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-基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 8b7t | ||||||
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タイトル | CPSF73 CTD3 | ||||||
要素 | CPSF73 | ||||||
キーワード | RNA BINDING PROTEIN (RNA結合タンパク質) / Cleavage and polyadenylation specifity factor | ||||||
機能・相同性 | 機能・相同性情報 | ||||||
生物種 | Encephalitozoon cuniculi (ウサギエンケファリトゾーン) | ||||||
手法 | 溶液NMR / simulated annealing | ||||||
データ登録者 | Thore, S. / Mackereth, C. | ||||||
資金援助 | 1件
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引用 | ジャーナル: Open Biology / 年: 2023 タイトル: Molecular details of the CPSF73-CPSF100 C-terminal heterodimer and interaction with Symplekin. 著者: Thore, S. / Raoelijaona, F. / Talenton, V. / Fribourg, S. / Mackereth, C.D. #1: ジャーナル: Biorxiv / 年: 2023 タイトル: Molecular details of the CPSF73-CPSF100 C-terminal heterodimer and interaction with Symplekin 著者: Thore, S. / Raoelijaona, F. / Talenton, V. / Fribourg, S. / Mackereth, C. | ||||||
履歴 |
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-構造の表示
構造ビューア | 分子: MolmilJmol/JSmol |
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-ダウンロードとリンク
-ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | 8b7t.cif.gz | 522.5 KB | 表示 | PDBx/mmCIF形式 |
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PDB形式 | pdb8b7t.ent.gz | 445.7 KB | 表示 | PDB形式 |
PDBx/mmJSON形式 | 8b7t.json.gz | ツリー表示 | PDBx/mmJSON形式 | |
その他 | その他のダウンロード |
-検証レポート
アーカイブディレクトリ | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/b7/8b7t ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/b7/8b7t | HTTPS FTP |
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-関連構造データ
関連構造データ | 8ba1C C: 同じ文献を引用 (文献) |
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類似構造データ | 類似検索 - 機能・相同性F&H 検索 |
その他のデータベース |
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-リンク
-集合体
登録構造単位 |
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1 |
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NMR アンサンブル |
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-要素
#1: タンパク質 | 分子量: 8497.995 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 由来: (組換発現) Encephalitozoon cuniculi (ウサギエンケファリトゾーン) 株: GB-M1 / 遺伝子: ECU10_0900 / プラスミド: pET-MCN / 発現宿主: Escherichia coli BL21(DE3) (大腸菌) / 株 (発現宿主): lysY / 参照: UniProt: Q8SUE4 |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: 溶液NMR | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NMR実験 |
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-試料調製
詳細 |
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試料 |
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試料状態 | イオン強度: 150 mM / Label: conditions_1 / pH: 7.5 / 圧: 1 atm / 温度: 298 K |
-NMR測定
NMRスペクトロメーター |
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-解析
NMR software |
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精密化 |
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代表構造 | 選択基準: closest to the average | ||||||||||||||||||
NMRアンサンブル | コンフォーマー選択の基準: structures with the lowest energy 計算したコンフォーマーの数: 100 / 登録したコンフォーマーの数: 20 |