- PDB-5gnb: Crystal Structure of the Receptor Binding Domain of the Spike Gly... -
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基本情報
登録情報
データベース: PDB / ID: 5gnb
タイトル
Crystal Structure of the Receptor Binding Domain of the Spike Glycoprotein of Human Betacoronavirus HKU1 (HKU1 1A-CTD, 2.3 angstrom, native-SAD phasing)
プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray
放射波長
波長: 2.08 Å / 相対比: 1
反射
解像度: 2.3→49.2 Å / Num. obs: 43316 / % possible obs: 99.5 % / Observed criterion σ(I): -3 / 冗長度: 89.76 % / Biso Wilson estimate: 31.062 Å2 / CC1/2: 0.999 / Rmerge(I) obs: 0.23 / Net I/σ(I): 28.04
反射 シェル
解像度: 2.3→2.36 Å / 冗長度: 30.92 % / Rmerge(I) obs: 1.28 / Mean I/σ(I) obs: 3.37 / CC1/2: 0.894 / % possible all: 93.9
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解析
ソフトウェア
名称
バージョン
分類
PHENIX
(1.10.1_2155: ???)
精密化
XDS
データ削減
XDS
データスケーリング
SHELXCD
位相決定
精密化
構造決定の手法: 単波長異常分散 / 解像度: 2.3→49.2 Å / SU ML: 0.26 / 交差検証法: THROUGHOUT / σ(F): 1.93 / 位相誤差: 23.97 詳細: SF FILE CONTAINS FRIEDEL PAIRS UNDER I/F_MINUS AND I/F_PLUS COLUMNS.