ジャーナル: J.Mol.Biol. / 年: 2008 タイトル: Three-dimensional structures of Pseudomonas aeruginosa PvcA and PvcB, two proteins involved in the synthesis of 2-isocyano-6,7-dihydroxycoumarin. 著者: Drake, E.J. / Gulick, A.M.
プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray
放射波長
波長: 0.979 Å / 相対比: 1
反射
解像度: 2.5→50 Å / Num. all: 17774 / Num. obs: 17734 / % possible obs: 99.9 % / Observed criterion σ(I): -3 / 冗長度: 9.3 % / Biso Wilson estimate: 56.6 Å2 / Rmerge(I) obs: 0.083 / Net I/σ(I): 19.1
反射 シェル
解像度: 2.5→2.59 Å / Rmerge(I) obs: 0.484 / Mean I/σ(I) obs: 2.6 / % possible all: 99.8
-
解析
ソフトウェア
名称
バージョン
分類
Blu-Ice
データ収集
SnB
位相決定
REFMAC
5.2.0005
精密化
HKL-2000
データ削減
HKL-2000
データスケーリング
精密化
解像度: 2.5→30 Å / Cor.coef. Fo:Fc: 0.951 / Cor.coef. Fo:Fc free: 0.922 / SU B: 6.244 / SU ML: 0.14 / 交差検証法: THROUGHOUT / ESU R: 0.27 / ESU R Free: 0.214 / 立体化学のターゲット値: MAXIMUM LIKELIHOOD / 詳細: HYDROGENS HAVE BEEN ADDED IN THE RIDING POSITIONS
Rfactor
反射数
%反射
Selection details
Rfree
0.225
918
5.2 %
RANDOM
Rwork
0.187
-
-
-
obs
0.189
16728
99.72 %
-
溶媒の処理
イオンプローブ半径: 0.8 Å / 減衰半径: 0.8 Å / VDWプローブ半径: 1.2 Å / 溶媒モデル: BABINET MODEL WITH MASK