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-基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 2kwh | ||||||
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タイトル | Ral binding domain of RLIP76 (RalBP1) | ||||||
要素 | RalA-binding protein 1 | ||||||
キーワード | TRANSPORT PROTEIN (運搬体タンパク質) / GTPase activation | ||||||
機能・相同性 | 機能・相同性情報 doxorubicin transport / ABC-type glutathione-S-conjugate transporter / ABC-type glutathione S-conjugate transporter activity / xenobiotic detoxification by transmembrane export across the plasma membrane / ABC-type xenobiotic transporter / ABC-type xenobiotic transporter activity / regulation of Cdc42 protein signal transduction / regulation of small GTPase mediated signal transduction / small GTPase-mediated signal transduction / positive regulation of mitochondrial fission ...doxorubicin transport / ABC-type glutathione-S-conjugate transporter / ABC-type glutathione S-conjugate transporter activity / xenobiotic detoxification by transmembrane export across the plasma membrane / ABC-type xenobiotic transporter / ABC-type xenobiotic transporter activity / regulation of Cdc42 protein signal transduction / regulation of small GTPase mediated signal transduction / small GTPase-mediated signal transduction / positive regulation of mitochondrial fission / regulation of GTPase activity / xenobiotic transmembrane transporter activity / CDC42 GTPase cycle / transmembrane transporter activity / ATPase-coupled transmembrane transporter activity / RAC1 GTPase cycle / GTPase activator activity / transmembrane transport / small GTPase binding / positive regulation of GTPase activity / 紡錘体 / エンドサイトーシス / 走化性 / nuclear body / positive regulation of protein phosphorylation / ミトコンドリア / 核質 / ATP binding / 生体膜 / 細胞膜 / 細胞質基質 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | Homo sapiens (ヒト) | ||||||
手法 | 溶液NMR / simulated annealing | ||||||
Model details | closest to the average, model 1 | ||||||
データ登録者 | Fenwick, R.B. / Campbell, L.J. / Rajasekar, K. / Prasannan, S. / Nietlispach, D. / Camonis, J. / Owen, D. / Mott, H.R. | ||||||
引用 | ジャーナル: Structure / 年: 2010 タイトル: The RalB-RLIP76 complex reveals a novel mode of ral-effector interaction 著者: Fenwick, R.B. / Campbell, L.J. / Rajasekar, K. / Prasannan, S. / Nietlispach, D. / Camonis, J. / Owen, D. / Mott, H.R. | ||||||
履歴 |
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-構造の表示
構造ビューア | 分子: MolmilJmol/JSmol |
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-ダウンロードとリンク
-ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | 2kwh.cif.gz | 904.6 KB | 表示 | PDBx/mmCIF形式 |
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PDB形式 | pdb2kwh.ent.gz | 763.7 KB | 表示 | PDB形式 |
PDBx/mmJSON形式 | 2kwh.json.gz | ツリー表示 | PDBx/mmJSON形式 | |
その他 | その他のダウンロード |
-検証レポート
アーカイブディレクトリ | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/kw/2kwh ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/kw/2kwh | HTTPS FTP |
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-関連構造データ
-リンク
-集合体
登録構造単位 |
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1 |
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NMR アンサンブル |
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-要素
#1: タンパク質 | 分子量: 6600.567 Da / 分子数: 1 / 断片: UNP residues 393-446 / 変異: C411S / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Homo sapiens (ヒト) / 遺伝子: RALBP1, RLIP1, RLIP76 / 発現宿主: Escherichia coli (大腸菌) / 参照: UniProt: Q15311 |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: 溶液NMR | ||||||||||||||||||||||||||||
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NMR実験 |
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-試料調製
詳細 |
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試料 |
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試料状態 | イオン強度: 0.15 / pH: 6.3 / 圧: ambient / 温度: 298 K |
-NMR測定
NMRスペクトロメーター | タイプ: Bruker DRX / 製造業者: Bruker / モデル: DRX / 磁場強度: 500 MHz |
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-解析
NMR software |
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精密化 | 手法: simulated annealing / ソフトェア番号: 1 | ||||||||||||||||||
代表構造 | 選択基準: closest to the average | ||||||||||||||||||
NMRアンサンブル | コンフォーマー選択の基準: structures with the lowest energy 計算したコンフォーマーの数: 100 / 登録したコンフォーマーの数: 50 |