[English] 日本語
Yorodumi- PDB-3nic: DNA binding and cleavage by the GIY-YIG endonuclease R.Eco29kI in... -
+Open data
-Basic information
Entry | Database: PDB / ID: 3nic | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
Title | DNA binding and cleavage by the GIY-YIG endonuclease R.Eco29kI inactive variant Y49F | ||||||
Components |
| ||||||
Keywords | HYDROLASE/DNA / type II restriction endonuclease / GIY-YIG endonuclease / DNA-bound / HYDROLASE-DNA complex | ||||||
Function / homology | Restriction endonuclease, type II, Eco29kI / Eco29kI restriction endonuclease / identical protein binding / PHOSPHATE ION / DNA / DNA (> 10) / Eco29kIR Function and homology information | ||||||
Biological species | Escherichia coli (E. coli) | ||||||
Method | X-RAY DIFFRACTION / SYNCHROTRON / MOLECULAR REPLACEMENT / Resolution: 2.8 Å | ||||||
Authors | Mak, A.N.S. / Lambert, A.R. / Stoddard, B.L. | ||||||
Citation | Journal: Structure / Year: 2010 Title: Folding, DNA Recognition, and Function of GIY-YIG Endonucleases: Crystal Structures of R.Eco29kI. Authors: Mak, A.N. / Lambert, A.R. / Stoddard, B.L. #1: Journal: Nucleic Acids Res. / Year: 1992 Title: Eco29kI, a novel plasmid encoded restriction endonuclease from Escherichia coli. Authors: Pertzev, A.V. / Ruban, N.M. / Zakharova, M.V. / Beletzkaja, I.V. / Petrov, S.I. / Kravetz, A.N. / Solonin, A.S. | ||||||
History |
|
-Structure visualization
Structure viewer | Molecule: MolmilJmol/JSmol |
---|
-Downloads & links
-Download
PDBx/mmCIF format | 3nic.cif.gz | 871.4 KB | Display | PDBx/mmCIF format |
---|---|---|---|---|
PDB format | pdb3nic.ent.gz | 711.6 KB | Display | PDB format |
PDBx/mmJSON format | 3nic.json.gz | Tree view | PDBx/mmJSON format | |
Others | Other downloads |
-Validation report
Arichive directory | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/ni/3nic ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/ni/3nic | HTTPS FTP |
---|
-Related structure data
-Links
-Assembly
Deposited unit |
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
1 |
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
2 |
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3 |
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
4 |
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Unit cell |
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Noncrystallographic symmetry (NCS) | NCS domain:
|