登録情報 | データベース: PDB / ID: 5xya |
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タイトル | Crystal structure of a serine protease from Streptococcus species |
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要素 | Chemokine protease C |
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キーワード | LYASE (リアーゼ) / Subtilisin like / Cell adhesion (細胞接着) / Protease (プロテアーゼ) |
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機能・相同性 | 機能・相同性情報
C5a peptidase / serine-type endopeptidase activity / タンパク質分解 / 生体膜 / metal ion binding類似検索 - 分子機能Fn3-like domain / C5a peptidase-like domain / Fn3-like domain / PA domain superfamily / PA domain / PA domain / YSIRK type signal peptide / YSIRK Gram-positive signal peptide / Peptidase S8, subtilisin, His-active site / Serine proteases, subtilase family, histidine active site. ...Fn3-like domain / C5a peptidase-like domain / Fn3-like domain / PA domain superfamily / PA domain / PA domain / YSIRK type signal peptide / YSIRK Gram-positive signal peptide / Peptidase S8, subtilisin, His-active site / Serine proteases, subtilase family, histidine active site. / Serine proteases, subtilase family, aspartic acid active site. / Peptidase S8, subtilisin, Asp-active site / Serine proteases, subtilase family, serine active site. / Peptidase S8, subtilisin, Ser-active site / Gram-positive cocci surface proteins LPxTG motif profile. / LPXTG cell wall anchor domain / Serine proteases, subtilase domain profile. / Peptidase S8, subtilisin-related / Peptidase S8/S53 domain superfamily / Subtilase family / Peptidase S8/S53 domain / Immunoglobulin-like fold類似検索 - ドメイン・相同性 4-(2-AMINOETHYL)BENZENESULFONYL FLUORIDE / C5a peptidase類似検索 - 構成要素 |
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生物種 | ![](img/tx_bacteria.gif) Streptococcus pyogenes (化膿レンサ球菌) |
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手法 | X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度: 3 Å |
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データ登録者 | Jobichen, C. / Sivaraman, J. |
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引用 | ジャーナル: Biochem. J. / 年: 2018 タイトル: Structure of ScpC, a virulence protease fromStreptococcus pyogenes, reveals the functional domains and maturation mechanism. 著者: Jobichen, C. / Tan, Y.C. / Prabhakar, M.T. / Nayak, D. / Biswas, D. / Pannu, N.S. / Hanski, E. / Sivaraman, J. |
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履歴 | 登録 | 2017年7月6日 | 登録サイト: PDBJ / 処理サイト: PDBJ |
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改定 1.0 | 2018年8月8日 | Provider: repository / タイプ: Initial release |
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改定 1.1 | 2018年9月26日 | Group: Data collection / Database references / カテゴリ: citation / citation_author Item: _citation.journal_volume / _citation.page_first ..._citation.journal_volume / _citation.page_first / _citation.page_last / _citation.title / _citation_author.name |
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改定 1.2 | 2023年11月22日 | Group: Data collection / Database references ...Data collection / Database references / Derived calculations / Refinement description カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model / struct_conn Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ..._database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _struct_conn.conn_type_id / _struct_conn.id / _struct_conn.pdbx_dist_value / _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag / _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr1_label_atom_id / _struct_conn.ptnr1_label_comp_id / _struct_conn.ptnr1_label_seq_id / _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr2_label_asym_id / _struct_conn.ptnr2_label_atom_id / _struct_conn.ptnr2_label_comp_id / _struct_conn.ptnr2_label_seq_id |
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