+Open data
-Basic information
Entry | Database: PDB / ID: 7qys | ||||||||||||
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Title | Crystal structure of RimK from Pseudomonas syringae DC3000 | ||||||||||||
Components | Probable alpha-L-glutamate ligase | ||||||||||||
Keywords | LIGASE / ATP-grasp fold / glutamate ligase / ribosomal modification | ||||||||||||
Function / homology | Function and homology information acid-amino acid ligase activity / Ligases; Forming carbon-nitrogen bonds; Acid-amino-acid ligases (peptide synthases) / translation / ATP binding / metal ion binding Similarity search - Function | ||||||||||||
Biological species | Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000 (bacteria) | ||||||||||||
Method | X-RAY DIFFRACTION / SYNCHROTRON / MOLECULAR REPLACEMENT / Resolution: 2.9 Å | ||||||||||||
Authors | Thompson, C.M.A. / Little, R.H. / Stevenson, C.E.M. / Lawson, D.M. / Malone, J.G. | ||||||||||||
Funding support | United Kingdom, 3items
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Citation | Journal: Proteins / Year: 2023 Title: Structural insights into the mechanism of adaptive ribosomal modification by Pseudomonas RimK. Authors: Thompson, C.M.A. / Little, R.H. / Stevenson, C.E.M. / Lawson, D.M. / Malone, J.G. | ||||||||||||
History |
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-Structure visualization
Structure viewer | Molecule: MolmilJmol/JSmol |
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-Downloads & links
-Download
PDBx/mmCIF format | 7qys.cif.gz | 1.7 MB | Display | PDBx/mmCIF format |
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PDB format | pdb7qys.ent.gz | 1.4 MB | Display | PDB format |
PDBx/mmJSON format | 7qys.json.gz | Tree view | PDBx/mmJSON format | |
Others | Other downloads |
-Validation report
Arichive directory | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/qy/7qys ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/qy/7qys | HTTPS FTP |
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-Related structure data
Related structure data | 7qyrC 4iwxS S: Starting model for refinement C: citing same article (ref.) |
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Similar structure data | Similarity search - Function & homologyF&H Search |
-Links
-Assembly
Deposited unit |
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Unit cell |
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Noncrystallographic symmetry (NCS) | NCS domain:
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