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Yorodumi- PDB-5ngo: Crystal structure of the PARP domain of Arabidopsis RADICAL-INDUC... -
+Open data
-Basic information
Entry | Database: PDB / ID: 5ngo | ||||||
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Title | Crystal structure of the PARP domain of Arabidopsis RADICAL-INDUCED CELL DEATH1 | ||||||
Components | Inactive poly [ADP-ribose] polymerase RCD1 | ||||||
Keywords | PLANT PROTEIN / inactive Poly-(ADP-ribose)-Polymerase / PARP | ||||||
Function / homology | Function and homology information lateral root morphogenesis / response to ethylene / jasmonic acid mediated signaling pathway / ethylene-activated signaling pathway / response to ozone / embryo development ending in seed dormancy / response to water deprivation / programmed cell death / response to superoxide / regulation of reactive oxygen species metabolic process ...lateral root morphogenesis / response to ethylene / jasmonic acid mediated signaling pathway / ethylene-activated signaling pathway / response to ozone / embryo development ending in seed dormancy / response to water deprivation / programmed cell death / response to superoxide / regulation of reactive oxygen species metabolic process / response to osmotic stress / NAD+ ADP-ribosyltransferase activity / response to salt stress / nitric oxide biosynthetic process / nuclear matrix / defense response to bacterium / nucleus / cytoplasm Similarity search - Function | ||||||
Biological species | Arabidopsis thaliana (thale cress) | ||||||
Method | X-RAY DIFFRACTION / SYNCHROTRON / SAD / Resolution: 2.5 Å | ||||||
Authors | Wirthmueller, L. / Banfield, M.J. | ||||||
Citation | Journal: New Phytol. / Year: 2018 Title: Arabidopsis downy mildew effector HaRxL106 suppresses plant immunity by binding to RADICAL-INDUCED CELL DEATH1. Authors: Wirthmueller, L. / Asai, S. / Rallapalli, G. / Sklenar, J. / Fabro, G. / Kim, D.S. / Lintermann, R. / Jaspers, P. / Wrzaczek, M. / Kangasjarvi, J. / MacLean, D. / Menke, F.L.H. / Banfield, M.J. / Jones, J.D.G. | ||||||
History |
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-Structure visualization
Structure viewer | Molecule: MolmilJmol/JSmol |
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-Downloads & links
-Download
PDBx/mmCIF format | 5ngo.cif.gz | 541.7 KB | Display | PDBx/mmCIF format |
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PDB format | pdb5ngo.ent.gz | 453.5 KB | Display | PDB format |
PDBx/mmJSON format | 5ngo.json.gz | Tree view | PDBx/mmJSON format | |
Others | Other downloads |
-Validation report
Arichive directory | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/ng/5ngo ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/ng/5ngo | HTTPS FTP |
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-Related structure data
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-Links
-Assembly
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Unit cell |
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Noncrystallographic symmetry (NCS) | NCS domain:
NCS domain segments: Component-ID: 0 / Refine code: 0
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