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-基本情報
登録情報 | データベース: EMDB / ID: EMD-4135 | |||||||||||||||
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タイトル | Structure of the mammalian rescue complex with Pelota and Hbs1l assembled on a UGA stop codon. | |||||||||||||||
マップデータ | Postprocessed, sharpened map. | |||||||||||||||
試料 |
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キーワード | Translation (翻訳) / Elongation / Ribosome (リボソーム) | |||||||||||||||
機能・相同性 | 機能・相同性情報 stalled ribosome sensor activity / Dom34-Hbs1 complex / RNA surveillance / nuclear-transcribed mRNA catabolic process, no-go decay / mRNA decay by 3' to 5' exoribonuclease / mesenchymal to epithelial transition / nuclear-transcribed mRNA catabolic process, non-stop decay / nonfunctional rRNA decay / ribosome disassembly / endoderm development ...stalled ribosome sensor activity / Dom34-Hbs1 complex / RNA surveillance / nuclear-transcribed mRNA catabolic process, no-go decay / mRNA decay by 3' to 5' exoribonuclease / mesenchymal to epithelial transition / nuclear-transcribed mRNA catabolic process, non-stop decay / nonfunctional rRNA decay / ribosome disassembly / endoderm development / positive regulation of BMP signaling pathway / inner cell mass cell proliferation / stem cell population maintenance / chromosome organization / translation elongation factor activity / rescue of stalled ribosome / maturation of LSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA) / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / cytosolic ribosome / 加水分解酵素; 酸無水物に作用; GTPに作用・細胞または細胞小器官の運動に関与 / ribosome binding / regulation of translation / 5S rRNA binding / cytosolic large ribosomal subunit / リボソーム / structural constituent of ribosome / 細胞周期 / 翻訳 (生物学) / ribonucleoprotein complex / 細胞分裂 / GTPase activity / GTP binding / 核小体 / シグナル伝達 / RNA binding / extracellular exosome / 生体膜 / metal ion binding / 細胞質基質 / 細胞質 類似検索 - 分子機能 HBS1-like protein, N-terminal domain superfamily / HBS1-like protein, N-terminal / HBS1 N-terminus / Translation release factor pelota / Pelota/DOM34, N-terminal domain / eRF1 domain 2 / eRF1 domain 2 / eRF1 domain 1 / eRF1 domain 1/Pelota-like / eRF1 domain 3 ...HBS1-like protein, N-terminal domain superfamily / HBS1-like protein, N-terminal / HBS1 N-terminus / Translation release factor pelota / Pelota/DOM34, N-terminal domain / eRF1 domain 2 / eRF1 domain 2 / eRF1 domain 1 / eRF1 domain 1/Pelota-like / eRF1 domain 3 / eRF1, domain 2 superfamily / eRF1 domain 3 / eRF1_1 / Translation elongation factor EFTu/EF1A, C-terminal / Elongation factor Tu C-terminal domain / Translation elongation factor EF1A/initiation factor IF2gamma, C-terminal / Ribosomal protein S12e signature. / Ribosomal protein S19e signature. / 40S Ribosomal protein S10 / Plectin/S10, N-terminal / Plectin/S10 domain / Ribosomal protein S17e signature. / Ribosomal protein L27e signature. / Ribosomal protein L44e signature. / Ribosomal protein L10e signature. / Ribosomal protein S7e signature. / Ribosomal protein L7, eukaryotic / Ribosomal protein L30, N-terminal / Ribosomal L30 N-terminal domain / Ribosomal protein S3Ae signature. / Ribosomal protein S27e signature. / Ribosomal protein L39e, conserved site / Ribosomal protein L24e signature. / Ribosomal protein L5 eukaryotic, C-terminal / Ribosomal L18 C-terminal region / Ribosomal protein L6e signature. / Ribosomal protein L30e signature 1. / Translation elongation factor EFTu-like, domain 2 / Ribosomal protein L30e signature 2. / Ribosomal protein L36e signature. / Ribosomal protein L39e signature. / Ribosomal protein L35Ae signature. / Ribosomal protein L39e / Ribosomal protein L39e domain superfamily / Ribosomal protein S6e signature. / Ribosomal L39 protein / Ribosomal protein S28e signature. / Ribosomal protein L31e signature. / Elongation factor Tu domain 2 / Ribosomal protein L5 eukaryotic/L18 archaeal / Ribosomal large subunit proteins 60S L5, and 50S L18 / Ribosomal protein L7, eukaryotic/archaeal / Ribosomal protein L7/L30 / Ribosomal protein L32e signature. / Ribosomal protein L6 signature 2. / Ribosomal protein L15e signature. / Ribosomal protein L21e signature. / Ribosomal protein L37e signature. / Translational (tr)-type GTP-binding domain / Elongation factor Tu GTP binding domain / Translational (tr)-type guanine nucleotide-binding (G) domain profile. / Ribosomal protein L11 signature. / 50S ribosomal protein L30e-like / Ubiquitin domain signature. / Ribosomal protein L23 signature. / Ribosomal protein S3 signature. / Ribosomal protein S10 signature. / Ribosomal protein S14 signature. / Ribosomal protein L5 signature. / Ribosomal protein L29 signature. / Type-2 KH domain profile. / Ribosomal protein S19 signature. / Ribosomal protein S7 signature. / Ribosomal protein L15 signature. / Ribosomal protein S17 signature. / Ribosomal protein S13 signature. / Ribosomal protein S13 family profile. / Ribosomal protein S8 signature. / Ribosomal protein S4 signature. / Ribosomal protein S15 signature. / S4 RNA-binding domain profile. / Ribosomal protein S11 signature. / Ribosomal protein L14 signature. / Ribosomal protein L22 signature. / Ubiquitin domain profile. / Ribosomal protein S9 signature. / Ribosomal protein L30, ferredoxin-like fold domain / Ribosomal protein L30, ferredoxin-like fold domain superfamily / Ribosomal protein L30p/L7e / Ribosomal protein L24 signature. / Ribosomal protein L3 signature. / Translation protein, beta-barrel domain superfamily / Trp-Asp (WD) repeats signature. / Trp-Asp (WD) repeats profile. / Trp-Asp (WD) repeats circular profile. / Winged helix-like DNA-binding domain superfamily / P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolase 類似検索 - ドメイン・相同性 Large ribosomal subunit protein uL16 / Small ribosomal subunit protein uS4 / Large ribosomal subunit protein eL24 / Large ribosomal subunit protein uL23 / Large ribosomal subunit protein eL33 / Small ribosomal subunit protein eS12 / Large ribosomal subunit protein eL29 / Small ribosomal subunit protein uS9 / Large ribosomal subunit protein eL31 / Large ribosomal subunit protein eL21 ...Large ribosomal subunit protein uL16 / Small ribosomal subunit protein uS4 / Large ribosomal subunit protein eL24 / Large ribosomal subunit protein uL23 / Large ribosomal subunit protein eL33 / Small ribosomal subunit protein eS12 / Large ribosomal subunit protein eL29 / Small ribosomal subunit protein uS9 / Large ribosomal subunit protein eL31 / Large ribosomal subunit protein eL21 / Large ribosomal subunit protein uL29 / Small ribosomal subunit protein uS10 / Small ribosomal subunit protein RACK1 / Ubiquitin-ribosomal protein eS31 fusion protein / Large ribosomal subunit protein eL6 / Large ribosomal subunit protein uL11 / Large ribosomal subunit protein uL15 / Small ribosomal subunit protein uS15 / Large ribosomal subunit protein uL24 / Small ribosomal subunit protein eS1 / Large ribosomal subunit protein eL8 / Small ribosomal subunit protein eS7 / Large ribosomal subunit protein uL6 / Large ribosomal subunit protein eL43 / Large ribosomal subunit protein uL18 / Large ribosomal subunit protein eL14 / Large ribosomal subunit protein eL15 / Small ribosomal subunit protein uS11 / Large ribosomal subunit protein uL14 / Ubiquitin-like FUBI-ribosomal protein eS30 fusion protein / Small ribosomal subunit protein eS25 / Large ribosomal subunit protein eL30 / Small ribosomal subunit protein uS7 / Small ribosomal subunit protein uS8 / Small ribosomal subunit protein eS28 / Large ribosomal subunit protein uL3 / Small ribosomal subunit protein eS6 / Small ribosomal subunit protein eS19 / Small ribosomal subunit protein uS3 / Small ribosomal subunit protein uS13 / Plectin/eS10 N-terminal domain-containing protein / Small ribosomal subunit protein uS17 / Large ribosomal subunit protein eL39 / Large ribosomal subunit protein eL36 / Small ribosomal subunit protein eS17 / Large ribosomal subunit protein uL30 / Large ribosomal subunit protein uL5 / Large ribosomal subunit protein uL22 / Large ribosomal subunit protein uL6 / Large ribosomal subunit protein eL27 / Small ribosomal subunit protein eS27 / Small ribosomal subunit protein uS19 / Large ribosomal subunit protein eL42 / Large ribosomal subunit protein eL32 / Large ribosomal subunit protein eL28 / Small ribosomal subunit protein uS14 / Protein pelota homolog / HBS1-like protein / Large ribosomal subunit protein eL37 類似検索 - 構成要素 | |||||||||||||||
生物種 | Oryctolagus cuniculus (ウサギ) / Homo sapiens (ヒト) | |||||||||||||||
手法 | 単粒子再構成法 / クライオ電子顕微鏡法 / 解像度: 3.67 Å | |||||||||||||||
データ登録者 | Shao S / Murray J | |||||||||||||||
資金援助 | 英国, 3件
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引用 | ジャーナル: Cell / 年: 2016 タイトル: Decoding Mammalian Ribosome-mRNA States by Translational GTPase Complexes. 著者: Sichen Shao / Jason Murray / Alan Brown / Jack Taunton / V Ramakrishnan / Ramanujan S Hegde / 要旨: In eukaryotes, accurate protein synthesis relies on a family of translational GTPases that pair with specific decoding factors to decipher the mRNA code on ribosomes. We present structures of the ...In eukaryotes, accurate protein synthesis relies on a family of translational GTPases that pair with specific decoding factors to decipher the mRNA code on ribosomes. We present structures of the mammalian ribosome engaged with decoding factor⋅GTPase complexes representing intermediates of translation elongation (aminoacyl-tRNA⋅eEF1A), termination (eRF1⋅eRF3), and ribosome rescue (Pelota⋅Hbs1l). Comparative analyses reveal that each decoding factor exploits the plasticity of the ribosomal decoding center to differentially remodel ribosomal proteins and rRNA. This leads to varying degrees of large-scale ribosome movements and implies distinct mechanisms for communicating information from the decoding center to each GTPase. Additional structural snapshots of the translation termination pathway reveal the conformational changes that choreograph the accommodation of decoding factors into the peptidyl transferase center. Our results provide a structural framework for how different states of the mammalian ribosome are selectively recognized by the appropriate decoding factor⋅GTPase complex to ensure translational fidelity. | |||||||||||||||
履歴 |
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-構造の表示
ムービー |
ムービービューア |
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構造ビューア | EMマップ: SurfViewMolmilJmol/JSmol |
添付画像 |
-ダウンロードとリンク
-EMDBアーカイブ
マップデータ | emd_4135.map.gz | 13.2 MB | EMDBマップデータ形式 | |
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ヘッダ (付随情報) | emd-4135-v30.xml emd-4135.xml | 107.5 KB 107.5 KB | 表示 表示 | EMDBヘッダ |
FSC (解像度算出) | emd_4135_fsc.xml | 14.6 KB | 表示 | FSCデータファイル |
画像 | emd_4135.png | 189 KB | ||
Filedesc metadata | emd-4135.cif.gz | 21.5 KB | ||
その他 | emd_4135_half_map_1.map.gz emd_4135_half_map_2.map.gz | 246.4 MB 247.2 MB | ||
アーカイブディレクトリ | http://ftp.pdbj.org/pub/emdb/structures/EMD-4135 ftp://ftp.pdbj.org/pub/emdb/structures/EMD-4135 | HTTPS FTP |
-関連構造データ
関連構造データ | 5lzxMC 4129C 4130C 4131C 4132C 4133C 4134C 4136C 4137C 5lzsC 5lztC 5lzuC 5lzvC 5lzwC 5lzyC 5lzzC M: このマップから作成された原子モデル C: 同じ文献を引用 (文献) |
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類似構造データ |
-リンク
EMDBのページ | EMDB (EBI/PDBe) / EMDataResource |
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「今月の分子」の関連する項目 |
-マップ
ファイル | ダウンロード / ファイル: emd_4135.map.gz / 形式: CCP4 / 大きさ: 282.6 MB / タイプ: IMAGE STORED AS FLOATING POINT NUMBER (4 BYTES) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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注釈 | Postprocessed, sharpened map. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ボクセルのサイズ | X=Y=Z: 1.34 Å | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
密度 |
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対称性 | 空間群: 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
詳細 | EMDB XML:
CCP4マップ ヘッダ情報:
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-添付データ
-ハーフマップ: Half map 1.
ファイル | emd_4135_half_map_1.map | ||||||||||||
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注釈 | Half map 1. | ||||||||||||
投影像・断面図 |
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密度ヒストグラム |
-ハーフマップ: Half map 2.
ファイル | emd_4135_half_map_2.map | ||||||||||||
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注釈 | Half map 2. | ||||||||||||
投影像・断面図 |
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密度ヒストグラム |
-試料の構成要素
+全体 : Affinity-purified 80S ribosome-nascent chain complex reconstitute...
全体 | 名称: Affinity-purified 80S ribosome-nascent chain complex reconstituted with Pelota and Hbs1l. |
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要素 |
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+超分子 #1: Affinity-purified 80S ribosome-nascent chain complex reconstitute...
超分子 | 名称: Affinity-purified 80S ribosome-nascent chain complex reconstituted with Pelota and Hbs1l. タイプ: complex / ID: 1 / 親要素: 0 / 含まれる分子: #1-#87 |
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由来(天然) | 生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ) |
分子量 | 理論値: 3.3 MDa |
+分子 #1: uL2
分子 | 名称: uL2 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 1 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
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由来(天然) | 生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ) |
分子量 | 理論値: 28.088863 KDa |
配列 | 文字列: MGRVIRGQRK GAGSVFRAHV KHRKGAARLR AVDFAERHGY IKGIVKDIIH DPGRGAPLAK VVFRDPYRFK KRTELFIAAE GIHTGQFVY CGKKAQLNIG NVLPVGTMPE GTIVCCLEEK PGDRGKLARA SGNYATVISH NPETKKTRVK LPSGSKKVIS S ANRAVVGV ...文字列: MGRVIRGQRK GAGSVFRAHV KHRKGAARLR AVDFAERHGY IKGIVKDIIH DPGRGAPLAK VVFRDPYRFK KRTELFIAAE GIHTGQFVY CGKKAQLNIG NVLPVGTMPE GTIVCCLEEK PGDRGKLARA SGNYATVISH NPETKKTRVK LPSGSKKVIS S ANRAVVGV VAGGGRIDKP ILKAGRAYHK YKAKRNCWPR VRGVAMNPVE HPFGGGNHQH IGKPSTIRRD APAGRKVGLI AA RRTGRLR GTKTVQEKEN |
+分子 #2: Ul3
分子 | 名称: Ul3 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 2 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
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由来(天然) | 生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ) |
分子量 | 理論値: 46.107977 KDa |
配列 | 文字列: MSHRKFSAPR HGSLGFLPRK RSSRHRGKVK SFPKDDPSKP VHLTAFLGYK AGMTHIVREV DRPGSKVNKK EVVEAVTIVE TPPMVVVGI VGYVETPRGL RTFKTVFAEH ISDECKRRFY KNWHKSKKKA FTKYCKKWQD DAGKRQLDKD FSSMKKYCQV I RVLAHTQM ...文字列: MSHRKFSAPR HGSLGFLPRK RSSRHRGKVK SFPKDDPSKP VHLTAFLGYK AGMTHIVREV DRPGSKVNKK EVVEAVTIVE TPPMVVVGI VGYVETPRGL RTFKTVFAEH ISDECKRRFY KNWHKSKKKA FTKYCKKWQD DAGKRQLDKD FSSMKKYCQV I RVLAHTQM RLLPLRQKKA HLMEIQVNGG TVAEKLDWAR ERLEQQVPVS QVFGQDEMID VIGVTKGKGY KGVTSRWHTK KL PRKTHRG LRKVACIGAW HPARVAFSVA RAGQKGYHHR TEINKKIYKI GQGYLIKDGK LIKNNASTDY DLSDKSINPL GGF VHYGEV TNDFVMLKGC VVGTKKRVLT LRKSLLVQTK RRALEKIDLK FIDTTSKFGH GRFQTVEEKK AFMGPLKKDR IAKE EGA UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL3 |
+分子 #3: uL4
分子 | 名称: uL4 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 3 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
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由来(天然) | 生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ) |
分子量 | 理論値: 47.727559 KDa |
配列 | 文字列: MACARPLISV YSEKGESSGK NVTLPAVFKA PIRPDIVNFV HTNLRKNNRQ PYAVSELAGH QTSAESWGTG RAVARIPRVR GGGTHRSGQ GAFGNMCRGG RMFAPTKTWR RWHRRVNTTQ KRYAICSALA ASALPALVMS KGHRIEEVPE LPLVVEDKVE G YKKTKEAV ...文字列: MACARPLISV YSEKGESSGK NVTLPAVFKA PIRPDIVNFV HTNLRKNNRQ PYAVSELAGH QTSAESWGTG RAVARIPRVR GGGTHRSGQ GAFGNMCRGG RMFAPTKTWR RWHRRVNTTQ KRYAICSALA ASALPALVMS KGHRIEEVPE LPLVVEDKVE G YKKTKEAV LLLKKLKAWN DIKKVYASQR MRAGKGKMRN RRRIQRRGPC VIYNEDNGIV KAFRNIPGIT LLNVTKLNIL KL APGGHVG RFCIWTESAF RKLDDLYGTW RKAASLKSNY NLPMHKMLNT DLSRILKSPE IQRALRAPRK KIHRRVLKKN PLK NLRIML KLNPYAKTMR RNTILRQARN HKLRVERAAA ALAAKSDPKE APAKKKPVVG KKVKKPRAVG IKQKKKPVVG RKAA AAKKP AADKKAADKR AGPEDKKPAA |
+分子 #4: 60S ribosomal protein L5
分子 | 名称: 60S ribosomal protein L5 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 4 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
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由来(天然) | 生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ) |
分子量 | 理論値: 34.481828 KDa |
配列 | 文字列: MGFVKVVKNK AYFKRYQVKF RRRREGKTDY YARKRLVIQD KNKYNTPKYR MIVRVTNRDI ICQIAYARIE GDMIVCAAYA HELPKYGVK VGLTNYAAAY CTGLLLARRL LNRFGMDKIY EGQVEVTGDE YNVESIDGQP GAFTCYLDAG LARTTTGNKV F GALKGAVD ...文字列: MGFVKVVKNK AYFKRYQVKF RRRREGKTDY YARKRLVIQD KNKYNTPKYR MIVRVTNRDI ICQIAYARIE GDMIVCAAYA HELPKYGVK VGLTNYAAAY CTGLLLARRL LNRFGMDKIY EGQVEVTGDE YNVESIDGQP GAFTCYLDAG LARTTTGNKV F GALKGAVD GGLSIPHSTK RFPGYDSESK EFNAEVHRKH IMGQNVADYM RYLMEEDEDA YKKQFSQYIK NNVTPDMMEE MY KKAHAAI RENPVYEKKP KREVKKKRWN RPKMSLAQKK DRVAQKKASF LRAQERAAES UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL18 |
+分子 #5: 60S ribosomal protein L6
分子 | 名称: 60S ribosomal protein L6 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 5 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
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由来(天然) | 生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ) |
分子量 | 理論値: 33.028336 KDa |
配列 | 文字列: MAGEKAPAAK PDATKKSPAK KADHARGKAK KKTLAEKKPK KGKPHCSRNP VLVRGIGRYS RSAMYSRKAL YKRKYAAPKS RIERKKKRE KVLATVTKPV GGDKNGGTRV VKLRKMPRYY PTEDVPRKLL SHGKKPFSQH VRKLRASITP GTILIILTGR H RGKRVVFL ...文字列: MAGEKAPAAK PDATKKSPAK KADHARGKAK KKTLAEKKPK KGKPHCSRNP VLVRGIGRYS RSAMYSRKAL YKRKYAAPKS RIERKKKRE KVLATVTKPV GGDKNGGTRV VKLRKMPRYY PTEDVPRKLL SHGKKPFSQH VRKLRASITP GTILIILTGR H RGKRVVFL KQLSSGLLLV TGPLSLNRVP LRRTHQKFVI ATSTKIDISG VKIPKHLTDA YFKKKKLRKP RHQEGEIFDT EK EKYEITE QRKVDQKAVD SQILPKIKAV PQLQGYLRSV FALTNGVYPH KLVF UniProtKB: Large ribosomal subunit protein eL6 |
+分子 #6: uL30
分子 | 名称: uL30 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 6 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
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由来(天然) | 生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ) |
分子量 | 理論値: 29.201836 KDa |
配列 | 文字列: MEGAEEKKKV PAVPETLKKK RRNFAELKIK RLRKKFAQKM LRKARRKLIY EKAKHYHKEY RQMYRTEIRM ARMARKAGNF YVPAEPKLA FVIRIRGING VSPKVRKVLQ LLRLRQIFNG TFVKLNKASI NMLRIVEPYI AWGYPNLKSV NELIYKRGYG K INKKRIAL ...文字列: MEGAEEKKKV PAVPETLKKK RRNFAELKIK RLRKKFAQKM LRKARRKLIY EKAKHYHKEY RQMYRTEIRM ARMARKAGNF YVPAEPKLA FVIRIRGING VSPKVRKVLQ LLRLRQIFNG TFVKLNKASI NMLRIVEPYI AWGYPNLKSV NELIYKRGYG K INKKRIAL TDNTLIARSL GKYNIICMED LIHEIYTVGK HFKEANNFLW PFKLSSPRGG MKKKTTHFVE GGDAGNREDQ IN RLIRRMN UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL30 |
+分子 #7: eL8
分子 | 名称: eL8 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 7 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
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由来(天然) | 生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ) |
分子量 | 理論値: 36.221516 KDa |
配列 | 文字列: MSSYRLGYCM KEERHNLVLC LWSQSPGILN SKCLWPFTNI HLLVGALPRE GAGGAWGGGR SEQLPTCSTT HHDFTWDKKV VNPLFEKRP KNFGIGQDIQ PKRDLTRFVK WPRYIRLQRQ RAILYKRLKV PPAINQFTQV LDRQTATQLL KLAHKYRPET K QEKKQRLL ...文字列: MSSYRLGYCM KEERHNLVLC LWSQSPGILN SKCLWPFTNI HLLVGALPRE GAGGAWGGGR SEQLPTCSTT HHDFTWDKKV VNPLFEKRP KNFGIGQDIQ PKRDLTRFVK WPRYIRLQRQ RAILYKRLKV PPAINQFTQV LDRQTATQLL KLAHKYRPET K QEKKQRLL ARAEKKAAGK GDVPTKRPPV LRAGVNTVTT LVENKKAQLV VIAHDVDPIE LVVFLPALCR KMGVPYCILK GK ARLGRLV HRKTCTTVAF TQVNSEDKGA LAKLVEAIRT NYNDRYDEIR RHWGGNVLGP KSVARIAKLE KAKAKELATK LG UniProtKB: Large ribosomal subunit protein eL8 |
+分子 #8: uL6
分子 | 名称: uL6 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 8 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
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由来(天然) | 生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ) |
分子量 | 理論値: 21.871418 KDa |
配列 | 文字列: MKTILSNQTV DIPENVDISL KGRTVIVKGP RGTLRRDFNH INVELSLLGK KKKRLRVDKW WGNRKELATV RTICSHVQNM IKGVTLGFR YKMRSVYAHF PINVVIQENG SLVEIRNFLG EKYIRRVRMR PGVACSVSQA QKDELVLEGN DIELVSNSAA L IQQATTVK ...文字列: MKTILSNQTV DIPENVDISL KGRTVIVKGP RGTLRRDFNH INVELSLLGK KKKRLRVDKW WGNRKELATV RTICSHVQNM IKGVTLGFR YKMRSVYAHF PINVVIQENG SLVEIRNFLG EKYIRRVRMR PGVACSVSQA QKDELVLEGN DIELVSNSAA L IQQATTVK NKDIRKFLDG IYVSEKGTVQ QADE UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL6 |
+分子 #9: Ribosomal protein L10 (Predicted)
分子 | 名称: Ribosomal protein L10 (Predicted) / タイプ: protein_or_peptide / ID: 9 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
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由来(天然) | 生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ) |
分子量 | 理論値: 24.643057 KDa |
配列 | 文字列: MGRRPARCYR YCKNKPYPKS RFCRGVPDAK IRIFDLGRKK AKVDEFPLCG HMVSDEYEQL SSEALEAARI CANKYMVKSC GKDGFHIRV RLHPFHVIRI NKMLSCAGAD RLQTGMRGAF GKPQGTVARV HIGQVIMSIR TKLQNKEHVV EALRRAKFKF P GRQKIHIS ...文字列: MGRRPARCYR YCKNKPYPKS RFCRGVPDAK IRIFDLGRKK AKVDEFPLCG HMVSDEYEQL SSEALEAARI CANKYMVKSC GKDGFHIRV RLHPFHVIRI NKMLSCAGAD RLQTGMRGAF GKPQGTVARV HIGQVIMSIR TKLQNKEHVV EALRRAKFKF P GRQKIHIS KKWGFTKFNA DEFEDMVAEK RLIPDGCGVK YIPNRGPLDK WRALHS UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL16 |
+分子 #10: uL5
分子 | 名称: uL5 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 10 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
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由来(天然) | 生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ) |
分子量 | 理論値: 20.288465 KDa |
配列 | 文字列: MAQDQGEKEN PMRELRIRKL CLNICVGESG DRLTRAAKVL EQLTGQTPVF SKARYTVRSF GIRRNEKIAV HCTVRGAKAE EILEKGLKV REYELRKNNF SDTGNFGFGI QEHIDLGIKY DPSIGIYGLD FYVVLGRPGF SIADKKRRTG CIGAKHRISK E EAMRWFQQ KYDGIILPGK UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL5 |
+分子 #11: eL13
分子 | 名称: eL13 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 11 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
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由来(天然) | 生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ) |
分子量 | 理論値: 24.331723 KDa |
配列 | 文字列: MAPSRNGMIL KPHFHKDWQR RVATWFNQPA RKIRRRKARQ ARARRIAPRP AAGPIRPIVR CPTVRYHTKV RAGRGFSLEE LRVAGIHKK VARTIGISVD PRRRNKSTES LQANVQRLKE YRSKLVLFPR KPSAPKKGDS SAEELKLATQ LTGPVMPIRN V FKKEKARV ...文字列: MAPSRNGMIL KPHFHKDWQR RVATWFNQPA RKIRRRKARQ ARARRIAPRP AAGPIRPIVR CPTVRYHTKV RAGRGFSLEE LRVAGIHKK VARTIGISVD PRRRNKSTES LQANVQRLKE YRSKLVLFPR KPSAPKKGDS SAEELKLATQ LTGPVMPIRN V FKKEKARV ITEEEKNFKA FASLRMARAN ARLFGIRAKR AKEAAEQDVE KKK |
+分子 #12: eL14
分子 | 名称: eL14 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 12 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
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由来(天然) | 生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ) |
分子量 | 理論値: 23.870549 KDa |
配列 | 文字列: MVFRRFVEVG RVAYVSFGPH AGKLVAIVDV IDQNRALVDG PCTRVRRQAM PFKCMQLTDF ILKFPHSARQ KYVRKAWEKA DINTKWAAT RWAKKIEARE RKAKMTDFDR YKVMKAKKMR NRIIKNEVKK LQRAALLKAS PKKAPVAKGA VAAAAAAAKV P AKKATAAG ...文字列: MVFRRFVEVG RVAYVSFGPH AGKLVAIVDV IDQNRALVDG PCTRVRRQAM PFKCMQLTDF ILKFPHSARQ KYVRKAWEKA DINTKWAAT RWAKKIEARE RKAKMTDFDR YKVMKAKKMR NRIIKNEVKK LQRAALLKAS PKKAPVAKGA VAAAAAAAKV P AKKATAAG KKAAAQKAPA QKAPAQKAAG QKAAQPPKAQ KGQKPPAQKA PAPKASGKKA UniProtKB: Large ribosomal subunit protein eL14 |
+分子 #13: Ribosomal protein L15
分子 | 名称: Ribosomal protein L15 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 13 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
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由来(天然) | 生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ) |
分子量 | 理論値: 24.207285 KDa |
配列 | 文字列: MGAYKYIQEL WRKKQSDVMR FLLRVRCWQY RQLSALHRAP RPTRPDKARR LGYKAKQGYV IYRIRVRRGG RKRPVPKGAT YGKPVHHGV NQLKFARSLQ SVAEERAGRH CGALRVLNSY WVGEDSTYKF FEVILIDPFH KAIRRNPDTQ WITKPVHKHR E MRGLTSAG ...文字列: MGAYKYIQEL WRKKQSDVMR FLLRVRCWQY RQLSALHRAP RPTRPDKARR LGYKAKQGYV IYRIRVRRGG RKRPVPKGAT YGKPVHHGV NQLKFARSLQ SVAEERAGRH CGALRVLNSY WVGEDSTYKF FEVILIDPFH KAIRRNPDTQ WITKPVHKHR E MRGLTSAG RKSRGLGKGH KFHHTIGGSR RAAWRRRNTL QLHRYR UniProtKB: Large ribosomal subunit protein eL15 |
+分子 #14: uL13
分子 | 名称: uL13 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 14 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
---|---|
由来(天然) | 生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ) |
分子量 | 理論値: 23.533299 KDa |
配列 | 文字列: MAEGQVLVLD GRGHLLGRLA AIVAKQVLLG RKVVVVRCEG INISGNFYRN KLKYLAFLRK RMNTNPSRGP YHFRAPSRIF WRTVRGMLP HKTKRGQAAL DRLKVFDGIP PPYDKKKRMV VPAALKVVRL KPTRKFAYLG RLAHEVGWKY QAVTATLEEK R KEKAKIHY ...文字列: MAEGQVLVLD GRGHLLGRLA AIVAKQVLLG RKVVVVRCEG INISGNFYRN KLKYLAFLRK RMNTNPSRGP YHFRAPSRIF WRTVRGMLP HKTKRGQAAL DRLKVFDGIP PPYDKKKRMV VPAALKVVRL KPTRKFAYLG RLAHEVGWKY QAVTATLEEK R KEKAKIHY RKKKQLMRLR KQAEKNVEKK ISKFTDVLKT HGLLV |
+分子 #15: uL22
分子 | 名称: uL22 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 15 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
---|---|
由来(天然) | 生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ) |
分子量 | 理論値: 21.444221 KDa |
配列 | 文字列: MVRYSLDPEN PTKSCKSRGS NLRVHFKNTR ETAQAIKGMH IRKATKYLKD VTLKKQCVPF RRYNGGVGRC AQAKQWGWTQ GRWPKKSAE FLLHMLKNAE SNAELKGLDV DSLVIEHIQV NKAPKMRRRT YRAHGRINPY MSSPCHIEMI LTEKEQIVPK P EEEVAQKK KISQKKLKKQ KLMARE UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL22 |
+分子 #16: eL18
分子 | 名称: eL18 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 16 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
---|---|
由来(天然) | 生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ) |
分子量 | 理論値: 21.699688 KDa |
配列 | 文字列: MGVDIRHNKD RKVRRKEPKS QDIYLRLLVK LYRFLARRTN STFNQVVLKR LFMSRTNRPP LSLSRMIRKM KLPGRENKTA VVVGTVTDD VRVQEVPKLK VCALRVTSRA RSRILKAGGK ILTFDQLALD SPKGRGTVLL SGPRKGREVY RHFGKAPGTP H SHTKPYVR SKGRKFERAR GRRASRGYKN |
+分子 #17: eL19
分子 | 名称: eL19 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 17 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
---|---|
由来(天然) | 生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ) |
分子量 | 理論値: 23.535281 KDa |
配列 | 文字列: MSMLRLQKRL ASSVLRCGKK KVWLDPNETN EIANANSRQQ IRKLIKDGLI IRKPVTVHSR ARCRKNTLAR RKGRHMGIGK RKGTANARM PEKVTWMRRM RILRRLLRRY RESKKIDRHM YHSLYLKVKG NVFKNKRILM EHIHKLKADK ARKKLLADQA E ARRSKTKE ...文字列: MSMLRLQKRL ASSVLRCGKK KVWLDPNETN EIANANSRQQ IRKLIKDGLI IRKPVTVHSR ARCRKNTLAR RKGRHMGIGK RKGTANARM PEKVTWMRRM RILRRLLRRY RESKKIDRHM YHSLYLKVKG NVFKNKRILM EHIHKLKADK ARKKLLADQA E ARRSKTKE ARKRREERLQ AKKEEIIKTL SKEEETKK |
+分子 #18: eL20
分子 | 名称: eL20 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 18 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
---|---|
由来(天然) | 生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ) |
分子量 | 理論値: 20.827561 KDa |
配列 | 文字列: MKASGTLREY KVVGRCLPTP KCRTPPLYRM RIFAPNHVVA KSRFWYFVSQ LKKMKKSSGE IVYCGQVFEK SPLRVKNFGI WLRYDSRSG THNMYREYRD LTTAGAVTQC YRDMGARHRA RAHSIQIMKV EEIAASKCRR PAVKQFHDSK IKFPLPHRVL R RQHKPRFT TKRPNTFF |
+分子 #19: eL21
分子 | 名称: eL21 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 19 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
---|---|
由来(天然) | 生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ) |
分子量 | 理論値: 18.609988 KDa |
配列 | 文字列: MTNTKGKRRG TRYMFSRPFR KHGVVPLATY MRIYKKGDIV DIKGMGTVQK GMPHKCYHGK TGRVYNVTQH AVGIVVNKQV KGKILAKRI NVRIEHIKHS KSRDSFLKRV KENDQKKKEA KEKGTWVQLK RQPAPPREAH FVRTNGKEPE LLEPIPYEFM A UniProtKB: Large ribosomal subunit protein eL21 |
+分子 #20: eL22
分子 | 名称: eL22 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 20 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
---|---|
由来(天然) | 生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ) |
分子量 | 理論値: 14.813015 KDa |
配列 | 文字列: MAPVKKLVAK GGKKKKQLLK FTLDCTHPVE DGIMDAANFE QFLQERIKVN GKAGNLGGGV VSLERSKSKI TVTSEVPFSK RYLKYLTKK YLKKNNLRDW LRVVANTKES YELRYFQINQ DEEEEEEED |
+分子 #21: uL14
分子 | 名称: uL14 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 21 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
---|---|
由来(天然) | 生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ) |
分子量 | 理論値: 14.892505 KDa |
配列 | 文字列: MSKRGRGGSS GAKFRISLGL PVGAVINCAD NTGAKNLYII SVKGIKGRLN RLPAAGVGDM VMATVKKGKP ELRKKVHPAV VIRQRKSYR RKDGVFLYFE DNAGVIVNNK GEMKGSAITG PVAKECADLW PRIASNAGSI A UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL14 |
+分子 #22: eL24
分子 | 名称: eL24 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 22 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
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由来(天然) | 生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ) |
分子量 | 理論値: 17.825111 KDa |
配列 | 文字列: MKVELCSFSG YKIYPGHGRR YARTDGKVFQ FLNAKCESAF LSKRNPRQIN WTVLYRRKHK KGQSEEIQKK RTRRAVKFQR AITGASLAD IMAKRNQKPE VRKAQREQAI RAAKEAKKAK QASKKTAMAA AKAPTKAAPK QKIVKPVKVS APRVGGKR UniProtKB: Large ribosomal subunit protein eL24 |
+分子 #23: uL23
分子 | 名称: uL23 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 23 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
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由来(天然) | 生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ) |
分子量 | 理論値: 17.768246 KDa |
配列 | 文字列: MAPKAKKEAP APPKVEAKAK ALKAKKAVLK GVHSHKKKKI RTSPTFRRPK TLRLRRQPKY PRKSAPRRNK LDHYAIIKFP LTTESAMKK IEDNNTLVFI VDVKANKHQI KQAVKKLYDI DVAKVNTLIR PDGEKKAYVR LAPDYDALDV ANKIGII UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL23 |
+分子 #24: uL24
分子 | 名称: uL24 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 24 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
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由来(天然) | 生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ) |
分子量 | 理論値: 17.303363 KDa |
配列 | 文字列: MKFNPFVTSD RSKNRKRHFN APSHIRRKIM SSPLSKELRQ KYNVRSMPIR KDDEVQVVRG HYKGQQIGKV VQVYRKKYVI YIERVQREK ANGTTVHVGI HPSKVVITRL KLDKDRKKIL ERKAKSRQVG KEKGKYKEET IEKMQE UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL24 |
+分子 #25: 60S ribosomal protein L27
分子 | 名称: 60S ribosomal protein L27 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 25 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
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由来(天然) | 生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ) |
分子量 | 理論値: 15.835831 KDa |
配列 | 文字列: MGKFMKPGKV VLVLAGRYSG RKAVIVKNID DGTSDRPYSH ALVAGIDRYP RKVTAAMGKK KIAKRSKIKS FVKVYNYNHL MPTRYSVDI PLDKTVVNKD VFRDPALKRK ARREAKVKFE ERYKTGKNKW FFQKLRF UniProtKB: Large ribosomal subunit protein eL27 |
+分子 #26: uL15
分子 | 名称: uL15 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 26 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
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由来(天然) | 生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ) |
分子量 | 理論値: 16.620561 KDa |
配列 | 文字列: MPSRLRKTRK LRGHVSHGHG RIGKHRKHPG GRGNAGGMHH HRINFDKYHP GYFGKVGMRH YHLKRNQSFC PTVNLDKLWT LVSEQTRVN AAKNKTGAAP IIDVVRSGYY KVLGKGKLPK QPVIVKAKFF SRRAEEKIKG VGGACVLVA UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL15 |
+分子 #27: eL29
分子 | 名称: eL29 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 27 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
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由来(天然) | 生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ) |
分子量 | 理論値: 26.708707 KDa |
配列 | 文字列: MAKSKNHTTH NQSRKWHRNG IKKPRSQRYE SLKGVDPKFL RNMRFAKKHN KKGLKKMQAN NAKAMAARAE AIKALVKPKE VKPTIPKGV SRKLHRLAYI AHPKLGRRAR ARIARGLRLS RPQTKAKAKT EPQIKGKVKA QIKAQAQAQI KSKGKGKAQA E TKPKAQAE ...文字列: MAKSKNHTTH NQSRKWHRNG IKKPRSQRYE SLKGVDPKFL RNMRFAKKHN KKGLKKMQAN NAKAMAARAE AIKALVKPKE VKPTIPKGV SRKLHRLAYI AHPKLGRRAR ARIARGLRLS RPQTKAKAKT EPQIKGKVKA QIKAQAQAQI KSKGKGKAQA E TKPKAQAE TKPKAQAQAK PKAQAQGKPK AQAQGKPKAQ AQAKPKAQAQ AKPKAQAQTK PKAQATPAAP VPAQAPPKGA QP PAKAP UniProtKB: Large ribosomal subunit protein eL29 |
+分子 #28: eL30
分子 | 名称: eL30 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 28 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
---|---|
由来(天然) | 生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ) |
分子量 | 理論値: 12.807065 KDa |
配列 | 文字列: MVAAKKTKKS LESINSRLQL VMKSGKYVLG YKQSLKMIRQ GKAKLVILAN NCPALRKSEI EYYAMLAKTG VHHYSGNNIE LGTACGKYY RVCTLSIIDP GDSDIIRSMP EQTGEK UniProtKB: Large ribosomal subunit protein eL30 |
+分子 #29: eL31
分子 | 名称: eL31 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 29 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
---|---|
由来(天然) | 生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ) |
分子量 | 理論値: 14.494938 KDa |
配列 | 文字列: MAPAKKGGEK KKGRSAINEV VTREYTINIH KRIHGVGFKK RAPRALKEIR KFAMKEMGTP DVRIDTRLNK AVWAKGIRNV PYRIRVRLS RKRNEDEDSP NKLYTLVTYV PVTTFKNLQT VNVDEN UniProtKB: Large ribosomal subunit protein eL31 |
+分子 #30: eL32
分子 | 名称: eL32 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 30 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
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由来(天然) | 生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ) |
分子量 | 理論値: 15.898932 KDa |
配列 | 文字列: MAALRPLVKP KIVKKRTKKF IRHQSDRYVK IKRNWRKPRG IDNRVRRRFK GQILMPNIGY GSNKKTKHML PSGFRKFLVH NVKELEVLL MCNKSYCAEI AHNVSSKNRK AIVERAAQLA IRVTNPNARL RSEENE UniProtKB: Large ribosomal subunit protein eL32 |
+分子 #31: eL33
分子 | 名称: eL33 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 31 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
---|---|
由来(天然) | 生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ) |
分子量 | 理論値: 12.580809 KDa |
配列 | 文字列: MSGRLWCKAI FAGYKRGLRN QREHTALLKI EGVYARDETE FYLGKRCAYV YKAKNNTVTP GGKPNKTRVI WGKVTRAHGN SGMVRAKFR SNLPAKAIGH RIRVMLYPSR I UniProtKB: Large ribosomal subunit protein eL33 |
+分子 #32: eL34
分子 | 名称: eL34 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 32 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
---|---|
由来(天然) | 生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ) |
分子量 | 理論値: 13.326074 KDa |
配列 | 文字列: MVQRLTYRRR LSYNTASNKT RLSRTPGNRI VYLYTKKVGK APKSACGVCP GRLRGVRAVR PKVLMRLSKT KKHVSRAYGG SMCAKCVRD RIKRAFLIEE QKIVVKVLKA QAQSQKAK |
+分子 #33: uL29
分子 | 名称: uL29 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 33 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
---|---|
由来(天然) | 生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ) |
分子量 | 理論値: 14.566599 KDa |
配列 | 文字列: MAKIKARDLR GKKKEELLKQ LDDLKVELSQ LRVAKVTGGA ASKLSKIRVV RKSIARVLTV INQTQKENLR KFYKGKKYKP LDLRPKKTR AMRRRLNKHE ESLKTKKQQR KERLYPLRKY AVKA UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL29 |
+分子 #34: 60S ribosomal protein L36
分子 | 名称: 60S ribosomal protein L36 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 34 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
---|---|
由来(天然) | 生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ) |
分子量 | 理論値: 12.263834 KDa |
配列 | 文字列: MALRYPMAVG LNKGHKVTKN VSKPRHSRRR GRLTKHTKFV RDMIREVCGF APYERRAMEL LKVSKDKRAL KFIKKRVGTH IRAKRKREE LSSVLAAMRK AAAKKD UniProtKB: Large ribosomal subunit protein eL36 |
+分子 #35: Ribosomal protein L37
分子 | 名称: Ribosomal protein L37 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 35 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
---|---|
由来(天然) | 生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ) |
分子量 | 理論値: 11.111032 KDa |
配列 | 文字列: MTKGTSSFGK RRNKTHTLCR RCGSKAYHLQ KSTCGKCGYP AKRKRKYNWS AKAKRRNTTG TGRMRHLKIV YRRFRHGFRE GTTPKPKRA AVAASSSS UniProtKB: Large ribosomal subunit protein eL37 |
+分子 #36: eL38
分子 | 名称: eL38 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 36 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
---|---|
由来(天然) | 生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ) |
分子量 | 理論値: 8.238948 KDa |
配列 | 文字列: MPRKIEEIKD FLLTARRKDA KSVKIKKNKD NVKFKVRCSR YLYTLVITDK EKAEKLKQSL PPGLAVKELK |
+分子 #37: eL39
分子 | 名称: eL39 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 37 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
---|---|
由来(天然) | 生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ) |
分子量 | 理論値: 6.455775 KDa |
配列 | 文字列: MSSHKTFRIK RFLAKKQKQN RPIPQWIWMK TGNKIRYNSK RRHWRRTKLG L UniProtKB: Large ribosomal subunit protein eL39 |
+分子 #38: eL40
分子 | 名称: eL40 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 38 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
---|---|
由来(天然) | 生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ) |
分子量 | 理論値: 11.69979 KDa |
配列 | 文字列: MGDPESGGCI PPDQQRLIFA GKQLEDGRTL SDYNIQKEST LHLVLRLRGG IIEPSLRQLA QKYNCDKMIC RKCYARLHPR AVNCRKKKC GHTNNLRPKK KVK |
+分子 #39: eL41
分子 | 名称: eL41 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 39 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
---|---|
由来(天然) | 生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ) |
分子量 | 理論値: 3.473451 KDa |
配列 | 文字列: MRAKWRKKRM RRLKRKRRKM RQRSK |
+分子 #40: eL42
分子 | 名称: eL42 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 40 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
---|---|
由来(天然) | 生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ) |
分子量 | 理論値: 12.476973 KDa |
配列 | 文字列: MVNVPKTRRT FCKKCGKHQP HKVTQYKKGK DSLYAQGKRR YDRKQSGYGG QTKPIFRKKA KTTKKIVLRL ECVEPNCRSK RMLAIKRCK HFELGGDKKR KGQVIQF UniProtKB: Large ribosomal subunit protein eL42 |
+分子 #41: eL43
分子 | 名称: eL43 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 41 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
---|---|
由来(天然) | 生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ) |
分子量 | 理論値: 10.29935 KDa |
配列 | 文字列: MAKRTKKVGI VGKYGTRYGA SLRKMVKKIE ISQHAKYTCS FCGKTKMKRR AVGIWHCGSC MKTVAGGAWT YNTTSAVTVK SAIRRLKEL KDQ UniProtKB: Large ribosomal subunit protein eL43 |
+分子 #42: eL28
分子 | 名称: eL28 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 42 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
---|---|
由来(天然) | 生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ) |
分子量 | 理論値: 15.783614 KDa |
配列 | 文字列: MSAHLQWMVV RNCSSFLIKR NKQTYSTEPN NLKARNSFRY NGLIHRKTVG VEPAADGKGV VVVMKRRSGQ RKPATSYVRT TINKNARAT LSSIRHMIRK NKYHPDLRMA AIRRASAILR SQKPVMVKRK RTRPTKSS UniProtKB: Large ribosomal subunit protein eL28 |
+分子 #43: uL10
分子 | 名称: uL10 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 43 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
---|---|
由来(天然) | 生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ) |
分子量 | 理論値: 34.380504 KDa |
配列 | 文字列: MPREDRATWK SNYFLKIIQL LDDYPKCFIV GADNVGSKQM QQIRMSLRGK AVVLMGKNTM MRKAIRGHLE NNPALEKLLP HIRGNVGFV FTKEDLTEIR DMLLANKVPA AARAGAIAPC EVTVPAQNTG LGPEKTSFFQ ALGITTKISR GTIEILSDVQ L IKTGDKVG ...文字列: MPREDRATWK SNYFLKIIQL LDDYPKCFIV GADNVGSKQM QQIRMSLRGK AVVLMGKNTM MRKAIRGHLE NNPALEKLLP HIRGNVGFV FTKEDLTEIR DMLLANKVPA AARAGAIAPC EVTVPAQNTG LGPEKTSFFQ ALGITTKISR GTIEILSDVQ L IKTGDKVG ASEATLLNML NISPFSFGLI IQQVFDNGSI YNPEVLDITE DTLHSRFLEG VRNVASVCLQ IGYPTVASVP HS IINGYKR VLALSVETEY TFPLAEKVKA FLADPSAFVA AAPVAAASTA APAAAAAAPA KVEAKEESEE SDEDMGFGLF D |
+分子 #44: uL11
分子 | 名称: uL11 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 44 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
---|---|
由来(天然) | 生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ) |
分子量 | 理論値: 17.847619 KDa |
配列 | 文字列: MPPKFDPNEI KVVYLRCTGG EVGATSALAP KIGPLGLSPK KVGDDIAKAT GDWKGLRITV KLTIQNRQAQ IEVVPSASAL IIKALKEPP RDRKKQKNIK HSGNITFDEI VNIARQMRHR SLARELSGTI KEILGTAQSV GCNVDGRHPH DIIDDINSGA V ECPAS UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL11 |
+分子 #45: Nascent chain
分子 | 名称: Nascent chain / タイプ: protein_or_peptide / ID: 45 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
---|---|
由来(天然) | 生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ) |
分子量 | 理論値: 715.816 Da |
配列 | 文字列: DSPGLKV |
+分子 #52: uS2
分子 | 名称: uS2 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 52 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
---|---|
由来(天然) | 生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ) |
分子量 | 理論値: 32.958016 KDa |
配列 | 文字列: MSGALDVLQM KEEDVLKFLA AGTHLGGTNL DFQMEQYIYK RKSDGIYIIN LKRTWEKLLL AARAIVAIEN PADVSVISSR NTGQRAVLK FAAATGATPI AGRFTPGTFT NQIQTAFREP RLLVVTDPRA DHQPLTEASY VNLPTIALCN TDSPLRYVDI A IPCNNKGA ...文字列: MSGALDVLQM KEEDVLKFLA AGTHLGGTNL DFQMEQYIYK RKSDGIYIIN LKRTWEKLLL AARAIVAIEN PADVSVISSR NTGQRAVLK FAAATGATPI AGRFTPGTFT NQIQTAFREP RLLVVTDPRA DHQPLTEASY VNLPTIALCN TDSPLRYVDI A IPCNNKGA HSVGLMWWML AREVLRMRGT ISREHPWEVM PDLYFYRDPE EIEKEEQAAA EKAVTKEEFQ GEWTAPAPEF TA TQPEVAD WSEGVQVPSV PIQQFPTEDW SAQPATEDWS AAPTAQATEW VGTTTEWS |
+分子 #53: 40S ribosomal protein S3a
分子 | 名称: 40S ribosomal protein S3a / タイプ: protein_or_peptide / ID: 53 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
---|---|
由来(天然) | 生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ) |
分子量 | 理論値: 30.002061 KDa |
配列 | 文字列: MAVGKNKRLT KGGKKGAKKK VVDPFSKKDW YDVKAPAMFN IRNIGKTLVT RTQGTKIASD GLKGRVFEVS LADLQNDEVA FRKFKLITE DVQGKNCLTN FHGMDLTRDK MCSMVKKWQT MIEAHVDVKT TDGYLLRLFC VGFTKKRNNQ IRKTSYAQHQ Q VRQIRKKM ...文字列: MAVGKNKRLT KGGKKGAKKK VVDPFSKKDW YDVKAPAMFN IRNIGKTLVT RTQGTKIASD GLKGRVFEVS LADLQNDEVA FRKFKLITE DVQGKNCLTN FHGMDLTRDK MCSMVKKWQT MIEAHVDVKT TDGYLLRLFC VGFTKKRNNQ IRKTSYAQHQ Q VRQIRKKM MEIMTREVQT NDLKEVVNKL IPDSIGKDIE KACQSIYPLH DVFVRKVKML KKPKFELGKL MELHGEGSSS GK ATGDETG AKVERADGYE PPVQESV UniProtKB: Small ribosomal subunit protein eS1 |
+分子 #54: uS5
分子 | 名称: uS5 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 54 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
---|---|
由来(天然) | 生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ) |
分子量 | 理論値: 31.327395 KDa |
配列 | 文字列: MADDAGAAGG PGDPGGPGIG GRGGFRGGFG SGVRGRGRGR GRGRGRGRGA RGGKAEDKEW LPVTKLGRLV KDMKIKSLEE IYLFSLPIK ESEIIDFFLG ASLKDEVLKI MPVQKQTRAG QRTRFKAFVA IGDYNGHVGL GVKCSKEVAT AIRGAIILAK L SIVPVRRG ...文字列: MADDAGAAGG PGDPGGPGIG GRGGFRGGFG SGVRGRGRGR GRGRGRGRGA RGGKAEDKEW LPVTKLGRLV KDMKIKSLEE IYLFSLPIK ESEIIDFFLG ASLKDEVLKI MPVQKQTRAG QRTRFKAFVA IGDYNGHVGL GVKCSKEVAT AIRGAIILAK L SIVPVRRG YWGNKIGKPH TVPCKVTGRC GSVLVRLIPA PRGTGIVSAP VPKKLLMMAG IDDCYTSARG CTATLGNFAK AT FDAISKT YSYLTPDLWK ETVFTKSPYQ EFTDHLVKTH TRVSVQRTQA PAVATT |
+分子 #55: uS3
分子 | 名称: uS3 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 55 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
---|---|
由来(天然) | 生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ) |
分子量 | 理論値: 26.715344 KDa |
配列 | 文字列: MAVQISKKRK FVADGIFKAE LNEFLTRELA EDGYSGVEVR VTPTRTEIII LATRTQNVLG EKGRRIRELT AVVQKRFGFP EGSVELYAE KVATRGLCAI AQAESLRYKL LGGLAVRRAC YGVLRFIMES GAKGCEVVVS GKLRGQRAKS MKFVDGLMIH S GDPVNYYV ...文字列: MAVQISKKRK FVADGIFKAE LNEFLTRELA EDGYSGVEVR VTPTRTEIII LATRTQNVLG EKGRRIRELT AVVQKRFGFP EGSVELYAE KVATRGLCAI AQAESLRYKL LGGLAVRRAC YGVLRFIMES GAKGCEVVVS GKLRGQRAKS MKFVDGLMIH S GDPVNYYV DTAVRHVLLR QGVLGIKVKI MLPWDPSGKI GPKKPLPDHV SIVEPKDEIL PTTPISEQKG GKPEPPAMPQ PV PTA UniProtKB: Small ribosomal subunit protein uS3 |
+分子 #56: eS4
分子 | 名称: eS4 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 56 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
---|---|
由来(天然) | 生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ) |
分子量 | 理論値: 29.654869 KDa |
配列 | 文字列: MARGPKKHLK RVAAPKHWML DKLTGVFAPR PSTGPHKLRE CLPLIIFLRN RLKYALTGDE VKKICMQRFI KIDGKVRTDI TYPAGFMDV ISIDKTGENF RLIYDTKGRF AVHRITPEEA KYKLCKVRKI FVGTKGIPHL VTHDARTIRY PDPLIKVNDT I QIDLETGK ...文字列: MARGPKKHLK RVAAPKHWML DKLTGVFAPR PSTGPHKLRE CLPLIIFLRN RLKYALTGDE VKKICMQRFI KIDGKVRTDI TYPAGFMDV ISIDKTGENF RLIYDTKGRF AVHRITPEEA KYKLCKVRKI FVGTKGIPHL VTHDARTIRY PDPLIKVNDT I QIDLETGK ITDFIKFDTG NLCMVTGGAN LGRIGVITNR ERHPGSFDVV HVKDANGNSF ATRLSNIFVI GKGNKPWISL PR GKGIRLT IAEERDKRLA AKQSSG |
+分子 #57: uS7
分子 | 名称: uS7 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 57 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
---|---|
由来(天然) | 生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ) |
分子量 | 理論値: 22.913453 KDa |
配列 | 文字列: MTEWETAAPA VAETPDIKLF GKWSTDDVQI NDISLQDYIA VKEKYAKYLP HSAGRYAAKR FRKAQCPIVE RLTNSMMMHG RNNGKKLMT VRIVKHAFEI IHLLTGENPL QVLVNAIINS GPREDSTRIG RAGTVRRQAV DVSPLRRVNQ AIWLLCTGAR E AAFRNIKT ...文字列: MTEWETAAPA VAETPDIKLF GKWSTDDVQI NDISLQDYIA VKEKYAKYLP HSAGRYAAKR FRKAQCPIVE RLTNSMMMHG RNNGKKLMT VRIVKHAFEI IHLLTGENPL QVLVNAIINS GPREDSTRIG RAGTVRRQAV DVSPLRRVNQ AIWLLCTGAR E AAFRNIKT IAECLADELI NAAKGSSNSY AIKKKDELER VAKSNR UniProtKB: Small ribosomal subunit protein uS7 |
+分子 #58: 40S ribosomal protein S6
分子 | 名称: 40S ribosomal protein S6 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 58 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
---|---|
由来(天然) | 生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ) |
分子量 | 理論値: 28.751906 KDa |
配列 | 文字列: MKLNISFPAT GCQKLIEVDD ERKLRTFYEK RMATEVAADA LGEEWKGYVV RISGGNDKQG FPMKQGVLTH GRVRLLLSKG HSCYRPRRT GERKRKSVRG CIVDANLSVL NLVIVKKGEK DIPGLTDTTV PRRLGPKRAS RIRKLFNLSK EDDVRQYVVR K PLNKEGKK ...文字列: MKLNISFPAT GCQKLIEVDD ERKLRTFYEK RMATEVAADA LGEEWKGYVV RISGGNDKQG FPMKQGVLTH GRVRLLLSKG HSCYRPRRT GERKRKSVRG CIVDANLSVL NLVIVKKGEK DIPGLTDTTV PRRLGPKRAS RIRKLFNLSK EDDVRQYVVR K PLNKEGKK PRTKAPKIQR LVTPRVLQHK RRRIALKKQR TKKNKEEAAE YAKLLAKRMK EAKEKRQEQI AKRRRLSSLR AS TSKSESS QK UniProtKB: Small ribosomal subunit protein eS6 |
+分子 #59: eS7
分子 | 名称: eS7 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 59 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
---|---|
由来(天然) | 生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ) |
分子量 | 理論値: 22.168914 KDa |
配列 | 文字列: MFSSSAKIVK PNGEKPDEFE SGISQALLEL EMNSDLKAQL RELNITAAKE IEVGGGRKAI IIFVPVPQLK SFQKIQVRLV RELEKKFSG KHVVFIAQRR ILPKPTRKSR TKNKQKRPRS RTLTAVHDAI LEDLVFPSEI VGKRIRVKLD GSRLIKVHLD K AQQNNVEH ...文字列: MFSSSAKIVK PNGEKPDEFE SGISQALLEL EMNSDLKAQL RELNITAAKE IEVGGGRKAI IIFVPVPQLK SFQKIQVRLV RELEKKFSG KHVVFIAQRR ILPKPTRKSR TKNKQKRPRS RTLTAVHDAI LEDLVFPSEI VGKRIRVKLD GSRLIKVHLD K AQQNNVEH KVETFSGVYK KLTGKDVNFE FPEFQL UniProtKB: Small ribosomal subunit protein eS7 |
+分子 #60: eS8
分子 | 名称: eS8 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 60 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
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由来(天然) | 生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ) |
分子量 | 理論値: 24.263387 KDa |
配列 | 文字列: MGISRDNWHK RRKTGGKRKP YHKKRKYELG RPAANTKIGP RRIHTVRVRG GNKKYRALRL DVGNFSWGSE CCTRKTRIID VVYNASNNE LVRTKTLVKN CIVLIDSTPY RQWYESHYAL PLGRKKGAKL TPEEEEILNK KRSKKIQKKY DERKKNAKIS S LLEEQFQQ ...文字列: MGISRDNWHK RRKTGGKRKP YHKKRKYELG RPAANTKIGP RRIHTVRVRG GNKKYRALRL DVGNFSWGSE CCTRKTRIID VVYNASNNE LVRTKTLVKN CIVLIDSTPY RQWYESHYAL PLGRKKGAKL TPEEEEILNK KRSKKIQKKY DERKKNAKIS S LLEEQFQQ GKLLACIASR PGQCGRADGY VLEGKELEFY LRKIKARKGK |
+分子 #61: Ribosomal protein S9 (Predicted)
分子 | 名称: Ribosomal protein S9 (Predicted) / タイプ: protein_or_peptide / ID: 61 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
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由来(天然) | 生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ) |
分子量 | 理論値: 22.641564 KDa |
配列 | 文字列: MPVARSWVCR KTYVTPRRPF EKSRLDQELK LIGEYGLRNK REVWRVKFTL AKIRKAAREL LTLDEKDPRR LFEGNALLRR LVRIGVLDE GKMKLDYILG LKIEDFLERR LQTQVFKLGL AKSIHHARVL IRQRHIRVRK QVVNIPSFIV RLDSQKHIDF S LRSPYGGG ...文字列: MPVARSWVCR KTYVTPRRPF EKSRLDQELK LIGEYGLRNK REVWRVKFTL AKIRKAAREL LTLDEKDPRR LFEGNALLRR LVRIGVLDE GKMKLDYILG LKIEDFLERR LQTQVFKLGL AKSIHHARVL IRQRHIRVRK QVVNIPSFIV RLDSQKHIDF S LRSPYGGG RPGRVKRKNA KKGQGGAGAG DDEEED UniProtKB: Small ribosomal subunit protein uS4 |
+分子 #62: eS10
分子 | 名称: eS10 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 62 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
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由来(天然) | 生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ) |
分子量 | 理論値: 18.933846 KDa |
配列 | 文字列: MLMPKKNRIA IYELLFKEGV MVAKKDVHMP KHPELADKNV PNLHVMKAMQ SLKSRGYVKE QFAWRHFYWY LTNEGIQYLR DYLHLPPEI VPATLRRSRP ETGRPRPKGL EGERPARLTR GEADRDTYRR SAVPPGADKK AEAGAGSATE FQFRGGFGRG R GQPPQ UniProtKB: Plectin/eS10 N-terminal domain-containing protein |
+分子 #63: uS17
分子 | 名称: uS17 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 63 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
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由来(天然) | 生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ) |
分子量 | 理論値: 18.468826 KDa |
配列 | 文字列: MADIQTERAY QKQPTIFQNK KRVLLGETGK EKLPRYYKNI GLGFKTPKEA IEGTYIDKKC PFTGNVSIRG RILSGVVTKM KMQRTIVIR RDYLHYIRKY NRFEKRHKNM SVHLSPCFRD VQIGDIVTVG ECRPLSKTVR FNVLKVTKAA GTKKQFQKF UniProtKB: Small ribosomal subunit protein uS17 |
+分子 #64: 40S ribosomal protein S12
分子 | 名称: 40S ribosomal protein S12 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 64 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
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由来(天然) | 生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ) |
分子量 | 理論値: 14.538987 KDa |
配列 | 文字列: MAEEGIAAGG VMDVNTALQE VLKTALIHDG LARGIREAAK ALDKRQAHLC VLASNCDEPM YVKLVEALCA EHQINLIKVD DNKKLGEWV GLCKIDREGK PRKVVGCSCV VVKDYGKESQ AKDVIEEYFK CKK UniProtKB: Small ribosomal subunit protein eS12 |
+分子 #65: uS15
分子 | 名称: uS15 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 65 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
---|---|
由来(天然) | 生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ) |
分子量 | 理論値: 17.259389 KDa |
配列 | 文字列: MGRMHAPGKG LSQSALPYRR SVPTWLKLTS DDVKEQIYKL AKKGLTPSQI GVILRDSHGV AQVRFVTGNK ILRILKSKGL APDLPEDLY HLIKKAVAVR KHLERNRKDK DAKFRLILIE SRIHRLARYY KTKRVLPPNW KYESSTASAL VA UniProtKB: Small ribosomal subunit protein uS15 |
+分子 #66: uS11
分子 | 名称: uS11 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 66 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
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由来(天然) | 生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ) |
分子量 | 理論値: 18.133984 KDa |
配列 | 文字列: MKARALSGSG VRRRRAAMAP RKGKEKKEEQ VISLGPQVAE GENVFGVCHI FASFNDTFVH VTDLSGKETI CRVTGGMKVK ADRDESSPY AAMLAAQDVA QRCKELGITA LHIKLRATGG NRTKTPGPGA QSALRALARS GMKIGRIEDV TPIPSDSTRR K GGRRGRRL UniProtKB: Small ribosomal subunit protein uS11 |
+分子 #67: uS19
分子 | 名称: uS19 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 67 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
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由来(天然) | 生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ) |
分子量 | 理論値: 17.049182 KDa |
配列 | 文字列: MAEVEQKKKR TFRKFTYRGV DLDQLLDMSY EQLMQLYSAR QRRRLSRGLR RKQHSLLKRL RKAKKEAPPM EKPEVVKTHL RDMIILPEM VGSMVGVYNG KTFNQVEIKP EMIGHYLGEF SITYKPVKHG RPGIGATHSS RFIPLK UniProtKB: Small ribosomal subunit protein uS19 |
+分子 #68: uS9
分子 | 名称: uS9 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 68 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
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由来(天然) | 生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ) |
分子量 | 理論値: 16.477377 KDa |
配列 | 文字列: MPSKGPLQSV QVFGRKKTAT AVAHCKRGNG LIKVNGRPLE MIEPRTLQYK LLEPVLLLGK ERFAGVDIRV RVKGGGHVAQ IYAIRQSIS KALVAYYQKY VDEASKKEIK DILIQYDRTL LVADPRRCES KKFGGPGARA RYQKSYR UniProtKB: Small ribosomal subunit protein uS9 |
+分子 #69: eS17
分子 | 名称: eS17 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 69 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
---|---|
由来(天然) | 生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ) |
分子量 | 理論値: 15.552119 KDa |
配列 | 文字列: MGRVRTKTVK KAARVIIEKY YTRLGNDFHT NKRVCEEIAI IPSKKLRNKI AGYVTHLMKR IQRGPVRGIS IKLQEEERER RDNYVPEVS ALDQEIIEVD PDTKEMLKLL DFGSLSNLQV TQPTVGMNFK TPRGAV UniProtKB: Small ribosomal subunit protein eS17 |
+分子 #70: uS13
分子 | 名称: uS13 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 70 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
---|---|
由来(天然) | 生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ) |
分子量 | 理論値: 17.759777 KDa |
配列 | 文字列: MSLVIPEKFQ HILRVLNTNI DGRRKIAFAI TAIKGVGRRY AHVVLRKADI DLTKRAGELT EDEVERVITI MQNPRQYKIP DWFLNRQKD VKDGKYSQVL ANGLDNKLRE DLERLKKIRA HRGLRHFWGL RVRGQHTKTT GRRGRTVGVS KKK UniProtKB: Small ribosomal subunit protein uS13 |
+分子 #71: eS19
分子 | 名称: eS19 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 71 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
---|---|
由来(天然) | 生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ) |
分子量 | 理論値: 16.10664 KDa |
配列 | 文字列: MPGVTVKDVN QQEFVRALAA FLKKSGKLKV PEWVDTVKLA KHKELAPYDE NWFYTRAAST ARHLYLRGGA GVGSMTKIYG GRQRNGVMP SHFSRGSKSV ARRVLQALEG LKMVEKDQDG GRKLTPQGQR DLDRIAGQVA AAKKKH UniProtKB: Small ribosomal subunit protein eS19 |
+分子 #72: uS10
分子 | 名称: uS10 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 72 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
---|---|
由来(天然) | 生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ) |
分子量 | 理論値: 13.398763 KDa |
配列 | 文字列: MAFKDTGKTP VEPEVAIHRI RITLTSRNVK SLEKVCADLI RGAKEKNLKV KGPVRMPTKT LRITTRKTPC GEGSKTWDRF QMRIHKRLI DLHSPSEIVK QITSISIEPG VEVEVTIADA UniProtKB: Small ribosomal subunit protein uS10 |
+分子 #73: eS21
分子 | 名称: eS21 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 73 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
---|---|
由来(天然) | 生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ) |
分子量 | 理論値: 9.124389 KDa |
配列 | 文字列: MQNDAGEFVD LYVPRKCSAS NRIIGAKDHA SIQMNVAEVD KVTGRFNGQF KTYAICGAIR RMGESDDSIL RLAKADGIVS KNF |
+分子 #74: uS8
分子 | 名称: uS8 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 74 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
---|---|
由来(天然) | 生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ) |
分子量 | 理論値: 14.865555 KDa |
配列 | 文字列: MVRMNVLADA LKSINNAEKR GKRQVLIRPC SKVIVRFLTV MMKHGYIGEF EIIDDHRAGK IVVNLTGRLN KCGVISPRFD VQLKDLEKW QNNLLPSRQF GFIVLTTSAG IMDHEEARRK HTGGKILGFF F UniProtKB: Small ribosomal subunit protein uS8 |
+分子 #75: uS12
分子 | 名称: uS12 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 75 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
---|---|
由来(天然) | 生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ) |
分子量 | 理論値: 15.844666 KDa |
配列 | 文字列: MGKCRGLRTA RKLRSHRRDQ KWHDKQYKKA HLGTALKANP FGGASHAKGI VLEKVGVEAK QPNSAIRKCV RVQLIKNGKK ITAFVPNDG CLNFIEENDE VLVAGFGRKG HAVGDIPGVR FKVVKVANVS LLALYKGKKE RPRS |
+分子 #76: eS24
分子 | 名称: eS24 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 76 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
---|---|
由来(天然) | 生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ) |
分子量 | 理論値: 15.107924 KDa |
配列 | 文字列: MNDTVTIRTR KFMTNRLLQR KQMVIDVLHP GKATVPKTEI REKLAKMYKT TPDVIFVFGF RTHFGGGKTT GFGMIYDSLD YAKKNEPKH RLARHGLYEK KKTSRKQRKE RKNRMKKVRG TAKANVGAGK K |
+分子 #77: eS25
分子 | 名称: eS25 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 77 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
---|---|
由来(天然) | 生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ) |
分子量 | 理論値: 13.776224 KDa |
配列 | 文字列: MPPKDDKKKK DAGKSAKKDK DPVNKSGGKA KKKKWSKGKV RDKLNNLVLF DKATYDKLCK EVPNYKLITP AVVSERLKIR GSLARAALQ ELLSKGLIKL VSKHRAQVIY TRNTKGGDAP AAGEDA UniProtKB: Small ribosomal subunit protein eS25 |
+分子 #78: eS26
分子 | 名称: eS26 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 78 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
---|---|
由来(天然) | 生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ) |
分子量 | 理論値: 13.047532 KDa |
配列 | 文字列: MTKKRRNNGR AKKGRGHVQP IRCTNCARCV PKDKAIKKFV IRNIVEAAAV RDISEASVFD AYVLPKLYVK LHYCVSCAIH SKVVRNRSR EARKDRTPPP RFRPAGAAPR PPPKPM |
+分子 #79: 40S ribosomal protein S27
分子 | 名称: 40S ribosomal protein S27 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 79 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
---|---|
由来(天然) | 生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ) |
分子量 | 理論値: 9.480186 KDa |
配列 | 文字列: MPLAKDLLHP SPEEEKRKHK KKRLVQSPNS YFMDVKCPGC YKITTVFSHA QTVVLCVGCS TVLCQPTGGK ARLTEGCSFR RKQH UniProtKB: Small ribosomal subunit protein eS27 |
+分子 #80: eS28
分子 | 名称: eS28 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 80 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
---|---|
由来(天然) | 生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ) |
分子量 | 理論値: 7.855052 KDa |
配列 | 文字列: MDTSRVQPIK LARVTKVLGR TGSQGQCTQV RVEFMDDTSR SIIRNVKGPV REGDVLTLLE SEREARRLR UniProtKB: Small ribosomal subunit protein eS28 |
+分子 #81: uS14
分子 | 名称: uS14 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 81 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
---|---|
由来(天然) | 生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ) |
分子量 | 理論値: 6.690821 KDa |
配列 | 文字列: MGHQQLYWSH PRKFGQGSRS CRVCSNRHGL IRKYGLNMCR QCFRQYAKDI GFIKLD UniProtKB: Small ribosomal subunit protein uS14 |
+分子 #82: eS30
分子 | 名称: eS30 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 82 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
---|---|
由来(天然) | 生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ) |
分子量 | 理論値: 14.498884 KDa |
配列 | 文字列: MQLFVRAQEL HTLEVTGRET VAQIKAHVAS LEGIAPEDQV VLLAGTPLED EATLGQCGVE ALSTLEVAGR MLGGKVHGSL ARVGKVRGQ TLKVAKQEKK KKRTGRAKRR MQYNRRFVNV VPTFGKKKGP NANS UniProtKB: Ubiquitin-like FUBI-ribosomal protein eS30 fusion protein |
+分子 #83: eS31
分子 | 名称: eS31 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 83 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
---|---|
由来(天然) | 生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ) |
分子量 | 理論値: 18.004041 KDa |
配列 | 文字列: MQIFVKTLTG KTITLEVEPS DTIENVKAKI QDKEGIPPDQ QRLIFAGKQL EDGRTLSDYN IQKESTLHLV LRLRGGAKKR KKKSYTTPK KNKHKRKKVK LAVLKYYKVD ENGKISRLRR ECPSDECGAG VFMASHFDRH YCGKCCLTYC FNKPEDK UniProtKB: Ubiquitin-ribosomal protein eS31 fusion protein |
+分子 #84: RACK1
分子 | 名称: RACK1 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 84 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
---|---|
由来(天然) | 生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ) |
分子量 | 理論値: 35.115652 KDa |
配列 | 文字列: MTEQMTLRGT LKGHNGWVTQ IATTPQFPDM ILSASRDKTI IMWKLTRDET NYGIPQRALR GHSHFVSDVV ISSDGQFALS GSWDGTLRL WDLTTGTTTR RFVGHTKDVL SVAFSSDNRQ IVSGSRDKTI KLWNTLGVCK YTVQDESHSE WVSCVRFSPN S SNPIIVSC ...文字列: MTEQMTLRGT LKGHNGWVTQ IATTPQFPDM ILSASRDKTI IMWKLTRDET NYGIPQRALR GHSHFVSDVV ISSDGQFALS GSWDGTLRL WDLTTGTTTR RFVGHTKDVL SVAFSSDNRQ IVSGSRDKTI KLWNTLGVCK YTVQDESHSE WVSCVRFSPN S SNPIIVSC GWDKLVKVWN LANCKLKTNH IGHTGYLNTV TVSPDGSLCA SGGKDGQAML WDLNEGKHLY TLDGGDIINA LC FSPNRYW LCAATGPSIK IWDLEGKIIV DELKQEVIST SSKAEPPQCT SLAWSADGQT LFAGYTDNLV RVWQVTIGTR UniProtKB: Small ribosomal subunit protein RACK1 |
+分子 #86: Protein pelota homolog
分子 | 名称: Protein pelota homolog / タイプ: protein_or_peptide / ID: 86 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO EC番号: 加水分解酵素; エステル加水分解酵素 |
---|---|
由来(天然) | 生物種: Homo sapiens (ヒト) |
分子量 | 理論値: 45.519312 KDa |
組換発現 | 生物種: Escherichia coli BL21(DE3) (大腸菌) |
配列 | 文字列: MKLVRKNIEK DNAGQVTLVP EEPEDMWHTY NLVQVGDSLR ASTIRKVQTE SSTGSVGSNR VRTTLTLCVE AIDFDSQACQ LRVKGTNIQ ENEYVKMGAY HTIELEPNRQ FTLAKKQWDS VVLERIEQAC DPAWSADVAA VVMQEGLAHI CLVTPSMTLT R AKVEVNIP ...文字列: MKLVRKNIEK DNAGQVTLVP EEPEDMWHTY NLVQVGDSLR ASTIRKVQTE SSTGSVGSNR VRTTLTLCVE AIDFDSQACQ LRVKGTNIQ ENEYVKMGAY HTIELEPNRQ FTLAKKQWDS VVLERIEQAC DPAWSADVAA VVMQEGLAHI CLVTPSMTLT R AKVEVNIP RKRKGNCSQH DRALERFYEQ VVQAIQRHIH FDVVKCILVA SPGFVREQFC DYMFQQAVKT DNKLLLENRS KF LQVHASS GHKYSLKEAL CDPTVASRLS DTKAAGEVKA LDDFYKMLQH EPDRAFYGLK QVEKANEAMA IDTLLISDEL FRH QDVATR SRYVRLVDSV KENAGTVRIF SSLHVSGEQL SQLTGVAAIL RFPVPELSDQ EGDSSSEEDG SENLYFQGAH HHHH HST UniProtKB: Protein pelota homolog |
+分子 #87: HBS1-like protein
分子 | 名称: HBS1-like protein / タイプ: protein_or_peptide / ID: 87 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
---|---|
由来(天然) | 生物種: Homo sapiens (ヒト) |
分子量 | 理論値: 78.637961 KDa |
組換発現 | 生物種: Homo sapiens (ヒト) |
配列 | 文字列: MDYKDHDGDY KDHDIDYKDD DDKAGSMARH RNVRGYNYDE DFEDDDLYGQ SVEDDYCISP STAAQFIYSR RDKPSVEPVE EYDYEDLKE SSNSVSNHQL SGFDQARLYS CLDHMREVLG DAVPDEILIE AVLKNKFDVQ KALSGVLEQD RVQSLKDKNE A TVSTGKIA ...文字列: MDYKDHDGDY KDHDIDYKDD DDKAGSMARH RNVRGYNYDE DFEDDDLYGQ SVEDDYCISP STAAQFIYSR RDKPSVEPVE EYDYEDLKE SSNSVSNHQL SGFDQARLYS CLDHMREVLG DAVPDEILIE AVLKNKFDVQ KALSGVLEQD RVQSLKDKNE A TVSTGKIA KGKPVDSQTS RSESEIVPKV AKMTVSGKKQ TMGFEVPGVS SEENGHSFHT PQKGPPIEDA IASSDVLETA SK SANPPHT IQASEEQSST PAPVKKSGKL RQQIDVKAEL EKRQGGKQLL NLVVIGHVDA GKSTLMGHML YLLGNINKRT MHK YEQESK KAGKASFAYA WVLDETGEER ERGVTMDVGM TKFETTTKVI TLMDAPGHKD FIPNMITGAA QADVAVLVVD ASRG EFEAG FETGGQTREH GLLVRSLGVT QLAVAVNKMD QVNWQQERFQ EITGKLGHFL KQAGFKESDV GFIPTSGLSG ENLIT RSQS SELTKWYKGL CLLEQIDSFK PPQRSIDKPF RLCVSDVFKD QGSGFCITGK IEAGYIQTGD RLLAMPPNET CTVKGI TLH DEPVDWAAAG DHVSLTLVGM DIIKINVGCI FCGPKVPIKA CTRFRARILI FNIEIPITKG FPVLLHYQTV SEPAVIK RL ISVLNKSTGE VTKKKPKFLT KGQNALVELQ TQRPIALELY KDFKELGRFM LRYGGSTIAA GVVTEIKE UniProtKB: HBS1-like protein |
+分子 #46: P-site tRNA
分子 | 名称: P-site tRNA / タイプ: rna / ID: 46 / コピー数: 1 |
---|---|
由来(天然) | 生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ) |
分子量 | 理論値: 24.436551 KDa |
配列 | 文字列: GUCUCCGUAG UGUAGCGGUU AUCACGUUCG CCUAACACGC GAAAGGUCCU CGGUUCGAAA CCGGGCGGAA ACACCA |
+分子 #47: E-site tRNA
分子 | 名称: E-site tRNA / タイプ: rna / ID: 47 / コピー数: 1 |
---|---|
由来(天然) | 生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ) |
分子量 | 理論値: 24.102275 KDa |
配列 | 文字列: GCCCGGAUAG CUCAGCUGUA GAGCAUCAGA CUUUUAAUCU GAGGGUCCAG GGUUCAAGUC CCUGUUCGGG CGCCA |
+分子 #48: 28S ribosomal RNA
分子 | 名称: 28S ribosomal RNA / タイプ: rna / ID: 48 / コピー数: 1 |
---|---|
由来(天然) | 生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ) |
分子量 | 理論値: 1.148115375 MDa |
配列 | 文字列: CGCGACCUCA GAUCAGACGU GGCGACCCGC UGAAUUUAAG CAUAUUAGUC AGCGGAGGAA AAGAAACUAA CCAGGAUUCC CUCAGUAAC GGCGAGUGAA CAGGGAAGAG CCCAGCGCCG AAUCCCCGCC CCGCGGCGGG GCGCGGGAAA UGUGGCGUAC G GAAGACCC ...文字列: CGCGACCUCA GAUCAGACGU GGCGACCCGC UGAAUUUAAG CAUAUUAGUC AGCGGAGGAA AAGAAACUAA CCAGGAUUCC CUCAGUAAC GGCGAGUGAA CAGGGAAGAG CCCAGCGCCG AAUCCCCGCC CCGCGGCGGG GCGCGGGAAA UGUGGCGUAC G GAAGACCC ACUCCCCGGC GCCGGGGGGC CCAAGUCCUU CUGAUCGAGG CCCAGCCCGU GGACGGUGUG AGGCCGGUAG CG GCCCCCG GCGCGCCGGG CCCGGGUCUU CCCGGAGUCG GGUUGCUUGG GAAUGCAGCC CAAAGCGGGU GGUAAACUCC AUC UAAGGC UAAAUACCGG CACGAGACCG AUAGUCAACA AGUACCGUAA GGGAAAGUUG AAAAGAACUU UGAAGAGAGA GUUC AAGAG GGCGUGAAAC CGUUAAGAGG UAAACGGGUG GGGUCCGCGC AGUCCGCCCG GAGGAUUCAA CCCGGCGGCG CGGUC CGGC CGUGCCGGCG GGGCGGAUCU CCCGCUCCCG UCGGCGGGGG ACCGCCCCCC GGCCGGCGAC CGGCCGCCGC CGGGCG CAU UUCCACCGCG GCGGUGCGCC GCGACCGGCU CCGGGACGGC UGGGAAGGCC CCGGCGGGGA AGGUGGCCCG GGGGCCC CG GGUGUUACAG CCCCGCCCCG GCAGCAGCAG CUCGCCGAAU CCCGGGGCCG AGGGAGCGAG ACCCGUGCGC CGCGCUCU C CCCCCUCGGG GGGGCCGGGC CACCCCUCCC ACGGCGCGAC CGCUGGGGCG GACUGUCCAG UGCGCCCCGG GCGGGUCGC GCCGUCGGGC CCGGGGGGCC ACGCGUCCCC CGCGAGCGCA CGGGGUCGGC GGCGAUGUCG GCUACCCACC CGACCCGUCU UGAAACACG GACCAAGGAG UCUAACACGU GCGCGAGUCG GGGGCUACGA AAGCCGCCGU GGCGCAAUGA AGGUGAAGGC C GGCGGCGC GCCGCCGGCC GAGGUGGGAU CCCGAGGCCU UCCAGUCCGC CGAGGGCGCA CCACCGGCCC GUCUCGCCCG CC GCGCCGG GGAGGUGGAG CACGAGCGCA CGUGUUAGGA CCCGAAAGAU GGUGAACUAU GCCUGGGCAG GGCGAAGCCA GAG GAAACU CUGGUGGAGG UCCGUAGCGG UCCUGACGUG CGAAUCGGUC GUCCGACCUG GGUAUAGGGG CGAAAGACUA AUCG AACCA UCUAGUAGCU GGUUCCCUCC AAAGUUUCCC UCAGGAUAGC UGGCGCUCUC CGCAGUUUUA UCCGGUAAAG CGAAU GAUU AGAGGUCUUG GGGCCGAAAC GAUCUCAACC UAUUCUCAAA CUUUAAAUGG GUAAGAAGCC CGGCUCGCUG GUGUGG AGC CGGGCGUGGA AUGCGAGUGC CUAGUGGGCC ACUUUUGGUA AGCAGAACUG GCGCUGCGGG AUGAACCGAA CGCCGGG UU AAGGCGCCCG AUGCCGACGC UCAUCAGACC CCAGAAAAGG UGUUGGUUGA UAUAGACAGC AGGAUGGUGG CCAUGGAA G UCGGAAUCCG CUAAGGAGUG UGUAACAACU CACCUGCCGA AUCAACUAGC CCUGAAAAUG GAUGGCGCUG GAGCGUCGG GCCCAUACCC GGCCGUCGCU GGCAGUCGGC AGAGCGAGAA AGAGAGUGGC GCGGACGCUA CGCCGCGACG AGUAGGAGGG CCGCUGCGG UGAGCCUUGA AGCCUAGGGC GCGGGCCCGG GUGGAGCCGC CGCAGGUGCA GAUCUUGGUG GUAGUAGCAA A UAUUCAAA CGAGAACUUU GAAGGCCGAA GUGGAGAAGG GUUCCAUGUG AACAGCAGUU GAACAUGGGU CAGUCGGUCC UG AGAGAUG GGCGAGCGCC GUUCCGAAGG GACGGGCGAU GGCCUCCGUU GCCCUCAGCC GAUCGAAAGG GAGUCGGGUU CAG AUCCCC GAAUCCGGAG UGGCGGAGAU GGGCGCCGCG AGGCGUCCAG UGCGGUAACG CGACCGAUCC CGGAGAAGCC GGCG GGAGC CCCGGGGAGA GUUCUCUUUU CUUUGUGAAG GGCAGGGCGC CCUGGAAUGG GUUCGCCCCG AGAGAGGGGC CCGUG CCUU GGAAAGCGUC GCGGUUCCGG CGGCGUCCGG UGAGCUCUCG CUGGCCCUUG AAAAUCCGGG GGAGAGGGUG UAAAUC UCG CGCCGGGCCG UACCCAUAUC CGCAGCAGGU CUCCAAGGUG AACAGCCUCU GGCAUGUUGG AACAAUGUAG GUAAGGG AA GUCGGCAAGC CGGAUCCGUA ACUUCGGGAU AAGGAUUGGC UCUAAGGGCU GGCAGCCGAC UUAGAACUGG UGCGGACC A GGGGAAUCCG ACUGUUUAAU UAAAACAAAG CAUCGCGAAG GCCCGCGGCG GGUGUUGACG CGAUGUGAUU UCUGCCCAG UGCUCUGAAU GUCAAAGUGA AGAAAUUCAA UGAAGCGCGG GUAAACGGCG GGAGUAACUA UGACUCUCUU AAGGUAGCCA AAUGCCUCG UCAUCUAAUU AGUGACGCGC AUGAAUGGAU GAACGAGAUU CCCACUGUCC CUACCUACUA UCCAGCGAAA C CACAGCCA AGGGAACGGG CUUGGCGGAA UCAGCGGGGA AAGAAGACCC UGUUGAGCUU GACUCUAGUC UGGCACGGUG AA GAGACGU UUUUUCACUG ACCCGGUGAG GCGGGGGGGC GAGCCGGGCU CUCGCUUCUG GCGCCAAGCG CCCGGCCGGC CGG GCGCGA CCCGCUCCGG GGACAGUGCC AGGUGGGGAG UUUGACUGGG GCGGUACACC UGUCAAACGG UAACGCAGGU GUCC UAAGG CGAGCUCAGG GAGGACAGAA ACCUCCCGUG GAGCAGAAGG GCAAAAGCUC GCUUGAUCUU GAUUUUCAGU ACGAA UACA GACCGUGAAA GCGGGGCCUC ACGAUCCUUC UGACCUUUUG GGUUUUAAGC AGGAGGUGUC AGAAAAGUUA CCACAG GGA UAACUGGCUU GUGGCGGCCA AGCGUUCAUA GCGACGUCGC UUUUUGAUCC UUCGAUGUCG GCUCUUCCUA UCAUUGU GA AGCAGAAUUC ACCAAGCGUU GGAUUGUUCA CCCACUAAUA GGGAACGUGA GCUGGGUUUA GACCGUCGUG AGACAGGU U AGUUUUACCC UACUGAUGAU GUGUUGUUGC CAUGGUAAUC CUGCUCAGUA CGAGAGGAAC CGCAGGUUCA GACAUUUGG UGUAUGUGCU UGGCUGAGGA GCCAAUGGGG CGAAGCUACC AUCUGUGGGA UUAUGACUGA ACGCCUCUAA GUCAGAAUCC CGCCCAGGC GGAACGAUAG CGCCGGAGCC UCGGUUGGCC UCGGAUAGCC GGUCCCCCGC CGGGGUCCGG UGCGGAGAGC C CUUCGUCC CGGGAAACGG GGCGGCCGGA AAGGGGGCCG CCCUCUCGCC CGUCACGCAC CGCACGUUCG UGGGGAACCU GG CGCUAAA CCAUUCGUAG ACGACCUGCU UCUGGGUCGG GGUUUCGUAC GUAGCAGAGC AGCUGCUGCG AUCUAUUGAA AGU CAGCCC UCGACACAAG GGUUUGU |
+分子 #49: 5S ribosomal RNA
分子 | 名称: 5S ribosomal RNA / タイプ: rna / ID: 49 / コピー数: 1 |
---|---|
由来(天然) | 生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ) |
分子量 | 理論値: 38.691914 KDa |
配列 | 文字列: GUCUACGGCC AUACCACCCU GAACGCGCCC GAUCUCGUCU GAUCUCGGAA GCUAAGCAGG GUCGGGCCUG GUUAGUACUU GGAUGGGAG ACCGCCUGGG AAUACCGGGU GCUGUAGGCU U |
+分子 #50: 5.8S ribosomal RNA
分子 | 名称: 5.8S ribosomal RNA / タイプ: rna / ID: 50 / コピー数: 1 |
---|---|
由来(天然) | 生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ) |
分子量 | 理論値: 50.143648 KDa |
配列 | 文字列: CGACUCUUAG CGGUGGAUCA CUCGGCUCGU GCGUCGAUGA AGAACGCAGC UAGCUGCGAG AAUUAAUGUG AAUUGCAGGA CACAUUGAU CAUCGACACU UCGAACGCAC UUGCGGCCCC GGGUUCCUCC CGGGGCUACG CCUGUCUGAG CGUCGCU |
+分子 #51: 18S ribosomal RNA
分子 | 名称: 18S ribosomal RNA / タイプ: rna / ID: 51 / コピー数: 1 |
---|---|
由来(天然) | 生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ) |
分子量 | 理論値: 602.778875 KDa |
配列 | 文字列: UACCUGGUUG AUCCUGCCAG UAGCAUAUGC UUGUCUCAAA GAUUAAGCCA UGCAUGUCUA AGUACGCACG GCCGGUACAG UGAAACUGC GAAUGGCUCA UUAAAUCAGU UAUGGUUCCU UUGGUCGCUC GCUCCUCUCC UACUUGGAUA ACUGUGGUAA U UCUAGAGC ...文字列: UACCUGGUUG AUCCUGCCAG UAGCAUAUGC UUGUCUCAAA GAUUAAGCCA UGCAUGUCUA AGUACGCACG GCCGGUACAG UGAAACUGC GAAUGGCUCA UUAAAUCAGU UAUGGUUCCU UUGGUCGCUC GCUCCUCUCC UACUUGGAUA ACUGUGGUAA U UCUAGAGC UAAUACAUGC CGACGGGCGC UGACCCCCUU CGCGGGGGGG AUGCGUGCAU UUAUCAGAUC AAAACCAACC CG GUCAGCC CCUCUCCGGC CCCGGCCGGG GGGCGGGCGC CGGCGGCUUU GGUGACUCUA GAUAACCUCG GGCCGAUCGC ACG CCCCCC GUGGCGGCGA CGACCCAUUC GAACGUCUGC CCUAUCAACU UUCGAUGGUA GUCGCCGUGC CUACCAUGGU GACC ACGGG UGACGGGGAA UCAGGGUUCG AUUCCGGAGA GGGAGCCUGA GAAACGGCUA CCACAUCCAA GGAAGGCAGC AGGCG CGCA AAUUACCCAC UCCCGACCCG GGGAGGUAGU GACGAAAAAU AACAAUACAG GACUCUUUCG AGGCCCUGUA AUUGGA AUG AGUCCACUUU AAAUCCUUUA ACGAGGAUCC AUUGGAGGGC AAGUCUGGUG CCAGCAGCCG CGGUAAUUCC AGCUCCA AU AGCGUAUAUU AAAGUUGCUG CAGUUAAAAA GCUCGUAGUU GGAUCUUGGG AGCGGGCGGG CGGUCCGCCG CGAGGCGA G CCACCGCCCG UCCCCGCCCC UUGCCUCUCG GCGCCCCCUC GAUGCUCUUA GCUGAGUGUC CCGCGGGGCC CGAAGCGUU UACUUUGAAA AAAUUAGAGU GUUCAAAGCA GGCCCGAGCC GCCUGGAUAC CGCAGCUAGG AAUAAUGGAA UAGGACCGCG GUUCUAUUU UGUUGGUUUU CGGAACUGAG GCCAUGAUUA AGAGGGACGG CCGGGGGCAU UCGUAUUGCG CCGCUAGAGG U GAAAUUCU UGGACCGGCG CAAGACGGAC CAGAGCGAAA GCAUUUGCCA AGAAUGUUUU CAUUAAUCAA GAACGAAAGU CG GAGGUUC GAAGACGAUC AGAUACCGUC GUAGUUCCGA CCAUAAACGA UGCCGACUGG CGAUGCGGCG GCGUUAUUCC CAU GACCCG CCGGGCAGCU UCCGGGAAAC CAAAGUCUUU GGGUUCCGGG GGGAGUAUGG UUGCAAAGCU GAAACUUAAA GGAA UUGAC GGAAGGGCAC CACCAGGAGU GGAGCCUGCG GCUUAAUUUG ACUCAACACG GGAAACCUCA CCCGGCCCGG ACACG GACA GGAUUGACAG AUUGAUAGCU CUUUCUCGAU UCCGUGGGUG GUGGUGCAUG GCCGUUCUUA GUUGGUGGAG CGAUUU GUC UGGUUAAUUC CGAUAACGAA CGAGACUCUG GCAUGCUAAC UAGUUACGCG ACCCCCGAGC GGUCGGCGUC CCCCAAC UU CUUAGAGGGA CAAGUGGCGU UCAGCCACCC GAGAUUGAGC AAUAACAGGU CUGUGAUGCC CUUAGAUGUC CGGGGCUG C ACGCGCGCUA CACUGACUGG CUCAGCGUGU GCCUACCCUA CGCCGGCAGG CGCGGGUAAC CCGUUGAACC CCAUUCGUG AUGGGGAUCG GGGAUUGCAA UUAUUCCCCA UGAACGAGGA AUUCCCAGUA AGUGCGGGUC AUAAGCUUGC GUUGAUUAAG UCCCUGCCC UUUGUACACA CCGCCCGUCG CUACUACCGA UUGGAUGGUU UAGUGAGGCC CUCGGAUCGG CCCCGCCGGG G UCGGCCCA CGGCCCUGGC GGAGCGCUGA GAAGACGGUC GAACUUGACU AUCUAGAGGA AGUAAAAGUC GUAACAAGGU UU CCGUAGG UGAACCUGCG GAAGGAUCAU UA |
+分子 #85: mRNA (UGA stop codon)
分子 | 名称: mRNA (UGA stop codon) / タイプ: rna / ID: 85 / コピー数: 1 |
---|---|
由来(天然) | 生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ) |
分子量 | 理論値: 2.511545 KDa |
配列 | 文字列: UCAAAGUU |
+分子 #88: MAGNESIUM ION
分子 | 名称: MAGNESIUM ION / タイプ: ligand / ID: 88 / コピー数: 264 / 式: MG |
---|---|
分子量 | 理論値: 24.305 Da |
+分子 #89: ZINC ION
分子 | 名称: ZINC ION / タイプ: ligand / ID: 89 / コピー数: 8 / 式: ZN |
---|---|
分子量 | 理論値: 65.409 Da |
+分子 #90: PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER
分子 | 名称: PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER / タイプ: ligand / ID: 90 / コピー数: 1 / 式: GCP |
---|---|
分子量 | 理論値: 521.208 Da |
Chemical component information | ChemComp-G2P: |
-実験情報
-構造解析
手法 | クライオ電子顕微鏡法 |
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解析 | 単粒子再構成法 |
試料の集合状態 | particle |
-試料調製
濃度 | 0.2 mg/mL | |||||||||||||||
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緩衝液 | pH: 7.4 構成要素:
| |||||||||||||||
グリッド | モデル: Quantifoil R2/2 / 材質: COPPER / メッシュ: 400 / 支持フィルム - 材質: CARBON / 支持フィルム - トポロジー: CONTINUOUS / 支持フィルム - Film thickness: 5 / 前処理 - タイプ: GLOW DISCHARGE | |||||||||||||||
凍結 | 凍結剤: ETHANE / チャンバー内湿度: 100 % / チャンバー内温度: 277 K / 装置: FEI VITROBOT MARK III 詳細: 3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.. |
-電子顕微鏡法
顕微鏡 | FEI TITAN KRIOS |
---|---|
電子線 | 加速電圧: 300 kV / 電子線源: FIELD EMISSION GUN |
電子光学系 | C2レンズ絞り径: 70.0 µm / 倍率(補正後): 104478 / 照射モード: FLOOD BEAM / 撮影モード: BRIGHT FIELDBright-field microscopy / Cs: 2.7 mm / 倍率(公称値): 59000 |
試料ステージ | 試料ホルダーモデル: FEI TITAN KRIOS AUTOGRID HOLDER ホルダー冷却材: NITROGEN |
撮影 | フィルム・検出器のモデル: FEI FALCON II (4k x 4k) 検出モード: INTEGRATING / 実像数: 1556 / 平均露光時間: 1.0 sec. / 平均電子線量: 30.0 e/Å2 |
実験機器 | モデル: Titan Krios / 画像提供: FEI Company |
-画像解析
-原子モデル構築 1
精密化 | 空間: RECIPROCAL / プロトコル: OTHER / 温度因子: 56.8 / 当てはまり具合の基準: FSCaverage |
---|---|
得られたモデル | PDB-5lzx: |
+万見について
-お知らせ
-2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました
EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました
- EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
- これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。
関連情報:EMDBヘッダ
-2020年8月12日: 新型コロナ情報
新型コロナ情報
URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php
新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。
関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ
+2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ
新型コロナウイルスの構造データ
- 国際ウイルス分類委員会(ICTV)は、新型コロナウイルス感染症(COVID-19)の病原ウイルスの略称を「SARS-CoV-2」と決定しました。
- 万見で扱っている構造データベースでは、"COVID-19 virus"、"2019-nCoV"といった別称・仮称でも登録されています。こちらでウイルスの詳細と構造データの一覧を見られます。
関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報
+2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更
EMDBのIDの桁数の変更
- EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
- EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。
関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか? / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記
+2017年7月12日: PDB大規模アップデート
PDB大規模アップデート
- 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
- 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
- このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例:em_softwareなど)。
- EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。
外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。
-万見 (Yorodumi)
幾万の構造データを、幾万の視点から
- 万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
- EM Navigatorの詳細ページの後継、Omokage検索のフロントエンドも兼ねています。
関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較 / 万見検索 / 2016年8月31日: 新しいEM Navigatorと万見 / 万見文献 / Jmol/JSmol / 機能・相同性情報 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点