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    - PDB-3izd: リボソーム大サブユニットRNA(拡張部位E27L-out状態)のモデル - Saccharomyces cerevisiae(パン... -

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    基本情報

    エントリ情報
    データベース: PDB / ID: 3izd
    タイトルModel of the large subunit RNA expansion segment ES27L-out based on a 6.1 A cryo-EM map of Saccharomyces cerevisiae translating 80S ribosome. 3IZD is a small part (an expansion segment) which is in an alternative conformation to what is in already 3IZF.
    記述子151-MER
    キーワードRIBOSOME / eukaryotic ribosome / homology modelling / de novo modeling / ribosomal RNA / rRNA / RNA expansion segments
    試料の由来Saccharomyces cerevisiae / 酵母 / サッカロミセス・セレビシエ /
    手法電子顕微鏡 (8.6 A 分解能)
    データ登録者Armache, J.-P. / Jarasch, A. / Anger, A.M. / Villa, E. / Becker, T. / Bhushan, S. / Jossinet, F. / Habeck, M. / Dindar, G. / Franckenberg, S. / Marquez, V. / Mielke, T. / Thomm, M. / Berninghausen, O. / Beatrix, B. / Soeding, J. / Westhof, E. / Wilson, D.N. / Beckmann, R.
    引用Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A., 2010, 107, 19748-19753

    primary. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A., 2010, 107, 19748-19753 StrPapers
    Cryo-EM structure and rRNA model of a translating eukaryotic 80S ribosome at 5.5-A resolution.
    Jean-Paul Armache / Alexander Jarasch / Andreas M Anger / Elizabeth Villa / Thomas Becker / Shashi Bhushan / Fabrice Jossinet / Michael Habeck / Gülcin Dindar / Sibylle Franckenberg / Viter Marquez / Thorsten Mielke / Michael Thomm / Otto Berninghausen / Birgitta Beatrix / Johannes Söding / Eric Westhof / Daniel N Wilson / Roland Beckmann

    #1. Proc.Natl.Acad.Sci.USA, 2010, 107, 19754-19759 StrPapers
    Localization of eukaryote-specific ribosomal proteins in a 5.5-A cryo-EM map of the 80S eukaryotic ribosome.
    Armache, J.P. / Jarasch, A. / Anger, A.M. / Villa, E. / Becker, T. / Bhushan, S. / Jossinet, F. / Habeck, M. / Dindar, G. / Franckenberg, S. / Marquez, V. / Mielke, T. / Thomm, M. / Berninghausen, O. / Beatrix, B. / Soding, J. / Westhof, E. / Wilson, D.N. / Beckmann, R.

    日付登録: 2010年10月13日 / 公開: 2010年12月1日 / 最新の修正: 2012年5月30日

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    ダウンロードとリンク

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    集合体

    登録構造単位
    A: rRNA expansion segment ES27L in an "out" conformation

    48.7 kDa, 1 分子
    分子量 (理論値)分子数
    合計
    (水以外)
    48,7221
    ポリマ-48,7221
    非ポリマ-00
    0

    Omokage検索
    #1登録構造と同一 / 登録者が定義した集合体 / 対称操作: (同一)x1
    ダウンロード

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    構成要素

    #1RNA鎖 / rRNA expansion segment ES27L in an "out" conformation / 由来: Saccharomyces cerevisiae (組換発現) / 参照: GenBank: U53879.1

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    実験情報

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    実験

    実験手法: ELECTRON MICROSCOPY

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    試料調製

    試料調製pH: 7.5

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    電子顕微鏡撮影

    RadiationDiffraction protocol: SINGLE WAVELENGTH / Monochromatic or laue m l: M / Scattering type: x-ray
    Radiation wavelength相対比: 1

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    解析

    3次元再構成分解能: 8.6 A
    置いた原子数 #LASTタンパク質: 0 / 核酸: 3044 / リガンド: 0 / 溶媒: 0 / 合計: 3044

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