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-基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 2ctb | ||||||
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タイトル | THE HIGH RESOLUTION CRYSTAL STRUCTURE OF THE COMPLEX BETWEEN CARBOXYPEPTIDASE A AND L-PHENYL LACTATE | ||||||
要素 | CARBOXYPEPTIDASE A | ||||||
キーワード | HYDROLASE(C-TERMINAL PEPTIDASE) | ||||||
機能・相同性 | 機能・相同性情報 carboxypeptidase A / leukotriene metabolic process / metallocarboxypeptidase activity / タンパク質分解 / extracellular space / zinc ion binding 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | Bos taurus (ウシ) | ||||||
手法 | X線回折 / 解像度: 1.5 Å | ||||||
データ登録者 | Teplyakov, A. / Wilson, K.S. / Orioli, P. / Mangani, S. | ||||||
引用 | ジャーナル: Acta Crystallogr.,Sect.D / 年: 1993 タイトル: High-resolution structure of the complex between carboxypeptidase A and L-phenyl lactate. 著者: Teplyakov, A. / Wilson, K.S. / Orioli, P. / Mangani, S. | ||||||
履歴 |
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-構造の表示
構造ビューア | 分子: MolmilJmol/JSmol |
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-ダウンロードとリンク
-ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | 2ctb.cif.gz | 73 KB | 表示 | PDBx/mmCIF形式 |
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PDB形式 | pdb2ctb.ent.gz | 57.6 KB | 表示 | PDB形式 |
PDBx/mmJSON形式 | 2ctb.json.gz | ツリー表示 | PDBx/mmJSON形式 | |
その他 | その他のダウンロード |
-検証レポート
アーカイブディレクトリ | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/ct/2ctb ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/ct/2ctb | HTTPS FTP |
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-関連構造データ
-リンク
-集合体
登録構造単位 |
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1 |
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単位格子 |
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Atom site foot note | 1: PEPTIDE BONDS BETWEEN RESIDUES SER 197 - TYR 198, PRO 205 - TYR 206, AND ARG 272 - ASP 273 ARE IN CIS CONFORMATION. 2: SIDE CHAINS OF ARG 2, SER 134, AND ARG 276 HAVE WEAK ELECTRON DENSITY. THEIR ATOMIC B FACTORS REACHED THE MAXIMUM VALUE (99.99) ALLOWED BY THE REFINEMENT PROGRAM. |
-要素
#1: タンパク質 | 分子量: 34517.480 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Bos taurus (ウシ) / 参照: UniProt: P00730, carboxypeptidase A |
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#2: 化合物 | ChemComp-ZN / |
#3: 水 | ChemComp-HOH / |
-実験情報
-実験
実験 | 手法: X線回折 |
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-試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.11 Å3/Da / 溶媒含有率: 41.73 % | ||||||||||||||||||
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結晶化 | *PLUS pH: 7.5 / 手法: 蒸気拡散法, ハンギングドロップ法 / 詳細: referred to J.Mol.Biol. 19.423-441 1966 | ||||||||||||||||||
溶液の組成 | *PLUS
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-データ収集
反射 | *PLUS 最高解像度: 1.54 Å / 最低解像度: 3.5 Å / Num. obs: 37803 / % possible obs: 88.7 % / Num. measured all: 91192 / Rmerge(I) obs: 0.043 |
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-解析
ソフトウェア | 名称: PROLSQ / 分類: 精密化 | ||||||||||||||||||
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精密化 | 最高解像度: 1.5 Å 詳細: SIDE CHAINS OF ARG 2, SER 134, AND ARG 276 HAVE WEAK ELECTRON DENSITY. THEIR ATOMIC B FACTORS REACHED THE MAXIMUM VALUE (99.99) ALLOWED BY THE REFINEMENT PROGRAM.
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精密化ステップ | サイクル: LAST / 最高解像度: 1.5 Å
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ソフトウェア | *PLUS 名称: PROLSQ / 分類: refinement | ||||||||||||||||||
精密化 | *PLUS 最高解像度: 1.54 Å / Num. reflection obs: 37638 / Rfactor obs: 0.151 / 最低解像度: 8 Å | ||||||||||||||||||
溶媒の処理 | *PLUS | ||||||||||||||||||
原子変位パラメータ | *PLUS | ||||||||||||||||||
拘束条件 | *PLUS
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