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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 6lto | ||||||
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タイトル | cryo-EM structure of full length human Pannexin1 | ||||||
![]() | Pannexin-1![]() | ||||||
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機能・相同性 | ![]() ATP transmembrane transporter activity / ATP transport / Electric Transmission Across Gap Junctions / ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | ![]() ![]() | ||||||
手法 | ![]() ![]() ![]() | ||||||
![]() | Mou, L.Q. / Ke, M. / Xiao, Q.J. / Wu, J.P. / Deng, D. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: Structural basis for gating mechanism of Pannexin 1 channel. 著者: Luqiu Mou / Meng Ke / Mengxiao Song / Yuanyue Shan / Qingjie Xiao / Qingting Liu / Jialu Li / Ke Sun / Lei Pu / Li Guo / Jia Geng / Jianping Wu / Dong Deng / ![]() | ||||||
履歴 |
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構造の表示
ムービー |
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構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 379.6 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 319 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
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-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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要素
#1: タンパク質 | ![]() 分子量: 49378.277 Da / 分子数: 7 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) ![]() ![]() 発現宿主: Insect cell expression vector pTIE1 (その他) 参照: UniProt: Q96RD7 |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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EM実験 | 試料の集合状態: PARTICLE / 3次元再構成法: ![]() |
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試料調製
構成要素 | 名称: full length human Pannexin1 / タイプ: ORGANELLE OR CELLULAR COMPONENT / Entity ID: all / 由来: RECOMBINANT |
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由来(天然) | 生物種: ![]() ![]() |
由来(組換発現) | 生物種: Insect cell expression vector pTIE1 (その他) |
緩衝液 | pH: 8 |
試料 | 濃度: 5 mg/ml / 包埋: NO / シャドウイング: NO / 染色![]() ![]() |
試料支持 | グリッドの材料: COPPER / グリッドのサイズ: 300 divisions/in. / グリッドのタイプ: Quantifoil R1.2/1.3 |
急速凍結![]() | 装置: FEI VITROBOT MARK IV / 凍結剤: ETHANE / 湿度: 100 % / 凍結前の試料温度: 281 K / 詳細: blot for 3.5 seconds before plunging |
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電子顕微鏡撮影
実験機器 | ![]() モデル: Titan Krios / 画像提供: FEI Company |
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顕微鏡 | モデル: FEI TITAN KRIOS |
電子銃 | 電子線源![]() ![]() |
電子レンズ | モード: BRIGHT FIELD![]() ![]() |
試料ホルダ | 凍結剤: NITROGEN 試料ホルダーモデル: FEI TITAN KRIOS AUTOGRID HOLDER |
撮影 | 電子線照射量: 50 e/Å2 / フィルム・検出器のモデル: GATAN K3 (6k x 4k) |
電子光学装置 | エネルギーフィルター名称![]() |
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解析
ソフトウェア | 名称: PHENIX / バージョン: 1.14_3260: / 分類: 精密化 | ||||||||||||||||||||||||
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EMソフトウェア |
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CTF補正![]() | タイプ: PHASE FLIPPING AND AMPLITUDE CORRECTION | ||||||||||||||||||||||||
対称性 | 点対称性![]() ![]() | ||||||||||||||||||||||||
3次元再構成![]() | 解像度: 3.1 Å / 解像度の算出法: FSC 0.143 CUT-OFF / 粒子像の数: 251945 / 対称性のタイプ: POINT | ||||||||||||||||||||||||
拘束条件 |
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