登録情報 | データベース: PDB / ID: 3c95 |
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タイトル | Exonuclease I (apo) |
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要素 | Exodeoxyribonuclease IエキソデオキシリボヌクレアーゼI |
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キーワード | HYDROLASE (加水分解酵素) / Exonuclease (エキソヌクレアーゼ) / SSB / genome maintenance (ゲノム) / DNA damage (DNA修復) / DNA repair (DNA修復) |
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機能・相同性 | 機能・相同性情報
エキソデオキシリボヌクレアーゼI / single-stranded DNA 3'-5' DNA exonuclease activity / DNA catabolic process / 5'-deoxyribose-5-phosphate lyase activity / single-stranded DNA binding / 3'-5'-RNA exonuclease activity / DNA修復 / magnesium ion binding類似検索 - 分子機能 Helix Hairpins - #1240 / Exonuclease ExoI, domain 3 / Exonuclease ExoI, domain 2 / Exodeoxyribonuclease I, C-terminal / エキソデオキシリボヌクレアーゼI / Exonuclease I, SH3-like domain / Exonuclease I, C-terminal alpha-helical domain / Exonuclease I, SH3-like domain superfamily / Exonuclease C-terminal / Exonuclease I (ExoI) SH3-like domain profile. ...Helix Hairpins - #1240 / Exonuclease ExoI, domain 3 / Exonuclease ExoI, domain 2 / Exodeoxyribonuclease I, C-terminal / エキソデオキシリボヌクレアーゼI / Exonuclease I, SH3-like domain / Exonuclease I, C-terminal alpha-helical domain / Exonuclease I, SH3-like domain superfamily / Exonuclease C-terminal / Exonuclease I (ExoI) SH3-like domain profile. / Exonuclease I (ExoI) C-terminal domain profile. / Oligoribonuclease / PX Domain / エキソヌクレアーゼ / Exonuclease, RNase T/DNA polymerase III / EXOIII / Monooxygenase / Ribonuclease H-like superfamily/Ribonuclease H / Helix Hairpins / Nucleotidyltransferase; domain 5 / Ribonuclease H superfamily / Ribonuclease H-like superfamily / Up-down Bundle / 2-Layer Sandwich / Orthogonal Bundle / Mainly Alpha / Alpha Beta類似検索 - ドメイン・相同性 |
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生物種 | Escherichia coli (大腸菌) |
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手法 | X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度: 1.7 Å |
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データ登録者 | Keck, J.L. / Lu, D. |
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引用 | ジャーナル: Proc.Natl.Acad.Sci.USA / 年: 2008 タイトル: Structural basis of Escherichia coli single-stranded DNA-binding protein stimulation of exonuclease I. 著者: Lu, D. / Keck, J.L. |
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履歴 | 登録 | 2008年2月15日 | 登録サイト: RCSB / 処理サイト: RCSB |
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改定 1.0 | 2008年7月8日 | Provider: repository / タイプ: Initial release |
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改定 1.1 | 2011年7月13日 | Group: Advisory / Version format compliance |
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改定 1.2 | 2012年3月21日 | Group: Database references |
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改定 1.3 | 2017年10月25日 | Group: Refinement description / カテゴリ: software |
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改定 1.4 | 2023年8月30日 | Group: Data collection / Database references ...Data collection / Database references / Derived calculations / Refinement description カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model / pdbx_struct_conn_angle / struct_conn / struct_ref_seq_dif / struct_site Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ..._database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.value / _struct_conn.pdbx_dist_value / _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id / _struct_ref_seq_dif.details / _struct_site.pdbx_auth_asym_id / _struct_site.pdbx_auth_comp_id / _struct_site.pdbx_auth_seq_id |
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