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-基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 7p55 | ||||||
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タイトル | NMR structure of human ACE2 21-42 fragment in HFIP/water 50/50 v/v | ||||||
要素 | Processed angiotensin-converting enzyme 2 | ||||||
キーワード | ANTIVIRAL PROTEIN / STRUCTURE FROM CYANA 2.1 (構造) / angiotensin converting enzyme 2 (アンジオテンシン変換酵素2) / ACE2 (アンジオテンシン変換酵素2) / SARS-CoV-2 (SARSコロナウイルス2) / COVID-19 (新型コロナウイルス感染症 (2019年)) | ||||||
機能・相同性 | 機能・相同性情報 positive regulation of amino acid transport / アンジオテンシン変換酵素2 / positive regulation of L-proline import across plasma membrane / 加水分解酵素; プロテアーゼ; ペプチド結合加水分解酵素; 金属プロテアーゼ / angiotensin-mediated drinking behavior / tryptophan transport / positive regulation of gap junction assembly / regulation of systemic arterial blood pressure by renin-angiotensin / regulation of vasoconstriction / regulation of cardiac conduction ...positive regulation of amino acid transport / アンジオテンシン変換酵素2 / positive regulation of L-proline import across plasma membrane / 加水分解酵素; プロテアーゼ; ペプチド結合加水分解酵素; 金属プロテアーゼ / angiotensin-mediated drinking behavior / tryptophan transport / positive regulation of gap junction assembly / regulation of systemic arterial blood pressure by renin-angiotensin / regulation of vasoconstriction / regulation of cardiac conduction / peptidyl-dipeptidase activity / angiotensin maturation / maternal process involved in female pregnancy / Metabolism of Angiotensinogen to Angiotensins / metallocarboxypeptidase activity / Attachment and Entry / carboxypeptidase activity / negative regulation of signaling receptor activity / positive regulation of cardiac muscle contraction / regulation of cytokine production / ウイルスのライフサイクル / blood vessel diameter maintenance / regulation of transmembrane transporter activity / brush border membrane / negative regulation of smooth muscle cell proliferation / 繊毛 / negative regulation of ERK1 and ERK2 cascade / endocytic vesicle membrane / metallopeptidase activity / positive regulation of reactive oxygen species metabolic process / virus receptor activity / regulation of cell population proliferation / regulation of inflammatory response / endopeptidase activity / Induction of Cell-Cell Fusion / Potential therapeutics for SARS / entry receptor-mediated virion attachment to host cell / receptor-mediated endocytosis of virus by host cell / Attachment and Entry / membrane fusion / receptor-mediated virion attachment to host cell / symbiont entry into host cell / 脂質ラフト / apical plasma membrane / 小胞体 / 細胞膜 / extracellular space / extracellular exosome / zinc ion binding / extracellular region / 生体膜 / identical protein binding / 細胞膜 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | Homo sapiens (ヒト) | ||||||
手法 | 溶液NMR / torsion angle dynamics | ||||||
データ登録者 | Santoro, A. / Buonocore, M. / Grimaldi, M. / D'Ursi, A.M. | ||||||
資金援助 | 1件
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引用 | ジャーナル: Heliyon / 年: 2022 タイトル: Structural analysis of a simplified model reproducing SARS-CoV-2 S RBD/ACE2 binding site. 著者: Buonocore, M. / Santoro, A. / Grimaldi, M. / Covelli, V. / Firoznezhad, M. / Rodriquez, M. / Santin, M. / D'Ursi, A.M. | ||||||
履歴 |
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-構造の表示
構造ビューア | 分子: MolmilJmol/JSmol |
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-ダウンロードとリンク
-ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | 7p55.cif.gz | 363.2 KB | 表示 | PDBx/mmCIF形式 |
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PDB形式 | pdb7p55.ent.gz | 274.6 KB | 表示 | PDB形式 |
PDBx/mmJSON形式 | 7p55.json.gz | ツリー表示 | PDBx/mmJSON形式 | |
その他 | その他のダウンロード |
-検証レポート
アーカイブディレクトリ | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/p5/7p55 ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/p5/7p55 | HTTPS FTP |
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-関連構造データ
関連構造データ | 7p5gC 7p5qC 7p5sC C: 同じ文献を引用 (文献) |
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類似構造データ | 類似検索 - 機能・相同性F&H 検索 |
その他のデータベース |
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-リンク
-集合体
登録構造単位 |
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1 |
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NMR アンサンブル |
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-要素
#1: タンパク質・ペプチド | 分子量: 2718.941 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 合成 / 由来: (合成) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: Q9BYF1 |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: 溶液NMR | ||||||||||||||||||||||||
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NMR実験 |
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-試料調製
詳細 | タイプ: solution 内容: 2.5 mM ACE(21-42), 40 % v/v H2O, 10 % v/v [U-100% 2H] D2O, 50 v/v Hexafluoroisopropanol, 50% hexafluoroisopropanol/40% H2O/10% D2O Label: ACE(21-42) / 溶媒系: 50% hexafluoroisopropanol/40% H2O/10% D2O | ||||||||||||||||||||
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試料 |
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試料状態 | イオン強度: 0 Not defined / Label: condition_1 / pH: 2.5 / PH err: 0.1 / 圧: 1 atm / 温度: 298 K |
-NMR測定
NMRスペクトロメーター | タイプ: Bruker AVANCE II / 製造業者: Bruker / モデル: AVANCE II / 磁場強度: 500 MHz |
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-解析
NMR software |
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精密化 | 手法: torsion angle dynamics / ソフトェア番号: 3 | |||||||||||||||
代表構造 | 選択基準: target function | |||||||||||||||
NMRアンサンブル | コンフォーマー選択の基準: target function / 計算したコンフォーマーの数: 50 / 登録したコンフォーマーの数: 50 |