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- PDB-1n0q: 3ANK: A designed ankyrin repeat protein with three identical cons... -
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Open data
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Basic information
Entry | Database: PDB / ID: 1n0q | ||||||
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Title | 3ANK: A designed ankyrin repeat protein with three identical consensus repeats | ||||||
![]() | 3 ankyrin repeats | ||||||
![]() | ![]() ![]() | ||||||
Function / homology | Ankyrin repeat-containing domain / Serine Threonine Protein Phosphatase 5, Tetratricopeptide repeat / ![]() ![]() ![]() | ||||||
Method | ![]() ![]() ![]() | ||||||
![]() | Mosavi, L.K. / Minor Jr., D.L. / Peng, Z.-Y. | ||||||
![]() | ![]() Title: Consensus-derived structural determinants of the ankyrin repeat motif. Authors: Mosavi, L.K. / Minor Jr., D.L. / Peng, Z.-Y. | ||||||
History |
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Structure visualization
Structure viewer | Molecule: ![]() ![]() |
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Downloads & links
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Download
PDBx/mmCIF format | ![]() | 48 KB | Display | ![]() |
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PDB format | ![]() | 36.2 KB | Display | ![]() |
PDBx/mmJSON format | ![]() | Tree view | ![]() | |
Others | ![]() |
-Validation report
Arichive directory | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
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-Related structure data
Related structure data | ![]() 1n0rC ![]() 4ankS C: citing same article ( S: Starting model for refinement |
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Similar structure data |
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Links
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Assembly
Deposited unit | ![]()
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1 |
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Unit cell |
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Components
#1: Protein | Mass: 9938.445 Da / Num. of mol.: 2 Source method: isolated from a genetically manipulated source Gene: designed consensus ankyrin repeat / Plasmid: pAED4 / Production host: ![]() ![]() ![]() #2: Chemical | ChemComp-TFA / | ![]() #3: Water | ChemComp-HOH / | ![]() |
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-Experimental details
-Experiment
Experiment | Method: ![]() |
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-
Sample preparation
Crystal | Density Matthews: 2.27 Å3/Da / Density % sol: 45.83 % | ||||||||||||||||||||||||||||||
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Crystal grow![]() | Temperature: 293 K / Method: vapor diffusion, hanging drop / pH: 7 Details: HEPES, MPD, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K | ||||||||||||||||||||||||||||||
Crystal grow | *PLUS | ||||||||||||||||||||||||||||||
Components of the solutions | *PLUS
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-Data collection
Diffraction | Mean temperature: 77 K |
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Diffraction source | Source: ![]() ![]() ![]() |
Detector | Type: ADSC QUANTUM 210 / Detector: CCD / Date: Mar 15, 2002 |
Radiation | Protocol: SINGLE WAVELENGTH / Monochromatic (M) / Laue (L): M / Scattering type: x-ray |
Radiation wavelength | Wavelength![]() |
Reflection | Resolution: 1.26→19.96 Å / Num. all: 43548 / Num. obs: 41302 / % possible obs: 99.52 % / Rsym value: 0.087 / Net I/σ(I): 11.8 |
Reflection | *PLUS Rmerge(I) obs: 0.087 |
Reflection shell | *PLUS Num. unique obs: 2246 / Rmerge(I) obs: 0.08 / Mean I/σ(I) obs: 1.7 |
-
Processing
Software |
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Refinement | Method to determine structure![]() ![]() Starting model: 4ANK Resolution: 1.26→19.96 Å / Cor.coef. Fo:Fc: 0.966 / Cor.coef. Fo:Fc free: 0.961 / TLS residual ADP flag: LIKELY RESIDUAL / Cross valid method: THROUGHOUT / σ(F): 1 / Stereochemistry target values: MAXIMUM LIKELIHOOD
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Solvent computation | Shrinkage radii: 0.8 Å / Solvent model: BABINET MODEL WITH MASK | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Displacement parameters | Biso mean: 12.618 Å2
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Refinement step | Cycle: LAST / Resolution: 1.26→19.96 Å
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Refine LS restraints |
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LS refinement shell | Resolution: 1.26→1.293 Å / Total num. of bins used: 20 /
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Refinement TLS params. | Method: refined / Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION
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Refinement TLS group |
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Refinement | *PLUS Rfactor Rfree![]() ![]() | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Solvent computation | *PLUS | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Displacement parameters | *PLUS | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Refine LS restraints | *PLUS
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