[日本語] English
万見
- EMDB-15175: Cryo-EM structure of Lincomycin bound to the Listeria monocytogen... -

+
データを開く


IDまたはキーワード:

読み込み中...

-
基本情報

登録情報
データベース: EMDB / ID: EMD-15175
タイトルCryo-EM structure of Lincomycin bound to the Listeria monocytogenes 50S ribosomal subunit.
マップデータPost-processed masked final map.
試料
  • 複合体: Lincomycin bound to the Listeria monocytogenes 50S ribosomal subunit.
    • タンパク質・ペプチド: x 27種
    • RNA: x 2種
  • リガンド: x 7種
機能・相同性
機能・相同性情報


large ribosomal subunit rRNA binding / large ribosomal subunit / cytoplasmic translation / 5S rRNA binding / cytosolic large ribosomal subunit / transferase activity / tRNA binding / negative regulation of translation / rRNA binding / リボソーム ...large ribosomal subunit rRNA binding / large ribosomal subunit / cytoplasmic translation / 5S rRNA binding / cytosolic large ribosomal subunit / transferase activity / tRNA binding / negative regulation of translation / rRNA binding / リボソーム / structural constituent of ribosome / 翻訳 (生物学) / ribonucleoprotein complex / mRNA binding / RNA binding / 細胞質
類似検索 - 分子機能
Ribosomal protein L31 type B / Ribosomal protein L31 signature. / Ribosomal protein L31 / Ribosomal protein L31 superfamily / Ribosomal protein L31 / Ribosomal protein L21, conserved site / Ribosomal protein L21 signature. / Ribosomal protein L16 signature 1. / : / Ribosomal protein L6, conserved site ...Ribosomal protein L31 type B / Ribosomal protein L31 signature. / Ribosomal protein L31 / Ribosomal protein L31 superfamily / Ribosomal protein L31 / Ribosomal protein L21, conserved site / Ribosomal protein L21 signature. / Ribosomal protein L16 signature 1. / : / Ribosomal protein L6, conserved site / Ribosomal protein L6 signature 1. / Ribosomal protein L16, conserved site / Ribosomal protein L16 signature 2. / Ribosomal protein L17 signature. / Ribosomal protein L28/L24 superfamily / Ribosomal protein L36 signature. / Ribosomal protein L32p, bacterial type / Ribosomal protein L28 / Ribosomal protein L35, conserved site / Ribosomal protein L35 signature. / Ribosomal protein L33, conserved site / Ribosomal protein L33 signature. / Ribosomal protein L35, non-mitochondrial / Ribosomal protein L5, bacterial-type / Ribosomal protein L6, bacterial-type / Ribosomal protein L18, bacterial-type / Ribosomal protein L19, conserved site / Ribosomal protein L19 signature. / Ribosomal protein L36 / Ribosomal protein L36 superfamily / Ribosomal protein L36 / Ribosomal protein L20 signature. / Ribosomal protein L27, conserved site / Ribosomal protein L27 signature. / Ribosomal protein L14P, bacterial-type / Ribosomal protein L34, conserved site / Ribosomal protein L34 signature. / Ribosomal protein L22, bacterial/chloroplast-type / Ribosomal protein L35 / Ribosomal protein L35 superfamily / Ribosomal protein L2, bacterial/organellar-type / Ribosomal protein L35 / Ribosomal L28 family / Ribosomal protein L33 / Ribosomal protein L33 / Ribosomal protein L28/L24 / Ribosomal protein L33 superfamily / : / Ribosomal protein L30, bacterial-type / Ribosomal protein L16 / Ribosomal protein L18 / Ribosomal L18 of archaea, bacteria, mitoch. and chloroplast / L28p-like / Ribosomal protein L20 / Ribosomal protein L20 / Ribosomal protein L20, C-terminal / Ribosomal protein L21 / Ribosomal protein L27 / Ribosomal L27 protein / Ribosomal protein L19 / Ribosomal protein L19 superfamily / Ribosomal protein L19 / Ribosomal proteins 50S L24/mitochondrial 39S L24 / Ribosomal protein L17 / Ribosomal protein L17 superfamily / Ribosomal protein L17 / Ribosomal protein L21-like / L21-like superfamily / Ribosomal prokaryotic L21 protein / Ribosomal L32p protein family / Ribosomal protein L24 / Ribosomal protein L32p / Ribosomal protein L34 / Ribosomal protein L34 / Ribosomal protein L13, bacterial-type / Ribosomal protein L3, bacterial/organelle-type / Ribosomal protein L15, bacterial-type / 50S ribosomal protein uL4 / Ribosomal protein L30, conserved site / Ribosomal protein L5, conserved site / Ribosomal protein L29, conserved site / Ribosomal protein L30 signature. / : / Ribosomal protein L15, conserved site / Ribosomal protein L5, N-terminal / Ribosomal protein L5 signature. / Ribosomal protein L5, C-terminal / Ribosomal protein L5 / Ribosomal protein L5 domain superfamily / Ribosomal protein L2, conserved site / Ribosomal protein L2 signature. / Ribosomal protein L10e/L16 / Ribosomal protein L10e/L16 superfamily / Ribosomal protein L29 signature. / Ribosomal protein L5 / ribosomal L5P family C-terminus / Ribosomal protein L6, alpha-beta domain / Ribosomal protein L6 / Ribosomal protein L6, alpha-beta domain superfamily / Ribosomal protein L16p/L10e
類似検索 - ドメイン・相同性
Large ribosomal subunit protein uL24 / Large ribosomal subunit protein bL19 / Large ribosomal subunit protein bL31B / Large ribosomal subunit protein bL35 / Large ribosomal subunit protein uL2 / Large ribosomal subunit protein uL4 / Large ribosomal subunit protein bL20 / Large ribosomal subunit protein bL27 / Large ribosomal subunit protein bL28 / Large ribosomal subunit protein uL29 ...Large ribosomal subunit protein uL24 / Large ribosomal subunit protein bL19 / Large ribosomal subunit protein bL31B / Large ribosomal subunit protein bL35 / Large ribosomal subunit protein uL2 / Large ribosomal subunit protein uL4 / Large ribosomal subunit protein bL20 / Large ribosomal subunit protein bL27 / Large ribosomal subunit protein bL28 / Large ribosomal subunit protein uL29 / Large ribosomal subunit protein bL32B / Large ribosomal subunit protein bL33A / Large ribosomal subunit protein bL34 / Large ribosomal subunit protein bL36 / Large ribosomal subunit protein uL3 / Large ribosomal subunit protein uL23 / Large ribosomal subunit protein uL6 / Large ribosomal subunit protein uL18 / Large ribosomal subunit protein uL15 / Large ribosomal subunit protein bL17 / Large ribosomal subunit protein uL13 / Large ribosomal subunit protein bL21 / Large ribosomal subunit protein uL22 / Large ribosomal subunit protein uL16 / Large ribosomal subunit protein uL14 / Large ribosomal subunit protein uL5 / Large ribosomal subunit protein uL30
類似検索 - 構成要素
生物種Listeria monocytogenes E (リステリア・モノサイトゲネス) / Listeria monocytogenes EGD-e (リステリア・モノサイトゲネス)
手法単粒子再構成法 / クライオ電子顕微鏡法 / 解像度: 2.3 Å
データ登録者Koller TO / Crowe-McAuliffe C / Wilson DN
資金援助 スウェーデン, 2件
OrganizationGrant number国
Other governmentDLR01KI1820
Swedish Research Council2018-00956 スウェーデン
引用ジャーナル: Nucleic Acids Res / 年: 2022
タイトル: Structural basis for HflXr-mediated antibiotic resistance in Listeria monocytogenes.
著者: Timm O Koller / Kathryn J Turnbull / Karolis Vaitkevicius / Caillan Crowe-McAuliffe / Mohammad Roghanian / Ondřej Bulvas / Jose A Nakamoto / Tatsuaki Kurata / Christina Julius / Gemma C ...著者: Timm O Koller / Kathryn J Turnbull / Karolis Vaitkevicius / Caillan Crowe-McAuliffe / Mohammad Roghanian / Ondřej Bulvas / Jose A Nakamoto / Tatsuaki Kurata / Christina Julius / Gemma C Atkinson / Jörgen Johansson / Vasili Hauryliuk / Daniel N Wilson /
要旨: HflX is a ubiquitous bacterial GTPase that splits and recycles stressed ribosomes. In addition to HflX, Listeria monocytogenes contains a second HflX homolog, HflXr. Unlike HflX, HflXr confers ...HflX is a ubiquitous bacterial GTPase that splits and recycles stressed ribosomes. In addition to HflX, Listeria monocytogenes contains a second HflX homolog, HflXr. Unlike HflX, HflXr confers resistance to macrolide and lincosamide antibiotics by an experimentally unexplored mechanism. Here, we have determined cryo-EM structures of L. monocytogenes HflXr-50S and HflX-50S complexes as well as L. monocytogenes 70S ribosomes in the presence and absence of the lincosamide lincomycin. While the overall geometry of HflXr on the 50S subunit is similar to that of HflX, a loop within the N-terminal domain of HflXr, which is two amino acids longer than in HflX, reaches deeper into the peptidyltransferase center. Moreover, unlike HflX, the binding of HflXr induces conformational changes within adjacent rRNA nucleotides that would be incompatible with drug binding. These findings suggest that HflXr confers resistance using an allosteric ribosome protection mechanism, rather than by simply splitting and recycling antibiotic-stalled ribosomes.
履歴
登録2022年6月15日-
ヘッダ(付随情報) 公開2022年11月2日-
マップ公開2022年11月2日-
更新2022年11月16日-
現状2022年11月16日処理サイト: PDBe / 状態: 公開

-
構造の表示

添付画像

emd_15175.png

ダウンロードとリンク

-
マップ

ファイルダウンロード / ファイル: emd_15175.map.gz / 形式: CCP4 / 大きさ: 244.1 MB / タイプ: IMAGE STORED AS FLOATING POINT NUMBER (4 BYTES)
注釈Post-processed masked final map.
投影像・断面図

画像のコントロール

大きさ
明度
コントラスト
その他
軸Z (Sec.)Y (Row.)X (Col.)
0.77 Å/pix.
x 400 pix.
= 309. Å		0.77 Å/pix.
x 400 pix.
= 309. Å		0.77 Å/pix.
x 400 pix.
= 309. Å

表面

投影像

断面 (1/3)

断面 (1/2)

断面 (2/3)

画像は Spider により作成

ボクセルのサイズX=Y=Z: 0.7725 Å
密度

ヒストグラム

ヒストグラム (対数)
表面レベル登録者による: 0.03
最小 - 最大-0.2238391 - 0.43268916
平均 (標準偏差)0.00059460243 (±0.01273682)
対称性空間群: 1
詳細

EMDB XML:

マップ形状
Axis orderXYZ
Origin000
サイズ400400400
Spacing400400400
セルA=B=C: 309.0 Å
α=β=γ: 90.0 °

-
添付データ

-
追加マップ: Final 3D refined map.

ファイルemd_15175_additional_1.map
注釈Final 3D refined map.
投影像・断面図
軸ZYX

投影像

断面 (1/2)
密度ヒストグラム

ヒストグラム

ヒストグラム (対数)

-
ハーフマップ: Half-map2.

ファイルemd_15175_half_map_1.map
注釈Half-map2.
投影像・断面図
軸ZYX

投影像

断面 (1/2)
密度ヒストグラム

ヒストグラム

ヒストグラム (対数)

-
ハーフマップ: Half-map 1.

ファイルemd_15175_half_map_2.map
注釈Half-map 1.
投影像・断面図
軸ZYX

投影像

断面 (1/2)
密度ヒストグラム

ヒストグラム

ヒストグラム (対数)

-
試料の構成要素

+
全体 : Lincomycin bound to the Listeria monocytogenes 50S ribosomal subunit.

全体名称: Lincomycin bound to the Listeria monocytogenes 50S ribosomal subunit.
要素
  • 複合体: Lincomycin bound to the Listeria monocytogenes 50S ribosomal subunit.
    • タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L28
    • タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L29
    • タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L30
    • タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L31 type Bリボソーム
    • タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L32-2リボソーム
    • タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L33 1リボソーム
    • タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L34
    • タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L35
    • タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L36
    • RNA: 23S ribosomal RNA23SリボソームRNA
    • RNA: 5S ribosomal RNA5SリボソームRNA
    • タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L2
    • タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L3
    • タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L4
    • タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L5
    • タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L6
    • タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L13
    • タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L14
    • タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L15
    • タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L16
    • タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L17
    • タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L18
    • タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L19
    • タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L20
    • タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L21
    • タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L22
    • タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L23
    • タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L24
    • タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L27
  • リガンド: ZINC ION
  • リガンド: SPERMIDINEスペルミジン
  • リガンド: MAGNESIUM ION
  • リガンド: 1,4-DIAMINOBUTANEプトレシン
  • リガンド: LINCOMYCINリンコマイシン
  • リガンド: POTASSIUM IONカリウム
  • リガンド: water水

+
超分子 #1: Lincomycin bound to the Listeria monocytogenes 50S ribosomal subunit.

超分子名称: Lincomycin bound to the Listeria monocytogenes 50S ribosomal subunit.
タイプ: complex / キメラ: Yes / ID: 1 / 親要素: 0 / 含まれる分子: #1-#29
由来(天然)生物種: Listeria monocytogenes E (リステリア・モノサイトゲネス)
分子量理論値: 1 MDa

+
分子 #1: 50S ribosomal protein L28

分子名称: 50S ribosomal protein L28 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 1 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Listeria monocytogenes EGD-e (リステリア・モノサイトゲネス)
株: ATCC BAA-679 / EGD-e
分子量理論値: 7.010383 KDa
配列文字列:
MAKECVITGR KSRSGNKRSH AMNSSKRTWK ANLQKVRILV NGKPKKVWVS ARALKSGKVE RV

+
分子 #2: 50S ribosomal protein L29

分子名称: 50S ribosomal protein L29 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 2 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Listeria monocytogenes EGD-e (リステリア・モノサイトゲネス)
株: ATCC BAA-679 / EGD-e
分子量理論値: 7.414548 KDa
配列文字列:
MKANDIRDLS TTEIQDQEKA LKEELFNLRF QLATGQLENT ARIREVRKAI ARMKTIVRER ELA

+
分子 #3: 50S ribosomal protein L30

分子名称: 50S ribosomal protein L30 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 3 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Listeria monocytogenes EGD-e (リステリア・モノサイトゲネス)
株: ATCC BAA-679 / EGD-e
分子量理論値: 6.504753 KDa
配列文字列:
MAKLEITLKR SLIGRPQPQR KTVQALGLGK TNSVVVKEDN PAIRGMITKV SHLVDVKEV

+
分子 #4: 50S ribosomal protein L31 type B

分子名称: 50S ribosomal protein L31 type B / タイプ: protein_or_peptide / ID: 4 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Listeria monocytogenes EGD-e (リステリア・モノサイトゲネス)
株: ATCC BAA-679 / EGD-e
分子量理論値: 9.27436 KDa
配列文字列:
MKTGIHPEYR PVVFVDTSTD FKFLSGSTKS SSETIKWEDG NEYPLLRVEI SSDSHPFYTG KQKHATADGR VDRFNKKYGL K

+
分子 #5: 50S ribosomal protein L32-2

分子名称: 50S ribosomal protein L32-2 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 5 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Listeria monocytogenes EGD-e (リステリア・モノサイトゲネス)
株: ATCC BAA-679 / EGD-e
分子量理論値: 6.534564 KDa
配列文字列:
MAVPFRRTSK AKKRKRRTHV KLQLPGMNEC SNCGEYRLSH HVCPECGQYD GKDVANS

+
分子 #6: 50S ribosomal protein L33 1

分子名称: 50S ribosomal protein L33 1 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 6 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Listeria monocytogenes EGD-e (リステリア・モノサイトゲネス)
株: ATCC BAA-679 / EGD-e
分子量理論値: 6.021034 KDa
配列文字列:
MRVNITLECT ECGDRNYITT KNKRENPERI ELKKYCPRLR RVTLHRETK

+
分子 #7: 50S ribosomal protein L34

分子名称: 50S ribosomal protein L34 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 7 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Listeria monocytogenes EGD-e (リステリア・モノサイトゲネス)
株: ATCC BAA-679 / EGD-e
分子量理論値: 5.319457 KDa
配列文字列:
MKRTYQPSKR KRKKVHGFRT RMSTKNGRRV LASRRRKGRK VLSA

+
分子 #8: 50S ribosomal protein L35

分子名称: 50S ribosomal protein L35 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 8 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Listeria monocytogenes EGD-e (リステリア・モノサイトゲネス)
株: ATCC BAA-679 / EGD-e
分子量理論値: 7.746438 KDa
配列文字列:
MPKMKTHRGS AKRFKRTGSG KLKRRHGFTS HMFANKSQKQ KRKLRKSAMV SAGDFKRIRQ MVAKMK

+
分子 #9: 50S ribosomal protein L36

分子名称: 50S ribosomal protein L36 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 9 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Listeria monocytogenes EGD-e (リステリア・モノサイトゲネス)
株: ATCC BAA-679 / EGD-e
分子量理論値: 4.33646 KDa
配列文字列:
MKVRPSVKPM CEKCKVIRRK GKVMVICENP KHKQKQG

+
分子 #12: 50S ribosomal protein L2

分子名称: 50S ribosomal protein L2 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 12 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Listeria monocytogenes EGD-e (リステリア・モノサイトゲネス)
株: ATCC BAA-679 / EGD-e
分子量理論値: 30.568367 KDa
配列文字列: MAIKKYKPTT NGRRHMTSSD FAEITTSTPE KSLLRPLKKK AGRNNQGKLT VRHHGGGHKR QYRVIDFKRN KDGIPGRVAT IEYDPNRSA NIALINYADG EKRYIIAAKG LEVGQTIYSG AEADIKVGNA LELKDIPVGT VIHNIEMKPG KGGQLVRSAG T SAQVLGKE ...文字列:
MAIKKYKPTT NGRRHMTSSD FAEITTSTPE KSLLRPLKKK AGRNNQGKLT VRHHGGGHKR QYRVIDFKRN KDGIPGRVAT IEYDPNRSA NIALINYADG EKRYIIAAKG LEVGQTIYSG AEADIKVGNA LELKDIPVGT VIHNIEMKPG KGGQLVRSAG T SAQVLGKE GKYVLIRLNS GEVRMILATC RATIGQVGNE QHELINIGKA GRSRWMGKRP TVRGSVMNPN DHPHGGGEGK AP IGRKSPM SPWGKPTLGY KTRKKNNNSD KFIVRRRKKK

+
分子 #13: 50S ribosomal protein L3

分子名称: 50S ribosomal protein L3 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 13 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Listeria monocytogenes EGD-e (リステリア・モノサイトゲネス)
株: ATCC BAA-679 / EGD-e
分子量理論値: 22.863459 KDa
配列文字列: MTKGILGRKV GMTQVFTENG ELIPVTVIEA AQNVVLQKKT VETDGYEAVQ IGFEDKRAIL SNKPEQGHVA KANTTPKRFI REFRDVNLD EYEIGAEVKV DVFAEGDIID ATGVSKGKGF QGVIKRHGQS RGPMAHGSRY HRRPGSMGPV APNRVFKNKL L PGRMGGEQ ...文字列:
MTKGILGRKV GMTQVFTENG ELIPVTVIEA AQNVVLQKKT VETDGYEAVQ IGFEDKRAIL SNKPEQGHVA KANTTPKRFI REFRDVNLD EYEIGAEVKV DVFAEGDIID ATGVSKGKGF QGVIKRHGQS RGPMAHGSRY HRRPGSMGPV APNRVFKNKL L PGRMGGEQ ITIQNLEIVK VDVEKNVLLV KGNVPGAKKA LVQIKTATKA K

+
分子 #14: 50S ribosomal protein L4

分子名称: 50S ribosomal protein L4 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 14 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Listeria monocytogenes EGD-e (リステリア・モノサイトゲネス)
株: ATCC BAA-679 / EGD-e
分子量理論値: 22.640262 KDa
配列文字列: MPKLSLLKQD GTNAGEITLN DTVFGIEPNE KVVVDVILSQ RASLRQGTHK VKNRSEVRGG GRKPWRQKGT GRARQGSIRS PQWRGGGVV FGPTPRSYAY KLPKKVRRLA IKSILSSKVN EEKLVVLEGL TFDAPKTKEF AAFLKNISVD TKALIVVAGE S ENVELSAR ...文字列:
MPKLSLLKQD GTNAGEITLN DTVFGIEPNE KVVVDVILSQ RASLRQGTHK VKNRSEVRGG GRKPWRQKGT GRARQGSIRS PQWRGGGVV FGPTPRSYAY KLPKKVRRLA IKSILSSKVN EEKLVVLEGL TFDAPKTKEF AAFLKNISVD TKALIVVAGE S ENVELSAR NLQGITVIPA ESISVLEVAK HDKLIITKAA VEKVEEVLA

+
分子 #15: 50S ribosomal protein L5

分子名称: 50S ribosomal protein L5 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 15 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Listeria monocytogenes EGD-e (リステリア・モノサイトゲネス)
株: ATCC BAA-679 / EGD-e
分子量理論値: 20.023248 KDa
配列文字列:
MNRLKDQYLK EIVPALMSKF NYDSVMEVPK IDKIVINTGV GDATANAKVL DSAVEELALI TGQKPVITKA KNSIAGFRLR EGMPIGAKV TLRGERMYDF LDKLVTVSLP RVRDFRGVSK KAFDGRGNYT LGVREQLIFP EIDYDQVSKV RGMDVVIVTT A KSDEESHE LLTQLGMPFQ K

+
分子 #16: 50S ribosomal protein L6

分子名称: 50S ribosomal protein L6 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 16 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Listeria monocytogenes EGD-e (リステリア・モノサイトゲネス)
株: ATCC BAA-679 / EGD-e
分子量理論値: 19.434365 KDa
配列文字列:
MSRIGKKTIV IPAGVTVTLN GSTATVKGPK GELVKEFNPE ITIKIEGNEI NVSRPTDNKN HRALHGTTRA ILNNMVVGVS EGYEKKLEL IGVGYRAQKQ GDKLVLNVGY SHPVEFVAPK GVDIEVPANT QVIVKGYNKE HVGELAANIR AVRPPEPYKG K GIRYEGEH VRRKEGKTGK

+
分子 #17: 50S ribosomal protein L13

分子名称: 50S ribosomal protein L13 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 17 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Listeria monocytogenes EGD-e (リステリア・モノサイトゲネス)
株: ATCC BAA-679 / EGD-e
分子量理論値: 16.227671 KDa
配列文字列:
MRTTYMAKPG EVERKWYVID ATGVSLGRLS SEVASILRGK NKPQFTPHID TGDFVIIINA GKIGLTGKKA TDKIYYRHSQ YPGGLKSRT AGEMRTNNPE KLLELSIKGM LPKNSLGRQL FKKLHVYGGS EHEHAAQQPE VYELRG

+
分子 #18: 50S ribosomal protein L14

分子名称: 50S ribosomal protein L14 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 18 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Listeria monocytogenes EGD-e (リステリア・モノサイトゲネス)
株: ATCC BAA-679 / EGD-e
分子量理論値: 13.248427 KDa
配列文字列:
MIQQESRMKV ADNSGAREVL TIKVLGGSGR KTANIGDVVV CTVKQATPGG VVKKGEVVKA VIVRTKSGAR RQDGSYIKFD ENACVIIRD DKSPRGTRIF GPVARELREN NFMKIVSLAP EVL

+
分子 #19: 50S ribosomal protein L15

分子名称: 50S ribosomal protein L15 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 19 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Listeria monocytogenes EGD-e (リステリア・モノサイトゲネス)
株: ATCC BAA-679 / EGD-e
分子量理論値: 15.812118 KDa
配列文字列:
MKLHELKPSE GSRKERNRVG RGTGSGNGKT SGRGHKGQKA RSGGGVRLGF EGGQLPLFRR IPKRGFTNIN RKEFAIVNLD VLNRFEDGT EVTPELLVET GIIRNEKSGI KILSNGNIEK KLTVKANKFS AAAKEAIEAA GGKTEVI

+
分子 #20: 50S ribosomal protein L16

分子名称: 50S ribosomal protein L16 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 20 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Listeria monocytogenes EGD-e (リステリア・モノサイトゲネス)
株: ATCC BAA-679 / EGD-e
分子量理論値: 16.171043 KDa
配列文字列:
MLVPKRVKYR REFRGNMRGR AKGGTEVAFG EYGLQAVEAS WITNRQIEAA RIAMTRYMKR GGKVWIKIFP HKSYTSKPIG VRMGKGKGA PEGWVSPVKR GKIMFEIAGV PEDVAREALR LAAHKLPVKT KIVKREEIGG EANES

+
分子 #21: 50S ribosomal protein L17

分子名称: 50S ribosomal protein L17 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 21 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Listeria monocytogenes EGD-e (リステリア・モノサイトゲネス)
株: ATCC BAA-679 / EGD-e
分子量理論値: 15.246793 KDa
配列文字列:
MGYRKLGRTS SQRKALLRDL ATDLIVFERI ETTEARAKEI RKVVEKLITS GKKGDLHARR QAAAFIRHEV VEVVQVDAKG KDGSTVKKN RPVYALQKLF DDVAPRYAER QGGYTRILKK GPRRGDGAPM VIIELV

+
分子 #22: 50S ribosomal protein L18

分子名称: 50S ribosomal protein L18 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 22 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Listeria monocytogenes EGD-e (リステリア・モノサイトゲネス)
株: ATCC BAA-679 / EGD-e
分子量理論値: 13.121936 KDa
配列文字列:
MITKIDKNKV RKKRHARVRS KISGTESRPR LNVFRSNKNI YAQIIDDVNG VTLASASNLD KDFGSAESKV DAASKVGELV AKRASEKGI TSVTFDRGGY LYHGRVKALA EAARENGLEF

+
分子 #23: 50S ribosomal protein L19

分子名称: 50S ribosomal protein L19 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 23 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Listeria monocytogenes EGD-e (リステリア・モノサイトゲネス)
株: ATCC BAA-679 / EGD-e
分子量理論値: 13.146463 KDa
配列文字列:
MNKLIDEITK SQLNPDVPNF RPGDTVRVHA KVVEGTRERI QLFEGVVIKR RGAGISETFT VRKISNSVGV ERTFPVHTPR IAKLEVIRR GKVRRAKLYY LRNLRGKAAR IKEIR

+
分子 #24: 50S ribosomal protein L20

分子名称: 50S ribosomal protein L20 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 24 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Listeria monocytogenes EGD-e (リステリア・モノサイトゲネス)
株: ATCC BAA-679 / EGD-e
分子量理論値: 13.71935 KDa
配列文字列:
MPRVKGGTVT RKRRKKIVKL AKGYYGSKHL LFKVANQAVM KSYQYAYRDR RQKKRDFRRL WIARINAAAR MQDLSYSKLM HGLKLAGID INRKMLADLA VNDIASFNTL ADSAKKALAK

+
分子 #25: 50S ribosomal protein L21

分子名称: 50S ribosomal protein L21 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 25 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Listeria monocytogenes EGD-e (リステリア・モノサイトゲネス)
株: ATCC BAA-679 / EGD-e
分子量理論値: 11.234029 KDa
配列文字列:
MYAIIETGGK QIKVEAGQEI YVEKLAGEVG DVVTFDKVLF VGGDSAKVGV PFVEGATVTA KVEKQGRAKK LTVYKYKPKK NYHKKQGHR QPYTKLTIDA INA

+
分子 #26: 50S ribosomal protein L22

分子名称: 50S ribosomal protein L22 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 26 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Listeria monocytogenes EGD-e (リステリア・モノサイトゲネス)
株: ATCC BAA-679 / EGD-e
分子量理論値: 12.895945 KDa
配列文字列:
MASEVTSAKA VAKTVRIAPR KARIVIDLIR GKQVGEAIAI LKYTPRSASP IIEKVLKSAI ANAEHNYDLD INNLVVEEAF VDEGPTLKR FRPRAQGRAS AINKRTSHIT VVVSEVKEG

+
分子 #27: 50S ribosomal protein L23

分子名称: 50S ribosomal protein L23 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 27 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Listeria monocytogenes EGD-e (リステリア・モノサイトゲネス)
株: ATCC BAA-679 / EGD-e
分子量理論値: 10.935654 KDa
配列文字列:
MDARDIIKRP VVTEESTSIL DDKKYTFEVD TRATKTQVKY AVEEIFDVKV AKVNVMNYKG KLKRMGRYAG YTNKRRKAIV TVTADSKEI QFFEV

+
分子 #28: 50S ribosomal protein L24

分子名称: 50S ribosomal protein L24 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 28 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Listeria monocytogenes EGD-e (リステリア・モノサイトゲネス)
分子量理論値: 11.205304 KDa
配列文字列:
MHVKKGDKVK VITGKDKGKS GKVLAAFPKK DRVLIEGINM VKKHTKPSNV NPQGGILNVE APIHVSNVML LDPKTGEPTR VGYEVKGDK KVRVAKKSGE VIDK

+
分子 #29: 50S ribosomal protein L27

分子名称: 50S ribosomal protein L27 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 29 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Listeria monocytogenes EGD-e (リステリア・モノサイトゲネス)
株: ATCC BAA-679 / EGD-e
分子量理論値: 10.57193 KDa
配列文字列:
MLKFDIQHFA HKKGGGSTSN GRDSESKRLG AKRADGQFVT GGSILYRQRG TKIYPGTNVG RGGDDTLFAK TDGVVRFERM GRDKKKVSV YPEVQEA

+
分子 #10: 23S ribosomal RNA

分子名称: 23S ribosomal RNA / タイプ: rna / ID: 10 / コピー数: 1
由来(天然)生物種: Listeria monocytogenes EGD-e (リステリア・モノサイトゲネス)
分子量理論値: 950.710438 KDa
配列文字列: GGUUAAGUUA GAAAGGGCGC ACGGUGGAUG CCUUGGCACU AGGAGCCGAA GAAGGACGGG ACUAACACCG AUAUGCUUUG GGGAGCUGU ACGUAAGCGU UGAUCCAGAG AUUUCCGAAU GGGGGAACCC ACUAUCUUUA GUCGGAUAGU AUCCUUACGU G AAUACAUA ...文字列:
GGUUAAGUUA GAAAGGGCGC ACGGUGGAUG CCUUGGCACU AGGAGCCGAA GAAGGACGGG ACUAACACCG AUAUGCUUUG GGGAGCUGU ACGUAAGCGU UGAUCCAGAG AUUUCCGAAU GGGGGAACCC ACUAUCUUUA GUCGGAUAGU AUCCUUACGU G AAUACAUA GCGUGAGGAA GGCAGACCCA GGGAACUGAA ACAUCUAAGU ACCUGGAGGA AGAGAAAGAA AAAUCGAUUU CC UGAGUAG CGGCGAGCGA AACGGAAAGA GCCCAAACCA AGAAGCUUGC UUCUUGGGGU UGUAGGACAC UCUAUAUGGA GUU ACAAAA GAAAGUUAUA AAUGAAGCGG UCUGGAAAGG CCCGCCAAAG ACGGUAACAG CCCGGUAGUU GAAAUGGCUU UCCC UCCAG AGUGGAUCCU GAGUACGGCG GAACACGUGA AAUUCCGUCG GAAUCCGGGA GGACCAUCUC CCAAGGCUAA AUACU CCCU AGUGACCGAU AGUGAACCAG UACCGUGAGG GAAAGGUGAA AAGCACCCCG GAAGGGGAGU GAAACAGUUC CUGAAA CCG UGUGCCUACA AGUAGUUAGA GCCCGUUAAU GGGUGAUAGC GUGCCUUUUG UAGAAUGAAC CGGCGAGUUA CGAUUUG UU GCAAGGUUAA GCGGAAAAAG CGGAGCCGUA GCGAAAGCGA GUCUGAAUAG GGCGCAUAAG UAACAGGUCG UAGACCCG A AACCAGGUGA UCUACCCAUG UCCAGGAUGA AGGUAAGGUA AUACUUACUG GAGGUCCGAA CCCACGCACG UUGAAAAGU GCGGGGAUGA GGUGUGGGUA GCGGAGAAAU UCCAAUCGAA CUUGGAGAUA GCUGGUUCUC UCCGAAAUAG CUUUAGGGCU AGCCUCGAG GUAAAGAGUC AUGGAGGUAG AGCACUGUUU GGACUAGGGG CCCUUCUCGG GUUACCGAAU UCAGAUAAAC U CCGAAUGC CAUGUACUUA UACUCGGGAG UCAGACUGCG AGUGAUAAGA UCCGUAGUCG AAAGGGAAAC AGCCCAGACC AC CAGUUAA GGUCCCCAAA UAUAUGUUAA GUGGAAAAGG AUGUGGGGUU GCUUAGACAA CCAGGAUGUU GGCUUAGAAG CAG CCACCA UUGAAAGAGU GCGUAAUAGC UCACUGGUCG AGUGACCCCG CGCCGAAAAU GUACCGGGGC UAAACAUAUU ACCG AAACU GUGGAUGAAC CUCUUUAGAG GUUCGUGGUA GGAGAGCGUU CUAAGGGCGG UGAAGUCAGA CCGGAAGGAC UGGUG GAGC GCUUAGAAGU GAGAAUGCCG GUAUGAGUAG CGAAAGAAGG GUGAGAAUCC CUUCCACCGA AUAUCUAAGG UUUCCU GAG GAAGGCUCGU CCGCUCAGGG UUAGUCGGGA CCUAAGCCGA GGCCGAUAGG CGUAGGCGAU GGACAACAGG UAGAGAU UC CUGUACCAGU GCUAAUUGUU UAACCGAUGG GGUGACACAG AAGGAUAGGG AAUCGCACGA AUGGAAAUGU GCGUCCAA G CAGUGAGUGU GAGAAGUAGG CAAAUCCGCU UCUCGCGAAG CAUGAGCUGU GAUGGGGAAG GAAAUUAAGU ACGGAAGUU CCUGAUUUCA CGCUGUCAAG AAAAGCCUCU AGGAAGAGUA GUACUGCCCG UACCGCAAAC CGACACAGGU AGAUGAGGAG AGAAUCCUA AGGUGAGCGA GAGAACUCUC GUUAAGGAAC UCGGCAAAAU GACCCCGUAA CUUCGGGAGA AGGGGUGCUC U AUUAGGGU GCAAGCCCGA GAGAGCCGCA GUGAAUAGGC CCAGGCGACU GUUUAGCAAA AACACAGGUC UCUGCAAAAC CG UAAGGUG ACGUAUAGGG GCUGACGCCU GCCCGGUGCU GGAAGGUUAA GAGGAGUGCU UAGCUUCGGC GAAGGUACGA AUU GAAGCC CCAGUAAACG GCGGCCGUAA CUAUAACGGU CCUAAGGUAG CGAAAUUCCU UGUCGGGUAA GUUCCGACCC GCAC GAAAG GCGCAACGAU CUGGGCACUG UCUCAACGAG AGACUCGGUG AAAUUAUAGU ACCUGUGAAG AUGCAGGUUA CCCGC GACA GGACGGAAAG ACCCCGUGGA GCUUUACUGC AACCUGAUAU GGAAUGUUUG UACCGCUUGU ACAGGAUAGG UAGGAG CCG AAGAGACGUG UGCGCUAGCA UACGAGGAGG CAAUGGUGGG AUACUACCCU GGCUGUAUGA CCAUUCUAAC CCGCCAC GC UUAGCGCGUG GGGAGACAGU GUCAGGUGGG CAGUUUGACU GGGGCGGUCG CCUCCUAAAG AGUAACGGAG GCGCCCAA A GGUUCCCUCA GAAUGGAUGG AAAUCAUUCG CAGAGUGUAA AGGCACAAGG GAGCUUGACU GCGAGACUGA CAAGUCGAG CAGGGACGAA AGUCGGGCUU AGUGAUCCGG UGGUUCCGCA UGGAAGGGCC AUCGCUCAAC GGAUAAAAGC UACCCCGGGG AUAACAGGC UUAUCUCCCC CAAGAGUCCA CAUCGACGGG GAGGUUUGGC ACCUCGAUGU CGGCUCGUCG CAUCCUGGGG C UGUAGUCG GUCCCAAGGG UUGGGCUGUU CGCCCAUUAA AGCGGCACGC GAGCUGGGUU CAGAACGUCG UGAGACAGUU CG GUCCCUA UCCGUCGCGG GCGCAGGAAA UUUGAGAGGA GCUGUCCUUA GUACGAGAGG ACCGGGAUGG ACACACCGCU GGU GUACCA GUUGUUCCGC CAGGAGCAUC GCUGGGUAGC UAUGUGUGGC AGGGAUAAAC GCUGAAAGCA UCUAAGCGUG AAGC CCCCC UCAAGAUGAG AUUUCCCAUU UCUUCGGAAA GUAAGAUCCC UGAAAGAUGA UCAGGUAGAU AGGUUUGGAG UGGAA GUGU AGCGAUACAU GGAGCGGACA AAUACUAAUC GAUCGAGGAC UUAACCA

+
分子 #11: 5S ribosomal RNA

分子名称: 5S ribosomal RNA / タイプ: rna / ID: 11 / コピー数: 1
由来(天然)生物種: Listeria monocytogenes EGD-e (リステリア・モノサイトゲネス)
分子量理論値: 36.71673 KDa
配列文字列:
CUGGUAGUUA UGGCGAGAAG GUCACACCCG UUCCCAUACC GAACACGGUA GUUAAGCUUC UCUGCGCCAA UGGUAGUUGG GGGCUUCCC CCUGCGAGAG UAGGUCGCUG CCGGG

+
分子 #30: ZINC ION

分子名称: ZINC ION / タイプ: ligand / ID: 30 / コピー数: 2 / 式: ZN
分子量理論値: 65.409 Da

+
分子 #31: SPERMIDINE

分子名称: SPERMIDINE / タイプ: ligand / ID: 31 / コピー数: 1 / 式: SPD
分子量理論値: 145.246 Da
Chemical component information

ChemComp-SPD:
SPERMIDINE / スペルミジン / スペルミジン

+
分子 #32: MAGNESIUM ION

分子名称: MAGNESIUM ION / タイプ: ligand / ID: 32 / コピー数: 165 / 式: MG
分子量理論値: 24.305 Da

+
分子 #33: 1,4-DIAMINOBUTANE

分子名称: 1,4-DIAMINOBUTANE / タイプ: ligand / ID: 33 / コピー数: 2 / 式: PUT
分子量理論値: 88.151 Da
Chemical component information

ChemComp-PUT:
1,4-DIAMINOBUTANE / プトレシン / プトレシン

+
分子 #34: LINCOMYCIN

分子名称: LINCOMYCIN / タイプ: ligand / ID: 34 / コピー数: 1 / 式: 3QB
分子量理論値: 406.537 Da
Chemical component information

ChemComp-3QB:
LINCOMYCIN / リンコマイシン / 抗生剤*YM / リンコマイシン

+
分子 #35: POTASSIUM ION

分子名称: POTASSIUM ION / タイプ: ligand / ID: 35 / コピー数: 1 / 式: K
分子量理論値: 39.098 Da

+
分子 #36: water

分子名称: water / タイプ: ligand / ID: 36 / コピー数: 1381 / 式: HOH
分子量理論値: 18.015 Da
Chemical component information

ChemComp-HOH:
WATER / 水

-
実験情報

-
構造解析

手法クライオ電子顕微鏡法
解析単粒子再構成法
試料の集合状態particle

-
試料調製

緩衝液pH: 7.5
構成要素:
濃度式名称
20.0 mMC8H18N2O4SHEPES
15.0 mMMg(OAc)2Magnesium acetate
95.0 mMKClPotassium chloride
5.0 mMNH4ClAmmonium chloride
0.5 mMCaCl2Calcium chloride
8.0 mMC4H12N2Putrescineプトレシン
1.0 mMC7H19N3Spermidineスペルミジン
0.5 mMC10H16N2O8EDTAエチレンジアミン四酢酸

詳細: 0.05% Nikkol
グリッドモデル: Quantifoil R2/2 / 材質: COPPER / 支持フィルム - 材質: CARBON / 支持フィルム - トポロジー: CONTINUOUS / 支持フィルム - Film thickness: 2.0 nm
凍結凍結剤: ETHANE-PROPANE / チャンバー内湿度: 100 % / チャンバー内温度: 277 K / 装置: FEI VITROBOT MARK IV
詳細5 OD260/mL

-
電子顕微鏡法

顕微鏡FEI TITAN KRIOS
電子線加速電圧: 300 kV / 電子線源: FIELD EMISSION GUN
電子光学系照射モード: FLOOD BEAM / 撮影モード: BRIGHT FIELDBright-field microscopy
最大 デフォーカス（公称値）: 1.4000000000000001 µm
最小 デフォーカス（公称値）: 0.4 µm / 倍率（公称値）: 270000
撮影フィルム・検出器のモデル: GATAN K2 SUMMIT (4k x 4k)
検出モード: COUNTING / 平均電子線量: 40.3 e/Å2
実験機器
モデル: Titan Krios / 画像提供: FEI Company

-
画像解析

粒子像選択選択した数: 506262
CTF補正ソフトウェア - 名称: CTFFIND (ver. 4.1.14)
初期モデルモデルのタイプ: PDB ENTRY
PDBモデル - PDB ID:

7nhn


詳細: Listeria monocytogenes 70S
初期 角度割当タイプ: ANGULAR RECONSTITUTION / ソフトウェア - 名称: RELION (ver. 3.1.3)
最終 3次元分類クラス数: 6 / 平均メンバー数/クラス: 100000 / ソフトウェア - 名称: RELION (ver. 3.1.3)
最終 角度割当タイプ: ANGULAR RECONSTITUTION / ソフトウェア - 名称: RELION (ver. 3.1.3)
最終 再構成使用したクラス数: 1 / アルゴリズム: FOURIER SPACE / 解像度のタイプ: BY AUTHOR / 解像度: 2.3 Å / 解像度の算出法: FSC 0.143 CUT-OFF / 使用した粒子像数: 285330
FSC曲線 (解像度の算出)

+
万見について

-
お知らせ

-
2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

-
2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

+
2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

+
2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか？ / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

+
2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例：em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

-
万見 (Yorodumi)

幾万の構造データを、幾万の視点から

  • 万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
  • EM Navigatorの詳細ページの後継、Omokage検索のフロントエンドも兼ねています。

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較 / 万見検索 / 2016年8月31日: 新しいEM Navigatorと万見 / 万見文献 / Jmol/JSmol / 機能・相同性情報 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

他の情報も見る