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-基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 8x61 | ||||||
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タイトル | Cryo-EM structure of ATP-bound FtsE(E163Q)X | ||||||
要素 |
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キーワード | TRANSPORT PROTEIN (運搬体タンパク質) / abc transporter / cell division (細胞分裂) | ||||||
機能・相同性 | 機能・相同性情報 division septum / divisome complex / Gram-negative-bacterium-type cell wall / peptidoglycan turnover / plasma membrane protein complex / FtsZ-dependent cytokinesis / division septum assembly / cell division site / extrinsic component of membrane / ATPase complex ...division septum / divisome complex / Gram-negative-bacterium-type cell wall / peptidoglycan turnover / plasma membrane protein complex / FtsZ-dependent cytokinesis / division septum assembly / cell division site / extrinsic component of membrane / ATPase complex / positive regulation of cell division / transmembrane transporter activity / transmembrane transport / 細胞分裂 / response to antibiotic / ATP hydrolysis activity / ATP binding / 細胞膜 / 細胞質 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | Escherichia coli K-12 (大腸菌) | ||||||
手法 | 電子顕微鏡法 / 単粒子再構成法 / クライオ電子顕微鏡法 / 解像度: 3.05 Å | ||||||
データ登録者 | Zhang, Z.Y. / Chen, Y.T. | ||||||
資金援助 | 中国, 1件
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引用 | ジャーナル: To Be Published タイトル: Cryo-EM structure of ATP-bound FtsE(E163Q)X 著者: Zhang, Z.Y. / Chen, Y.T. | ||||||
履歴 |
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-構造の表示
構造ビューア | 分子: MolmilJmol/JSmol |
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-ダウンロードとリンク
-ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | 8x61.cif.gz | 157 KB | 表示 | PDBx/mmCIF形式 |
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PDB形式 | pdb8x61.ent.gz | 118.4 KB | 表示 | PDB形式 |
PDBx/mmJSON形式 | 8x61.json.gz | ツリー表示 | PDBx/mmJSON形式 | |
その他 | その他のダウンロード |
-検証レポート
アーカイブディレクトリ | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/x6/8x61 ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/x6/8x61 | HTTPS FTP |
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-関連構造データ
関連構造データ | 38077MC M: このデータのモデリングに利用したマップデータ C: 同じ文献を引用 (文献) |
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類似構造データ | 類似検索 - 機能・相同性F&H 検索 |
-リンク
-集合体
登録構造単位 |
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1 |
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-要素
#1: タンパク質 | 分子量: 24475.295 Da / 分子数: 2 / 変異: E163Q / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Escherichia coli K-12 (大腸菌) / 遺伝子: ftsE, b3463, JW3428 / 発現宿主: Escherichia coli (大腸菌) / 参照: UniProt: P0A9R7 #2: タンパク質 | 分子量: 38583.500 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Escherichia coli K-12 (大腸菌) / 遺伝子: ftsX, ftsS, b3462, JW3427 / 発現宿主: Escherichia coli (大腸菌) / 参照: UniProt: P0AC30 #3: 化合物 | 研究の焦点であるリガンドがあるか | Y | |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: 電子顕微鏡法 |
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EM実験 | 試料の集合状態: 3D ARRAY / 3次元再構成法: 単粒子再構成法 |
-試料調製
構成要素 | 名称: cell division complex FtsEX / タイプ: COMPLEX / Entity ID: #1-#2 / 由来: RECOMBINANT |
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由来(天然) | 生物種: Escherichia coli (strain K12) (大腸菌) |
由来(組換発現) | 生物種: Escherichia coli (大腸菌) |
緩衝液 | pH: 8 |
試料 | 包埋: NO / シャドウイング: NO / 染色: NO / 凍結: YES |
急速凍結 | 凍結剤: ETHANE |
-電子顕微鏡撮影
顕微鏡 | モデル: FEI TITAN |
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電子銃 | 電子線源: FIELD EMISSION GUN / 加速電圧: 300 kV / 照射モード: OTHER |
電子レンズ | モード: OTHER / 最大 デフォーカス(公称値): 2500 nm / 最小 デフォーカス(公称値): 1200 nm |
撮影 | 電子線照射量: 60 e/Å2 フィルム・検出器のモデル: GATAN K3 BIOQUANTUM (6k x 4k) |
-解析
CTF補正 | タイプ: PHASE FLIPPING AND AMPLITUDE CORRECTION | ||||||||||||||||||||||||
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3次元再構成 | 解像度: 3.05 Å / 解像度の算出法: FSC 0.143 CUT-OFF / 粒子像の数: 370231 / 対称性のタイプ: POINT | ||||||||||||||||||||||||
拘束条件 |
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