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-基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 6z5n | ||||||
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タイトル | DnaJB1 JD-GF | ||||||
要素 | DnaJ homolog subfamily B member 1 | ||||||
キーワード | CHAPERONE (シャペロン) / Molecular Chaperone (シャペロン) / J-domain protein / Hsp40 (Hsp40) / DnaJ (Hsp40) | ||||||
機能・相同性 | 機能・相同性情報 先体 / negative regulation of inclusion body assembly / positive regulation of ATP-dependent activity / transcription regulator inhibitor activity / ATPase activator activity / chaperone cofactor-dependent protein refolding / HSF1-dependent transactivation / response to unfolded protein / Regulation of HSF1-mediated heat shock response / Attenuation phase ...先体 / negative regulation of inclusion body assembly / positive regulation of ATP-dependent activity / transcription regulator inhibitor activity / ATPase activator activity / chaperone cofactor-dependent protein refolding / HSF1-dependent transactivation / response to unfolded protein / Regulation of HSF1-mediated heat shock response / Attenuation phase / regulation of cellular response to heat / protein folding chaperone / forebrain development / Hsp70 protein binding / HSP90 chaperone cycle for steroid hormone receptors (SHR) in the presence of ligand / MAPK6/MAPK4 signaling / transcription corepressor activity / unfolded protein binding / cellular response to heat / ATPase binding / protein-folding chaperone binding / 樹状突起スパイン / postsynaptic density / cadherin binding / neuronal cell body / glutamatergic synapse / 核小体 / negative regulation of transcription by RNA polymerase II / extracellular exosome / 核質 / 細胞核 / 細胞質基質 / 細胞質 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | Homo sapiens (ヒト) | ||||||
手法 | 溶液NMR / na | ||||||
データ登録者 | Avraham-Abayev, M. / London, N. / Rosenzweig, R. | ||||||
資金援助 | European Union, 1件
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引用 | ジャーナル: Nature / 年: 2020 タイトル: HSP40 proteins use class-specific regulation to drive HSP70 functional diversity. 著者: Faust, O. / Abayev-Avraham, M. / Wentink, A.S. / Maurer, M. / Nillegoda, N.B. / London, N. / Bukau, B. / Rosenzweig, R. | ||||||
履歴 |
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-構造の表示
構造ビューア | 分子: MolmilJmol/JSmol |
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-ダウンロードとリンク
-ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | 6z5n.cif.gz | 328.3 KB | 表示 | PDBx/mmCIF形式 |
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PDB形式 | pdb6z5n.ent.gz | 274.7 KB | 表示 | PDB形式 |
PDBx/mmJSON形式 | 6z5n.json.gz | ツリー表示 | PDBx/mmJSON形式 | |
その他 | その他のダウンロード |
-検証レポート
アーカイブディレクトリ | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/z5/6z5n ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/z5/6z5n | HTTPS FTP |
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-関連構造データ
類似構造データ | |
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その他のデータベース |
-リンク
-集合体
登録構造単位 |
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1 |
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NMR アンサンブル |
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-要素
#1: タンパク質 | 分子量: 12223.381 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Homo sapiens (ヒト) / 遺伝子: DNAJB1, DNAJ1, HDJ1, HSPF1 / 発現宿主: Escherichia coli (大腸菌) / 参照: UniProt: P25685 |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: 溶液NMR | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NMR実験 |
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-試料調製
詳細 |
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試料 |
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試料状態 |
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-NMR測定
NMRスペクトロメーター |
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-解析
NMR software |
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精密化 | 手法: na / ソフトェア番号: 1 | |||||||||||||||
代表構造 | 選択基準: lowest energy | |||||||||||||||
NMRアンサンブル | コンフォーマー選択の基準: structures with the lowest energy 計算したコンフォーマーの数: 25000 / 登録したコンフォーマーの数: 10 |