登録情報 | データベース: PDB / ID: 5xus |
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タイトル | Crystal structure of Lachnospiraceae bacterium ND2006 Cpf1 in complex with crRNA and target DNA (TTTA PAM) |
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要素 | - DNA (29-MER)
- DNA (5'-D(*CP*GP*TP*CP*CP*TP*TP*TP*A)-3')
- LbCpf1
- crRNA
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キーワード | HYDROLASE/RNA/DNA / nuclease (ヌクレアーゼ) / HYDROLASE-RNA-DNA complex |
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機能・相同性 | 機能・相同性情報 |
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生物種 | Lachnospiraceae bacterium ND2006 (バクテリア) synthetic construct (人工物) |
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手法 | X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度: 2.5 Å |
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データ登録者 | Yamano, T. / Nishimasu, H. / Ishitani, R. / Nureki, O. |
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引用 | ジャーナル: Mol. Cell / 年: 2017 タイトル: Structural Basis for the Canonical and Non-canonical PAM Recognition by CRISPR-Cpf1. 著者: Yamano, T. / Zetsche, B. / Ishitani, R. / Zhang, F. / Nishimasu, H. / Nureki, O. |
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履歴 | 登録 | 2017年6月26日 | 登録サイト: PDBJ / 処理サイト: PDBJ |
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改定 1.0 | 2017年8月9日 | Provider: repository / タイプ: Initial release |
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改定 1.1 | 2017年12月6日 | Group: Database references / カテゴリ: citation Item: _citation.country / _citation.journal_abbrev ..._citation.country / _citation.journal_abbrev / _citation.journal_id_ASTM / _citation.journal_id_CSD / _citation.journal_id_ISSN / _citation.journal_volume / _citation.page_first / _citation.page_last / _citation.pdbx_database_id_DOI / _citation.pdbx_database_id_PubMed / _citation.title / _citation.year |
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改定 1.2 | 2023年11月22日 | Group: Data collection / Database references ...Data collection / Database references / Derived calculations / Refinement description カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model / pdbx_struct_conn_angle / struct_conn Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ..._database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_atom_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_atom_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_atom_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.value / _struct_conn.pdbx_dist_value / _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr1_label_asym_id / _struct_conn.ptnr1_label_atom_id / _struct_conn.ptnr1_label_comp_id / _struct_conn.ptnr1_label_seq_id / _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr2_label_asym_id / _struct_conn.ptnr2_label_atom_id / _struct_conn.ptnr2_label_comp_id / _struct_conn.ptnr2_label_seq_id |
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