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-基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1jp0 | ||||||||||||||||||
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タイトル | NMR Structure of the LP5.1 Hairpin from Bacillus RNase P RNA Refined WITHOUT Residual Dipolar Couplings | ||||||||||||||||||
要素 | 5'-R(*キーワード | RNA (リボ核酸) / RIBONUCLEIC ACID (リボ核酸) / RNASE P (リボヌクレアーゼP) / HAIRPIN / RESIDUAL DIPOLAR COUPLING REFINEMENT / UGNRAU | 機能・相同性 | リボ核酸 / RNA (> 10) | 機能・相同性情報 手法 | 溶液NMR / torsion angle dynamics | データ登録者 | Leeper, T.C. / Schmidt, F.J. / Van Doren, S.R. | 引用 | ジャーナル: Nat.Struct.Biol. / 年: 2002 | タイトル: Structure of the UGAGAU hexaloop that braces Bacillus RNase P for action. 著者: Leeper, T.C. / Martin, M.B. / Kim, H. / Cox, S. / Semenchenko, V. / Schmidt, F.J. / Van Doren, S.R. 履歴 |
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-構造の表示
構造ビューア | 分子: MolmilJmol/JSmol |
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-ダウンロードとリンク
-ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | 1jp0.cif.gz | 359.9 KB | 表示 | PDBx/mmCIF形式 |
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PDB形式 | pdb1jp0.ent.gz | 303.3 KB | 表示 | PDB形式 |
PDBx/mmJSON形式 | 1jp0.json.gz | ツリー表示 | PDBx/mmJSON形式 | |
その他 | その他のダウンロード |
-検証レポート
アーカイブディレクトリ | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/jp/1jp0 ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/jp/1jp0 | HTTPS FTP |
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-関連構造データ
-リンク
-集合体
登録構造単位 |
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1 |
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NMR アンサンブル |
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-要素
#1: RNA鎖 | 分子量: 6776.060 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 合成 / 詳細: IN VITRO TRANSCRIPTION |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: 溶液NMR | ||||||||||||||||||||||||
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NMR実験 |
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-試料調製
詳細 |
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試料状態 |
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結晶化 | *PLUS 手法: その他 / 詳細: NMR |
-NMR測定
放射 | プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M | |||||||||||||||
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放射波長 | 相対比: 1 | |||||||||||||||
NMRスペクトロメーター |
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-解析
NMR software |
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精密化 | 手法: torsion angle dynamics / ソフトェア番号: 1 詳細: residual dipolar coupling refinement were NOT used for this structure, see 1JOX. | ||||||||||||
代表構造 | 選択基準: closest to the average | ||||||||||||
NMRアンサンブル | コンフォーマー選択の基準: structures with the lowest energy 計算したコンフォーマーの数: 100 / 登録したコンフォーマーの数: 28 |