登録情報 | データベース: PDB / ID: 6u3u |
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タイトル | Crystal Structure of Shiga Toxin 2K |
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要素 | (Shiga toxin 2K subunit ...) x 2 |
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キーワード | TOXIN (毒素) / Shiga Toxin (ベロ毒素) / AB5 Toxin (AB5毒素) / Toxoid |
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機能・相同性 | 機能・相同性情報
hemolysis by symbiont of host erythrocytes / RRNA-N-グリコシラーゼ / rRNA N-glycosylase activity / : / toxin activity / negative regulation of translation / extracellular region類似検索 - 分子機能 OB fold (Dihydrolipoamide Acetyltransferase, E2P) - #70 / Shiga-like toxin, subunit A / Shiga-like toxin, beta subunit / Shiga-like toxin beta subunit / Ricin (A Subunit), domain 2 / Ricin (A Subunit), domain 2 / Ricin (A subunit); domain 1 / Ricin (A subunit), domain 1 / エンテロトキシン / Ribosome-inactivating protein conserved site ...OB fold (Dihydrolipoamide Acetyltransferase, E2P) - #70 / Shiga-like toxin, subunit A / Shiga-like toxin, beta subunit / Shiga-like toxin beta subunit / Ricin (A Subunit), domain 2 / Ricin (A Subunit), domain 2 / Ricin (A subunit); domain 1 / Ricin (A subunit), domain 1 / エンテロトキシン / Ribosome-inactivating protein conserved site / Shiga/ricin ribosomal inactivating toxins active site signature. / Ribosome-inactivating protein / Ribosome-inactivating protein, subdomain 1 / Ribosome-inactivating protein, subdomain 2 / Ribosome-inactivating protein superfamily / Ribosome inactivating protein / Few Secondary Structures / イレギュラー / OB fold (Dihydrolipoamide Acetyltransferase, E2P) / Βバレル / 3-Layer(aba) Sandwich / Mainly Beta / Alpha Beta類似検索 - ドメイン・相同性 |
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生物種 | ![](img/tx_bacteria.gif) ![](data/taxo/icon/Escherichia_coli_S.png) Escherichia coli (大腸菌) |
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手法 | X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度: 2.287 Å |
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データ登録者 | Zhang, Y.Z. / He, X.H. |
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資金援助 | 米国, 1件 組織 | 認可番号 | 国 |
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United States Department of Agriculture (USDA) | | 米国 |
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引用 | ジャーナル: Microorganisms / 年: 2019 タイトル: Structural and Functional Characterization of Stx2k, a New Subtype of Shiga Toxin 2. 著者: Hughes, A.C. / Zhang, Y. / Bai, X. / Xiong, Y. / Wang, Y. / Yang, X. / Xu, Q. / He, X. |
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履歴 | 登録 | 2019年8月22日 | 登録サイト: RCSB / 処理サイト: RCSB |
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改定 1.0 | 2020年7月1日 | Provider: repository / タイプ: Initial release |
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改定 1.1 | 2023年10月11日 | Group: Data collection / Database references ...Data collection / Database references / Derived calculations / Refinement description カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / citation / database_2 / pdbx_initial_refinement_model / pdbx_struct_conn_angle / struct_conn Item: _citation.country / _database_2.pdbx_DOI ..._citation.country / _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_atom_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_symmetry / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_atom_id / _pdbx_struct_conn_angle.value / _struct_conn.pdbx_dist_value / _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr1_label_asym_id / _struct_conn.ptnr1_label_atom_id / _struct_conn.ptnr2_symmetry |
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