PDB-7ek9: Crystal structure of apo streptavidin at cryogenic temperature

IDまたはキーワード:

登録情報

データベース: PDB / ID: 7ek9

タイトル

Crystal structure of apo streptavidin at cryogenic temperature

要素

Streptavidin

ストレプトアビジン

キーワード

STRUCTURAL PROTEIN (タンパク質) /

Streptavidin (ストレプトアビジン) / cooperative allostery /

ambient temperature (室温) / cryogenic temperature

機能・相同性

機能・相同性情報

biotin binding / extracellular region
類似検索 - 分子機能

生物種

Streptomyces avidinii (バクテリア)

手法

X線回折 /

シンクロトロン /

フーリエ合成 / 解像度: 1.1 Å

データ登録者

DeMirci, H. / Ayan, E. / Destan, E. / Ertem, F.B.

資金援助

米国,

トルコ, 2件

引用

ジャーナル: To Be Published
タイトル: Crystal structure of apo streptavidin at cryogenic temperature
著者: DeMirci, H.

履歴

登録	2021年4月4日	登録サイト: PDBJ / 処理サイト: PDBJ
改定 1.0	2021年9月29日	Provider: repository / タイプ: Initial release
改定 1.1	2024年5月29日	Group: Data collection / カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond

構造ビューア	分子: MolmilJmol/JSmol

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ダウンロード

PDBx/mmCIF形式	7ek9.cif.gz	231.9 KB	表示	PDBx/mmCIF形式
PDB形式	pdb7ek9.ent.gz	189.6 KB	表示	PDB形式
PDBx/mmJSON形式	7ek9.json.gz		ツリー表示	PDBx/mmJSON形式
その他	その他のダウンロード

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検証レポート

アーカイブディレクトリ	https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/ek/7ek9 ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/ek/7ek9	HTTPS FTP

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関連構造データ

類似構造データ	1kl5-d 4cpi-2 4bx5-d 4cph-d 4y59-d 1lcv-1 6avk-1 5b5g-d 6lng-1 4y5d-d Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) 類似検索 - 機能・相同性F&H 検索類似検索 - 機能F&H 検索類似検索 - 相同性F&H 検索

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リンク

PDBのページ	PDBj / wwPDB / NCBI

登録構造単位

A: Streptavidin

B: Streptavidin

C: Streptavidin

D: Streptavidin

ヘテロ分子

52.4 kDa, 4 ポリマー
Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細)

1

登録構造と同一
登録者・ソフトウェアが定義した集合体
根拠: native gel electrophoresis

単位格子

Length a, b, c (Å)	46.373, 85.946, 58.188
Angle α, β, γ (deg.)	90.000, 98.730, 90.000
Int Tables number	4
Space group name H-M	P12₁1

#1: タンパク質	Streptavidin / ストレプトアビジン分子量: 12981.024 Da / 分子数: 4 / 由来タイプ: 組換発現由来: (組換発現) Streptomyces avidinii (バクテリア) 発現宿主: Streptomyces avidinii (バクテリア) / 参照: UniProt: P22629
#2: 化合物	ChemComp-MRD / (4R)-2-METHYLPENTANE-2,4-DIOL / (4R)-2-メチル-2,4-ペンタンジオ-ル / 2-Methyl-2,4-pentanediol 分子量: 118.174 Da / 分子数: 3 / 由来タイプ: 合成 / 式: C₆H₁₄O₂ / タイプ: SUBJECT OF INVESTIGATION / コメント: 沈殿剤*YM
#3: 化合物	ChemComp-MPD / (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL / (S)-2-メチル-2,4-ペンタンジオ-ル / 2-Methyl-2,4-pentanediol 分子量: 118.174 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 合成 / 式: C₆H₁₄O₂ / タイプ: SUBJECT OF INVESTIGATION / コメント: 沈殿剤*YM
#4: 水	ChemComp-HOH / water / 水分子量: 18.015 Da / 分子数: 617 / 由来タイプ: 天然 / 式: H₂O
研究の焦点であるリガンドがあるか	Y

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実験

実験	手法: X線回折 / 使用した結晶の数: 1

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試料調製

結晶	マシュー密度: 2.21 Å³/Da / 溶媒含有率: 44.28 %
結晶化	温度: 294 K / 手法: マイクロバッチ法 / pH: 6 / 詳細: Pact PremierTM 100 mM MMT buffer, PEG 1500

-
データ収集

回折

平均測定温度: 100 K / Serial crystal experiment: N

放射光源

由来:

シンクロトロン / サイト:

SSRL

/ ビームライン: BL12-2 / 波長: 0.979 Å

検出器

タイプ: DECTRIS PILATUS 6M / 検出器: PIXEL / 日付: 2017年5月2日

放射

プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray

放射波長

波長: 0.979 Å / 相対比: 1

反射

解像度: 1.1→18 Å / Num. obs: 147496 / % possible obs: 80.7 % / 冗長度: 2.1 % / R_merge(I) obs: 0.058 / R_pim(I) all: 0.045 / R_rim(I) all: 0.074 / Χ²: 1.119 / Net I/σ(I): 12.9 / Num. measured all: 316645

反射シェル

Diffraction-ID: 1

解像度 (Å)	冗長度 (%)	R_merge(I) obs	Num. unique obs	CC_1/2	R_pim(I) all	R_rim(I) all	Χ²	% possible all
1.1-1.14	1.7	0.354	8700	0.769	0.296	0.464	0.754	47.8
1.14-1.18	1.9	0.274	12508	0.855	0.219	0.352	0.897	68.6
1.18-1.24	2.2	0.253	15787	0.892	0.195	0.321	0.856	86.7
1.24-1.3	2.2	0.193	15710	0.934	0.15	0.245	0.99	86.3
1.3-1.39	2.2	0.142	15850	0.96	0.109	0.181	1.075	87
1.39-1.49	2.2	0.106	16081	0.975	0.082	0.135	1.225	87.9
1.49-1.64	2.2	0.081	15902	0.984	0.062	0.102	1.341	87.3
1.64-1.88	2.2	0.064	16208	0.988	0.05	0.082	1.35	88.6
1.88-2.37	2.2	0.053	16172	0.991	0.041	0.067	1.302	88.3
2.37-18	2.1	0.045	14578	0.993	0.036	0.058	1.026	78.9

-
解析

ソフトウェア

名称	バージョン	分類
HKL-2000		データスケーリング
PHENIX	1.19	精密化
PDB_EXTRACT	3.27	データ抽出
XDS		データ削減
PHENIX		位相決定

精密化

構造決定の手法:

フーリエ合成 / 解像度: 1.1→17.896 Å / SU ML: 0.09 / 交差検証法: THROUGHOUT / σ(F): 1.34 / 位相誤差: 18.05 / 立体化学のターゲット値: ML

	R_factor	反射数	%反射
R_free	0.1871	7384	5.02 %
R_work	0.1587	139839	-
obs	0.1602	147223	80.89 %

溶媒の処理

減衰半径: 0.9 Å / VDWプローブ半径: 1.11 Å / 溶媒モデル: FLAT BULK SOLVENT MODEL

原子変位パラメータ

B_iso max: 100.85 Å² / B_iso mean: 20.9826 Å² / B_iso min: 6.3 Å²

精密化ステップ

サイクル: final / 解像度: 1.1→17.896 Å

	タンパク質	核酸	リガンド	溶媒	全体
原子数	3580	0	32	624	4236
B_iso mean	-	-	29.03	34.26	-
残基数	-	-	-	-	482

LS精密化シェル

Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION / R_factor R_free error: 0

解像度 (Å)	R_factor R_free	Num. reflection R_free	R_factor R_work	Num. reflection R_work	% reflection obs (%)
1.1-1.1125	0.2419	141	0.2158	2405	42
1.1125-1.1256	0.2485	147	0.2171	2815	49
1.1256-1.1393	0.2336	163	0.2061	3119	54
1.1393-1.1537	0.2341	180	0.1979	3433	60
1.1537-1.1689	0.2237	215	0.1918	3981	69
1.1689-1.1849	0.2022	233	0.1884	4529	79
1.1849-1.2018	0.1967	290	0.1846	4897	86
1.2018-1.2198	0.2123	271	0.1886	5074	87
1.2198-1.2388	0.2183	261	0.1882	4965	87
1.2388-1.2591	0.1969	243	0.1882	5044	87
1.2591-1.2808	0.2023	244	0.1822	5037	87
1.2808-1.3041	0.2056	279	0.1785	4785	84
1.3041-1.3292	0.1971	252	0.1744	4891	84
1.3292-1.3563	0.183	267	0.1727	5075	88
1.3563-1.3858	0.1968	278	0.1687	5059	89
1.3858-1.418	0.1802	257	0.1637	5123	88
1.418-1.4535	0.1776	267	0.1623	5081	88
1.4535-1.4928	0.1693	248	0.1585	5022	87
1.4928-1.5367	0.1712	276	0.152	4747	83
1.5367-1.5862	0.1724	270	0.1522	5141	89
1.5862-1.6429	0.1717	256	0.1534	5189	90
1.6429-1.7086	0.1801	279	0.1463	5180	90
1.7086-1.7863	0.173	271	0.151	5158	89
1.7863-1.8804	0.1854	267	0.1503	4989	86
1.8804-1.9981	0.1728	263	0.1452	4995	86
1.9981-2.1521	0.1704	251	0.1407	5175	89
2.1521-2.3682	0.1614	270	0.1474	5157	90
2.3682-2.7099	0.1914	267	0.1581	4923	85
2.7099-3.4103	0.1912	248	0.1498	4429	76
3.4103-17.896	0.2023	230	0.1624	4421	75

精密化 TLS

手法: refined / Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION

ID	L11 (°²)	L12 (°²)	L13 (°²)	L22 (°²)	L23 (°²)	L33 (°²)	S11 (Å °)	S12 (Å °)	S13 (Å °)	S21 (Å °)	S22 (Å °)	S23 (Å °)	S31 (Å °)	S32 (Å °)	S33 (Å °)	T11 (Å²)	T12 (Å²)	T13 (Å²)	T22 (Å²)	T23 (Å²)	T33 (Å²)	Origin x (Å)	Origin y (Å)	Origin z (Å)
1	2.127	-0.5574	-1.2845	1.9021	-1.0305	3.0074	-0.0619	-0.0425	-0.2384	-0.2024	-0.0526	-0.0314	0.5609	-0.0611	0.0935	0.3261	-0.0191	0.038	0.0869	-0.0172	0.1565	64.1685	-22.8961	15.4706
2	1.7801	0.3732	-0.1339	2.5343	0.7068	8.0074	-0.0231	0.0621	0.084	-0.4222	-0.1482	-0.1778	0.2393	0.2347	0.1499	0.2881	0.034	0.0638	0.087	-0.0018	0.1543	69.7127	-14.4604	11.6796
3	4.0601	4.3276	-2.586	5.1088	-3.7728	3.7657	0.1184	-0.2567	-0.155	0.1626	0.0497	0.4295	0.1964	-0.0255	-0.0728	0.2859	-0.0292	0.0375	0.0927	0.0244	0.2192	59.8791	-22.345	23.7169
4	4.8968	-0.8524	-1.4781	1.7235	-0.9323	2.1221	-0.033	-0.1406	-0.3346	-0.1222	0.0051	-0.0146	0.3051	0.0038	0.0397	0.1988	-0.0202	0.0001	0.0907	-0.0052	0.1198	62.7621	-18.4175	24.6598
5	5.4062	5.4175	-0.1355	9.3273	-1.964	7.3614	0.0138	-0.0472	-0.1098	-0.3871	-0.1739	-0.5559	-0.2457	0.4278	0.0982	0.2245	0.0289	0.0879	0.1475	0.0294	0.2229	75.061	-9.8583	18.1635
6	2.2206	-0.099	0.9171	6.2935	0.3744	7.9256	-0.0341	0.2852	-0.8183	-0.2668	-0.0308	-1.2041	0.4479	0.503	-0.0208	0.1774	0.0329	0.0566	0.137	-0.0115	0.2851	75.3709	-14.5264	24.077
7	8.2344	1.8047	0.1862	1.378	0.1207	0.3694	-0.1431	-0.1333	-0.0318	-0.0744	0.0645	-0.0444	0.237	-0.0793	0.0817	0.1277	-0.0209	-0.0069	0.087	0.0181	0.0993	60.3884	-15.2953	27.0908
8	2.6846	0.7762	0.8446	0.7139	0.624	0.5577	-0.084	0.1411	-0.5206	-0.1791	0.0949	0.1741	0.2028	-0.1777	-0.0478	0.2904	-0.1337	-0.0373	0.1567	0.0132	0.2242	48.0894	-21.0709	20.5199
9	2.1922	1.7398	2.1504	1.5382	1.615	2.1625	-0.0939	0.0639	-0.074	-0.1594	-0.2823	0.7648	0.2584	-0.4218	0.2942	0.3851	-0.329	-0.1316	0.0845	-0.0935	0.2285	46.2746	-20.0942	13.017
10	5.9025	-1.4775	-1.6482	0.6625	0.4676	0.5577	-0.1676	0.0471	-0.2033	-0.2144	0.0857	0.0523	0.2727	-0.111	0.0306	0.1299	-0.0348	-0.0157	0.0554	0.0177	0.0757	60.2905	-12.5046	21.8093
11	3.0639	-0.4	4.645	5.5783	2.649	9.0206	-0.1023	-0.1064	-0.1419	0.1586	0.1169	-0.3022	0.0975	0.3392	-0.0463	0.0702	-0.0087	-0.0057	0.1089	0.016	0.1248	72.9007	-9.377	28.0955
12	2.3464	1.6421	1.1899	1.9874	-1.0986	5.5395	-0.1209	0.0298	0.0646	-0.1107	0.0566	-0.9142	0.2683	0.573	-0.0237	0.1093	0.006	0.0101	0.1779	-0.0038	0.229	77.3864	-7.4848	27.6808
13	3.478	3.65	3.0649	4.338	3.6332	3.8923	-0.0159	-0.0456	-0.1085	-0.0498	0.0473	-0.0797	0.1527	-0.0664	-0.0186	0.1248	-0.0215	-0.0147	0.0701	0.0087	0.0853	63.2087	-6.9725	20.8247
14	2.2098	-0.0625	0.1767	0.5909	-0.2828	0.461	-0.0651	0.2932	-0.6431	-0.441	0.1736	-0.0513	0.2619	-0.0253	-0.2266	0.412	-0.2348	-0.0893	-0.004	-0.0894	0.1979	54.1468	-20.5145	10.7219
15	1.2413	-0.4246	-0.0285	2.1891	-0.434	0.0968	-0.0399	0.3242	-0.3911	-0.3555	0.0185	-0.0226	0.2694	-0.0493	-0.1391	0.3725	-0.0912	-0.03	0.1088	-0.0584	0.172	58.5994	-17.6391	9.6107
16	5.1392	2.2418	-0.6024	4.3672	5.2746	9.4204	-0.0742	0.0015	0.0944	-0.0889	0.0195	0.0255	-0.0913	0.0323	0.0687	0.111	-0.0047	-0.0321	0.0368	0.015	0.0878	63.3068	-2.4866	18.5583
17	5.5701	0.9772	3.5516	5.8024	-3.9826	6.033	-0.0526	-0.5358	0.6343	0.5504	-0.1122	0.3048	-0.6831	-0.1568	0.1627	0.2485	-0.0578	-0.0222	0.1409	-0.0529	0.1841	66.586	11.1914	25.9365
18	1.0982	0.8487	-0.5489	6.6806	1.0968	0.6643	-0.0645	-0.0519	0.3014	-0.1247	-0.0022	-0.1535	-0.4807	0.1642	0.0233	0.1613	-0.0295	-0.0227	0.073	-0.0033	0.1277	64.7486	5.813	17.8553
19	1.6163	-1.787	-0.8914	3.6279	2.2896	1.518	0.0037	0.131	-0.0644	-0.6702	-0.06	0.0513	0.2341	-0.0749	0.0313	0.2559	-0.0368	0.0098	0.0677	-0.0104	0.1099	62.6666	-11.2517	10.6155
20	1.7366	-1.3093	0.0554	7.935	4.0345	2.5049	0.1028	0.2558	-0.0452	-0.6259	0.064	-0.662	-0.2257	0.1147	-0.1022	0.6362	0.1099	0.094	0.1532	0.0043	0.2484	68.4545	-21.5253	8.4648
21	3.0369	-2.6804	4.5424	3.175	-2.7588	8.7267	-0.0734	-0.8274	0.2907	0.2721	0.0425	-0.317	-0.4763	0.5819	0.0149	0.1581	-0.0053	-0.003	0.2046	-0.0466	0.1163	59.1111	-1.6594	40.0848
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73	2.8949	3.1656	0.4201	5.2513	-2.0807	3.6659	-0.001	-0.6306	0.8836	0.8471	0.0717	0.8772	-0.9038	-0.6102	-0.341	0.3225	0.1827	0.059	0.4122	-0.1605	0.3531	41.6623	18.7008	17.3104
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76	5.6828	-6.0188	-1.8208	8.3967	1.3591	7.8917	-0.0416	-0.0105	-0.3255	0.1596	-0.1915	-0.3523	0.4306	0.6039	0.2073	0.1159	0.0221	0.0133	0.1265	0.037	0.1647	70.1392	-0.9824	10.4162
77	5.0576	-4.5863	-5.4162	4.2942	4.7891	7.2996	-0.1952	-0.2948	0.3099	0.2232	0.1473	-0.0944	-0.175	-0.0189	0.0854	0.0971	0.0177	-0.0168	0.0937	-0.0054	0.0911	58.2118	8.04	16.4476
78	5.8648	0.0372	-1.2835	6.8498	2.2647	6.4369	-0.069	-0.3065	0.6041	0.555	0.0666	0.1581	-0.5857	-0.0797	0.032	0.232	0.0804	-0.0052	0.1359	-0.0404	0.1609	50.9745	21.6164	18.2438

精密化 TLSグループ

ID	Refine-ID	Refine TLS-ID	Selection details	Auth asym-ID	Auth seq-ID
1	X-RAY DIFFRACTION	1	(chain A and resid 16:22)	A	16 - 22
2	X-RAY DIFFRACTION	2	(chain A and resid 23:28)	A	23 - 28
3	X-RAY DIFFRACTION	3	(chain A and resid 29:36)	A	29 - 36
4	X-RAY DIFFRACTION	4	(chain A and resid 37:43)	A	37 - 43
5	X-RAY DIFFRACTION	5	(chain A and resid 44:50)	A	44 - 50
6	X-RAY DIFFRACTION	6	(chain A and resid 51:54)	A	51 - 54
7	X-RAY DIFFRACTION	7	(chain A and resid 55:59)	A	55 - 59
8	X-RAY DIFFRACTION	8	(chain A and resid 60:65)	A	60 - 65
9	X-RAY DIFFRACTION	9	(chain A and resid 66:72)	A	66 - 72
10	X-RAY DIFFRACTION	10	(chain A and resid 73:77)	A	73 - 77
11	X-RAY DIFFRACTION	11	(chain A and resid 78:82)	A	78 - 82
12	X-RAY DIFFRACTION	12	(chain A and resid 83:87)	A	83 - 87
13	X-RAY DIFFRACTION	13	(chain A and resid 88:93)	A	88 - 93
14	X-RAY DIFFRACTION	14	(chain A and resid 94:100)	A	94 - 100
15	X-RAY DIFFRACTION	15	(chain A and resid 101:106)	A	101 - 106
16	X-RAY DIFFRACTION	16	(chain A and resid 107:113)	A	107 - 113
17	X-RAY DIFFRACTION	17	(chain A and resid 114:119)	A	114 - 119
18	X-RAY DIFFRACTION	18	(chain A and resid 120:125)	A	120 - 125
19	X-RAY DIFFRACTION	19	(chain A and resid 126:130)	A	126 - 130
20	X-RAY DIFFRACTION	20	(chain A and resid 131:136)	A	131 - 136
21	X-RAY DIFFRACTION	21	(chain B and resid 14:20)	B	14 - 20
22	X-RAY DIFFRACTION	22	(chain B and resid 21:25)	B	21 - 25
23	X-RAY DIFFRACTION	23	(chain B and resid 26:31)	B	26 - 31
24	X-RAY DIFFRACTION	24	(chain B and resid 32:36)	B	32 - 36
25	X-RAY DIFFRACTION	25	(chain B and resid 37:47)	B	37 - 47
26	X-RAY DIFFRACTION	26	(chain B and resid 48:53)	B	48 - 53
27	X-RAY DIFFRACTION	27	(chain B and resid 54:59)	B	54 - 59
28	X-RAY DIFFRACTION	28	(chain B and resid 60:65)	B	60 - 65
29	X-RAY DIFFRACTION	29	(chain B and resid 66:72)	B	66 - 72
30	X-RAY DIFFRACTION	30	(chain B and resid 73:77)	B	73 - 77
31	X-RAY DIFFRACTION	31	(chain B and resid 78:83)	B	78 - 83
32	X-RAY DIFFRACTION	32	(chain B and resid 84:88)	B	84 - 88
33	X-RAY DIFFRACTION	33	(chain B and resid 89:94)	B	89 - 94
34	X-RAY DIFFRACTION	34	(chain B and resid 95:100)	B	95 - 100
35	X-RAY DIFFRACTION	35	(chain B and resid 101:105)	B	101 - 105
36	X-RAY DIFFRACTION	36	(chain B and resid 106:110)	B	106 - 110
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38	X-RAY DIFFRACTION	38	(chain B and resid 117:125)	B	117 - 125
39	X-RAY DIFFRACTION	39	(chain B and resid 126:129)	B	126 - 129
40	X-RAY DIFFRACTION	40	(chain B and resid 130:134)	B	130 - 134
41	X-RAY DIFFRACTION	41	(chain C and resid 16:23)	C	16 - 23
42	X-RAY DIFFRACTION	42	(chain C and resid 24:29)	C	24 - 29
43	X-RAY DIFFRACTION	43	(chain C and resid 30:36)	C	30 - 36
44	X-RAY DIFFRACTION	44	(chain C and resid 37:43)	C	37 - 43
45	X-RAY DIFFRACTION	45	(chain C and resid 44:50)	C	44 - 50
46	X-RAY DIFFRACTION	46	(chain C and resid 51:55)	C	51 - 55
47	X-RAY DIFFRACTION	47	(chain C and resid 56:59)	C	56 - 59
48	X-RAY DIFFRACTION	48	(chain C and resid 60:65)	C	60 - 65
49	X-RAY DIFFRACTION	49	(chain C and resid 66:72)	C	66 - 72
50	X-RAY DIFFRACTION	50	(chain C and resid 73:79)	C	73 - 79
51	X-RAY DIFFRACTION	51	(chain C and resid 80:84)	C	80 - 84
52	X-RAY DIFFRACTION	52	(chain C and resid 85:90)	C	85 - 90
53	X-RAY DIFFRACTION	53	(chain C and resid 91:95)	C	91 - 95
54	X-RAY DIFFRACTION	54	(chain C and resid 96:101)	C	96 - 101
55	X-RAY DIFFRACTION	55	(chain C and resid 102:108)	C	102 - 108
56	X-RAY DIFFRACTION	56	(chain C and resid 109:115)	C	109 - 115
57	X-RAY DIFFRACTION	57	(chain C and resid 116:120)	C	116 - 120
58	X-RAY DIFFRACTION	58	(chain C and resid 121:126)	C	121 - 126
59	X-RAY DIFFRACTION	59	(chain C and resid 127:130)	C	127 - 130
60	X-RAY DIFFRACTION	60	(chain C and resid 131:135)	C	131 - 135
61	X-RAY DIFFRACTION	61	(chain D and resid 16:21)	D	16 - 21
62	X-RAY DIFFRACTION	62	(chain D and resid 22:26)	D	22 - 26
63	X-RAY DIFFRACTION	63	(chain D and resid 27:34)	D	27 - 34
64	X-RAY DIFFRACTION	64	(chain D and resid 35:43)	D	35 - 43
65	X-RAY DIFFRACTION	65	(chain D and resid 44:51)	D	44 - 51
66	X-RAY DIFFRACTION	66	(chain D and resid 52:57)	D	52 - 57
67	X-RAY DIFFRACTION	67	(chain D and resid 58:65)	D	58 - 65
68	X-RAY DIFFRACTION	68	(chain D and resid 66:72)	D	66 - 72
69	X-RAY DIFFRACTION	69	(chain D and resid 73:77)	D	73 - 77
70	X-RAY DIFFRACTION	70	(chain D and resid 78:82)	D	78 - 82
71	X-RAY DIFFRACTION	71	(chain D and resid 83:89)	D	83 - 89
72	X-RAY DIFFRACTION	72	(chain D and resid 90:96)	D	90 - 96
73	X-RAY DIFFRACTION	73	(chain D and resid 97:103)	D	97 - 103
74	X-RAY DIFFRACTION	74	(chain D and resid 104:109)	D	104 - 109
75	X-RAY DIFFRACTION	75	(chain D and resid 110:117)	D	110 - 117
76	X-RAY DIFFRACTION	76	(chain D and resid 118:123)	D	118 - 123
77	X-RAY DIFFRACTION	77	(chain D and resid 124:128)	D	124 - 128
78	X-RAY DIFFRACTION	78	(chain D and resid 129:135)	D	129 - 135

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

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これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

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新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

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万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
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