登録情報 | データベース: PDB / ID: 6c90 |
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タイトル | Human Mtr4 helicase in complex with ZCCHC8-CTD |
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要素 | - Exosome RNA helicase MTR4,Exosome RNA helicase MTR4
- Zinc finger CCHC domain-containing protein 8
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キーワード | HYDROLASE/RNA binding protein / HYDROLASE (加水分解酵素) / NEXT / EXOSOME / NUCLEOTIDE-BINDING / ATPASE (ATPアーゼ) / RNA (リボ核酸) / HELICASE (ヘリカーゼ) / TRANSLOCASE (輸送酵素) / RNA BINDING PROTEIN (RNA結合タンパク質) / HYDROLASE-RNA binding protein complex |
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機能・相同性 | 機能・相同性情報
: / snRNA catabolic process / TRAMP complex / RNA catabolic process / maturation of 5.8S rRNA / Major pathway of rRNA processing in the nucleolus and cytosol / catalytic step 2 spliceosome / mRNA Splicing - Major Pathway / rRNA processing / mRNA splicing, via spliceosome ...: / snRNA catabolic process / TRAMP complex / RNA catabolic process / maturation of 5.8S rRNA / Major pathway of rRNA processing in the nucleolus and cytosol / catalytic step 2 spliceosome / mRNA Splicing - Major Pathway / rRNA processing / mRNA splicing, via spliceosome / RNA helicase activity / nuclear body / ヘリカーゼ / nuclear speck / DNA damage response / 核小体 / ATP hydrolysis activity / RNA binding / zinc ion binding / 核質 / ATP binding / 細胞核類似検索 - 分子機能 rRNA-processing arch domain / Mtr4-like, beta-barrel domain / : / Exosome RNA helicase MTR4-like, stalk / ATP-dependent RNA helicase Ski2, C-terminal / ATP-dependent RNA helicase Ski2-like / DSHCT (NUC185) domain / DSHCT / PSP, proline-rich / PSP ...rRNA-processing arch domain / Mtr4-like, beta-barrel domain / : / Exosome RNA helicase MTR4-like, stalk / ATP-dependent RNA helicase Ski2, C-terminal / ATP-dependent RNA helicase Ski2-like / DSHCT (NUC185) domain / DSHCT / PSP, proline-rich / PSP / proline-rich domain in spliceosome associated proteins / DEAD/DEAH box helicase / DEAD/DEAH box helicase domain / Helicase conserved C-terminal domain / ジンクフィンガー / Zinc knuckle / Zinc finger, CCHC-type / Zinc finger CCHC-type profile. / helicase superfamily c-terminal domain / Superfamilies 1 and 2 helicase C-terminal domain profile. / Superfamilies 1 and 2 helicase ATP-binding type-1 domain profile. / DEAD-like helicases superfamily / Helicase, C-terminal / Helicase superfamily 1/2, ATP-binding domain / P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolase類似検索 - ドメイン・相同性 ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE / マロン酸 / L(+)-TARTARIC ACID / Exosome RNA helicase MTR4 / Zinc finger CCHC domain-containing protein 8類似検索 - 構成要素 |
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生物種 | Homo sapiens (ヒト) |
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手法 | X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度: 2.2 Å |
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データ登録者 | Puno, M.R. / Lima, C.D. |
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資金援助 | 米国, 2件 組織 | 認可番号 | 国 |
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National Institutes of Health/National Institute of General Medical Sciences (NIH/NIGMS) | GM118080 | 米国 | Howard Hughes Medical Institute (HHMI) | | 米国 |
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引用 | ジャーナル: Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. / 年: 2018 タイトル: Structural basis for MTR4-ZCCHC8 interactions that stimulate the MTR4 helicase in the nuclear exosome-targeting complex. 著者: Puno, M.R. / Lima, C.D. |
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履歴 | 登録 | 2018年1月25日 | 登録サイト: RCSB / 処理サイト: RCSB |
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改定 1.0 | 2018年5月30日 | Provider: repository / タイプ: Initial release |
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改定 1.1 | 2018年6月13日 | Group: Data collection / Database references / カテゴリ: citation Item: _citation.journal_abbrev / _citation.pdbx_database_id_DOI ..._citation.journal_abbrev / _citation.pdbx_database_id_DOI / _citation.pdbx_database_id_PubMed / _citation.title |
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改定 1.2 | 2018年6月20日 | Group: Data collection / Database references / カテゴリ: citation Item: _citation.journal_volume / _citation.page_first / _citation.page_last |
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改定 1.3 | 2019年11月20日 | Group: Author supporting evidence / カテゴリ: pdbx_audit_support / Item: _pdbx_audit_support.funding_organization |
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改定 1.4 | 2023年10月4日 | Group: Data collection / Database references ...Data collection / Database references / Derived calculations / Refinement description カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model / pdbx_struct_conn_angle / struct_conn Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ..._database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.value / _struct_conn.pdbx_dist_value / _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id |
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