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-基本情報
登録情報 | データベース: EMDB / ID: EMD-20096 | |||||||||
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タイトル | Cryo-EM reconstruction of the '010' binding pattern in the ADP-AlFx condition for dimeric kinesin-1 with a central bound site and empty flanking sites | |||||||||
マップデータ | None | |||||||||
試料 |
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生物種 | homo s (ウシ) | |||||||||
手法 | 単粒子再構成法 / クライオ電子顕微鏡法 / 解像度: 5.63 Å | |||||||||
データ登録者 | Cha HK / Debs G | |||||||||
資金援助 | 米国, 1件
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引用 | ジャーナル: To Be Published タイトル: Structural Intermediates of the Dimeric Kinesin Stepping Cycle Revealed by Cryo-EM 著者: Cha HK / Debs G / Liu X / Liu D / Sindelar CV | |||||||||
履歴 |
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-構造の表示
ムービー |
ムービービューア |
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構造ビューア | EMマップ: SurfViewMolmilJmol/JSmol |
添付画像 |
-ダウンロードとリンク
-EMDBアーカイブ
マップデータ | emd_20096.map.gz | 276 MB | EMDBマップデータ形式 | |
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ヘッダ (付随情報) | emd-20096-v30.xml emd-20096.xml | 8.5 KB 8.5 KB | 表示 表示 | EMDBヘッダ |
画像 | emd_20096.png | 145.4 KB | ||
アーカイブディレクトリ | http://ftp.pdbj.org/pub/emdb/structures/EMD-20096 ftp://ftp.pdbj.org/pub/emdb/structures/EMD-20096 | HTTPS FTP |
-関連構造データ
-リンク
EMDBのページ | EMDB (EBI/PDBe) / EMDataResource |
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-マップ
ファイル | ダウンロード / ファイル: emd_20096.map.gz / 形式: CCP4 / 大きさ: 303.3 MB / タイプ: IMAGE STORED AS FLOATING POINT NUMBER (4 BYTES) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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注釈 | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ボクセルのサイズ | X=Y=Z: 1.374 Å | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
密度 |
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対称性 | 空間群: 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
詳細 | EMDB XML:
CCP4マップ ヘッダ情報:
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-添付データ
-試料の構成要素
-全体 : Dimeric kinesin-1 in the presence of ADP-AlFx bound to taxol-stab...
全体 | 名称: Dimeric kinesin-1 in the presence of ADP-AlFx bound to taxol-stabilized microtubules |
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要素 |
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-超分子 #1: Dimeric kinesin-1 in the presence of ADP-AlFx bound to taxol-stab...
超分子 | 名称: Dimeric kinesin-1 in the presence of ADP-AlFx bound to taxol-stabilized microtubules タイプ: complex / ID: 1 / 親要素: 0 / 含まれる分子: #1 |
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由来(天然) | 生物種: homo s (ウシ) |
組換発現 | 生物種: Escherichia coli (大腸菌) |
-実験情報
-構造解析
手法 | クライオ電子顕微鏡法 |
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解析 | 単粒子再構成法 |
試料の集合状態 | filament |
-試料調製
緩衝液 | pH: 7 |
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凍結 | 凍結剤: ETHANE |
-電子顕微鏡法
顕微鏡 | FEI TITAN KRIOS |
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電子線 | 加速電圧: 300 kV / 電子線源: FIELD EMISSION GUN |
電子光学系 | 照射モード: FLOOD BEAM / 撮影モード: BRIGHT FIELDBright-field microscopy |
撮影 | フィルム・検出器のモデル: GATAN K2 SUMMIT (4k x 4k) 平均電子線量: 1.65 e/Å2 |
実験機器 | モデル: Titan Krios / 画像提供: FEI Company |
-画像解析
初期 角度割当 | タイプ: PROJECTION MATCHING |
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最終 角度割当 | タイプ: MAXIMUM LIKELIHOOD |
最終 再構成 | 解像度のタイプ: BY AUTHOR / 解像度: 5.63 Å / 解像度の算出法: FSC 0.143 CUT-OFF / 使用した粒子像数: 65639 |