+Open data
-Basic information
Entry | Database: PDB / ID: 60000000 | |||||||||
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Title | Crystal structure of Canton G6PD in complex with structural NADP | |||||||||
Components | Glucose-6-phosphate 1-dehydrogenase | |||||||||
Keywords | OXIDOREDUCTASE / G6PD / NADP | |||||||||
Function / homology | Function and homology information negative regulation of protein glutathionylation / pentose biosynthetic process / ribose phosphate biosynthetic process / glucose-6-phosphate dehydrogenase (NADP+) / positive regulation of calcium ion transmembrane transport via high voltage-gated calcium channel / glucose-6-phosphate dehydrogenase activity / response to iron(III) ion / pentose-phosphate shunt, oxidative branch / Pentose phosphate pathway / NADPH regeneration ...negative regulation of protein glutathionylation / pentose biosynthetic process / ribose phosphate biosynthetic process / glucose-6-phosphate dehydrogenase (NADP+) / positive regulation of calcium ion transmembrane transport via high voltage-gated calcium channel / glucose-6-phosphate dehydrogenase activity / response to iron(III) ion / pentose-phosphate shunt, oxidative branch / Pentose phosphate pathway / NADPH regeneration / negative regulation of cell growth involved in cardiac muscle cell development / glucose 6-phosphate metabolic process / NADP metabolic process / pentose-phosphate shunt / D-glucose binding / NFE2L2 regulates pentose phosphate pathway genes / response to food / cholesterol biosynthetic process / erythrocyte maturation / centriolar satellite / negative regulation of reactive oxygen species metabolic process / regulation of neuron apoptotic process / glutathione metabolic process / substantia nigra development / TP53 Regulates Metabolic Genes / lipid metabolic process / response to organic cyclic compound / cytoplasmic side of plasma membrane / glucose metabolic process / NADP binding / cellular response to oxidative stress / response to ethanol / intracellular membrane-bounded organelle / protein homodimerization activity / extracellular exosome / membrane / identical protein binding / cytosol / cytoplasm Similarity search - Function | |||||||||
Biological species | Homo sapiens (human) | |||||||||
Method | X-RAY DIFFRACTION / SYNCHROTRON / MOLECULAR REPLACEMENT / Resolution: 2.6 Å | |||||||||
Authors | Rahighi, S. / Mochly-Rosen, D. / Wakatsuki, S. | |||||||||
Citation | Journal: Nat Commun / Year: 2018 Title: Correcting glucose-6-phosphate dehydrogenase deficiency with a small-molecule activator. Authors: Hwang, S. / Mruk, K. / Rahighi, S. / Raub, A.G. / Chen, C.H. / Dorn, L.E. / Horikoshi, N. / Wakatsuki, S. / Chen, J.K. / Mochly-Rosen, D. | |||||||||
History |
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-Structure visualization
Structure viewer | Molecule: MolmilJmol/JSmol |
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-Downloads & links
-Download
PDBx/mmCIF format | 6e07.cif.gz | 1.5 MB | Display | PDBx/mmCIF format |
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PDB format | pdb6e07.ent.gz | 1.3 MB | Display | PDB format |
PDBx/mmJSON format | 6e07.json.gz | Tree view | PDBx/mmJSON format | |
Others | Other downloads |
-Validation report
Arichive directory | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/e0/6e07 ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/e0/6e07 | HTTPS FTP |
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-Related structure data
Related structure data | 6e08C 5vfl S: Starting model for refinement C: citing same article (ref.) |
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Similar structure data |
-Links
-Assembly
Deposited unit |
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Unit cell |
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Noncrystallographic symmetry (NCS) | NCS domain:
NCS domain segments: Component-ID: 0 / Refine code: 0
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