 snRNA / タイプ: rna / ID: 8 / コピー数: 1
由来(天然)生物種: human (ヒト)
分子量理論値: 60.186445 KDa
配列文字列:
AUCGCUUCUC GGCCUUUUGG CUAAGAUCAA GUGUAGUAUC UGUUCUUAUC AGUUUAAUAU CUGAUACGUC CUCUAUCCGA GGACAAUAU AUUAAAUGGA UUUUUGGAGC AGGGAGAUGG AAUAGGAGCU UGCUCCGUCC ACUCCACGCA UCGACCUGGU A UUGCAGUA CCUCCAGGAA CGGUGCACCC

+
分子 #45: INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE

分子名称: INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE / タイプ: ligand / ID: 45 / コピー数: 1 / : IHP
分子量理論値: 660.035 Da
Chemical component information

ChemComp-IHP:
INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE / フィチン酸 / フィチン酸

+
分子 #46: GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE

分子名称: GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE / タイプ: ligand / ID: 46 / コピー数: 1 / : GTP
分子量理論値: 523.18 Da
Chemical component information

ChemComp-GTP:
GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE / GTP / GTP, エネルギー貯蔵分子*YM / グアノシン三リン酸

+
分子 #47: MAGNESIUM ION

分子名称: MAGNESIUM ION / タイプ: ligand / ID: 47 / コピー数: 9 / : MG
分子量理論値: 24.305 Da

+
分子 #48: ZINC ION

分子名称: ZINC ION / タイプ: ligand / ID: 48 / コピー数: 7 / : ZN
分子量理論値: 65.409 Da

+
分子 #49: ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE

分子名称: ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE / タイプ: ligand / ID: 49 / コピー数: 1 / : ATP
分子量理論値: 507.181 Da
Chemical component information

ChemComp-ATP:
ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE / ATP / ATP, エネルギー貯蔵分子*YM / アデノシン三リン酸

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実験情報

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構造解析

手法クライオ電子顕微鏡法
解析単粒子再構成法
試料の集合状態particle

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試料調製

緩衝液pH: 7.9
凍結凍結剤: ETHANE

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電子顕微鏡法

顕微鏡FEI TITAN KRIOS
電子線加速電圧: 300 kV / 電子線源: FIELD EMISSION GUN
電子光学系照射モード: FLOOD BEAM / 撮影モード: BRIGHT FIELDBright-field microscopy / 最大 デフォーカス(公称値): 2.5 µm / 最小 デフォーカス(公称値): 1.2 µm
撮影フィルム・検出器のモデル: GATAN K2 SUMMIT (4k x 4k)
検出モード: SUPER-RESOLUTION / 平均電子線量: 50.0 e/Å2
実験機器
モデル: Titan Krios / 画像提供: FEI Company

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画像解析

初期 角度割当タイプ: MAXIMUM LIKELIHOOD
最終 角度割当タイプ: MAXIMUM LIKELIHOOD
最終 再構成解像度のタイプ: BY AUTHOR / 解像度: 3.6 Å / 解像度の算出法: FSC 0.143 CUT-OFF / 使用した粒子像数: 212224

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万見について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月:コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか? / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例:em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

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万見 (Yorodumi)

幾万の構造データを、幾万の視点から

  • 万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
  • EM Navigatorの詳細ページの後継、Omokage検索のフロントエンドも兼ねています。

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較 / 万見検索 / 2016年8月31日: 新しいEM Navigatorと万見 / 万見文献 / Jmol/JSmol / 機能・相同性情報 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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