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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 3sl7 | ||||||
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タイトル | Crystal structure of CBS-pair protein, CBSX2 from Arabidopsis thaliana | ||||||
![]() | CBS domain-containing protein CBSX2 | ||||||
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機能・相同性 | ![]() | ||||||
生物種 | ![]() ![]() ![]() | ||||||
手法 | ![]() ![]() ![]() | ||||||
![]() | Jeong, B.-C. / Lee, M.-R. / Song, H.K. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: Single cystathionine beta-synthase domain-containing proteins modulate development by regulating the thioredoxin system in Arabidopsis 著者: Yoo, K.S. / Ok, S.H. / Jeong, B.-C. / Jung, K.W. / Cui, M.H. / Hyoung, S. / Lee, M.-R. / Song, H.K. / Shin, J.S. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 128.9 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 109.6 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
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-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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単位格子 |
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非結晶学的対称性 (NCS) | NCSドメイン:
NCSドメイン領域:
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 19846.062 Da / 分子数: 2 / 断片: resideus in UNP 76-232 / 由来タイプ: 組換発現 由来: (組換発現) ![]() ![]() ![]() 遺伝子: CBSX2 / プラスミド: pET-GST / 発現宿主: ![]() ![]() ![]() #2: 化合物 | ChemComp-ACT / ![]() #3: 化合物 | ChemComp-GOL / | ![]() #4: 水 | ChemComp-HOH / | ![]() |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.46 Å3/Da / 溶媒含有率: 49.98 % |
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結晶化![]() | 温度: 295 K / 手法: 蒸気拡散法, ハンギングドロップ法 / pH: 6 詳細: 0.1M Bis-Tris, 0.2M Calcium acetate, 22% PEG 8000, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295.0K |
-データ収集
回折 |
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放射光源 |
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検出器 |
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放射 |
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放射波長 |
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反射 | 解像度: 1.905→50 Å / Num. obs: 31938 / 冗長度: 25 % / Rsym value: 0.057 |
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解析
ソフトウェア |
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精密化 | 構造決定の手法![]() ![]()
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溶媒の処理 | 減衰半径: 0.89 Å / VDWプローブ半径: 1 Å / 溶媒モデル: FLAT BULK SOLVENT MODEL / Bsol: 52.292 Å2 / ksol: 0.375 e/Å3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
原子変位パラメータ | Biso max: 130.67 Å2 / Biso mean: 43.3883 Å2 / Biso min: 3.12 Å2
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精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 1.905→35.13 Å
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拘束条件 |
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Refine LS restraints NCS |
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LS精密化 シェル | Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION / Total num. of bins used: 10
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精密化 TLS | 手法: refined / Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION
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精密化 TLSグループ |
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