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Yorodumi- PDB-2vgr: Structure of the WT-Phycoerythrobilin Synthase PebS from the Cyan... -
+Open data
-Basic information
Entry | Database: PDB / ID: 2vgr | ||||||
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Title | Structure of the WT-Phycoerythrobilin Synthase PebS from the Cyanophage P-SSM2 in Complex with the bound Substrate Biliverdin IXa | ||||||
Components | CYANOBACTERIAL PHYCOERYTHROBILIN | ||||||
Keywords | OXIDOREDUCTASE / CYANOPHAGES / BILIVERDIN IXA / PHYCOBILIN REDUCTASE / PHYCOBILIN SYNTHESIS / PROCHLOROCOCCUS / PHYCOERYTHROBILIN / BILIVERDIN REDUCTASE / FERREDOXIN DEPENDENT | ||||||
Function / homology | Function and homology information phycoerythrobilin synthase / oxidoreductase activity, acting on the CH-CH group of donors, iron-sulfur protein as acceptor / phytochromobilin biosynthetic process / cobalt ion binding Similarity search - Function | ||||||
Biological species | PROCHLOROCOCCUS PHAGE P-SSM2 (virus) | ||||||
Method | X-RAY DIFFRACTION / SYNCHROTRON / MOLECULAR REPLACEMENT / Resolution: 2.1 Å | ||||||
Authors | Dammeyer, T. / Hofmann, E. / Frankenberg-Dinkel, N. | ||||||
Citation | Journal: J.Biol.Chem. / Year: 2008 Title: Phycoerythrobilin Synthase (Pebs) of a Marine Virus: Crystal Structures of the Biliverdin Complex and the Substrate-Free Form. Authors: Dammeyer, T. / Hofmann, E. / Frankenberg-Dinkel, N. | ||||||
History |
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-Structure visualization
Structure viewer | Molecule: MolmilJmol/JSmol |
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-Downloads & links
-Download
PDBx/mmCIF format | 2vgr.cif.gz | 193.5 KB | Display | PDBx/mmCIF format |
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PDB format | pdb2vgr.ent.gz | 155.8 KB | Display | PDB format |
PDBx/mmJSON format | 2vgr.json.gz | Tree view | PDBx/mmJSON format | |
Others | Other downloads |
-Validation report
Arichive directory | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/vg/2vgr ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/vg/2vgr | HTTPS FTP |
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-Related structure data
Related structure data | 2vckSC 2vclC S: Starting model for refinement C: citing same article (ref.) |
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Similar structure data |
-Links
-Assembly
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Unit cell |
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Noncrystallographic symmetry (NCS) | NCS domain:
NCS domain segments: Refine code: 4
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