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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 4gnt | ||||||
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タイトル | Complex of ChREBP and 14-3-3beta | ||||||
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機能・相同性 | ![]() : / : / Butyrate Response Factor 1 (BRF1) binds and destabilizes mRNA / carbohydrate response element binding / Tristetraprolin (TTP, ZFP36) binds and destabilizes mRNA / Regulation of localization of FOXO transcription factors / Chk1/Chk2(Cds1) mediated inactivation of Cyclin B:Cdk1 complex / RHO GTPases activate PKNs / regulation of cell cycle => GO:0051726 / Activation of BAD and translocation to mitochondria ...: / : / Butyrate Response Factor 1 (BRF1) binds and destabilizes mRNA / carbohydrate response element binding / Tristetraprolin (TTP, ZFP36) binds and destabilizes mRNA / Regulation of localization of FOXO transcription factors / Chk1/Chk2(Cds1) mediated inactivation of Cyclin B:Cdk1 complex / RHO GTPases activate PKNs / regulation of cell cycle => GO:0051726 / Activation of BAD and translocation to mitochondria / Frs2-mediated activation / MTOR signalling / Signaling by Hippo / Negative regulation of MAPK pathway / glucose mediated signaling pathway / TP53 Regulates Metabolic Genes / RAF activation / mTORC1-mediated signalling / negative regulation of protein dephosphorylation / MAP2K and MAPK activation / cytoplasmic sequestering of protein / Rap1 signalling / negative regulation of G protein-coupled receptor signaling pathway / positive regulation of fatty acid biosynthetic process / negative regulation of oxidative phosphorylation / regulation of glycolytic process / ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | ![]() ![]() ![]() | ||||||
手法 | ![]() ![]() ![]() | ||||||
![]() | Zhang, H. / Huang, N. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: Crystal Structure of Carbohydrate Response Element Binding Protein (ChREBP) in complex with 14-3-3b 著者: Ge, Q. / Huang, N. / Zhang, H. / Uyeda, K. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 120 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 95.2 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
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-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 | ![]()
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2 | ![]()
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3 |
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単位格子 |
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Components on special symmetry positions |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 28240.658 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() | ||
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#2: タンパク質・ペプチド | ![]() 分子量: 2768.206 Da / 分子数: 1 / Fragment: UNP residues 117-137 / 由来タイプ: 合成 / 由来: (合成) ![]() ![]() ![]() | ||
#3: 化合物 | ChemComp-SO4 / ![]() #4: 水 | ChemComp-HOH / | ![]() |
-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 3.22 Å3/Da / 溶媒含有率: 61.8 % |
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結晶化![]() | 温度: 293 K / 手法: 蒸気拡散法, ハンギングドロップ法 / pH: 6.5 詳細: 100mM sodium citrate, 200mM sodium/potassium tartrate, 2.2M ammonium sulfate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K |
-データ収集
回折 | 平均測定温度: 100 K |
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放射光源 | 由来: ![]() ![]() ![]() |
検出器 | 日付: 2012年3月1日 |
放射 | プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray |
放射波長 | 波長![]() |
反射 | 解像度: 2.41→33.7 Å / Num. all: 29835 / Num. obs: 28628 / % possible obs: 3.3 % / Observed criterion σ(F): 0 / Observed criterion σ(I): 0 |
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解析
ソフトウェア |
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精密化 | 構造決定の手法![]() ![]()
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溶媒の処理 | イオンプローブ半径: 0.8 Å / 減衰半径: 0.8 Å / VDWプローブ半径: 1.4 Å / 溶媒モデル: MASK | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
原子変位パラメータ | Biso mean: 84.541 Å2
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精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 2.41→33.74 Å
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拘束条件 |
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LS精密化 シェル | 解像度: 2.411→2.474 Å / Total num. of bins used: 20
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精密化 TLS | 手法: refined / Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION
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精密化 TLSグループ |
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