[English] 日本語
Yorodumi- PDB-7ddw: Crystal structure of a mutant Staphylococcus equorum manganese su... -
+Open data
-Basic information
Entry | Database: PDB / ID: 7ddw | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
Title | Crystal structure of a mutant Staphylococcus equorum manganese superoxide dismutase S126C | ||||||
Components | Superoxide dismutase | ||||||
Keywords | OXIDOREDUCTASE / superoxide dismutase / Staphylococcus equorum / disulfide bond | ||||||
Function / homology | Function and homology information superoxide dismutase / superoxide dismutase activity / metal ion binding Similarity search - Function | ||||||
Biological species | Staphylococcus equorum (bacteria) | ||||||
Method | X-RAY DIFFRACTION / SYNCHROTRON / MOLECULAR REPLACEMENT / Resolution: 1.88 Å | ||||||
Authors | Retnoningrum, D.S. / Yoshida, H. / Razani, M.D. / Meidianto, V.F. / Hartanto, A. / Artarini, A. / Ismaya, W.T. | ||||||
Citation | Journal: J.Struct.Biol. / Year: 2021 Title: The role of S126 in the Staphylococcus equorum MnSOD activity and stability. Authors: Retnoningrum, D.S. / Yoshida, H. / Razani, M.D. / Muliadi, R. / Meidianto, V.F. / Artarini, A. / Ismaya, W.T. #1: Journal: Acta Crystallogr F Struct Biol Commun / Year: 2018 Title: The first crystal structure of manganese superoxide dismutase from the genus Staphylococcus. Authors: Retnoningrum, D.S. / Yoshida, H. / Arumsari, S. / Kamitori, S. / Ismaya, W.T. | ||||||
History |
|
-Structure visualization
Structure viewer | Molecule: MolmilJmol/JSmol |
---|
-Downloads & links
-Download
PDBx/mmCIF format | 7ddw.cif.gz | 527.4 KB | Display | PDBx/mmCIF format |
---|---|---|---|---|
PDB format | pdb7ddw.ent.gz | 431.4 KB | Display | PDB format |
PDBx/mmJSON format | 7ddw.json.gz | Tree view | PDBx/mmJSON format | |
Others | Other downloads |
-Validation report
Arichive directory | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/dd/7ddw ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/dd/7ddw | HTTPS FTP |
---|
-Related structure data
Related structure data | 5x2jS S: Starting model for refinement |
---|---|
Similar structure data |
-Links
-Assembly
Deposited unit |
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
1 |
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
2 |
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3 |
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Unit cell |
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Noncrystallographic symmetry (NCS) | NCS domain:
NCS domain segments: Component-ID: 1 / Beg auth comp-ID: ALA / Beg label comp-ID: ALA / Refine code: 1
|