温度: 298 K / 手法: 蒸気拡散法, ハンギングドロップ法 / pH: 6 詳細: 40 mg/mL protein in 50 mM benzamidine, 3.75 M TMAO, 0.2 M AmSO4, 0.1 M MES, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
-
データ収集
回折
平均測定温度: 100 K
放射光源
由来: SEALED TUBE / タイプ: OXFORD DIFFRACTION NOVA / 波長: 1.54 Å
検出器
タイプ: OXFORD ONYX CCD / 検出器: CCD / 日付: 2010年10月14日
放射
プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray
放射波長
波長: 1.54 Å / 相対比: 1
反射
解像度: 2.8→51.7 Å / Num. all: 7217 / Num. obs: 7217 / % possible obs: 99.7 % / 冗長度: 10 % / Rsym value: 0.1 / Net I/σ(I): 20
反射 シェル
解像度 (Å)
冗長度 (%)
Rmerge(I) obs
Mean I/σ(I) obs
Rsym value
Diffraction-ID
% possible all
2.8-2.95
10.3
0.286
2.6
0.286
1
100
2.95-3.13
10.3
0.188
3.9
0.188
1
100
3.13-3.35
10.2
0.145
5.1
0.145
1
100
3.35-3.61
10.1
0.104
7
0.104
1
100
3.61-3.96
10.2
0.085
8.4
0.085
1
100
3.96-4.43
10
0.064
10.2
0.064
1
100
4.43-5.11
9.9
0.063
10.6
0.063
1
100
5.11-6.26
9.6
0.078
9.1
0.078
1
100
6.26-8.85
9.1
0.063
11.3
0.063
1
100
8.85-20.148
7.3
0.037
17
0.037
1
91.7
-
位相決定
位相決定
手法: 分子置換
Phasing MR
最高解像度
最低解像度
Rotation
2.91 Å
20.15 Å
Translation
2.91 Å
20.15 Å
-
解析
ソフトウェア
名称
バージョン
分類
NB
SCALA
3.3.16
データスケーリング
MOLREP
位相決定
REFMAC
精密化
PDB_EXTRACT
3.1
データ抽出
CrysalisPro
データ収集
CrysalisPro
データ削減
精密化
解像度: 2.8→20.15 Å / Cor.coef. Fo:Fc: 0.933 / Cor.coef. Fo:Fc free: 0.885 / SU B: 11.659 / SU ML: 0.237 / 交差検証法: THROUGHOUT / ESU R: 3.832 / ESU R Free: 0.352 / 立体化学のターゲット値: MAXIMUM LIKELIHOOD / 詳細: HYDROGENS HAVE BEEN ADDED IN THE RIDING POSITIONS
Rfactor
反射数
%反射
Selection details
Rfree
0.24788
336
4.7 %
RANDOM
Rwork
0.18165
-
-
-
obs
0.18469
6831
99.6 %
-
溶媒の処理
イオンプローブ半径: 0.8 Å / 減衰半径: 0.8 Å / VDWプローブ半径: 1.4 Å / 溶媒モデル: MASK