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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 4mht | ||||||
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タイトル | TERNARY STRUCTURE OF HHAI METHYLTRANSFERASE WITH NATIVE DNA AND ADOHCY | ||||||
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![]() | TRANSFERASE/DNA / COMPLEX (METHYLTRANSFERASE-DNA) / ![]() ![]() | ||||||
機能・相同性 | ![]() ![]() ![]() ![]() 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | ![]() ![]() | ||||||
手法 | ![]() ![]() | ||||||
![]() | Cheng, X. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: Enzymatic C5-cytosine methylation of DNA: mechanistic implications of new crystal structures for HhaL methyltransferase-DNA-AdoHcy complexes. 著者: O'Gara, M. / Klimasauskas, S. / Roberts, R.J. / Cheng, X. #1: ![]() タイトル: HhaI Methyltransferase Flips its Target Base Out of the DNA Helix 著者: Klimasauskas, S. / Kumar, S. / Roberts, R.J. / Cheng, X. #2: ![]() タイトル: Crystal Structure of the HhaI DNA Methyltransferase Complexed with S-Adenosyl- L-Methionine 著者: Cheng, X. / Kumar, S. / Posfai, J. / Pflugrath, J.W. / Roberts, R.J. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 98.7 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 72.3 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
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-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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単位格子 |
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要素
#1: DNA鎖 | 分子量: 3676.431 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 合成 |
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#2: DNA鎖 | 分子量: 3980.624 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 合成 |
#3: タンパク質 | 分子量: 37042.207 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) ![]() ![]() |
#4: 化合物 | ChemComp-SAH / ![]() |
#5: 水 | ChemComp-HOH / ![]() |
-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 3.52 Å3/Da / 溶媒含有率: 65.06 % | |||||||||||||||||||||||||
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結晶化![]() | *PLUS 温度: 16 ℃ / pH: 5.6 / 手法: unknown | |||||||||||||||||||||||||
溶液の組成 | *PLUS
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-データ収集
放射光源 | 由来: ![]() ![]() ![]() |
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検出器 | タイプ: MARRESEARCH / 検出器: IMAGE PLATE |
放射 | プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray |
放射波長 | 相対比: 1 |
反射 | % possible obs: 90 % / 冗長度: 3.7 % / Rmerge(I) obs: 0.06 |
反射 | *PLUS % possible obs: 90 % / 冗長度: 3.7 % |
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解析
ソフトウェア |
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精密化 | 解像度: 2.7→20 Å / σ(F): 2 /
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精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 2.7→20 Å
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拘束条件 |
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LS精密化 シェル | 解像度: 2.7→2.82 Å /
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ソフトウェア | *PLUS 名称: ![]() | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
精密化 | *PLUS 最高解像度: 2.7 Å / 最低解像度: 20 Å / σ(F): 2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
溶媒の処理 | *PLUS | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
原子変位パラメータ | *PLUS | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
拘束条件 | *PLUS
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