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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 6w84 | ||||||
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タイトル | K2P2.1 (TREK-1), 200 mM K+ | ||||||
![]() | Potassium channel subfamily K member 2 | ||||||
![]() | METAL TRANSPORT / ![]() ![]() | ||||||
機能・相同性 | ![]() TWIK related potassium channel (TREK) / Phase 4 - resting membrane potential / positive regulation of cellular response to hypoxia / cardiac ventricle development / negative regulation of cardiac muscle cell proliferation / stabilization of membrane potential / potassium ion leak channel activity / astrocyte projection / potassium channel inhibitor activity / negative regulation of DNA biosynthetic process ...TWIK related potassium channel (TREK) / Phase 4 - resting membrane potential / positive regulation of cellular response to hypoxia / cardiac ventricle development / negative regulation of cardiac muscle cell proliferation / stabilization of membrane potential / potassium ion leak channel activity / astrocyte projection / potassium channel inhibitor activity / negative regulation of DNA biosynthetic process / outward rectifier potassium channel activity / cochlea development / ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | ![]() ![]() ![]() | ||||||
手法 | ![]() ![]() ![]() | ||||||
![]() | Lolicato, M. / Minor, D.L. | ||||||
資金援助 | ![]()
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![]() | ![]() タイトル: K 2P channel C-type gating involves asymmetric selectivity filter order-disorder transitions. 著者: Lolicato, M. / Natale, A.M. / Abderemane-Ali, F. / Crottes, D. / Capponi, S. / Duman, R. / Wagner, A. / Rosenberg, J.M. / Grabe, M. / Minor Jr., D.L. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 213.7 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 168.1 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
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-関連構造データ
関連構造データ | ![]() 6w7bC ![]() 6w7cC ![]() 6w7dC ![]() 6w7eC ![]() 6w82C ![]() 6w83C ![]() 6w85C ![]() 6w86C ![]() 6w87C ![]() 6w88C ![]() 6w8aC ![]() 6w8cC ![]() 6w8fC ![]() 6cq6S C: 同じ文献を引用 ( S: 精密化の開始モデル |
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類似構造データ |
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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単位格子 |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 34303.938 Da / 分子数: 2 変異: K84R, Q85E, T86K, I88L, A89R, Q90A, A92P, N95S, S96D, T97Q, N119A, S300A, E306A 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() #2: 化合物 | #3: 化合物 | ChemComp-D12 / ![]() #4: 化合物 | ChemComp-K / #5: 化合物 | ChemComp-OCT / | ![]() 研究の焦点であるリガンドがあるか | N | |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 4.06 Å3/Da / 溶媒含有率: 69.7 % |
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結晶化![]() | 温度: 277 K / 手法: 蒸気拡散法, ハンギングドロップ法 / pH: 8 詳細: 22-25% PEG400, 100mM HEPES pH=8.0, 1mM CdCl2, 200mM KCl |
-データ収集
回折 |
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放射光源 |
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検出器 |
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放射 |
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放射波長 |
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反射 | 解像度: 3.7→47.83 Å / Num. obs: 12454 / % possible obs: 99.9 % / 冗長度: 10.7 % / Rmerge(I) obs: 0.131 / Net I/σ(I): 7.1 | ||||||||||||||||||
反射 シェル | 解像度: 3.7→4.05 Å / Num. unique obs: 2880 / CC1/2: 0.12 |
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解析
ソフトウェア |
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精密化 | 構造決定の手法![]() ![]() 開始モデル: 6cq6 解像度: 3.7→14.99 Å / Cor.coef. Fo:Fc: 0.937 / Cor.coef. Fo:Fc free: 0.89 / 交差検証法: THROUGHOUT / SU Rfree Blow DPI: 0.714
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原子変位パラメータ | Biso mean: 253.28 Å2
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Refine analyze | Luzzati coordinate error obs: 0.84 Å | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 3.7→14.99 Å
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拘束条件 |
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LS精密化 シェル | 解像度: 3.7→3.75 Å
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精密化 TLS | 手法: refined / Origin x: 1.611 Å / Origin y: -24.1846 Å / Origin z: -27.5526 Å
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精密化 TLSグループ |
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