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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1qfj | ||||||
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タイトル | CRYSTAL STRUCTURE OF NAD(P)H:FLAVIN OXIDOREDUCTASE FROM ESCHERICHIA COLI | ||||||
![]() | PROTEIN (FLAVIN REDUCTASE) | ||||||
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機能・相同性 | ![]() riboflavin reductase [NAD(P)H] / riboflavin reductase (NAD(P)H) activity / riboflavin reductase (NADPH) activity / protein repair / : / ![]() ![]() 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | ![]() ![]() ![]() | ||||||
手法 | ![]() ![]() ![]() | ||||||
![]() | Ingelman, M. / Ramaswamy, S. / Niviere, V. / Fontecave, M. / Eklund, H. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: Crystal structure of NAD(P)H:flavin oxidoreductase from Escherichia coli. 著者: Ingelman, M. / Ramaswamy, S. / Niviere, V. / Fontecave, M. / Eklund, H. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 189.4 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 154.5 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
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-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 | ![]()
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単位格子 |
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非結晶学的対称性 (NCS) | NCS oper:
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 26143.791 Da / 分子数: 4 / 由来タイプ: 組換発現 詳細: DISULFIDE LINKS BETWEEN MOLECULES A AND D AS WELL AS B AND C RESPECTIVELY 由来: (組換発現) ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() #2: 化合物 | ChemComp-GOL / ![]() #3: 水 | ChemComp-HOH / | ![]() |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.7 Å3/Da / 溶媒含有率: 51 % | ||||||||||||||||||||||||||||||
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結晶化![]() | pH: 6.5 詳細: 15 % PEG 4000, 0.5 M NACL, 100 MM BIS-TRIS PROPANE PH 6.5 | ||||||||||||||||||||||||||||||
結晶化 | *PLUS 温度: 4 ℃ / 手法: 蒸気拡散法 | ||||||||||||||||||||||||||||||
溶液の組成 | *PLUS
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-データ収集
回折 | 平均測定温度: 100 K |
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放射光源 | 由来: ![]() ![]() ![]() |
検出器 | タイプ: MARRESEARCH / 検出器: IMAGE PLATE / 日付: 1995年6月1日 |
放射 | プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray |
放射波長 | 波長![]() |
反射 | 解像度: 2.2→20 Å / Num. all: 54692 / Num. obs: 54692 / % possible obs: 93.2 % / Observed criterion σ(I): 0 / 冗長度: 6.8 % / Rmerge(I) obs: 0.064 / Net I/σ(I): 9.3 |
反射 シェル | 解像度: 2.2→2.24 Å / 冗長度: 6 % / Rmerge(I) obs: 0.235 / Mean I/σ(I) obs: 3.9 / % possible all: 88.2 |
反射 | *PLUS Num. measured all: 626153 |
反射 シェル | *PLUS % possible obs: 88.2 % |
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解析
ソフトウェア |
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精密化 | 構造決定の手法![]() ![]()
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原子変位パラメータ | Biso mean: 35.4 Å2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 2.2→20 Å
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拘束条件 |
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ソフトウェア | *PLUS 名称: REFMAC / 分類: refinement | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
精密化 | *PLUS | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
溶媒の処理 | *PLUS | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
原子変位パラメータ | *PLUS |