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-基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 3or7 | ||||||
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タイトル | On the structural basis of modal gating behavior in K+channels - E71I | ||||||
要素 |
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キーワード | IMMUNE SYSTEM/TRANSPORT PROTEIN (免疫系) / inactivation / alpha-helical (Αヘリックス) / Potassium channel (カリウムチャネル) / IMMUNE SYSTEM-TRANSPORT PROTEIN complex (免疫系) | ||||||
機能・相同性 | 機能・相同性情報 delayed rectifier potassium channel activity / voltage-gated potassium channel complex / identical protein binding 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | Streptomyces lividans (スナパリシン) Mus musculus (ハツカネズミ) | ||||||
手法 | X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度: 2.3 Å | ||||||
データ登録者 | Chakrapani, S. / Cordero-Morales, J.F. / Jogini, V. / Pan, A.C. / Cortes, D.M. / Roux, B. / Perozo, E. | ||||||
引用 | ジャーナル: Nat.Struct.Mol.Biol. / 年: 2011 タイトル: On the structural basis of modal gating behavior in K(+) channels. 著者: Chakrapani, S. / Cordero-Morales, J.F. / Jogini, V. / Pan, A.C. / Cortes, D.M. / Roux, B. / Perozo, E. | ||||||
履歴 |
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-構造の表示
構造ビューア | 分子: MolmilJmol/JSmol |
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-ダウンロードとリンク
-ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | 3or7.cif.gz | 109 KB | 表示 | PDBx/mmCIF形式 |
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PDB形式 | pdb3or7.ent.gz | 88.1 KB | 表示 | PDB形式 |
PDBx/mmJSON形式 | 3or7.json.gz | ツリー表示 | PDBx/mmJSON形式 | |
その他 | その他のダウンロード |
-検証レポート
アーカイブディレクトリ | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/or/3or7 ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/or/3or7 | HTTPS FTP |
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-関連構造データ
-リンク
-集合体
登録構造単位 |
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1 |
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単位格子 |
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Components on special symmetry positions |
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-要素
#1: 抗体 | 分子量: 23411.242 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Mus musculus (ハツカネズミ) | ||
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#2: 抗体 | 分子量: 23435.738 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Mus musculus (ハツカネズミ) | ||
#3: タンパク質 | 分子量: 10962.780 Da / 分子数: 1 / Fragment: UNP RESIDUES 22-124 / Mutation: E71I / 由来タイプ: 組換発現 由来: (組換発現) Streptomyces lividans (スナパリシン) 発現宿主: Escherichia coli (大腸菌) / 参照: UniProt: P0A334 | ||
#4: 化合物 | ChemComp-K / #5: 水 | ChemComp-HOH / | |
-実験情報
-実験
実験 | 手法: X線回折 / 使用した結晶の数: 1 |
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-試料調製
結晶 | マシュー密度: 4.02 Å3/Da / 溶媒含有率: 69.4 % |
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結晶化 | 温度: 298 K / 手法: 蒸気拡散法, シッティングドロップ法 / pH: 6 詳細: 20-25% PEG400, 50mM magnesium acetate, 50mM sodium acetate pH 5.0-6.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K |
-データ収集
放射光源 | 由来: シンクロトロン / サイト: APS / ビームライン: 19-ID / 波長: 1 Å |
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検出器 | タイプ: ADSC QUANTUM 315 / 検出器: CCD / 日付: 2006年10月13日 |
放射 | プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray |
放射波長 | 波長: 1 Å / 相対比: 1 |
反射 | 解像度: 2.3→40 Å / Num. all: 40893 / Num. obs: 39318 / % possible obs: 96 % / Observed criterion σ(F): 2 / Observed criterion σ(I): 2 |
-解析
ソフトウェア |
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精密化 | 構造決定の手法: 分子置換 / 解像度: 2.3→40 Å / σ(F): 2
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精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 2.3→40 Å
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拘束条件 |
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