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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 7faj | ||||||
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タイトル | CARM1 bound with compound 43 | ||||||
![]() | Histone-arginine methyltransferase CARM1 | ||||||
![]() | ![]() | ||||||
機能・相同性 | ![]() : / histone H3R17 methyltransferase activity / histone H3R2 methyltransferase activity / negative regulation of dendrite development / type I protein arginine methyltransferase / protein-arginine omega-N asymmetric methyltransferase activity / histone arginine N-methyltransferase activity / protein methyltransferase activity / regulation of intracellular estrogen receptor signaling pathway / protein-arginine N-methyltransferase activity ...: / histone H3R17 methyltransferase activity / histone H3R2 methyltransferase activity / negative regulation of dendrite development / type I protein arginine methyltransferase / protein-arginine omega-N asymmetric methyltransferase activity / histone arginine N-methyltransferase activity / protein methyltransferase activity / regulation of intracellular estrogen receptor signaling pathway / protein-arginine N-methyltransferase activity / replication fork reversal / positive regulation of epithelial cell apoptotic process / ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | ![]() ![]() | ||||||
手法 | ![]() ![]() ![]() | ||||||
![]() | Cao, D.Y. / Li, J. / Xiong, B. | ||||||
資金援助 | 1件
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![]() | ![]() タイトル: Structure-Based Discovery of Potent CARM1 Inhibitors for Solid Tumor and Cancer Immunology Therapy. 著者: Zhang, Z. / Guo, Z. / Xu, X. / Cao, D. / Yang, H. / Li, Y. / Shi, Q. / Du, Z. / Guo, X. / Wang, X. / Chen, D. / Zhang, Y. / Chen, L. / Zhou, K. / Li, J. / Geng, M. / Huang, X. / Xiong, B. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 336.9 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 221.3 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
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-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 | ![]()
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単位格子 |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 38228.598 Da / 分子数: 4 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() 参照: UniProt: Q86X55, type I protein arginine methyltransferase #2: 化合物 | ChemComp-XJ4 / #3: 水 | ChemComp-HOH / | ![]() 研究の焦点であるリガンドがあるか | Y | |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.55 Å3/Da / 溶媒含有率: 51.69 % |
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結晶化![]() | 温度: 298 K / 手法: 蒸気拡散法, ハンギングドロップ法 / 詳細: 22-27% PEG 3350, 0.15M sodium malate, pH 7.0 |
-データ収集
回折 | 平均測定温度: 100 K / Serial crystal experiment: N |
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放射光源 | 由来: ![]() ![]() ![]() |
検出器 | タイプ: ADSC QUANTUM 315r / 検出器: CCD / 日付: 2017年11月22日 |
放射 | プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray |
放射波長 | 波長![]() |
反射 | 解像度: 2.24507255823→75.3 Å / Num. obs: 74529 / % possible obs: 99.3 % / 冗長度: 13.6 % / Biso Wilson estimate: 36.9000070658 Å2 / Rmerge(I) obs: 0.074 / Net I/σ(I): 14.5 |
反射 シェル | 解像度: 2.25→2.3 Å / Rmerge(I) obs: 0.656 / Num. unique obs: 74529 / % possible all: 99.9 |
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解析
ソフトウェア |
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精密化 | 構造決定の手法![]() ![]() 開始モデル: 6IZQ 解像度: 2.24507255823→60.9248 Å / SU ML: 0.259406702227 / 交差検証法: NONE / σ(F): 1.3418418283 / 位相誤差: 26.095902159 立体化学のターゲット値: GeoStd + Monomer Library + CDL v1.2
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溶媒の処理 | 減衰半径: 0.9 Å / VDWプローブ半径: 1.11 Å / 溶媒モデル: FLAT BULK SOLVENT MODEL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
原子変位パラメータ | Biso mean: 39.7674088481 Å2 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 2.24507255823→60.9248 Å
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拘束条件 |
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LS精密化 シェル |
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