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-基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1k6h | ||||||||||||||||||
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タイトル | Solution Structure of Conserved AGNN Tetraloops: Insights into Rnt1p RNA processing | ||||||||||||||||||
要素 | RNA (5'-R(P*キーワード | RNA (リボ核酸) / RNA Tetraloop | 機能・相同性 | リボ核酸 / RNA (> 10) | 機能・相同性情報 手法 | 溶液NMR / simulated annealing | データ登録者 | Lebars, I. / Lamontagne, B. / Yoshizawa, S. / Abou Elela, S. / Fourmy, D. | 引用 | ジャーナル: EMBO J. / 年: 2001 | タイトル: Solution structure of conserved AGNN tetraloops: insights into Rnt1p RNA processing. 著者: Lebars, I. / Lamontagne, B. / Yoshizawa, S. / Aboul-Elela, S. / Fourmy, D. 履歴 |
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-構造の表示
構造ビューア | 分子: MolmilJmol/JSmol |
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-ダウンロードとリンク
-ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | 1k6h.cif.gz | 271.2 KB | 表示 | PDBx/mmCIF形式 |
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PDB形式 | pdb1k6h.ent.gz | 229.8 KB | 表示 | PDB形式 |
PDBx/mmJSON形式 | 1k6h.json.gz | ツリー表示 | PDBx/mmJSON形式 | |
その他 | その他のダウンロード |
-検証レポート
アーカイブディレクトリ | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/k6/1k6h ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/k6/1k6h | HTTPS FTP |
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-関連構造データ
-リンク
-集合体
登録構造単位 |
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1 |
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NMR アンサンブル |
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-要素
#1: RNA鎖 | 分子量: 7112.306 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 合成 / 詳細: Synthetic-T7 RNA transcript |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: 溶液NMR | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NMR実験 |
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-試料調製
詳細 |
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試料状態 |
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結晶化 | *PLUS 手法: その他 / 詳細: NMR |
-NMR測定
放射 | プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M | |||||||||||||||
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放射波長 | 相対比: 1 | |||||||||||||||
NMRスペクトロメーター |
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-解析
NMR software |
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精密化 | 手法: simulated annealing / ソフトェア番号: 1 | ||||||||||||
NMRアンサンブル | コンフォーマー選択の基準: structures with the lowest energy 計算したコンフォーマーの数: 25 / 登録したコンフォーマーの数: 20 |