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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 244l | ||||||
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タイトル | THE RESPONSE OF T4 LYSOZYME TO LARGE-TO-SMALL SUBSTITUTIONS WITHIN THE CORE AND ITS RELATION TO THE HYDROPHOBIC EFFECT | ||||||
![]() | T4 LYSOZYME | ||||||
![]() | ![]() | ||||||
機能・相同性 | ![]() viral release from host cell by cytolysis / peptidoglycan catabolic process / cell wall macromolecule catabolic process / ![]() ![]() 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | ![]() ![]() | ||||||
手法 | ![]() | ||||||
![]() | Xu, J. / Baase, W.A. / Baldwin, E. / Matthews, B.W. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: The response of T4 lysozyme to large-to-small substitutions within the core and its relation to the hydrophobic effect. 著者: Xu, J. / Baase, W.A. / Baldwin, E. / Matthews, B.W. #1: ![]() タイトル: Response of a Protein Structure to Cavity-Creating Mutations and its Relation to the Hydrophobic Effect 著者: Eriksson, A.E. / Baase, W.A. / Zhang, X.J. / Heinz, D.W. / Blaber, M. / Baldwin, E.P. / Matthews, B.W. #2: ![]() タイトル: Structure of Bacteriophage T4 Lysozyme Refined at 1.7 A Resolution 著者: Weaver, L.H. / Matthews, B.W. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 48.1 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 33.8 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
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-関連構造データ
関連構造データ | ![]() 235lC ![]() 236lC ![]() 237lC ![]() 238lC ![]() 239lC ![]() 240lC ![]() 241lC ![]() 242lC ![]() 243lC ![]() 245lC ![]() 246lC ![]() 247lC ![]() 248lC ![]() 249lC ![]() 250lC ![]() 251lC C: 同じ文献を引用 ( |
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類似構造データ |
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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単位格子 |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 18586.283 Da / 分子数: 1 / 変異: C54T, C97A, I100A / 由来タイプ: 組換発現 由来: (組換発現) ![]() ![]() 属: T4-like viruses / 生物種: Enterobacteria phage T4 sensu lato / 細胞株: S2 / 遺伝子: T4 LYSOZYME GENE / プラスミド: M13 / 細胞内の位置 (発現宿主): CYTOPLASM / 遺伝子 (発現宿主): T4 LYSOZYME GENE / 発現宿主: ![]() ![]() ![]() ![]() | ||||||
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#2: 化合物 | ![]() #3: 化合物 | ChemComp-BME / | ![]() #4: 化合物 | ChemComp-HED / | #5: 水 | ChemComp-HOH / | ![]() |
-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.8 Å3/Da / 溶媒含有率: 48.3 % | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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結晶化![]() | *PLUS pH: 6.7 / 手法: batch method / 詳細: Remington, S.J., (1978) J. Mol. Biol., 118, 81. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
溶液の組成 | *PLUS
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-データ収集
回折 | 平均測定温度: 300 K |
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放射光源 | 波長: 1.5418 |
検出器 | タイプ: XUONG-HAMLIN MULTIWIRE / 検出器: AREA DETECTOR / 日付: 1991年5月29日 |
放射 | 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray |
放射波長 | 波長![]() |
反射 | 最高解像度: 1.7 Å / Num. obs: 14885 / % possible obs: 62 % / Rsym value: 0.054 |
反射 | *PLUS Rmerge(I) obs: 0.054 |
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解析
ソフトウェア |
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精密化 | 構造決定の手法![]()
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溶媒の処理 | 溶媒モデル: BABINET SCALING | ||||||||||||||||||||||||||||||
精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 1.7→10 Å
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拘束条件 |
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ソフトウェア | *PLUS 名称: TNT / バージョン: 5E / 分類: refinement | ||||||||||||||||||||||||||||||
精密化 | *PLUS Rfactor all![]() | ||||||||||||||||||||||||||||||
溶媒の処理 | *PLUS | ||||||||||||||||||||||||||||||
原子変位パラメータ | *PLUS |