登録情報 | データベース: PDB / ID: 4yg3 |
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タイトル | Structural basis of glycan recognition in neonate-specific rotaviruses |
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要素 | Outer capsid protein VP4 |
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キーワード | VIRAL PROTEIN (ウイルスタンパク質) / rotavirus (ロタウイルス) / structural biology (構造生物学) / glycan (糖鎖) |
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機能・相同性 | 機能・相同性情報
host cell rough endoplasmic reticulum / host cytoskeleton / viral outer capsid / permeabilization of host organelle membrane involved in viral entry into host cell / symbiont entry into host cell via permeabilization of inner membrane / host cell endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment / virion attachment to host cell / host cell plasma membrane / 生体膜類似検索 - 分子機能 Haemagglutinin outer capsid protein VP4, concanavalin-like domain / Outer Capsid protein VP4 (Hemagglutinin) Concanavalin-like domain / Rotavirus VP4 helical domain / Rotavirus VP4 helical domain / Outer capsid protein VP4 / Rotavirus VP4, membrane interaction domain superfamily / Rotavirus VP4, membrane interaction domain / Rotavirus VP4 membrane interaction domain / Jelly Rolls - #200 / Concanavalin A-like lectin/glucanase domain superfamily ...Haemagglutinin outer capsid protein VP4, concanavalin-like domain / Outer Capsid protein VP4 (Hemagglutinin) Concanavalin-like domain / Rotavirus VP4 helical domain / Rotavirus VP4 helical domain / Outer capsid protein VP4 / Rotavirus VP4, membrane interaction domain superfamily / Rotavirus VP4, membrane interaction domain / Rotavirus VP4 membrane interaction domain / Jelly Rolls - #200 / Concanavalin A-like lectin/glucanase domain superfamily / Jelly Rolls / サンドイッチ / Mainly Beta類似検索 - ドメイン・相同性 Outer capsid protein VP4 / Outer capsid protein VP4類似検索 - 構成要素 |
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生物種 | Rotavirus A (ロタウイルス A) |
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手法 | X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度: 2.285 Å |
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データ登録者 | Hu, L. / Prasad, B.V.V. |
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資金援助 | 米国, 1件 組織 | 認可番号 | 国 |
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National Institutes of Health/National Institute Of Allergy and Infectious Diseases (NIH/NIAID) | AI36040 | 米国 |
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引用 | ジャーナル: Nat Commun / 年: 2015 タイトル: Structural basis of glycan specificity in neonate-specific bovine-human reassortant rotavirus. 著者: Hu, L. / Ramani, S. / Czako, R. / Sankaran, B. / Yu, Y. / Smith, D.F. / Cummings, R.D. / Estes, M.K. / Venkataram Prasad, B.V. |
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履歴 | 登録 | 2015年2月25日 | 登録サイト: RCSB / 処理サイト: RCSB |
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改定 1.0 | 2015年9月30日 | Provider: repository / タイプ: Initial release |
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改定 1.1 | 2015年10月14日 | Group: Database references |
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改定 1.2 | 2017年9月13日 | Group: Author supporting evidence / Derived calculations / カテゴリ: pdbx_audit_support / pdbx_struct_oper_list Item: _pdbx_audit_support.funding_organization / _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation |
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改定 1.3 | 2017年11月22日 | Group: Refinement description / カテゴリ: software / Item: _software.classification |
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改定 1.4 | 2019年12月11日 | Group: Author supporting evidence / カテゴリ: pdbx_audit_support / Item: _pdbx_audit_support.funding_organization |
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改定 1.5 | 2023年9月27日 | Group: Data collection / Database references / Refinement description カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession |
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